Creació d'un visor web per la visualització de dades d'interferometria de l'Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya

El propòsit d'aquest projecte és la creació d'un visor web per a la visualització de dades d'interferometria, amb les quals es poden mesurar moviments del terreny, per a l'Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya. Aquest treball ha estat possible gràcies al conveni de pràctiques entre l'Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya i el Màster en Geoinformació de la Universitat Autònoma de Barcelona. El projecte neix de la necessitat de l'Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya en tenir una eina interna, que permeti la visualització de totes aquelles dades d'interferometria que té en la base de dades, aquest visor servirà com a magatzem de dades agrupades per capes i anys. Es dissenya i implementa un visor intuïtiu, gràcies a les llibreries de Mapbx i Semantic UI, a partir de desplegables de mapes i capes dividides per anys. Es crea tot el conjunt de MBTiles corresponents a cada una de les capes i es programen totes les connexions per a la correcte visualització del visorEl propósito de este proyecto es la creación de un visor para la visualización de datos de interferometría, con los cuales se pueden medir movimientos del terreno, para el Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya. Este trabajo ha sido gracias al convenio de prácticas entre el Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya y el Màster en Geoinformació de la Universitat Autònoma de Barcelona. El proyecto nace de la necesidad del Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya en tener una herramienta interna, que permita la visualización de todos aquellos datos de interferometría que tienen en la base de datos, este visor servirá como almacén de datos agrupados en capas y años. Se diseña e implementa un visor intuitivo, gracias a las librerías de Mapbox y Semantic UI, a partir de desplegables de mapas y capas divididas por años. También se crea todo el conjunto de MBTiles correspondientes a cada una de las capas y se programan todas las conexiones para la correcta visualización del visorThe purpose of this project is the creation of a interface for the display of interferometry data, which to measure ground movements, for the Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya. All the work done it has been possible thanks to the agreement between the Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya and the Màster of Geoinformació from the Universitat Autònoma de Barcelona. This project was born from a specific need of the Institut Cartogràfic i Geològic de Catalunya to have an internal tool to display all the interferometry data from the database, and also to serve as a data store grouped in layers and years. An intuitive interface has been carefully designed and implemented based on dropdown maps and layers by years, from the Mapbox and Semantic UI libraries. In addition, it has been created all the MBTiles according to each layer and all the links has been programed to display the interfac

Millora del visor d'Espais VAT

En aquest Treball de Fi de Màster s'exposen els objectius, el desenvolupament i els resultats del projecte realitzat durant les pràctiques professionals a l'empresa Solucions Geogràfiques S.C.C.L., pràctiques que van començar el 23 d'abril del 2018 i van finalitzar el 22 de juny del mateix any. El projecte s'ha basat en la millora del visor d'Espais VAT, allotjat a la plataforma de CARTO, i en la creació d'un formulari de participació per a usuaris externs. Les modificacions de la plataforma CARTO en la gestió dels accessos als usuaris, les limitacions dels recursos lliures i l'adaptació a les eines que ja formen part del projecte, ha provocat que bona part d'aquest treball s'hagi centrat en la cerca d'alternatives. Per aquestes circumstàncies, aquest projecte no només m'ha permès posar en pràctica molts dels coneixements adquirits durant el Màster en Geoinformació (gestionant bases de dades, fent canvis de formats, simbolitzant, modificant codis html, ...) sinó que també m'ha obligat a conèixer noves eines i explorar diferents formes de treballEn este Trabajo de Fin de Máster se exponen los objetivos, el desarrollo y los resultados del proyecto realizado durante las prácticas profesionales en la empresa Solucions Geogràfiques S.C.C.L., prácticas que comenzaron el 23 de abril de 2018 y finalizaron el 22 de junio del mismo año. El proyecto se ha basado en la mejora del visor de Espais VAT, alojado en la plataforma de CARTO, y en la creación de un formulario de participación para usuarios externos. Las modificaciones de la plataforma CARTO en la gestión de los accesos a los usuarios, las limitaciones de los recursos libres y la adaptación a las herramientas que ya forman parte del proyecto han provocado que buena parte de este trabajo se haya centrado en la búsqueda de alternativas. Por estas circunstancias, este proyecto no sólo me ha permitido poner en práctica muchos de los conocimientos adquiridos durante el Máster en Geoinformación (gestionando bases de datos, haciendo cambios de formatos, simbolizando, modificando códigos html, ...) sino que también me ha obligado a conocer nuevas herramientas y explorar diferentes formas de trabajoIn this Final Master's Work, are exposed the objectives, the development and the results of the project carried out during the professional practices in the company Solucions Geogràfiques S.C.C.L., practices that began on April 23, 2018 and ended on June 22 of the same year. The project was based on the improvement of the viewer of Espais VAT, hosted on the CARTO platform, and on the creation of a participation form for users outside the project. The modifications of the CARTO platform in the management of access to users, the limitations of free resources and the adaptation to the tools that are already part of the project, has led to the fact that a good part of this work has focused on the search of alternatives. For these circumstances, this project not only allowed me to put into practice many of the knowledge acquired during the Master's in Geoinformation (managing databases, making changes of formats, symbolizing, modifying html codes ...), also forced me to know new tools and explore different forms of wor

Construction, characterization and preclinical evaluation of MTBVAC, the first live-attenuated M. tuberculosis-based vaccine to enter clinical trials

The development of a new tuberculosis vaccine is an urgent need due to the failure of the current vaccine, BCG, to protect against the respiratory form of the disease. MTBVAC is an attenuated Mycobacterium tuberculosis vaccine candidate genetically engineered to fulfil the Geneva consensus requirements to enter human clinical trials. We selected a M. tuberculosis clinical isolate to generate two independent deletions without antibiotic-resistance markers in the genes phoP, coding for a transcription factor key for the regulation of M. tuberculosis virulence, and fadD26, essential for the synthesis of the complex lipids phthiocerol dimycocerosates (DIM), one ofthe major mycobacterial virulence factors. The resultant strain MTBVAC exhibits safety and biodistribution profiles similar to BCG and confers superior protection in preclinical studies. These features have enabled MTBVAC to be the first live attenuated M. tuberculosis vaccine to enter clinical evaluation

Global Influenza Seasonality: Reconciling Patterns across Temperate and Tropical Regions

Bac k g r o u n d: Despite the significant disease burden of the influenza virus in humans, our understanding of the basis for its pronounced seasonality remains incomplete. Past observations that influenza epidemics occur in the winter across temperate climates, combined with insufficient knowledge about the epidemiology of influenza in the tropics, led to the perception that cool and dry conditions were a necessary, and possibly sufficient, driver of influenza epidemics. Recent reports of substantial levels of influenza virus activity and well-defined seasonality in tropical regions, where warm and humid conditions often persist year-round, have rendered previous hypotheses insufficient for explaining global patterns of influenza. Objectiv e: In this review, we examined the scientific evidence for the seasonal mechanisms that potentially explain the complex seasonal patterns of influenza disease activity observed globally. Me t h o d s: In this review we assessed the strength of a range of hypotheses that attempt to explain observations of influenza seasonality across different latitudes and how they relate to each other. We reviewed studies describing population-scale observations, mathematical models, and ecological, laboratory, and clinical experiments pertaining to influenza seasonality. The literature review includes studies that directly mention the topic of influenza seasonality, as well as other topics w

Envirocat

El presente documento describe las diferentes partes que componen el proyecto final Envirocat, liderado académicamente por la Universidad Autónoma de Barcelona, en conjunto con el Instituto Cartográfico y Geológico de Catalunya y que tiene como principal cliente objetivo al Museu de Ciències Naturals de Barcelona, en el programa de Master en Goeinformación, 2a Edición. El proyecto plantea como principal objetivo desarrollar y/o adaptar un complemento en lenguaje Python el cual le preste el servicio a la organización cliente de mantener en una herramienta-complemento, todas las capas en diferentes formatos que tiene propuestas en sus bases de datos para cualquier actividad que se requiera, puesto que, en la actualidad se tienen organizadas en forma de SIG independiente para cada proyecto. Además, para utilizarlas se deben repetir algunos pasos, como localización y cambios de proyección, que en momentos se tornan algo complejos. Como punto final, se plantea realizar un manual de usuario en el cual se le muestre, todos y cada uno de los pasos que deben seguirse para poder alimentar el repositorio y posterior a eso visualizar la información en el entorno de QGIS

Protein–protein interactions as a proxy to monitor conformational changes and activation states of the tomato resistance protein I-2

Plant resistance proteins (R) are involved in pathogen recognition and subsequent initiation of defence responses. Their activity is regulated by inter- and intramolecular interactions. In a yeast two-hybrid screen two clones (I2I-1 and I2I-2) specifically interacting with I-2, a Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici resistance protein of the CC-NB-LRR family, were identified. Sequence analysis revealed that I2I-1 belongs to the Formin gene family (SlFormin) whereas I2I-2 has homology to translin-associated protein X (SlTrax). SlFormin required only the N-terminal CC I-2 domain for binding, whereas SlTrax required both I-2 CC and part of the NB-ARC domain. Tomato plants stably silenced for these interactors were not compromised in I-2-mediated disease resistance. When extended or mutated forms of I-2 were used as baits, distinct and often opposite, interaction patterns with the two interactors were observed. These interaction patterns correlated with the proposed activation state of I-2 implying that active and inactive R proteins adopt distinct conformations. It is concluded that the yeast two hybrid system can be used as a proxy to monitor these different conformational states

Tracking Membrane Protein Association in Model Membranes

Membrane proteins are essential in the exchange processes of cells. In spite of great breakthrough in soluble proteins studies, membrane proteins structures, functions and interactions are still a challenge because of the difficulties related to their hydrophobic properties. Most of the experiments are performed with detergent-solubilized membrane proteins. However widely used micellar systems are far from the biological two-dimensions membrane. The development of new biomimetic membrane systems is fundamental to tackle this issue