43 research outputs found
Mikotoxinok előfordulása takarmányokban
A takarmányok káros anyagokat (toxikus elemeket, növényvédőszermaradékokat, mikotoxinokat) tartalmazhatnak, amelyek bekerülve az állati szervezetbe a szövetekben, vérben feldúsulva egészségkárosító hatásúak, ami az állati terméket fogyasztó embert is megbetegíthetik. Takarmánybiztonsági szempontból világszerte kiemelt jelentősége van a szántóföldi és raktári penészgombák termelte mikotoxinoknak. Összefoglaltuk a mikotoxinok takarmányokban való előfordulására vonatkozó szabályozást a világ különböző részein, különös tekintettel az Európára érvényes szabályozásra. Fontos szempont, hogy a szabályozási szinteknek megfelelő megbízható laboratóriumi vizsgálati módszerek álljanak rendelkezésre. A mikotoxinok vizsgálatára többféle módszer is alkalmazható: a nagyhatékonyságú folyadék-kromatográfia (HPLC), az ELISA, és vékonyréteg-kromatográfia (TLC). A módszerek használatáról és megfelelőségükről többek között az OMMI Központi Laboratóriuma által rendszeresen szervezett körvizsgálatok adnak érdemi információt. Az OMMI Központi Laboratóriumban évről-évre növekvő mintaszámmal vizsgálják a takarmány-alapanyagok és takarmánykeverékek mikotoxin szennyezettségét. A 2003-tól 2006. szeptember végéig terjedő időszakban kapott és feldolgozott mérési adatok: zearalenonra, trichotecén toxinokra, ochratoxin A-ra, aflatoxin B1-re vonatkozóan jól érzékeltetik az évek közötti változásokat, lehetőséget adnak a hatósági ellenőrzési szempontok és tervek megalapozott összeállításához. The feeding stuffs may contain toxic substances, as toxic elements, pesticide residues, mycotoxins, which could cause deleterious effect, diseasing the person consuming the animal products. In respect of feed safety, the mycotoxins produced by the field and warehouse mildew have great importance worldwide. We present the world-wide regulation connected with the mycotoxins occurred in feeds, in particular the European legislation. It’s an important aspect that reliable laboratory testing methods have to be available according to the regulated level. Various methods can be applied to analyze mycotoxins, among others, the ring tests commonly organized by OMMI Central Laboratory give substantive information about the application and the conformance of the High Performance Liquid Chromatography (HPLC), the ELISA and the Thin-Layer-Chromatography (TLC) methods. We analyze the contamination of mycotoxins in the feeds year by year in increasing number in the OMMI Central Laboratory. The measured and processed results of the period of 2003 and September 2006 in the respect of Zearalenone, trichotecene toxins, Ochratoxin A, Aflatoxin B1 show well the changes between years, and give opportunity to compile effectively the views, and plans of the authority control
Structural evidence for non-canonical binding of Ca2+ to a canonical EF-hand of a conventional myosin
Structural basis of Lewis(b) antigen binding by the Helicobacter pylori adhesin BabA
Helicobacter pylori is a leading cause of peptic ulceration and gastric cancer worldwide. To achieve colonization of the stomach, this Gram-negative bacterium adheres to Lewis(b) (Le(b)) antigens in the gastric mucosa using its outer membrane protein BabA. Structural information for BabA has been elusive, and thus, its molecular mechanism for recognizing Le(b) antigens remains unknown. We present the crystal structure of the extracellular domain of BabA, from H. pylori strain J99, in the absence and presence of Le(b) at 2.0- and 2.1-Å resolutions, respectively. BabA is a predominantly α-helical molecule with a markedly kinked tertiary structure containing a single, shallow Le(b) binding site at its tip within a β-strand motif. No conformational change occurs in BabA upon binding of Le(b), which is characterized by low affinity under acidic [K D (dissociation constant) of ~227 μM] and neutral (K D of ~252 μM) conditions. Binding is mediated by a network of hydrogen bonds between Le(b) Fuc1, GlcNAc3, Fuc4, and Gal5 residues and a total of eight BabA amino acids (C189, G191, N194, N206, D233, S234, S244, and T246) through both carbonyl backbone and side-chain interactions. The structural model was validated through the generation of two BabA variants containing N206A and combined D233A/S244A substitutions, which result in a reduction and complete loss of binding affinity to Le(b), respectively. Knowledge of the molecular basis of Le(b) recognition by BabA provides a platform for the development of therapeutics targeted at inhibiting H. pylori adherence to the gastric mucosa
Crystal Structure of the PIM2 Kinase in Complex with an Organoruthenium Inhibitor
BACKGROUND: The serine/threonine kinase PIM2 is highly expressed in human leukemia and lymphomas and has been shown to positively regulate survival and proliferation of tumor cells. Its diverse ATP site makes PIM2 a promising target for the development of anticancer agents. To date our knowledge of catalytic domain structures of the PIM kinase family is limited to PIM1 which has been extensively studied and which shares about 50% sequence identity with PIM2. PRINCIPAL FINDINGS: Here we determined the crystal structure of PIM2 in complex with an organoruthenium complex (inhibition in sub-nanomolar level). Due to its extraordinary shape complementarity this stable organometallic compound is a highly potent inhibitor of PIM kinases. SIGNIFICANCE: The structure of PIM2 revealed several differences to PIM1 which may be explored further to generate isoform selective inhibitors. It has also demonstrated how an organometallic inhibitor can be adapted to the binding site of protein kinases to generate highly potent inhibitors. ENHANCED VERSION: This article can also be viewed as an enhanced version in which the text of the article is integrated with interactive 3D representations and animated transitions. Please note that a web plugin is required to access this enhanced functionality. Instructions for the installation and use of the web plugin are available in Text S1
Cellular Active N-Hydroxyurea FEN1 Inhibitors Block Substrate Entry to the Active Site
The structure-specific nuclease human flap endonuclease-1 (hFEN1) plays a key role in DNA replication and repair and may be of interest as an oncology target. We present the first crystal structure of inhibitor-bound hFEN1 and show a cyclic N-hydroxyurea bound in the active site coordinated to two magnesium ions. Three such compounds had similar IC50 values but differed subtly in mode of action. One had comparable affinity for protein and protein– substrate complex and prevented reaction by binding to active site catalytic metal ions, blocking the unpairing of substrate DNA necessary for reaction. Other compounds were more competitive with substrate. Cellular thermal shift data showed engagement of both inhibitor types with hFEN1 in cells with activation of the DNA damage response evident upon treatment. However, cellular EC50s were significantly higher than in vitro inhibition constants and the implications of this for exploitation of hFEN1 as a drug target are discussed
Loci Memoriae Hungaricae
Előszó (S. Varga Pál) - 9 ; 1. A magyar emlékezethelyek kutatásának elméleti alapjai - 23 ; 1.1. Vita - 25 ; Gyáni Gábor: A magyar „emlékezet helyei” és a traumatikus múlt - 27 ; Fata Márta: A magyar emlékezethelyek specifikumai (Hozzászólás Gyáni Gábor vitaindítójához) - 36 ; Takáts József: A klasszikus és az új nacionalizmus (Hozzászólás Gyáni Gábor vitaindítójához) - 39 ; 1.2. Történelem és emlékezet - 43 ; Balogh László Levente: A Trianon-emlékművek és az áldozatdiskurzus - 45 ; Erős Vilmos: A történetírás-történet mint emlékezethely - 58 ; Gerő András: A nemzeti emlékezethelytől a nemzeti emlékhelyig - 69 ; 1.3. Emlékezethely és medialitás - 79 ; Kerékgyártó Béla: Építészet, identitás és emlékezet (Aldo Rossi elmélete ; és a lakótelepek példája) - 81 ; Bujdosó Ágnes: A televízió mint az emlékezés médiuma (Medialitás
és emlékezés sajátos összefüggései a Delta magazin főcímének kapcsán) - 96 ; Dunai Tamás: A Kádár-kori képregény mint emlékezethely - 106 ; Puskás István: „A Maradandóság Városában maradékomból élek.” (A nyolcvanas évek debreceni underground kultúrájának emlékezete) - 114 ; 1.4. Szociokulturális megközelítések - 125 ; Biczó Gábor: A kulturális emlékezet a szociokulturális konszenzusgyakorlatban: magyar–román együttélési közösségek példája - 127 ; Pék Győző–Almássy Zsuzsa–Szabó Gergely–Máth János–Kőszeghy Attila: Kollektív traumatikus eseményt követő kommunikáció vizsgálata (A magyarországi „vörösiszap-katasztrófá”-val kapcsolatos információfeldolgozás és érzelmi reakciók) - 140 ; 1.5. Az emlékezethely-kutatás nemzetközi eredményei - 151 ; Pabis Eszter: Az emlékezethelyek kutatásának eredményeiről Németországban és Svájcban - 153 ; Kovács Szilvia: Az emlékezet helyei a kultúratudományok térbeli fordulatának aspektusából (Moritz Csáky, Peter Stachel: Die Verortung von Gedächtnis) - 164 ; Pusztai Gábor: Németalföld emlékezete: holland és flamand nemzeti emlékezethelyek (Jo Tollebeek [red.]: Het geheugen van de Lage Landen) - 171 ; Réti Zsófia: Emlékezethelyek Hollandiában – A Lieux de mémoire et identités nationales című kötetről - 176 ; Száraz Orsolya: Olasz emlékezethelyek – három kötetben (I luoghi della memoria, a cura di Mario Isnenghi) - 183 ; Friedrich Judit: A kulturális emlékezet kutatása az ELTE Anglisztika Tanszékén (Egy OTKA-projektről és a Confrontations and Interactions című, angol nyelvű konferenciakötetről) - 191 ; 2. Mohács mint reprezentatív emlékezethely - 199 ; 2.1. Mohács a modern emlékezetkultúra küszöbén - 201 ; 2.1.1. A verbális közeg tanúsága - 201 ; Bitskey István: Mohács emlékezete egy kora újkori hitvitában - 203 ; Debreczeni Attila: Nemzeti nagylét, nagy temető és – Batsányi (Egy nemzeti
narratíva formálódása) - 208 ; Orbán László: Az útbaigazított emlékezet Kazinczynál (Identitásminták Kazinczy önéletrajzi szöveghálózatában – a kulturális emlékezethely gondolatának megjelenése) - 227 ; S. Varga Pál: „…keressetek alkalmat a hajdanra visszanézhetni…” (Mohács
emlékezethellyé válása a 19. század elejének magyar irodalmában) - 240 ; Brigovácz László: Intések az utókornak – Mohács hagyatéka reformkori szentbeszédekben - 250 ; 2.1.2. A festészet tanúsága - 259 ; Veszprémi Nóra: A magyar történeti festészet kezdetei? (A mohácsi csata képi
ábrázolásai a 18. század végén és a 19. század elején) - 261 ; Keserü Katalin: Mohácsról szól-e a Mohács-kép 1848/49 után? - 274 ; 2.2. Mohács emlékezete a modern korban – a történetírás, a politika és az irodalom tanúsága - 285 ; Szendrei Ákos: „Mohács-kép” a Szilágyi Sándor szerkesztette millenniumi A magyar nemzet történetében - 287 ; Erős Vilmos: Magyar Historikerstreit? (A Mohács-vita az 1960-as és 70-es években) - 301 ; Kerepeszki Róbert: Horthy Miklós mohácsi beszéde, 1926 (Emlékezethely a politikai gondolkodásban és a nemzetközi kapcsolatok történetében) - 313 ; Kovács Szilvia: Mohács – a történettudomány és a kulturális emlékezet narratívái (Krúdy Gyula: Mohács) - 325 ; 2.3. Idegenek szemében - 337 ; Györkös Attila: Mohács és a török–francia szövetség, avagy a „Nyugat árulásá”-nak mítosza - 339 ; Jakó Klára: Foglalkozik-e Moháccsal és a magyarsággal a 16. század vége és a 18. század eleje között a moldvai és havasalföldi krónikairodalom? - 352 ; Dobrovits Mihály: Nekik Mohács kell (A török Mohács-percepció kérdőjelei) - 362 ; Bárány Attila: Adalékok Mohács emlékezetéhez a Habsburgok államaiban: II. Lajos ábrázolásai a brüsszeli katedrálisban - 367 ; 2.4. Alternatív Mohács-képek - 385 ; Csorba Dávid: Az Angyalok kápolnája mint emlékezeti hely - 387 ; Baltavári Tamás: A mohácsi csata számítógépes rekonstrukciója és animációs megjelenítése - 397; A kötet szerzői - 403 ; Névmutató - 41
The structure of P-TEFb (CDK9/cyclin T1), its complex with flavopiridol and regulation by phosphorylation
The CCP4 suite : integrative software for macromolecular crystallography
The Collaborative Computational Project No. 4 (CCP4) is a UK-led international collective with a mission to develop, test, distribute and promote software for macromolecular crystallography. The CCP4 suite is a multiplatform collection of programs brought together by familiar execution routines, a set of common libraries and graphical interfaces. The CCP4 suite has experienced several considerable changes since its last reference article, involving new infrastructure, original programs and graphical interfaces. This article, which is intended as a general literature citation for the use of the CCP4 software suite in structure determination, will guide the reader through such transformations, offering a general overview of the new features and outlining future developments. As such, it aims to highlight the individual programs that comprise the suite and to provide the latest references to them for perusal by crystallographers around the world
Röntgenkristallographische Untersuchungen an zwei cysteinreichen antikarzinogenen Mikroproteinen
Zwei cysteinreiche, antikarzinogene Mikroproteine wurden mit röntgenkristallographischen Methoden untersucht.Der aus den Limabohnen isolierte Trypsin-Chymotrypsin Inhibitor (LBTI) gehört zu der Bowman-Birk-Familie der Serin-Protease-Inhibitoren. Die ungewöhnlich hohe Anzahl der Schwefelatome und die hohe Symmetrie der Raumgruppe ermöglichten die Strukturlösung anhand der in-house gemessenen anomalen Streuung von Schwefel. Die LBTI-Moleküle nehmen die der Bowman-Birk-Familie entsprechende bow-tie- >Faltung an. Sie bilden in der Kristallstruktur Dimere derart, dass die reaktiven Schlaufen unabgeschirmt bleiben.Der ternäre Komplex des LBTI mit dessen beiden Zielenzymen konnte mit der Methode des molekularen Ersatzes problemlos gelöst werden. Diese Struktur erhellte die wichtigsten Faktoren, die die Enzymspezifität beeinflussen können, wie die asymmetrische Verteilung der hydrophoben und hydrophilen Oberflächen an der Enzym-Inhibitor-Schnittstelle, oder Konformationsänderungen während einer gleichzeitigen Enzymbindung.Viscotoxine (VT) sind Mitglieder der Alpha- und Beta-Thionin-Familie und besitzen eine cytotoxische Wirkung, indem sie biologische Membrane zerstören können. Die Kristallstruktur der VT A3 Isoform wurde ebenfalls mit Hilfe der anomalen Dispersion des Schwefels gelöst. In diesem Fall verlangte die relativ niedrige Auflösung des anomalen Signals eine Verbesserung des Schweratom-Suchverfahrens für eine erfolgreiche Phasenbestimmung. Die dreidimensionale Struktur der VT A3 Moleküle ähnelt dem Buchstaben "L". Eine positiv geladene Bindungstasche konnte zwischen dem kurzen und langen Schenkel der L-Form lokalisiert werden, wo ein funktionell bedeutsames Phosphation gebunden ist. Die VT A3 Moleküle liegen in der Kristallstruktur als Dimere vor, die weiter zu Tetrameren verbunden sind.Die ausgezeichneten Diffraktionseigenschaften der Kristalle aus der Isoform B2 ermöglichten die Datensammlung bis zu atomarer Auflösung und die Strukturlösung mit ab initio direkten Methoden. Die in der relativen Lage der Monomere beobachteten Unterschiede und Sequenzvergleich der Isoformen deuten darauf hin, dass die für eine hohe cytotoxische Aktivität verantwortlichen hydrophoben Aminosäurereste an der äußeren Oberfläche des längeren L-Schenkels liegen