Microbioma do Pinus pinaster

Mestrado em MicrobiologiaPinus pinaster has a great environmental, historical and economical importance to Portugal. It represents the third place in occupation in forestry area. However, it has been losing area due to the modifications on land use, fires and diseases such as the pine wilt disease (PWD). Native from the North America the PWD has been spreading worldwide, it has spread through Asia and more recently was identified in Europe being detected in Portugal in 1999, representing a major threat to forests. Recently, the importance of the bacteria community to the PWD has been accessed and few studies address the microbiome of P. pinaster. Most of the existing studies uses culture-dependent techniques. This work aimed to reveal the bacterial community of healthy P. pinaster trees using culture-independent techniques. To observe the bacterial communities of healthy P. pinaster, stem samples from trees aged between 20 and 30 years were collected from 4 Portuguese locations: Comporta, Góis, Madeira Island and Vouzela. The trunks were cut into disks and the sawdust of the center of these disks were used to extract DNA. Samples were tested for the presence of the PWD nematode and all were negative. DGGE analysis was performed to compare the bacterial community of different samples and pyrosequencing was used to identify the community. After analyzing the DGGE profiles, a sample was cloned and sequenced, and the results showed that the most common and intense bands belonged to chloroplast genetic material. Pyrosequencing results had a great amount of reads belonging to chloroplast and they were eliminated from the study. With the pyrosequencing, six plyla were detected: Proteobacteria, Acidobacteria, Firmicutes, Bacteriodetes, Armatimonadetes and Actinobacteria. Proteobacteria was the most common, and from this plylum, Gammaproteobacteria was the most abundant class. Samples grouped by location and the location community differ significantly, only two OTUs were shared by all locations. Despite the low read number the bacterial community was characterized, and this information can be used for future studies.Pinus pinaster possui uma grande importância ambiental, histórica e económica em Portugal, conquistando o terceiro lugar em ocupação florestal. Entretanto sua área está a diminuir devido a modificações na utilização dos terrenos, fogos e doenças como a da murchidão do pinheiro (DMP). Nativa da América do Norte, a DMP vem se espalhando em uma escala global, já está presente na Ásia e mais recentemente na Europa, sendo detectada em 1999 em Portugal, representando assim uma ameaça a florestas do mundo inteiro. Existem evidências que apontam para a importância da comunidade bacteriana no desenvolvimento da DMP e poucos estudos abordam o microbioma do P. pinaster, com a maioria utilizando metodologias baseadas em cultivo. Este trabalho tem como objetivo revelar a comunidade bacteriana de árvores de P. pinaster saudáveis utilizando técnicas independentes de cultivo. Para observar a comunidade bacteriana do P. Pinaster saudável, árvores entre 20 e 30 anos de idade foram recolhida de 4 localidades portuguesas: Comporta, Góis, Ilha da Madeira e Vouzela. O tronco dessas árvores foi cortado em discos e o serrim do centro desses discos foi utilizado para extração de DNA. Todas as amostras foram testadas para a presença do nemátodo sendo que este estava ausente em todas as amostras. Foi feito DGGE com o objectivo de comparar a comunidade bacteriana de diferentes amostras, e esta foi identificada utilizando-se pirosequenciação. Tendo em conta os perfis de DGGE, foi feita a clonagem e sequenciação de uma das amostras, e verificou-se que as bandas mais intensas, e presentes em todas as amostras, eram material genético proveniente de cloroplastos. Os resultados de pirosequenciação revelaram uma grande quantidade de reads proveniente de cloroplastos que foram eliminadas do estudo. A análise dos resultados da pirosequenciação permitiu identificar seis filos: Proteobacteria, Acidobacteria, Firmicutes, Bacteriodetes, Armatimonadetes e Actinobacteria. Proteobacteria foi o filo mais comum e dele Gammaproteobacteria foi a classe mais abundante. As amostras se agruparam de acordo com o local de origem e as comunidades dos locais se diferenciavam significativamente. Apenas duas OTUs eram compartilhadas por todos os locais. Apesar do baixo número de reads, a estrutura da comunidade bacteriana foi caracterizada e essa informação pode ser agora utilizada em futuros estudos

Soluble human Suppression of Tumorigenicity 2 is associated with endoscopic activity in patients with moderate-to-severe ulcerative colitis treated with golimumab

Suppressor of Tumorigenicity 2 (ST2) is an IL33 receptor detected in the mucosa and serum of ulcerative colitis (UC) patients. We evaluated soluble ST2 (sST2) as a surrogate biomarker of disease outcome and therapeutic response, in moderate-to-severe UC patients treated with golimumab.Agência financiadora Merck Sharp and Dohme, Lda, Portugal MK8259-22info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Aplicação de Storytelling na Gestão do Conhecimento: Revisão Sistemática de Literatura

This article presents a systematic review of the literature regarding the application of storytelling in knowledge management. To survey the articles, Science Direct and Scopus databases were used in order to identify publications indexed in the databases mentioned in the period from 2011 to 2020. The articles were subjected using the Ordinatio method for an advanced selection with greater relevance. In the literature review, there is an approach on knowledge management practices with emphasis on narratives. Still in the literature review, the relation with decision making is contextualized. The research shows that the theme has been explored more recently in a form distributed among journals and between countries, in addition to showing that the main application of storytelling involves an evaluation of the narratives to obtain information regarding the experiences of the participating individuals. It also demonstrates that narratives are facilitators for understanding, communicating, extracting content and making decisions.Este artículo presenta una revisión sistemática de la literatura sobre la aplicación del storytelling en la gestión del conocimiento. Para relevar los artículos se utilizaron las bases de datos Science Direct y Scopus con el fin de identificar las publicaciones indexadas en las bases de datos mencionadas en el período 2011 a 2020. Los artículos se sometieron al método Ordinatio para la selección de las de mayor relevancia. En la revisión de la literatura, hay un enfoque sobre las prácticas de gestión del conocimiento con énfasis en las narrativas. Aún en la revisión de la literatura, se contextualiza la relación con la toma de decisiones. La investigación muestra que el tema ha sido explorado más recientemente en una forma distribuida entre revistas y entre países, además de mostrar que la principal aplicación del storytelling pasa por la evaluación de narrativas para obtener información relacionada con las experiencias de los individuos participantes. También demuestra que las narrativas facilitan la comprensión, la comunicación, la extracción de contenido y la toma de decisiones.Este artigo apresenta uma revisão sistemática da literatura referente a aplicação de storytelling na gestão do conhecimento. Para o levantamento dos artigos foram usadas as bases de dados Science Direct e Scopus com o objetivo de identificar publicações indexadas nas bases de dados mencionadas no período de 2011 a 2020. Os artigos foram submetidos ao método Ordinatio para a seleção daqueles com maior relevância. Na revisão de literatura há uma abordagem sobre práticas de gestão do conhecimento com destaque para as narrativas. Ainda na revisão de literatura é contextualizada a relação com a tomada de decisão. A pesquisa evidencia que o tema tem sido explorado mais recentemente de forma distribuída entre periódicos e entre países, além de evidenciar que a principal aplicação de storytelling envolve a avaliação das narrativas para obtenção de informações relativas às experiências dos indivíduos participantes. Demonstra ainda que as narrativas são facilitadoras para o entendimento, comunicação, extração de conteúdo e tomada de decisão

TRANSIÇÃO PARA OS CUIDADOS PALIATIVOS: AÇÕES FACILITADORAS PARA UMA COMUNICAÇÃO CENTRADA NO CLIENTE ONCOLÓGICO

RESUMO Introdução: a relação interpessoal profissional-cliente se torna primordial na transição para os cuidados paliativos para que juntos possam melhorar a comunicação nesse momento e alinhar o cuidado aos desejos do cliente. Objetivo: analisar como o cliente oncológico avalia a comunicação na transição para os cuidados paliativos; identificar suas necessidades e preferências acerca dessa comunicação relacionadas ao seu prognóstico, tomada de decisão e participação familiar; e apresentar proposta de ações facilitadoras para comunicação na transição para os cuidados paliativos, a partir das necessidades e preferências mencionadas pelo cliente. Método: pesquisa convergente assistencial realizada em um hospital federal do Rio de Janeiro, com 15 clientes oncológicos. Utilizou-se a entrevista semiestruturada seguida de discussão dialogada com cada participante. Aplicada análise temática. Resultados: na avaliação dos participantes, o acolhimento, a forma atenciosa, a informação da verdade e a linguagem simples e acessível foram elementos essenciais para construir uma relação de confiança e comunicação esclarecedora sobre o momento vivido. Ainda assim, os clientes ansiavam por mais informações sobre seu tratamento e prognóstico. Apesar de a maioria referir a preferência pela verdade, participação familiar e participação ativa no tratamento, outros demonstraram a preferência pelo não saber para não sofrer, a não participação familiar e a passividade na participação do tratamento. Conclusão: será a partir da priorização das ações de escuta ativa, do acolhimento, respeito à autonomia e utilização de linguagem clara e acessível que o profissional criará vínculo necessário e obterá mais êxito em realizar uma comunicação centrada nas necessidades e preferências do cliente oncológico

O USO DO ENTEROCLISMA NO PREPARO PARA O PARTO: ANÁLISE DE SUAS VANTAGENS E DESVANTAGENS

This study aimed at investigating the effects of intestinal cleansers on fecal contamination during labor and delivery amongst women assisted in a university hospital. The subjects were 90 pregnant women (43 normal births, 27 forceps and 20 caesarean sections). The population was divided in two randomized groups: with and without the use of intestinal cleansers. It was possible to conclude that intestinal cleansers did not provide faster labor and did note reduce fecal contamination. However, the women who had used an intestinal cleanser tended to regard it as positive.Se investigaron los efectos de los enemas sobre la contaminación fecal durante el trabajo de parto y el parto, entre mujeres atendidas en un hospital-escuela. La población estuvo constituida por 90 mujeres (43 partos normales, 27 con fórceps y 20 por cesárea). Se realizó un ensayo clínico aleatorio, se consideraron grupos: con y sin enemas. Se puede concluir que el enema no disminuyó el tiempo de trabajo de parto y no redujo la contaminación fecal. Aun así, las mujeres, que realizaron el enema tuvieron opinión más favorable sobre éste que aquellas que no lo realizaron.Investigaram-se os efeitos do enteroclisma sobre a contaminação fecal, durante o trabalho de parto e parto, entre mulheres atendidas num hospital-escola. A população foi constituída por 90 parturientes (43 partos normais, 27 fórceps e 20 cesáreas). Realizou-se um ensaio clínico randomizado, considerando-se dois grupos: com e sem enteroclisma. Pode-se concluir que o enteroclisma não abreviou o tempo de trabalho de parto e não reduziu a contaminação fecal. Entretanto, as mulheres que realizaram o enteroclisma tiveram opinião mais favorável sobre ele do que as que não o realizaram

Accuracy of faecal calprotectin and neutrophil Gelatinase B-associated Lipocalin in evaluating subclinical inflammation in UlceRaTIVE colitis-the ACERTIVE study

Background and Aims: Mucosal healing and histological remission are different targets for patients with ulcerative colitis, but both rely on an invasive endoscopic procedure. This study aimed to assess faecal calprotectin and neutrophil gelatinase B-associated lipocalin as biomarkers for disease activity in asymptomatic ulcerative colitis patients. Methods: This was a multicentric cross-sectional study including 371 patients, who were classified according to their endoscopic and histological scores. These results were evaluated alongside the faecal levels of both biomarkers. Results: Macroscopic lesions [i.e. endoscopic Mayo score >= 1] were present in 28% of the patients, and 9% had active disease according to fht Ulcerative Colitis Endoscopic Index of Severity. Moreover, 21% presented with histological inflammation according to the Geboes index, whereas 15% and 5% presented with focal and diffuse basal plasmacytosis, respectively. The faecal levels of calprotectin and neutrophil gelatinase B-associated lipocalin were statistically higher for patients with endoscopic lesions and histological activity. A receiver operating characteristic-based analysis revealed that both biomarkers were able to indicate mucosal healing and histological remission with an acceptable probability, and cut-off levels of 150-250 mu g/g for faecal calprotectin and 12 mu g/g for neutrophil gelatinase B-associated lipocalin were proposed. Conclusions: Faecal calprotectin and neutrophil gelatinase B-associated lipocalin levels are a valuable addition for assessment of disease activity in asymptomatic ulcerative colitis patients. Biological levels of the analysed biomarkers below the proposed thresholds can rule out the presence of macroscopic and microscopic lesions with a probability of 75-93%. However, caution should be applied whenever interpreting positive results, as these biomarkers present consistently low positive predictive values.Portuguese IBD Group [GEDII - Grupo de Estudo da Doenca Inflamatcria Intestinal]info:eu-repo/semantics/publishedVersio

SARS-CoV-2 introductions and early dynamics of the epidemic in Portugal

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Portugal was rapidly implemented by the National Institute of Health in the early stages of the COVID-19 epidemic, in collaboration with more than 50 laboratories distributed nationwide. Methods By applying recent phylodynamic models that allow integration of individual-based travel history, we reconstructed and characterized the spatio-temporal dynamics of SARSCoV-2 introductions and early dissemination in Portugal. Results We detected at least 277 independent SARS-CoV-2 introductions, mostly from European countries (namely the United Kingdom, Spain, France, Italy, and Switzerland), which were consistent with the countries with the highest connectivity with Portugal. Although most introductions were estimated to have occurred during early March 2020, it is likely that SARS-CoV-2 was silently circulating in Portugal throughout February, before the first cases were confirmed. Conclusions Here we conclude that the earlier implementation of measures could have minimized the number of introductions and subsequent virus expansion in Portugal. This study lays the foundation for genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Portugal, and highlights the need for systematic and geographically-representative genomic surveillance.We gratefully acknowledge to Sara Hill and Nuno Faria (University of Oxford) and Joshua Quick and Nick Loman (University of Birmingham) for kindly providing us with the initial sets of Artic Network primers for NGS; Rafael Mamede (MRamirez team, IMM, Lisbon) for developing and sharing a bioinformatics script for sequence curation (https://github.com/rfm-targa/BioinfUtils); Philippe Lemey (KU Leuven) for providing guidance on the implementation of the phylodynamic models; Joshua L. Cherry (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health) for providing guidance with the subsampling strategies; and all authors, originating and submitting laboratories who have contributed genome data on GISAID (https://www.gisaid.org/) on which part of this research is based. The opinions expressed in this article are those of the authors and do not reflect the view of the National Institutes of Health, the Department of Health and Human Services, or the United States government. This study is co-funded by Fundação para a Ciência e Tecnologia and Agência de Investigação Clínica e Inovação Biomédica (234_596874175) on behalf of the Research 4 COVID-19 call. Some infrastructural resources used in this study come from the GenomePT project (POCI-01-0145-FEDER-022184), supported by COMPETE 2020 - Operational Programme for Competitiveness and Internationalisation (POCI), Lisboa Portugal Regional Operational Programme (Lisboa2020), Algarve Portugal Regional Operational Programme (CRESC Algarve2020), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (ERDF), and by Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Experimental Gastric Carcinogenesis in Cebus apella Nonhuman Primates

The evolution of gastric carcinogenesis remains largely unknown. We established two gastric carcinogenesis models in New-World nonhuman primates. In the first model, ACP03 gastric cancer cell line was inoculated in 18 animals. In the second model, we treated 6 animals with N-methyl-nitrosourea (MNU). Animals with gastric cancer were also treated with Canova immunomodulator. Clinical, hematologic, and biochemical, including C-reactive protein, folic acid, and homocysteine, analyses were performed in this study. MYC expression and copy number was also evaluated. We observed that all animals inoculated with ACP03 developed gastric cancer on the 9th day though on the 14th day presented total tumor remission. In the second model, all animals developed pre-neoplastic lesions and five died of drug intoxication before the development of cancer. The last surviving MNU-treated animal developed intestinal-type gastric adenocarcinoma observed by endoscopy on the 940th day. The level of C-reactive protein level and homocysteine concentration increased while the level of folic acid decreased with the presence of tumors in ACP03-inoculated animals and MNU treatment. ACP03 inoculation also led to anemia and leukocytosis. The hematologic and biochemical results corroborate those observed in patients with gastric cancer, supporting that our in vivo models are potentially useful to study this neoplasia. In cell line inoculated animals, we detected MYC immunoreactivity, mRNA overexpression, and amplification, as previously observed in vitro. In MNU-treated animals, mRNA expression and MYC copy number increased during the sequential steps of intestinal-type gastric carcinogenesis and immunoreactivity was only observed in intestinal metaplasia and gastric cancer. Thus, MYC deregulation supports the gastric carcinogenesis process. Canova immunomodulator restored several hematologic measurements and therefore, can be applied during/after chemotherapy to increase the tolerability and duration of anticancer treatments

Síndrome do coração Pós-feriado: pacientes acometidos por arritmia cardíaca em detrimento do consumo exagerado de álcool: Post Holiday coração Syndrome: patients suffered by cardiac arrhythmia to the detriment of exaggerated alcohol consumption

INTRODUÇÃO: O álcool é conhecido por beneficiar o sistema cardiovascular com a ativação do sistema fibrinolítico, redução da agregação de plaquetas e aperfeiçoamento do perfil lipídico, entre outros mecanismos, quando consumido em doses moderadas. Todavia, seu uso de maneira abusiva culmina em patologias graves que podem evoluir para a morte, como a hipertensão arterial, a cardiomiopatia alcoólica, a arritmia cardíaca e até a “Síndrome do Coração Pós Feriado” ou do inglês, “Holiday Heart Syndrome”. OBJETIVOS: O presente estudo tem como objetivo delinear sobre a Síndrome do Coração Pós Feriado, transpassando por suas características clínicas, repercussões eletrofisiológicas, diagnóstico e manejo terapêutico. MATERIAIS E MÉTODOS: Dessa forma, o presente trabalho realizou uma revisão sistemática qualitativa, realizado no período entre julho e agosto de 2022, através de artigos das bases de dados Biblioteca Virtual em Saúde (BVS) e United States National Library of Medicine (PubMed). RESULTADOS E DISCUSSÃO: A interação do álcool no organismo está diretamente relacionada com o sistema nervoso autônomo do indivíduo, gerando um estado de desequilíbrio autonômico, assim há alterações elétricas, como acréscimo da frequência cardíaca, gerando um estado de taquicardia. A principal patologia encontrada em questão foi a taquicardia sinusal, sendo um tipo de arritmia e por conseguinte, notou-se a presença da fibrilação atrial, sendo o excesso no consumo de etanol é causador de aproximadamente 67% dos casos de emergências desta última enfermidade. CONCLUSÃO: Portanto, com base na literatura analisada, observou-se que a ingestão alcoólica aguda age retardando o sistema de condução cardíaco, atua no encurtamento do período refratário e o aumento da atividade simpática, além de aumentar os níveis de catecolaminas circulantes. Por fim, também se evidenciou uma associação entre álcool e fatores de risco, principalmente hipertensão e obesidade e essas patologias aumentam os episódios de fibrilação atrial

Educomunicação em Tempos de Pandemia:

Os textos que compõem esta obra são oriundos do VIII Colóquio Ibero-americano de Educomunicação (VIII CIEducom) e IX Colóquio Catarinense de Educomunicação (IX CCEducom), realizados em março de 2021. Em um ano no qual o vírus SARS-CoV-2 e variantes circularam por diversos territórios, Educomunicação em tempos de pandemia: práticas e desafios foi o tema discutido nos eventos. Este livro colocado à disposição do público é um modo de compartilhar caminhos e convidar pessoas curiosas a percorrerem, por meio das palavras e recursos gráficos, desafios identificados e estratégias para o enfrentamento deste inesperado período de pandemia