An Application of an Electronic Health Record System in order to integrate clinical and molecular data and guide therapeutic strategy in Paraguay.

Improve data management in two public hospitals in Paraguay - Hospital de Clínicas and Instituto Nacional del Cáncer (INCAN). Currently, data management in oncology department is complex and requires advanced Information System to process data where "omic" information should be integrated together with patient's clinical data to improve data analysis and decision-making process. Conceptual Modelling is an important and essential activity that helps us not only to design an abstract model of an advanced Information System but also facilitates the development process.CONACYT - Consejo Nacional de Ciencias y TecnologíaPROCIENCI

Role of intestinal epithelial tight junctions in the pathogenesis of Crohn’s Disease

Dionisio Díaz: Estudiante de Medicina, Ciclo de Metodología Científica II, Facultad de Medicina, Universidad de la República. Uruguay. La contribución en la realización del trabajo fue equivalente a la de los demás estudiantes.-- Rodrigo Dorelo: Estudiante de Medicina, Ciclo de Metodología Científica II, Facultad de Medicina, Universidad de la República. Uruguay. La contribución en la realización del trabajo fue equivalente a la de los demás estudiantes.-- Diego Fleitas: Estudiante de Medicina, Ciclo de Metodología Científica II, Facultad de Medicina, Universidad de la República. Uruguay. La contribución en la realización del trabajo fue equivalente a la de los demás estudiantes.-- Silvia Chifflet: Docente supervisor. Departamento de Bioquímica de la Facultad de Medicina, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay. Contacto: Silvia Chifflet. Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, Gral Flores 2125, 11800 Montevideo, Uruguay. Tel: (5982) 924 3414 ext. 3403. E-mail: [email protected] enfermedad de Crohn, un tipo de enfermedad inflamatoria intestinal, afecta la integridad estructural y funcional de la barrera intestinal. Esta barrera está constituida por una capa de células epiteliales que forman una monocapa continua y polarizada, estrechamente conectada por varios tipos de uniones celulares, entre las que se destacan las uniones estrechas. Las uniones estrechas forman una estructura continua entre los dominios apical y basolateral en las células epiteliales y endoteliales, creando una barrera paracelular selectiva fundamental para la homeostasis del organismo. La disfunción de la barrera epitelial juega un papel central en la fisiopatología de la enfermedad de Crohn. Los pacientes con enfermedad de Crohn presentan una pérdida de la función de barrera de las uniones estrechas y un aumento de la producción de citoquinas pro-inflamatorias, así como una desregulación del sistema inmune. En esta revisión se describe brevemente la composición molecular, estructura, interacciones y función de las uniones estrechas, además de mostrar evidencia reciente acerca de la relación entre la disfunción de las mismas y la enfermedad de Crohn. También se detalla el rol de la microbiota en la regulación de las uniones estrechas, así como el papel de la desregulación de estas uniones en el desarrollo del cáncer asociado a la enfermedad de Crohn. Finalmente, se describen hallazgos de la literatura actual respecto a la posible utilidad de las uniones estrechas como blanco de nuevos medicamentos.Crohn’s disease is an inflammatory bowel disease that affects the intestinal wall. This wall consists of an epithelial cell layer that forms a continuous polarized monolayer, closely connected by various types of cellular junctions. Among these, tight junctions play a relevant role. They form a continuous structure delimiting the apical and basolateral domains in epithelial and endothelial cells, creating in this way a selective paracellular barrier, fundamental for the homeostasis of the organism. There is increasing evidence that the dysfunction of the epithelial barrier plays a central role in the physio pathology of Crohn’s disease. Crohn’s disease patients exhibit a loss of the barrier function of the tight junctions, an increased production of pro-inflammatory cytokines and dysregulation of the immune system. In his review the molecular composition, structure, interactions and function of the tight junctions are briefly described, and recent evidence on the relationship between the dysfunction of the tight junctions and Crohn’s disease is commented. The role of microbiota in the regulation of tight junctions and the participation of tight junctions deregulation in the development of cancer associated to Crohn’s disease are also detailed. Finally, recent findings about the employment of tight junctions as targets for the development of new drugs are described

Violencia íntima, femicidios y armas de fuego en Argentina

La presencia de un arma de fuego en situaciones de violencia íntima incrementa la probabilidad de la victimización fatal. No obstante, en Argentina ninguna investigación completa se ha hecho sobre las armas de fuego en femicidios. Este trabajo exploratorio indaga sobre el rol de las armas de fuego en la violencia íntima en general y los femicidios en particular para una evaluación de las medidas de prevención existentes. Propone a) revisar la literatura académica y la normativa existente sobre el femicidio en general, y en América Latina y en Argentina en particular; b) revelar la preocupación internacional sobre el uso de armas de fuego en los femicidios; c) analizar los datos estadísticos disponibles sobre violencia íntima y femicidios que involucran armas de fuego en la Argentina y d) reflexionar acerca de las iniciativas legislativas, las políticas y acciones sociales para mejorar las medidas preventivas que reduzcan el uso del medio más letal para la comisión de femicidios: las armas de fuego

An application of an EHR based on conceptual modeling to integrate clinical and genomic data and guide therapeutic strategy

Currently, data management in oncology department is complex and requires advanced Information Systems (ISs) to process data where “omic” information should be integrated together with patient’s clinical data to improve data analysis and decision-making process. This research paper reports a practical experience in this context. A Conceptual Model (CM) has been designed to develop an Information System (IS) in order to manage clinical, pathological, and molecular data in a holistic way at the oncology department of two main Hospitals in Paraguay. Additionally, model-based archetypes have been proposed to specify the selected user interaction strategy. The CM and its associated archetypes are the basis to develop a clinical IS in order to load -firstly- and manage -secondly- all the clinical data that the domain requires, showing how feasible the approach is in practice, and how much the corresponding clinical data management is improved. In this work, we want to reinforce with this real experience how using a CM along with archetypes correctly helps to design, develop and manage better information systems, emphasizing the relevance of the selected clinical domain

Molecular profile in Paraguayan colorectal cancer patients, towards to a precision medicine strategy

[EN] Somatic mutation analysis and evaluation of microsatellite instability (MSI) have become mandatory for selecting personalized therapy strategies for advanced colorectal cancer and are not available as routine methods in Paraguay. The aims of this study were to analyze the molecular profile as well as the microsatellite status in a series of advanced colorectal patients from two public hospitals from Paraguay, to introduce these methodologies in the routine practice to guide the therapeutic decisions. Thirty-six patients diagnosed with advanced colorectal cancer from two referent public hospitals from Paraguay were recruited from May 2017 to February 2018. Sequenom Mass spectrometry, Oncocarta Panel V.1 was applied to analyze the mutational profile from formalin-fixed paraffin-embedded samples. The microsatellite status was tested by immunohistochemistry (IHC). The mean age of the patients was 52 years with a range from 20 to 74 years. Eighty-three percent of the patients included in the study have advanced-stage tumors at the moment of the diagnosis. Sixteen patients (44.4%) were wild-type for all the oncogene regions analyzed with the Oncocarta panel. Thirty-two hot-spot pathogenic variants on seven oncogenes, among 20 patients (55.6%), were identified, including KRAS, NRAS, BRAF, PI3KCA, FGFR, epidermal growth factor receptor, and PDGFRA. Moreover, 14 (38.8%) of these patients presented pathogenic variants in KRAS/NRAS or BRAF genes that have implications in the clinical practice decisions. Five patients (14%) presented MSI. The IHC study for microsatellite status and the molecular profile analysis through Sequenom mass spectrometry are feasible and useful methods, due to identify those patient candidates for targeted therapies and for the budgetary calculations of the National Health PlansCONACYT Paraguay, Grant/Award Number: PINV-156/2015; INSTITUTO CARLOS III, Grant/Award Number: 17/00026 and CD15/00153; FONDOS FEDER; BankiaFleitas-Kanonnikoff, T.; Martinez-Ciarpaglini, C.; Ayala, J.; Gauna, C.; Denis, R.; Yoffe, I.; Sforza, S.... (2019). Molecular profile in Paraguayan colorectal cancer patients, towards to a precision medicine strategy. Wiley Interdisciplinary Reviews. Computational Molecular Science (Online). 8(6):3120-3130. https://doi.org/10.1002/cam4.2191S3120313086Bray, F., Ferlay, J., Soerjomataram, I., Siegel, R. L., Torre, L. A., & Jemal, A. (2018). Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA: A Cancer Journal for Clinicians, 68(6), 394-424. doi:10.3322/caac.21492Bray, F., & Piñeros, M. (2016). Cancer patterns, trends and projections in Latin America and the Caribbean: a global context. Salud Pública de México, 58(2), 104-117. doi:10.21149/spm.v58i2.7779Bohorquez, M., Sahasrabudhe, R., Criollo, A., Sanabria-Salas, M. C., Vélez, A., Castro, J. M., … Carvajal-Carmona, L. G. (2016). Clinical manifestations of colorectal cancer patients from a large multicenter study in Colombia. Medicine, 95(40), e4883. doi:10.1097/md.0000000000004883Sartore-Bianchi, A., Trusolino, L., Martino, C., Bencardino, K., Lonardi, S., Bergamo, F., … Siena, S. (2016). Dual-targeted therapy with trastuzumab and lapatinib in treatment-refractory, KRAS codon 12/13 wild-type, HER2-positive metastatic colorectal cancer (HERACLES): a proof-of-concept, multicentre, open-label, phase 2 trial. The Lancet Oncology, 17(6), 738-746. doi:10.1016/s1470-2045(16)00150-9Martinez-Ciarpaglini, C., Oltra, S., Roselló, S., Roda, D., Mongort, C., Carrasco, F., … Cervantes, A. (2018). Low miR200c expression in tumor budding of invasive front predicts worse survival in patients with localized colon cancer and is related to PD-L1 overexpression. Modern Pathology, 32(2), 306-313. doi:10.1038/s41379-018-0124-5Gao, J., Aksoy, B. A., Dogrusoz, U., Dresdner, G., Gross, B., Sumer, S. O., … Schultz, N. (2013). Integrative Analysis of Complex Cancer Genomics and Clinical Profiles Using the cBioPortal. Science Signaling, 6(269), pl1-pl1. doi:10.1126/scisignal.2004088Chakravarty, D., Gao, J., Phillips, S., Kundra, R., Zhang, H., Wang, J., … Schultz, N. (2017). OncoKB: A Precision Oncology Knowledge Base. JCO Precision Oncology, (1), 1-16. doi:10.1200/po.17.00011Arnold, M., Sierra, M. S., Laversanne, M., Soerjomataram, I., Jemal, A., & Bray, F. (2016). Global patterns and trends in colorectal cancer incidence and mortality. Gut, 66(4), 683-691. doi:10.1136/gutjnl-2015-310912Ohhara, Y., Fukuda, N., Takeuchi, S., Honma, R., Shimizu, Y., Kinoshita, I., & Dosaka-Akita, H. (2016). Role of targeted therapy in metastatic colorectal cancer. World Journal of Gastrointestinal Oncology, 8(9), 642. doi:10.4251/wjgo.v8.i9.64

Seroprevalence of the strongyloides stercoralis infection in humans from yungas rainforest and gran chaco region from Argentina and Bolivia

The threadworm, Strongyloides stercoralis, is endemic in tropical and subtropical areas. Data on the prevalence and distribution of infection with this parasite species is scarce in many critical regions. We conducted a seroprevalence study of S. stercoralis infection in 13 locations in the Gran Chaco and Yungas regions of Argentina and Bolivia during the period 2010–2016. A total of 2803 human serum samples were analyzed by ELISA-NIE which has a sensitivity of 75% and specificity of 95%. Results showed that 551 (19.6%) of those samples were positive. The adjusted prevalence was 20.9%, (95% confidence interval (CI) 19.4%–22.4%). The distribution of cases was similar between females and males with an increase of prevalence with age. The prevalence in the different locations ranged from 7.75% in Pampa del Indio to 44.55% in Santa Victoria Este in the triple border between Argentina, Bolivia, and Paraguay in the Chaco region. Our results show that S. stercoralis is highly prevalent in the Chaco and Yungas regions, which should prompt prospective surveys to confirm our findings and the design and deployment of control measures.Fil: Cimino, Rubén Oscar. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Fleitas, Pedro Emanuel. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Fernández, Mariana. Asociación para el desarrollo sanitario regional; ArgentinaFil: Echazú, Adriana. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Juarez, Marisa del Valle. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Floridia Yapur, Noelia Aldana del Rosario. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Cajal, Silvana Pamela. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Seijo, Alfredo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas "Dr. Francisco Javier Muñiz"; ArgentinaFil: Abril, Marcelo. Fundación Mundo Sano; ArgentinaFil: Weinberg, Diego. Fundación Mundo Sano; ArgentinaFil: Piorno, Pablo Emiliano. Asociación para el desarrollo sanitario regional; ArgentinaFil: Caro, Nicolás. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Vargas, Paola. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Gil, José Fernando. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional. Grupo Vinculado al INENCO - Instituto de Investigaciones y Políticas del Ambiente Constituido | Universidad Nacional de Salta. Facultad de Cienicas Exactas. Departamento de Física. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional. Grupo Vinculado al INENCO - Instituto de Investigaciones y Políticas del Ambiente Constituido; ArgentinaFil: Crudo, Favio. Asociación para el desarrollo sanitario regional; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentin

Molecular profile in Paraguayan colorectal cancer patients, towards to a precision medicine strategy

Somatic mutation analysis and evaluation of microsatellite instability (MSI) have become mandatory for selecting personalized therapy strategies for advanced colorectal cancer and are not available as routine methods in Paraguay. The aims of this study were to analyze the molecular profile as well as the microsatellite status in a series of advanced colorectal patients from two public hospitals from Paraguay, to introduce these methodologies in the routine practice to guide the therapeutic decisions.CONACYT – Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaPROCIENCI

Una Aplicación de una Historia Clínica Electrónica (HCE) Basado en Modelos Conceptuales para Integrar Datos Clínicos y Genómicos y Orientar la Estrategia Terapéutica

[EN] Currently, data management in oncology department is complex and requires advanced Information Systems (ISs) to process data where "omic" information should be integrated together with patient's clinical data to improve data analysis and decision-making process. This research paper reports a practical experience in this context. A Conceptual Model (CM) has been designed to develop an Information System (IS) in order to manage clinical, pathological, and molecular data in a holistic way at the oncology department of two main Hospitals in Paraguay. Additionally, model-based archetypes have been proposed to specify the selected user interaction strategy. The CM and its associated archetypes are the basis to develop a clinical IS in order to load -firstly- and manage -secondly- all the clinical data that the domain requires, showing how feasible the approach is in practice, and how much the corresponding clinical data management is improved. In this work, we want to reinforce with this real experience how using a CM along with archetypes correctly helps to design, develop and manage better information systems, emphasizing the relevance of the selected clinical domain.[ES] Actualmente, la gestión de datos en el departamento de oncología es compleja y requiere sistemas de información avanzados para procesar datos donde la información "ómica" debe integrarse junto con los datos clínicos del paciente para mejorar el análisis de datos y el proceso de toma de decisiones. Este trabajo de investigación presenta una experiencia práctica en este contexto. Se ha diseñado un Modelo Conceptual (MC) para desarrollar un Sistema de Información (SI) con el fin de gestionar datos clínicos, patológicos y moleculares de manera integral en el departamento de oncología de dos hospitales principales en Paraguay. Además, se han propuesto arquetipos basados en modelos para especificar la estrategia de interacción del usuario. El MC y los arquetipos asociados son la base para desarrollar un SI clínico con el fin de cargar -primero- y gestionar -segundo- todos los datos clínicos que requiere el dominio, mostrando cuán factible es el enfoque en la práctica y cuánto se mejora la gestión de datos. En este trabajo, queremos reforzar con esta experiencia real, cómo el uso correcto de un MC junto con los arquetipos ayuda a diseñar, desarrollar y administrar mejores sistemas de información, enfatizando la relevancia del dominio clínico seleccionado.This work has been developed in the framework of the project PINV115-149 with the financial support of the Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT)- Paraguay, with resources del FEEI and with the financial support of the Spanish State Research Agency, the Generalitat Valenciana and "Multicenter Project of Multidisciplinary Training in Cancer and Application of Electronic Health Record (EHR)", and co-financed with ERDF.Arevshatyan, S.; Burriel, V.; Boscá, D.; Reyes Román, JF.; Pastor López, O.; Yoffe, I.; Denis, RMC.... (2020). An Application of an EHR Based on Conceptual Modeling to Integrate Clinical and Genomic Data and Guide Therapeutic Strategy. Anales de la Facultad de Ciencias Médicas. 53(1):17-30. https://doi.org/10.18004/anales/2020.053.01.17-030S173053

A global analysis of the impact of COVID-19 stay-at-home restrictions on crime

The implementation of COVID-19 stay-at-home policies was associated with a considerable drop in urban crime in 27 cities across 23 countries. More stringent restrictions over movement in public space were predictive of larger declines in crime. The stay-at-home restrictions to control the spread of COVID-19 led to unparalleled sudden change in daily life, but it is unclear how they affected urban crime globally. We collected data on daily counts of crime in 27 cities across 23 countries in the Americas, Europe, the Middle East and Asia. We conducted interrupted time series analyses to assess the impact of stay-at-home restrictions on different types of crime in each city. Our findings show that the stay-at-home policies were associated with a considerable drop in urban crime, but with substantial variation across cities and types of crime. Meta-regression results showed that more stringent restrictions over movement in public space were predictive of larger declines in crime.Peer reviewe

Movilidad horizontal, segmentación y ajuste laboral en España

En el transcurso de esta investigación se abordan temáticas que actualmente se encuentran sobre la mesa de debate en relación al mercado laboral en España. Su objetivo principal es el estudio de la movilidad que los distintos colectivos de trabajadores tienen en función del cambio de sector de actividad y de provincia como forma explorar los procesos de ajuste estructural que se han ocasionado a partir del año 2007. La perspectiva de análisis que se ha utilizado mantiene como punto de referencia central la segmentación de los mercados laborales y se ha servido de la aplicación de novedosas técnicas de construcción y análisis de datos sintéticos.During the course of this investigation, topics that are currently being debated regarding the laubor market in Spain are addressed. Its main objective is the study of the mobility that the different groups of workers actually have, due to the change of their sector of activity and to the region, as a way to explore the processes of structural adjustment that have taken place since 2007. The perspective of analysis applyed is focussed on segmentation of labor markets and used innovative construction and synthetic data analyisis techniques