Microbiological Quality of Water from Lis Valley Rice Ecosystems

A cultura do arroz tem um importante valor económico e social em Portugal, numa área total de cerca de 30 mil ha. Os agroecossistemas orizícolas são peculiares, desenvolvem-se em terrenos baixos, planos e aluvionares, na proximidade da costa, com uma natural dificuldade de drenagem e influência da salinidade, com o cultivo em canteiros regados por submersão contínua, num equilíbrio muito sensível. Os sistemas orizícolas desempenham um valioso papel ambiental, em harmonia com a produção de um alimento humano de reconhecida qualidade, num contributo significativo para a soberania alimentar nacional. Os principais constrangimentos atuais da rega do arroz prendem-se com a escassez de água, questões com uma dimensão mundial, sendo a poupança de água um tema muito estudado, com diversas soluções alternativas já implementadas na realidade de vários países. Este estudo teve como objetivo analisar a qualidade microbiológica da água e do solo no cultivo de arroz no Vale do Lis em sistemas de rega por submersão contínua e intermitente em canteiros de nível, e na rega por gotejamento num talhão de ensaio, para avaliar os respetivos impactos nos recursos hídricos, visando contribuir para o estabelecimento de boas práticas agrícolas e de saúde pública e ambiental no uso da água e do solo naqueles agroecossistemas. Na metodologia experimental foram selecionados os bioindicadores microbiológicos clássicos de contaminação fecal (coliformes totais, coliformes fecais e enterecocos fecais), bem como uma análise de resistência a antibióticos (enumeração de Enterobacteriaceae resistentes à ampicilina, caracterização fenotípica de bactérias resistentes isoladas e deteção molecular de seus genes de resistência a antibióticos. Os resultados dos bioindicadores clássicos nos sistemas de alagamento apontam para um impacte ambiental positivo, pois a água drenada tem melhor qualidade do que a água utilizada na rega. Por outro lado, estes arrozais apresentam indícios de poluição por fauna selvagem, o que reforça o serviço ambiental desempenhado por esses agroecossistemas, pois fornecem habitat e alimento para diversas espécies deste tipo. Em relação à análise de resistência aos antibióticos, os resultados indicam que a enumeração de Enterobacteriaceae resistentes à ampicilina permanece idêntica ou aumenta nas saídas de água, em comparação com as entradas, que os fenótipos de resistência a antibióticos testados estão amplamente disseminados nesses agroecossistemas e também são altamente prevalentes em amostras colhidas tanto nas entradas quanto nas saídas, com alta percentagem de isolados multirresistentes, e que a identificação de genes tet e sul revelou a prevalência de tetA, tetL, tetM e sul2. Como conclusão, em relação aos bioindicadores fecais, os sistemas de produção de arroz por alagamento têm um efeito depurador significativo na qualidade da água, contribuindo para a melhoria da qualidade da água de drenagem da rede coletiva. No entanto, a análise de resistência a antibióticos revelou que a saúde do agricultor e os ecossistemas de arroz podem estar ameaçados, pois esses ambientes atuam como um hotspot para a disseminação de determinantes genéticos de antibióticos. Propõe-se que os planos de gestão da água no aproveitamento hidroagrícola incluam a monitorização da qualidade da água de rega, com uma frequência de amostragem de acordo com as fontes de poluição, para estabelecer cuidados especiais de higiene e segurança.Rice cultivation has an important economic and social value in Portugal, covering a total area of about 30 thousand ha. Rice agroecosystems are peculiar. They are located in low, flat and alluvial lands, close to the coast, with a natural difficulty in drainage and a salinity influence, with cultivation in level basins, irrigated by continuous submersion, in a very sensitive balance. Rice farming systems play a valuable environmental role, in harmony with the production of a human food of recognized quality, in a significant contribution to national food sovereignty. The main current constraints of rice irrigation are related to water scarcity, issues with a global dimension, with water saving being a much studied topic, with several alternative solutions already implemented in several countries. This study aimed to analyse the microbiological quality of water and soil in rice cultivation in Vale do Lis with irrigation systems by continuous and intermittent submersion in level basins, and in drip irrigation, to evaluate the respective impacts on water resources, aiming to contribute to the establishment of good agricultural practices and public and environmental health regarding the use of water and soil in those agroecosystems. In the experimental methodology, the classic microbiological bioindicators of fecal contamination (total coliforms, fecal coliforms and fecal enterococci) were selected, as well as an analysis of antibiotic resistance (enumeration of ampicillin-resistant Enterobacteriaceae, phenotypic characterization of isolated resistant bacteria and molecular detection of their antibiotic resistance genes. The results of the classic bioindicators in flooding systems point to a positive environmental impact, as the drained water has better quality than the water used for irrigation. On the other hand, these rice paddies show signs of pollution by wild fauna , which reinforces the environmental service performed by these agroecosystems, as they provide habitat and food for several species of this type. Regarding the analysis of antibiotic resistance, the results indicate that the enumeration of ampicillin-resistant Enterobacteriaceae remains identical or increases in the water outlets, compared to the entrances, that the antibiotic resistance phenotypes tested are widely disseminated in these agroecosystems and are also highly prevalent in samples collected both at the entrances and at the exits, with a high percentage of multidrug-resistant isolates, and that the identification of tet and sul genes revealed the prevalence of tetA, tetL, tetM and sul2. In conclusion, in relation to fecal bioindicators, rice production systems by flooding have a significant purifying effect on water quality, contributing to improving the quality of drainage water from the collective network. However, antibiotic resistance analysis revealed that farmer health and rice ecosystems may be threatened as these environments act as a hotspot for the spread of genetic determinants of antibiotics. It is proposed that water management plans in hydro-agricultural development include monitoring the quality of irrigation water, with a sampling frequency according to the sources of pollution, to establish special hygiene and safety precautions

Retinoic acid in enteric lymphoid organogenesis

Tese de mestrado, Bioquímica , Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2010O desenvolvimento embrionário é um período crítico da vida do indivíduo durante o qual são formados os sistemas biológicos essenciais à sua sobrevivência. Exemplo disso é o sistema linfóide dos mamíferos, sistema este que consiste numa rede de órgãos linfóides que são classificados em primários ou secundários. É de notar que ao longo da vida adulta outras estruturas linfóides denominadas “terciárias” podem ser formadas, o que acontece no caso de certas inflamações crónicas ou infecções persistentes. Enquanto os órgãos linfóides primários, tais como a medula óssea e o timo, são locais privilegiados onde ocorre o desenvolvimento das células hematopoiéticas; os órgãos linfóides secundários formam uma rede ao longo do corpo onde residem linhas celulares hematopoiéticas maduras. Os órgãos linfóides secundários incluem, entre outros, os nódulos linfáticos e as placas de Peyer. Estas estruturas são cruciais na iniciação de respostas imunes uma vez que providenciam as condições ideais que levam à activação, diferenciação e homeostasia dos linfócitos. Para o correcto desenvolvimento destes órgãos é necessária a expressão de diversos genes bem como a interacção entre diferentes tipos celulares. Durante o desenvolvimento dos nódulos linfáticos é necessária a interacção de células hematopoiéticas denominadas células indutoras do Tecido Linfóide (LTi) e de células mesenquimais designadas células organizadoras do Tecido Linfóide (LTo). Esta interacção celular conduz à maturação das células mesenquimais ou de estroma que por sua vez resulta na atracção de células LTi adicionais. Este “feedback” positivo resulta na formação do primórdio do nódulo linfático. O desenvolvimento das Placas de Peyer (PP) está bem caracterizado e, à semelhança dos nódulos linfáticos, requer interacções entre células hematopoiéticas e de estroma. No entanto, para além das células LTi e LTo, um outro tipo de células hematopoiéticas, denominado células iniciadoras do Tecido Linfóide (LTin) estão envolvidas neste tipo de interacções. O modelo correntemente proposto para o desenvolvimento das PP postula que as células LTin interagem inicialmente com as células LTo através do eixo de sinalização RET/ARTN. Este sinal inicial resultaria então na maturação inicial das células do estroma e consequente produção de quimiocinas que, por sua vez, atrairiam células LTi formando-se assim o cluster celular que está na origem do primórdio do órgão. Apesar dos paralelos existentes entre o desenvolvimento dos nódulos linfáticos e das PP, estas estruturas não utilizam exactamente os mesmos eixos de sinalização. No caso dos nódulos linfáticos as mais importantes vias de sinalização são TRANCE e Linfotoxina β (LTβ). Inicialmente a interacção entre os dois tipos celulares é feita através da expressão de TRANCE pelas células de estroma e do seu receptor pelas células LTi. Aquando desta interacção, ocorre a indução da expressão de LTαβ na superfície das células LTi. Por sua vez as células LTo são activadas através do receptor de LTβ expresso na superfície destas últimas. Esta activação induz a produção das quimiocinas CXCL12 e CXCL13 atraindo assim células LTi adicionais. No caso das placas de Peyer as vias de sinalização mais importantes são RET, IL-7R e LTβ. Pensa-se que é através da via de sinalização RET que ocorre a expressão de LTβ nas LTin, expressão esta que permite que ocorra a sua interacção com as células de estroma. À semelhança do que acontece nos nódulos linfáticos, esta interacção de ligando/receptor irá originar um “feedback” positivo, atraindo assim as células LTi para o local do cluster. Estas células por sua vez, através da sinalização dada pelo IL-7R, irão expressar LTβ como as células LTin e interagir finalmente com as células LTo. A análise de animais deficientes em certas vias de sinalização reforça também a ideia que o desenvolvimento dos nódulos linfáticos e das placas de Peyer não obedece exactamente aos mesmos princípios. A título de exemplo, ratinhos deficientes em TRANCE não possuem nódulos linfáticos uma vez que a maturação das células de estroma é deficiente, no entanto possuem placas de Peyer normais. Por outro lado, deficiências no receptor da quimiocina IL7 resultam no desenvolvimento de apenas alguns nódulos linfáticos, demonstrado que esta via é importante, mas não crucial, para o desenvolvimento destas estruturas linfáticas. Contudo, estes animais são totalmente desprovidos de placas de Peyer, provando que esta via é essencial para o desenvolvimento deste tipo de estruturas entéricas. É ainda de notar que a via de sinalização RET é apenas essencial para o desenvolvimento de placas de Peyer . Ratinhos deficientes nesta tirosina quinase apesar de desenvolverem nódulos linfáticos são totalmente desprovidos de placas de Peyer. O processo de desenvolvimento embrionário requer no sentido mais lato várias vias de sinalização, sendo exemplo disso a do ácido retinóico (RA). Recentemente, o ácido retinóico surgiu como uma das moléculas importantes no desenvolvimento dos nódulos linfáticos. Van Pavert et al. descreveram que o RA produzido por células nervosas, adjacentes a células de estroma, induzia nestas últimas a produção da quimiocina CXCL13. Desta forma, esta molécula parece estar envolvida no despoletar de uma retroacção positiva que origina o primórdio dos nódulos linfáticos. Uma vez que o ácido retinóico parece ser importante no desenvolvimento dos nódulos linfáticos, pretendemos determinar se esta via de sinalização é também importante para o desenvolvimento das estruturas linfóides entéricas, nomeadamente das Placas de Peyer. Com este intuito, inicialmente utilizámos ratinhos geneticamente modificados que permitem a visualização, análise e manipulação ex vivo de todas as subpopulações hematopoiéticas durante a organogénese linfóide. A utilização destes modelos permite a micro dissecção de estruturas linfóides secundárias no embrião e a purificação ex vivo de populações hematopoiéticas e mesenquimais genuínas em diferentes estádios de desenvolvimento. Em paralelo, através de estudos imunocitoquímicos e genéticos, verificámos que o intestino embrionário alberga não apenas células que exprimen RALDH1, enzima importante na síntese de RA, bem como células alvo de RA. Tendo em conta estes modelos e os resultados assim obtidos prosseguimos com os objectivos propostos. De modo a compreender a influência do RA na formação das estruturas linfóides entéricas utilizámos culturas de intestinos embrionários nas quais é possível colocar micro-esferas de agarose impregnadas com ácido retinóico. Neste sistema observámos que o RA induz a formação de agregados de células hematopoiéticas que por sua vez induzem a expressão de VCAM-1 em células de estroma, formando assim estruturas linfóides embrionárias atópicas. É de notar que a composição celular dos agregados celulares formados pela sinalização RA é idêntica à composição das estruturas formadas pela sinalização via RET, isto é, células LTi e LTin. Relevante também é a correlação destas duas vias de sinalização, que foi possível estudar com base em culturas de intestinos embrionários onde se bloqueou a via de sinalização do ácido retinóico, fornecendo simultaneamente a sinalização por RET. Este bloqueio diminuiu significativamente a eficiência de agregação celular pela sinalização RET. Por outro lado, na ausência de RET, a eficiência de agregação por RA não foi modificada. Estes resultados sugerem que a via de sinalização por RA actua independentemente de RET e desempenhara a sua função maioritariamente a montante de RET. Adicionalmente verificámos que, o RA não aparenta estar envolvido na motilidade das células hematopoiéticas durante a organogénese entérica linfóide. O ácido retinóico está directamente interligado com a produção de quimiocinas durante o desenvolvimento dos nódulos linfáticos. Uma vez que esta molécula parece ter um papel semelhante no desenvolvimento das PP, é plausível que estas quimiocinas também estejam envolvidas na sinalização de RA durante o desenvolvimento destas estruturas. Com este pressuposto em mente, foram analisadas por reacção quantitativa de polimerase em cadeia (qPCR) amostras celulares de intestino fetal estimuladas com ácido retinóico durante 24h. Esta análise revelou que nem CXCL12 nem CXCL13 estavam sobreexpressas após estimulação. De forma a confirmar este resultado foram feitas culturas de intestinos embrionários onde foi fornecido o sinal de ácido retinóico e bloqueadas as quimiocinas em questão. Os resultados obtidos vieram confirmar a conclusão anterior, demonstrando que CXCL12 e 13 não são importantes para a sinalização de RA no desenvolvimento das placas de Peyer. Contudo, uma vez que outras quimiocinas podem estar envolvidas no desenvolvimento destas estruturas, foram feitos ensaios de expressão genética a partir de amostras celulares entéricas estimuladas com ácido retinóico. Estes estudos revelaram que a via de sinalização pelo ácido retinóico resulta numa assinatura genética que difere da previamente descrita durante o desenvolvimento dos nódulos linfáticos, apontando para um possível papel na diferenciação das células hematopoiéticas. Em conjunto, estes resultados apontam para um papel do ácido retinóico no desenvolvimento das placas de Peyer. O ácido retinóico emerge então como uma nova molécula importante na organogénese destas estruturas.Secondary Lymphoid Organs (SLOs), such as Lymph Nodes (LN) and Peyer’s Patches (PP), are crucial structures for the initiation of immune responses. Several molecules are required for the development of these structures, namely Lymphotoxin and several chemokines, while the tyrosine kinase RET has been shown to play a key role in PP organogenesis. Retinoic Acid (RA) has recently emerged as an important player during LN development through induction of CXCL13 expression. Despite many similarities, LN and PP development differ in several aspects. Here we show that RA specifically induces clustering of enteric haematopoietic cells, and is sufficient to induce the maturation of sessile mesenchymal cells. Interestingly, both RET and RA induced clusters are similarly composed by LTi and LTin cells. This finding suggested that RA and RET signalling could participate in the same events during PP formation. However, haematopoietic clustering induced by ARTN was only marginally affected by RA signalling block and absence of RET signalling did not impact on RA mediated clustering. Altogether, these results suggest that RA acts independently and mainly precedes RET signals. Furthermore, and contrary to LN development, we show that chemokines such as CXCL12 and 13 are not upregulated in gut samples stimulated with RA, neither affect clustering efficiency by RA. Altogether these results suggest that during PP development RET and RA signals act mostly independently of each other and that enteric RA signalling leads to a genetic signature that differs from what was previously described during LN development. RA emerges as a novel molecule in PP organogenesis. We suggest that this pathway may be involved with other signalling pathways in the processes that underlie enteric lymphoid organ formation and haematopoietic differentiation. These hypotheses will be further discussed taking advantage of both in vitro and in vivo approaches

Identification of a transient lymphoid population in the murine epidermis

Tese de doutoramento, Ciências Biomédicas (Imunologia), Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2015T cell progenitors are known to migrate from the fetal liver in embryos and the bone marrow in adults to the thymus where they differentiate into naïve T cells and then egress to peripheral tissues. However, different studies have shown that a pool of T cell progenitors may also exist in the periphery. Here, we identify a lymphoid population resembling these progenitors which transiently seed the epidermis during late embryogenesis in both WT and T cell-deficient mice, which we named ELCs (Epidermal Lymphoid Cells). These Thy1+CD2+ cells lack expression of CD3 and TCRαβ/γδ at their surface, reminiscent of the phenotype of extra or intra-thymic T cell progenitors, as well as Natural Killer cells. Similarly to dendritic epidermal T cells (DETC), ELCs are radio-resistant and capable of self-renewal, suggesting that the pool of ELCs that seed the skin during embryogenesis maintains itself throughout life. Additionally, ELCs have partial expression of T cell lineage markers, such as CD3 in their cytoplasm and expression of pTα. However, when introduced to in vitro, ex vivo and in vivo differentiation assays, ELCs did not differentiate into conventional T cells or DETCs, conclusively showing that they are not T cell progenitors. Nonetheless, upon phenotype analysis ELCs revealed to be IL15-dependent, express NK-lineage markers such as NK1.1, CD49b and CD244 and produce IFN-γ and IL-2 under stimulatory conditions. On top of that, ELCs have also shown to be dependent on the transcription factors Runx3 and Nfil3. Altogether, we report the discovery of a unique population of lymphoid cells within the murine epidermis with characteristics that point towards ELCs being a pool of NK-like cells. Whether ELCs interact with other immune or non-immune cell populations leading to unique immune functions in the epidermis remains to be investigated. Moreover, further studies would have to be addressed in order to further characterize the true origin, nature and function of such a population.Linfócitos e o seu desenvolvimento têm sido extremamente estudados nos últimos anos. A família de linfócitos inclui células T, células NK (Natural Killer) e a nova família de ILCs (Innate Lymphoid Cells). O processo de desenvolvimento de células T a partir de células progenitoras tem sido estudado ao largo de vários anos e é um processo relativamente bem caracterizado: precursores saem da medula óssea ou do fígado fetal, durante o desenvolvimento embrionário, e chegam ao timo como progenitores de células T. Ao longo do desenvolvimento dentro do timo, timócitos imaturos vão adquirindo a expressão de co-receptores e receptores característicos de células maduras, tais como CD3 e TCR (T cell receptor). Ainda que esta seja a rota tomada pela maioria das células T, outros mecanismos geracionais parecem existir tanto a priori da migração para o timo, no feto, como independentemente do timo, pós nascimento. Exemplo desta via alternativa é o facto de ratinhos sem timo apresentarem células T nas suas mucosas. Mesmo dentro das populações de células T que são geradas no timo durante o desenvolvimento embrionário, algumas subpopulações parecem ser capazes de se manterem independemente do timo no adulto, sendo a pele de particular interesse. DETCs (Dendritic epidermal T cells) são células T caracterizadas pela expressão de Thy1 (thymocyte antigen 1) e um TCR único, Vγ3Vδ1. Estas são as primeiras células a expressarem um TCR no timo fetal e após expressão de CD3 e do TCR maduro esta população expande e migra para a epiderme. Neste tecido, DETCs participam em processos de cicatrização, vigilância imunitária, entre outros. Estudos mostraram que esta população celular tem a capacidade de se renovar independentemente de precursores que circulam no sangue, nomeadamente aquando exposição a radiação. Contudo, o mecanismo exacto pela qual esta renovação ocorre é ainda desconhecido e a questão da existência de progenitores de DETCs na epiderme mantém-se sem resposta. No laboratório, usando uma combinação de modelos animais imuno-suficientes ou deficientes introduzimos uma nova camada no compartimento linfóide da epiderme. Neste trabalho revelámos a descoberta de uma nova população de linfócitos que aparece na epiderme durante fases tardias do desenvolvimento embrionário e decresce após nascimento em animais wild type (WT). No entanto, verificámos que esta mesma população de células acumula na epiderme de animais com defeitos intrínsecos ou extrínsecos na geração de células T, tais como ratinhos deficientes em Rag ou atímicos. A esta população de células chamámos ELC (Epidermal Lymphoid Cells). As ELCs apresentam à sua superfície moléculas características de linfócitos, como Thy1 e CD2, contudo não possuem expressão de moléculas características de células T maduras, tais como CD3 ou receptores de células T (TCR) αβ/γδ, sendo este fenótipo característico de progenitores de células T. De forma semelhante às DETCs, as ELCs mostram ser resistentes a radiação e capazes de se autorrenovarem in situ, impondo como possibilidade esta população colonizar a epiderme antes do nascimento. Contudo, ELCs encontradas na epiderme de ratinhos adultos ou na epiderme neonatal apresentam níveis equivalentes de expressão de pre-TCRα (pTα) mas variam nos seus níveis de expressão de CD3 no citoplasma. Tais características estão em concordância com a hipótese preliminar desta população ser um conjunto de progenitores de células T, possivelmente em diferentes fases de desenvolvimento. No entanto, após ensaios de diferenciação in vivo, in vitro ou ex vivo, as ELCs mostraram não ter capacidade de se diferenciarem em células T maduras, ou de progredir no processo de desenvolvimento de progenitores do mesmo tipo celular. Este conjunto de resultados repudiou a hipótese de ELCs serem progenitores de células T. Uma vez que o antigénio Thy1 não é específico de linfócitos T, sendo também partilhado pela linhagem de células NK, pôs-se a hipótese das ELCs pertencerem à família de células NK. Curiosamente, estas células mostraram ser dependentes de vias de sinalização ligadas a IL-15 e à cadeia gama comum (γc). É de notar que todos os linfócitos são dependentes de sinalização através de γc e que a interleucina IL-15 tem sido altamente associada ao desenvolvimento e manutenção de células NK. Ademais, ao explorar a expressão de moléculas únicas desta família celular, observámos que as ELCs expressam moléculas como NK1.1, CD49b e CD244 na sua superfície. Relevante para a caracterização de uma população é o seu perfil de produção de citocinas e de dependência de factores de transcrição. Perante condições estimulatórias as ELCs mostraram-se produtoras de IFN-γ e IL-2. Além disso, análises de animais deficientes para Runx3 e Nfil3, factores de transcrição cruciais para desenvolvimento de células NK, mostraram um decréscimo significativo na frequência de ELCs nas suas epidermes. Este conjunto de resultados fortalece a possibilidade de ELCs pertencerem à família de células NK. Em suma este trabalho aponta para a descoberta de uma nova população de linfócitos na epiderme de ratinhos, que devido à fase do desenvolvimento em que são encontrados, poderão interagir com outros componentes celulares e participar em mecanismos tolerogénicos aquando colonização da pele pelo seu microbioma. Contudo, mais estudos terão de ser realizados de forma a compreender a verdadeira natureza, origem e função desta população

Development of Artificial Intelligence Algorithms for Early Diagnosis of Sepsis

Sepsis is a prevalent syndrome that manifests itself through an uncontrolled response from the body to an infection, that may lead to organ dysfunction. Its diagnosis is urgent since early treatment can reduce the patients’ chances of having long-term consequences. Yet, there are many obstacles to achieving this early detection. Some stem from the syndrome’s pathogenesis, which lacks a characteristic biomarker. The available clinical detection tools are either too complex or lack sensitivity, in both cases delaying the diagnosis. Another obstacle relates to modern technology, that when paired with the many clinical parameters that are monitored to detect sepsis, result in extremely heterogenous and complex medical records, which constitute a big obstacle for the responsible clinicians, that are forced to analyse them to diagnose the syndrome. To help achieve this early diagnosis, as well as understand which parameters are most relevant to obtain it, an approach based on the use of Artificial Intelligence algorithms is proposed in this work, with the model being implemented in the alert system of a sepsis monitoring platform. This platform uses a Random Forest algorithm, based on supervised machine learning classification, that is capable of detecting the syndrome in two different scenarios. The earliest detection can happen if there are only five vital sign parameters available for measurement, namely heart rate, systolic and diastolic blood pressures, blood oxygen saturation level, and body temperature, in which case, the model has a score of 83% precision and 62% sensitivity. If besides the mentioned variables, laboratory analysis measurements of bilirubin, creatinine, hemoglobin, leukocytes, platelet count, and Creactive protein levels are available, the platform’s sensitivity increases to 77%. With this, it has also been found that the blood oxygen saturation level is one of the most important variables to take into account for the task, in both cases. Once the platform is tested in real clinical situations, together with an increase in the available clinical data, it is believed that the platform’s performance will be even better.A sépsis é uma síndrome com elevada incidência a nível global, que se manifesta através de uma resposta desregulada por parte do organismo a uma infeção, podendo resultar em disfunções orgânicas generalizadas. O diagnóstico da mesma é urgente, uma vez que um tratamento precoce pode reduzir as hipóteses de consequências a longo prazo para os doentes. Apesar desta necessidade, existem vários obstáculos. Alguns deles advêm da patogenia da síndrome, que carece de um biomarcador específico. As ferramentas de deteção clínica são demasiado complexas, ou pouco sensíveis, em ambos os casos atrasando o diagnóstico. Outro obstáculo relaciona-se com os avanços da tecnologia, que, com os vários parâmetros clínicos que são monitorizados, resulta em registos médicos heterogéneos e complexos, o que constitui um grande obstáculo para os profissionais de saúde, que se vêm forçados a analisá-los para diagnosticar a síndrome. Para atingir este diagnóstico precoce, bem como compreender quais os parâmetros mais relevantes para o alcançar, é proposta neste trabalho uma abordagem baseada num algoritmo de Inteligência Artificial, sendo o modelo implementado no sistema de alerta de uma plataforma de monitorização de sépsis. Esta plataforma utiliza um classificador Random Forest baseado em aprendizagem automática supervisionada, capaz de diagnosticar a síndrome de duas formas. Uma deteção mais precoce pode ocorrer através de cinco parâmetros vitais, nomeadamente frequência cardíaca, pressão arterial sistólica e diastólica, nível de saturação de oxigénio no sangue e temperatura corporal, caso em que o modelo atinge valores de 83% de precisão e 62% de sensibilidade. Se, para além das variáveis mencionadas, estiverem disponíveis análises laboratoriais de bilirrubina, creatinina, hemoglobina, leucócitos, contagem de plaquetas e níveis de proteína C-reativa, a sensibilidade da plataforma sobre para 77%. Concluiu-se que o nível de saturação de oxigénio no sangue é uma das variáveis mais importantes a ter em conta para o diagnóstico, em ambos os casos. A partir do momento que a plataforma venha a ser utilizada em situações clínicas reais, com o consequente aumento dos dados disponíveis, crê-se que o desempenho venha a ser ainda melhor

Portuguese fashion designers: behaviours for an international business

The Dissertation here presented pretends to analyse and characterize the most creative sector of Portuguese Textile and Apparel Industry: Portuguese Fashion Design. Today, Textile and Apparel Industry is one of the most important cluster of Portugal economy. However, this industry, did not always give the right importance to factors such as Creativeness, Innovation and Design as a way of reach competitive advantages in international markets. In a nutshell, Portuguese Fashion Design, despite difficult periods and constrains, has been able to reveal a continuously growth and respect on international markets. Obviously, we hear today about the successful investments by Textile and Apparel Industry on improvement, development and innovation as a strategic response to market demands or requirements. Fashion World is particularly known by its quick change and where the new ideas, new ways of doing things, new products and services of today will be obsoleted tomorrow. Under fast-changing environments, players need to adopt measures and strategies to fight back market demands and heavy competition in order to survive. With this, it is up to Portuguese Fashion Designers along with Textile and Apparel Industry to seek constant alternatives and opportunities to reach a high level of competitiveness and to keep up with market demands. Back to this dissertation, the comparison between three Portuguese fashion players based on news and interviews make it possible the analysis of Portuguese Fashion Design’s evolution and to draw guidelines about its future journey

1902 UM graduate bequeaths material to libraries, Montana Historical Society

The implications of the reduction of tropical forest in the carbon cycle has created a demand for development of non destructive methods to biomass estimates a key component in modeling biogeochemical cycles. The research had as objective to estimate indirectly the above ground biomass (AGB) of a pristine forest, correlating field data to IKONOS II satellite data. Biomass was obtained by indirect method and the vegetation analysis by means of horizontal structure. The original bands, vegetation index like ARVI, NDVI, MSAVI and R43, PCA and Tasseled Cap transforms and Spectral Mixing Linear Model were used in modeling. The integration of ground truth and satellite data was performed by statistical procedure, by the application of linear multiple regression using STEPWISE method. For the spatialization, the minimum and the maximum values of the confidence interval for biomass estimates provided by the model were adopted as classes. The confidence interval was 343,05 ± 14,90 Mg. ha-1 for 95% probability. The highest correlations between biomass and digital variables ARVI, SLMMVEG and NDVI are negative. Modeling demonstrated that the variables R43, NDVI, TCap3 and TCap4 were the best correlation with biomass data.A implicação da redução das florestas tropicais no ciclo de carbono vem criando uma demanda de desenvolvimento de métodos não-destrutivos para a determinação de biomassa, elemento importante na modelagem dos ciclos biogeoquímicos. A pesquisa teve por objetivo estimar indiretamente a biomassa acima do solo de uma floresta primária, correlacionando dados de campo e orbitais do satélite IKONOS II. A biomassa foi obtida pelo método indireto e a análise da vegetação por meio da estrutura horizontal. Na modelagem foram usadas as bandas originais, Índices de Vegetação, como ARVI, NDVI, MSAVI, R43, e Transformações por Componentes Principais, Tasseled Cap e Modelo Linear de Mistura Espectral. A integração da verdade de campo e os dados de satélite foi realizada por procedimentos estatísticos, aplicando-se regressão linear múltipla usando o método Stepwise. Para a espacialização, adotou-se como classes os valores mínimos e máximos dos limites de confiança das estimativas de biomassa obtidas com o modelo. O intervalo de confiança a 95% de probabilidade para a biomassa encontrada no campo foi de 343,05±14,90 Mg.ha-1. As maiores correlações entre biomassa e as variáveis digitais ARVI, MLMEVEG e NDVI são negativas. A modelagem mostrou que as variáveis R43, NDVI, TCap3 e TCap4 foram as que melhor se correlacionaram com a biomassa