The Spectrum of FANCM Protein Truncating Variants in European Breast Cancer Cases

Germline protein truncating variants (PTVs) in the FANCM gene have been associated with a 2–4-fold increased breast cancer risk in case-control studies conducted in different European populations. However, the distribution and the frequency of FANCM PTVs in Europe have never been investigated. In the present study, we collected the data of 114 European female breast cancer cases with FANCM PTVs ascertained in 20 centers from 13 European countries. We identified 27 different FANCM PTVs. The p.Gln1701* PTV is the most common PTV in Northern Europe with a maximum frequency in Finland and a lower relative frequency in Southern Europe. On the contrary, p.Arg1931* seems to be the most common PTV in Southern Europe. We also showed that p.Arg658*, the third most common PTV, is more frequent in Central Europe, and p.Gln498Thrfs*7 is probably a founder variant from Lithuania. Of the 23 rare or unique FANCM PTVs, 15 have not been previously reported. We provide here the initial spectrum of FANCM PTVs in European breast cancer cases

[Conforto térmico e bem-estar numa superfície comercial isolada]

Tese de mestrado. Engenharia de Segurança e Higiene Ocupacionais. Universidade do Porto. Faculdade de Engenharia. 201

Liver Trauma in the Kitchen: Preparing Whipped Cream with a Siphon Is Not without Risk

We report the case of a 36-year-old woman suffering from liver injury caused by the malfunction of a whipped cream siphon. When this patient handled the whipped cream siphon, the screwed metallic upper part of the siphon was suddenly dissociated from its base and came violently striking her right hypochondrium. At first, the severity of injury was underestimated. Subsequently, due to the persistence of pain experienced by the patient, an abdominal CT scan was performed. It highlighted a severe liver injury with rupture of a branch of the hepatic artery. The evolution was favorable after completion of an embolization and a secondary capsular rupture

The influence of natural dissolved organic matter on herbicide toxicity to marine microalgae is species-dependent

Microalgae, which are the foundation of aquatic food webs, may be the indirect target of herbicides used for agricultural and urban applications. Microalgae also interact with other compounds from their environment, such as natural dissolved organic matter (DOM), which can itself interact with herbicides. This study aimed to evaluate the influence of natural DOM on the toxicity of three herbicides (diuron, irgarol and S-metolachlor), singly and in ternary mixtures, to two marine microalgae, Chaetoceros calcitrans and Tetraselmis suecica, in monospecific, non-axenic cultures. Effects on growth, photosynthetic efficiency (Ф’M) and relative lipid content were evaluated. The chemical environment (herbicide and nutrient concentrations, dissolved organic carbon and DOM optical properties) was also monitored to assess any changes during the experiments. The results show that, without DOM, the highest irgarol concentration (I0.5: 0.5 mg L−1) and the strongest mixture (M2: irgarol 0.5 μg L−1 + diuron 0.5 μg L−1 + S-metolachlor 5.0 μg L−1) significantly decreased all parameters for both species. Similar impacts were induced by I0.5 and M2 in C. calcitrans (around −56% for growth, −50% for relative lipid content and −28% for Ф’M), but a significantly higher toxicity of M2 was observed in T. suecica (−56% and −62% with I0.5 and M2 for growth, respectively), suggesting a possible interaction between molecules. With DOM added to the culture media, a significant inhibition of these three parameters was also observed with I0.5 and M2 for both species. Furthermore, DOM modulated herbicide toxicity, which was decreased for C. calcitrans (−51% growth at I0.5 and M2) and increased for T. suecica (-64% and −75% growth at I0.5 and M2, respectively). In addition to the direct and/or indirect (via their associated bacteria) use of molecules present in natural DOM, the characterization of the chemical environment showed that the toxic effects observed on microalgae were accompanied by modifications of DOM composition and the quantity of dissolved organic carbon excreted and/or secreted by microorganisms. This toxicity modulation in presence of DOM could be explained by (i) the modification of herbicide bioavailability, (ii) a difference in cell wall composition between the two species, and/or (iii) a higher detoxification capacity of C. calcitrans by the use of molecules contained in DOM. This study therefore demonstrated, for the first time, the major modulating role of natural DOM on the toxicity of herbicides to marine microalgae

Abstract P6-08-12: Feasibility of a nation-wide family-based study to assess cancer risks in families with a predicted pathogenic variant identified through hereditary breast and ovary multi-gene panel testing: The TUMOSPEC study

International audienceBackground. Assessment of the age-dependent cancer risk conferred by germline predicted pathogenic variants (PPV) in cancer susceptibility genes is often hampered by the way the data are collected. Cohort-based data frequently contain an overrepresentation of patients carrying a gene variant of interest and an underrepresentation of cancer-free gene variant carriers. In order to overcome this problem, penetrance estimates can be grounded on family-based study designs, through the evaluation of index patients (IP) and their family relatives. The purpose of the TUMOSPEC study is to estimate the penetrance of PPV in genes whose literature data are currently inaccurate or limited and to determine their associated tumour spectrum. This will lead to an appropriate assessment of the clinical utility of testing these genes. Methods. IP are enrolled consecutively among patients who are being offered a germline genetic test in a hereditary breast and ovary cancer (HBOC) context in a participating cancer genetics clinics. A panel of 24 genes (ATM, BAP1, BARD1, BRIP1, CHEK2, FANCM, FAM175A, MRE11A, NBN, STK11, RINT1, XRCC2, PALB2, MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, CDH1, PTEN, RAD50, RAD51B, RAD51C, RAD51D, TP53) is tested in parallel of BRCA1 and BRCA2. If a PPV is identified, the IP is asked to give her/his first- and second-degree relatives and cousins address, regardless of their health status. Each relative is then contacted by the study coordinating centre (CC) to be invited. Each participant completes an epidemiological questionnaire addressing personal medical history and exposure to various risk factors, and provides a saliva sample to determine if he/she carries the familial PPV. The CC collects questionnaires, family history, clinical and genetic data. Results. Enrolment for the feasibility study takes place between Sep. 2017 and Dec. 2019 at each of the 46 participating french clinics. In June 2019, the study included 3,298 IP. So far, the CC received 1,241 TUMOSPEC panel results (37.6%) with a mean delay of 5 months [0.7 -17.5]. Among them, 169 carried a PPV in at least one of the genes (totalizing 183 PPV). Additionally, 44 IP with PPV identified beforehand were enrolled (table 1). Relatives’ invitation of these 213 IP began in June 2018. Among the relatives of the first 29 index cases contacted so far, 4.6 relatives per family consented to participate. Conclusions. The feasibility study showed that inclusion process is well adapted and that the communication between the various partners (clinicians, biologists, investigators and study participants) is quite smooth. Rates of inclusion for invited relatives (50%), for IP questionnaire completion (45%) and relatives biological sample collection (50%) are also very satisfactory and yet underestimated due to the recent start of relatives inclusions. Overall, this study shows that it is feasible to conduct a large-scale study to gather sufficient number of positive families for each gene included in the panel in a reasonable interval of time. This on-going national effort will allow to appropriately assess cancer risks cancer in families with a PPV in a gene often included in HBOC multi-gene panels. This is an essential step to optimize clinical management guidelines specific to each gene, and will represent a valuable resource for future research on the genetics of breast and ovary cancers

Safety of the Breast Cancer Adjuvant Radiotherapy in Ataxia–Telangiectasia Mutated Variant Carriers

International audienceThe Ataxia–Telangiectasia Mutated (ATM) gene is implicated in DNA double-strand break repair. Controversies in clinical radiosensitivity remain known for monoallelic carriers of the ATM pathogenic variant (PV). An evaluation of the single-nucleotide polymorphism (SNP) rs1801516 (G-A) showed different results regarding late subcutaneous fibrosis after breast radiation therapy (RT). The main objective of this study was to evaluate acute and late toxicities in carriers of a rare ATM PV or predicted PV and in carriers of minor allele A of rs1801516 facing breast RT. Fifty women with localized breast cancer treated with adjuvant RT between 2000 and 2014 at Institut Curie were selected. Acute and late toxicities in carriers of a rare PV or predicted PV (n= 9), in noncarriers (n = 41) and in carriers of SNP rs1801516 (G-A) (n = 8), were examined. The median age at diagnosis was 53 years old and 82% of patients had an invasive ductal carcinoma and 84% were at clinical stage I–IIB. With a median follow-up of 13 years, no significant difference between carriers and noncarriers was found for acute toxicities (p > 0.05). The same results were observed for late toxicities without an effect from the rs1801516 genotype on toxicities. No significant difference in acute or late toxicities was observed between rare ATM variant carriers and noncarriers after breast RT for localized breast cancer

AquaVIT Quand les plantes aquatiques invasives transcendent les frontières : approche pluridisciplinaire des relations entre espèces, milieux et gestionnaires

Le projet de recherche AquaVIT vise à accompagner l’évolution des modalités de gestiondes grands lacs aquitains, confrontés à des enjeux environnementaux liés à lacolonisation par les plantes aquatiques invasives. Ces plantes exotiques à caractèreenvahissant peuvent occuper une place importante au sein des écosystèmes lacustres et,par la même occasion, entraver de nombreux usages des lacs, notamment la pratiqued’activités de loisirs. En Nouvelle-Aquitaine, ces macrophytes invasifs font l’objet d’uneattention de la part des gestionnaires, élus et scientifiques depuis maintenant plus detrente ans. Néanmoins, un certain nombre d’interrogations demeurent. Les plantesprésentent encore des dynamiques de colonisation importantes dans de nombreux plansd’eau et les opérations de gestion visant à les réguler sont menées localement. Le projetde recherche AquaVIT s’intéresse particulièrement aux questions suivantes :- Les plantes invasives constituent-elles un élément perturbateur du bon fonctionnement écologique lacustre ?- Comment "faire avec" les plantes au quotidien ?- Comment "faire ensemble" ?Le projet AquaVIT affiche une ambition pluridisciplinaire forte, qui associe, dès saconception, les sciences humaines et sociales d’une part, et les sciences biogéochimiqueset écologiques d’autre part. Ce projet propose une alternative à la vision quantitative etmesurable, strictement centrée sur la plante (i.e distribution et biomasse des plantes), versune approche plus qualitative, orientée sur les relations entre la plante et sonenvironnement, celui-ci étant considéré d’un point de vue écosystémique et social.Appropriée par chacune des disciplines, cette posture a donné lieu à des approchesempiriques diverses et spécifiques. Dans le projet AquaVIT ont été déployées, entreautres, des enquêtes (qualitatives et quantitatives) auprès des acteurs, des études sociohistoriques basées sur des analyses de documents, mais aussi des prélèvements etmesures biologiques et physico-chimiques in situ, ainsi que des expérimentations enlaboratoire. Le croisement de ces regards et de ces méthodes constitue une des richessesdu projet. Les résultats obtenus invitent à s’éloigner d’une représentation univoque desconséquences potentielles de la présence d’herbiers denses de plantes aquatiquesinvasives, tout comme à contextualiser la problématique socio-environnementale de leurgestion. Ceci peut être illustré par le fait que les processus écologiques etbiogéochimiques à l’œuvre dans les herbiers sont étroitement liés aux conditionshydrodynamiques locales, ou encore que les représentations et les attitudes à leur sujetdépendent pour partie des usages et des pratiques de terrain. Dans certaines conditions,une telle « contextualisation » de la problématique a favorisé l’émergence d’innovationsorganisationnelles, se traduisant, par exemple, par des dispositifs à caractère participatif.En dépit des motivations et des intentions à s’engager, dont témoignent les usagers desplans d’eau, les soutiens (humains, techniques et financiers) des pouvoirs publics, restentessentiels. Sur un plan spatial, ces innovations peinent toutefois à dépasser l’échelle dessites, de sorte que la mise en relation entre plusieurs secteurs, que l’on est parfois enmesure d’attendre compte tenu de la dynamique des plantes et des processus, reposeencore très largement sur les réseaux sociotechniques des gestionnaires traditionnels desmilieux, et peu sur les utilisateurs finaux

Genesis : identification et caractérisation de nouveaux gènes de prédisposition au cancer du sein à partir de l'étude de paires de soeurs atteintes et de témoins apparentées et non apparentées

AbstractNational audienceContexte et Objectifs Le cancer du sein (CS) est une pathologie qui concerne environ 10 % des femmes dont l’espérance de vie est de plus de 80 ans. Les études de ségrégation ont montré que 5 % des cas sont liés à un facteur génétique transmis selon un mode dominant. Deux gènes, BRCA1 et BRCA2, ont été identifiés ; leurs mutations sont impliquées dans environ 5 % des CS et 20 % des cas familiaux testés (Miki et al., 1994, Wooster et al., 1995). Une partie des 80 % restant pourrait être expliquée par des prédispositions encore non identifiées mais dont le mode de transmission serait plus vraisemblablement récessif ou oligogénique. L’étude GENESIS a pour objectif d’identifier de nouveaux gènes de prédisposition et d’évaluer leur rôle dans l’apparition d’un CS ainsi que celui de facteurs non génétiques qui pourraient modifier leur effet. Données et Méthode GENESIS combine une étude de liaison génétique non paramétrique chez des paires de soeurs atteintes de CS et non porteuses d’unemutation des gènes BRCA et une étude d’association avec deux groupes témoins : soeurs indemnes et proches non apparentées (amies, collègues). Les analyses de liaison génétique exploreront l’ensemble du génome (GW). Les études d’association seront plus particulièrement centrées sur les régions d’intérêt désignées par les études de liaison et par les résultats publiés des études d’association GW. Les études d’association permettront, outre d’identifier de nouveaux facteurs génétiques, d’estimer les risques de CS associés et d’évaluer les éventuelles interactions gènes-environnement/style de vie. Le recueil de caractéristiques phénotypiques des cas (densité mammaire, caractéristiques tumorales examinées en tissu-array...) permettra de définir des endophénotypes et ainsi de diminuer l’hétérogénéité génétique attendue au sein de la population d’étude. L’effectif attendu est 6 000 personnes (1 000 paires de soeurs et 4 000 témoins et apparentés). Protocole du recueil des données et des prélèvements biologiques Les diverses étapes du protocole se font par courrier et sont coordonnées par le Centre Coordonnateur* et le Centre de Ressources Biologiques#. Les femmes index sont invitées à participer par les consultants en génétique du Groupe Génétique et Cancer (GGC) de la Fédération Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer. Les soeurs atteintes et indemnes, les frères et les parents ainsi qu’une proche non apparentée sont invités par les index. Les données épidémiologiques concernent les antécédents gynécologiques et obstétriques, les traitements hormonaux, les habitudes tabagiques actives et passives, la consommation d’alcool, l’activité physique,les expositions aux radiations,... Les échantillons sanguins (sang total, lymphocytes, plasma, sérum) et tumoraux sont collectés. Les mammographies des index, soeurs atteintes et de leurs témoins sont numérisées pour la mesure de la densité mammaire. État d’avancement Une étude pilote aété réalisée sur 48 cas index invités en novembre 2006. La participation a été de 81 %. L’étude nationale a commencé en avril 2007. Le protocole et l’avancement de GENESIS seront présentés en détail et la population incluse en janvier 2008 sera décrite. Retombées : L’identification de nouveauxgènes de prédisposition au CS aura un impact sur la prise en charge des femmes à risque. La connaissance de ces gènes permettra également de mieux comprendre l’origine d’un certain nombre de cas de CS a priori non familiaux et permettra d’optimiser la prise en charge de leurs apparentées.Enfin, la connaissance des fonctions biologiques de ces gènes, de leurs interactions avec des facteurs environnementaux permettra de proposer des actions de prévention. Remerciements : GENESIS est soutenue par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 200