Every which way? On predicting tumor evolution using cancer progression models

Successful prediction of the likely paths of tumor progression is valuable for diagnostic, prognostic, and treatment purposes. Cancer progression models (CPMs) use cross-sectional samples to identify restrictions in the order of accumulation of driver mutations and thus CPMs encode the paths of tumor progression. Here we analyze the performance of four CPMs to examine whether they can be used to predict the true distribution of paths of tumor progression and to estimate evolutionary unpredictability. Employing simulations we show that if fitness landscapes are single peaked (have a single fitness maximum) there is good agreement between true and predicted distributions of paths of tumor progression when sample sizes are large, but performance is poor with the currently common much smaller sample sizes. Under multi-peaked fitness landscapes (i.e., those with multiple fitness maxima), performance is poor and improves only slightly with sample size. In all cases, detection regime (when tumors are sampled) is a key determinant of performance. Estimates of evolutionary unpredictability from the best performing CPM, among the four examined, tend to overestimate the true unpredictability and the bias is affected by detection regime; CPMs could be useful for estimating upper bounds to the true evolutionary unpredictability. Analysis of twenty-two cancer data sets shows low evolutionary unpredictability for several of the data sets. But most of the predictions of paths of tumor progression are very unreliable, and unreliability increases with the number of features analyzed. Our results indicate that CPMs could be valuable tools for predicting cancer progression but that, currently, obtaining useful predictions of paths of tumor progression from CPMs is dubious, and emphasize the need for methodological work that can account for the probably multi-peaked fitness landscapes in cancerWork partially supported by BFU2015- 67302-R (MINECO/FEDER, EU) to RDU. CV supported by PEJD-2016-BMD-2116 from Comunidad de Madrid to RD

Metodología para la evaluación de los costos de la movilidad en el transporte público. Aplicación a la ciudad de Medellín (Colombia)

El presente estudio tiene como objetivo principal obtener una metodologia para la evaluación de los costos de la movilidad en el transporte público, que permita de una forma sencilla ser aplicado periódicamente, específicamente en la ciudad de Medellín (Colombia), y que intenta monetarizar el número máximo de parámetros operacionales, tanto directos como indirectos, temporales y algunas externalidades. En la primera instancia se incluyeron todos los costos que son originados por el desplazamiento en transporte público, los costos directos e indirectos de operación, los costos temporales y algunos costos externos. Posteriormente, se plantearon las metodologias encontradas para monetarizar todos lo costos descritos anteriormente. Y por último se realizó la aplicación de dichos procedimientos a la ciudadde Medellín (Colombia), teniendo en cuenta las consideraciones del caso

La producción de la voz : Estructuras anatómicas y biomecánica laríngea. Usos y abusos vocales en la tarea del docente de Educación Física

La voz no es sólo el sonido producido por un órgano o un sistema, la voz expresa y comunica completamente a las personas. En términos anatomofisiológicos la voz se produce gracias a la acción coordinada de varias estructuras de nuestro cuerpo. Estas estructuras coordinadas se denominan sistema fonatorio. Lo integran músculos de diferentes regiones del cuerpo, elementos del aparato respiratorio y del aparato digestivo. Esos componentes se adaptan y se coordinan para que pueda producirse el sonido humano al que llamamos voz, los cuales además se articulan y combinan en palabras y frases con las que nos comunicamos. También una adecuada alineación postural permite tener más capacidad de producir una amplia gama de sonidos en forma cómoda. El presente trabajo es una mirada de la fonación, desde una perspectiva eminentemente funcional, donde se enfatizan aspectos que nos ayudan a comprender mejor el uso vocal general y aquel que se desarrolla con fines ocupacionales y profesionales. En esta propuesta se pone el acento en el particular uso vocal en la docencia de la Educación Física en diferentes ámbitos, uso por demás exigido lo que genera abusos vocales y generalmente disfonías. Por último se ofrece algunas líneas de actuación concretas para que la situación actual se optimice y se reduzca la problemática en ésta áre

Avaluant la competència comunicativa de futurs professors

Saber comunicar les matemàtiques a alumnes de secundària és l'objectiu principal en la formació de futurs professors d'institut. Sabem però si els estudiants assoleixen les competències necessàries per ensenyar matemàtiques? En aquest sentit, Claudia Lorena Vargas ha presentat una tesi doctoral titulada "Evaluación de la competencia comunicativa en la formación del profesorado de matemática de educación secundaria" en la que explora quines capacitats adquireixen els estudiants del Màster de formació del professorat de Matemàtiques.Saber comunicar las matemáticas a alumnos de secundaria es el objetivo principal en la formación de futuros profesores de instituto. ¿Sabemos si los estudiantes alcanzan las competencias necesarias para enseñar matemáticas? En este sentido, Claudia Lorena Vargas ha presentado una tesis doctoral titulada "Evaluación de la competencia comunicativa en la formación del profesorado de matemática de educación secundaria" en la que explora qué capacidades adquieren los estudiantes del Máster de formación del profesorado de Matemáticas

Hacia una educación inclusiva : reinventar las prácticas curriculares, más allá de las políticas educativas

El presente artículo se propone dejar planteados algunos aportes y debates en torno a la definición de políticas educativas que promueven la inclusión y sus efectos en las prácticas curriculares que se configuran en el dispositivo escolar, el que define sus condiciones de posibilidad. Se plantea que no existe una aplicación lineal de las políticas educativas, atendiendo a las mediaciones que los actores educativos ponen en juego en las prácticas curriculares fundadas en una lógica escolar naturalizada. Por ello la necesidad de propiciar procesos de desnaturalización de las creencias de los actores educativos acerca de las formas de lo escolar, el aprender y el enseñar, el curriculum, la educación común, la educación especial y sus posibles relaciones. De este modo habilitar movimientos instituyentes que transformen las prácticas curriculares en herramientas para la inclusión educativa en términos de igualdad para todos/as.This article presents some contributions and discuss about the definition of educational policy that promotes inclusion and argues about its effects on curriculum practices setting scholar devices, which defines the opportunity conditions. It argues about the existence of a linear mapping of educational politics, considering the mediations that educational actors display on curricular practices based on a naturalized school practice. Therefore the need to promote the beliefs denaturalization of those involved in education in different ways of school: learning and teaching, curriculum, common education, special education and their possible relationships. Somehow, to promote instituting movements to transform curricular practices in inclusive education tools in terms of equality for everybody.Fil: Coicaud, Claudia.Fil: Díaz, Gladys

Propuesta de enseñanza del concepto de función para estudiantes de educación superior

La propuesta que se presenta hace parte de la investigación “Planteamiento didáctico del concepto de función para estudiantes de Educación Superior”, y surge de la necesidad de reducir los altos índices de pérdida y deserción en los primeros semestres de Ingeniería. Dicha situación generó una reflexión e interés en la búsqueda de una propuesta que permitiera una mayor comprensión del concepto de función. La propuesta de enseñanza de tipo inclusivo que se construye se encuentra sustentada en unos referentes epistemológicos y teóricos, y hace énfasis en la identificación de los diferentes elementos del concepto, de las formas y cambios de representación

Effect of thermal cycles on rock massif stability

The environmental conditions may play a relevant role in the stability of rock slopes. In fact, weathering can contribute to the reduction of strength of the material, while atmospheric actions may increase internal stresses in the rock massif. This Ph.D. thesis deals with the effect of atmospheric thermal cycles in rocks, from both experimental and numerical point of view. This research is focused on the real case of La Roque Gageac, a small town located in the south-west of France, which experiences rock fall risks. Installed instrumentation evidenced the main role played by thermal variations in rock falls occurrence. With the aim of isolating the effect of thermal cycles in the La Roque Gageac limestone, an experimental study is performed. Samples were obtained from blocks felt and intact cores drilled from the cliff face. These samples were submitted to thermal cycles between 10ºC and 50ºC, in order to mimic natural variations. The damage induced in the samples is evaluated through measurements of strains, elastic wave propagation velocities and uniaxial compressive strength. It is observed that samples experience an accumulation in strains and reduction in the elastic wave propagation velocity and material strength during the imposition of thermal cycles. The response depends moreover on the mineralogical composition of the rock, which varies from sample to sample, as the cliff presents a large heterogeneity. Based on the results obtained in the experimental program, principal characteristics of thermal damage have been evaluated, proposing a constitutive model capable to reproduce the macroscopic mechanical response of the rock under the applied thermal cycles. With this purpose, a constitutive model based on the concept of composite material defined by Vaunat & Gens (2003) is developed. This model considers the material as composed of two different components endowed with their own behavior and interacting each other. This constitutive model has been implemented in the finite elements code CODE_BRIGHT and validated with the experimental results. It allows a better understanding of the internal stresses developed in the material under thermal loading.Las condiciones ambientales juegan un papel relevante en la estabilidad de taludes de roca, de hecho, las variaciones climáticas pueden afectar tanto la resistencia del material como el nivel de esfuerzos internos a los que el macizo está sometido. Esta tesis doctoral se enfoca en el efecto de los ciclos térmicos atmosféricos en las rocas, desde un punto de vista experimental y numérico. Esta investigación se centra el caso de La Roque Gageac, un pequeño pueblo localizado en el Sur de Francia, que se ha visto afectado por importantes caídas de rocas, las cuales, de acuerdo con registros de instrumentación parecen estar ligadas a las variaciones de temperatura registradas en el sitio. Con el objetivo de aislar el efecto de los ciclos térmicos en la caliza de la Roque Gageac un estudio experimental es llevado a cabo, para esto se consideran muestras obtenidas de bloques caídos en eventos anteriores y de núcleos intactos obtenidos de la cara del acantilado. Dichas muestras han sido sometidas a ciclos de temperatura entre 10ºC y 50ºC con el fin de imitar las variaciones naturales. El daño inducido en las muestras es evaluado a través de medidas de deformación, velocidad de propagación de ondas elásticas y resistencia a la compresión uniaxial. Se observa una acumulación de deformaciones, así como la reducción en la velocidad de propagación de onda y la resistencia del material con la imposición de los ciclos térmicos. Adicionalmente, la respuesta obtenida depende de la composición mineralógica de la roca que varía entre muestras, debido a la heterogeneidad del acantilado. Con base en los resultados obtenidos en el programa experimental se definen las principales características del fenómeno de daño térmico, con lo cual es posible proponer un modelo numérico capaz de reproducir la respuesta mecánica a nivel macroscópico de la roca cuando es sometida a ciclos térmicos. Para esto se desarrolla un modelo constitutivo basado en el concepto de material compuesto definido por Vaunat & Gens (2003). Dicho modelo considera que el material bajo estudio está compuesto por dos componentes diferentes con comportamientos establecidos para cada uno y que interactúan entre ellos. Este modelo constitutivo es implementado en el código de elementos finitos CODE_BRIGHT y validado con los resultados experimentales, permitiendo un mejor entendimiento de la generación de tensiones internas en la roca cuando esta es sometida a cargas térmicas.Les conditions environnementales jouent un rôle important dans la stabilité des massifs rocheux. De fait, les variations climatiques peuvent affecter la résistance du matériau et également augmenter les contraintes internes dans le massif. Cette thèse étudie les effets des cycles thermiques atmosphériques sur les roches, dans une approche expérimentale puis numérique. Cette recherche est centrée sur le cas de la falaise de La Roque Gageac, un village du sudouest de la France, situé au pied d’une falaise qui présente une caverne à mi-hauteur. Cette commune a été affectée par plusieurs éboulements. Les données issues de l’instrumentation du massif montrent que ces instabilités sont liées aux cycles thermiques. Afin d’isoler l’effet des cycles thermiques dans la roche calcaire de La Roque Gageac, un programme expérimental a été mis en place. Des échantillons ont été prélevés sur deux sites de la falaise (blocs éboulés à l’intérieur de la caverne et carottés dans la face de la falaise). Ces échantillons ont été soumis à des cycles thermiques entre 10ºC et 50ºC afin de simuler les conditions enregistrées sur le site. L’endommagement de la roche est évalué en laboratoire par le suivi de mesures de déformations, de vitesses de propagation d’ondes élastiques et par l’évolution de la résistance à la compression uniaxial. Une réduction de la vitesse de propagation des ondes élastiques de compression et de cisaillement ainsi que de la résistance à la compression du matériau sont observées. De la même façon, les échantillons enregistrent une accumulation de déformations. De plus, la réponse des échantillons est influencée par la composition minéralogique de la roche. Celle-ci est liée au lieu de prélèvement, le calcaire de la falaise montrant une importante hétérogénéité. Les résultats du programme expérimental ont permis la détermination des caractéristiques principales du phénomène d’endommagement thermique. Une loi de comportement modélisant l’effet des cycles thermiques sur la roche calcaire de La Roque Gageac d’un point de vue macroscopique a été proposée. À cette fin, une loi de comportement sur la base de matériau composite présentée par Vaunat & Gens (2003) est suggérée. Ce modèle prend en compte un matériau formé de deux constituants au fonctionnement distinct dont l’interaction décrit le comportement de la roche. Le modèle a été introduit dans le programme aux éléments finis « CODE_BRIGHT » et est évalué en simulant la réponse observée sur les échantillons pendant le programme expérimental

Strategic Incorporation of Experiential Learning in Sustainability Through the Project “Path to A Sustainable Country”

Path to a Sustainable Country (in Spanish “Ruta País Sostenible”) is an institutional commitment that seeks to reinforce the importance of natural resources in the university community and promote learning based on experience. We make field trips around the country that connect nature and communities. The areas selected are the National Natural Parks (NNP) and the protected areas of Colombia (12% of the country's territory). This project has the intention to be closer to the territory´s realities. At the same time, we have an experiential analysis to develop academic projects that promote the conservation of ecosystem services, and the improvement of the quality of life of the surrounding communities.  Since 2022, we have made three field trips to the NNP: Chingaza (paramo), Bahía Málaga (mangrove), Desierto de la Tatacoa (tropical dry forest), El Zoque (andean forest), El Cocuy (Glacier). On those trips, we have had 150 participants among students, professors, staff, and alumni. We tested the most appropriate and effective sustainable learning process. The result indicated that 50% of people memorize the concepts when they directly observe nature and communities. Meanwhile, the second most successful tool was applied research (20%), followed by classes (16%), and finally, laboratory practices (14%)

Understanding Biomass Pyrolysis Kinetics: Improved Modeling -based on -comprehensive -thermokinetic Analysis

En el campo de la cinética de la pirólisis de biomasa se han desarrollado numerosos trabajos de investigación que no acaban de resolver aspectos básicos del proceso. El análisis de resultados termogravimétricos aún requiere el establecimiento de modelos y estrategias de evaluación más apropiadas para los diferentes tipos de biomasa. Esta tesis trata todos estos aspectos desde el punto de vista de la investigación fundamental. Se estudia el comportamiento térmico de biomasas representativas de los residuos de carpintería (madera de pino y haya) y de un cultivo energético (cardo borriquero) por medio de diferentes técnicas termoanalíticas, en el régimen de pirólisis lenta (slow pyrolysis), incluyendo varios pretratamientos de la biomasa para eliminar materia inorgánica y componente extractivo. La primera contribución de esta tesis corresponde a un estudio exhaustivo del efecto de los errores sistemáticos asociados a la experimentación en termogravimetría. El comportamiento térmico de un mismo material es observado en diferentes termobalanzas, bajo condiciones que se consideran equivalentes entre diferentes equipos, y los resultados son analizados estadísticamente. Consecutivamente, para la descripción de la pérdida global de masa, se estudian diferentes aproximaciones cinéticas basadas en reacciones parciales de primer y otros órdenes, por el modelo de pseudocomponentes. Se trata de determinar un conjunto común de parámetros cinéticos que describan satisfactoriamente experimentos provenientes de diversas termobalanzas y bajo diferentes regímenes de calentamiento: lineal y en escalera (aplicación sucesiva de rampas y periodos isotérmicos de calentamiento). Un conjunto común de energías de activación, resultado de la evaluación cinética de muestras pretratadas (lavadas con agua a 80 ºC), es aplicado en la descripción cinética de todos los tipos de experimentos llevados a cabo a lo largo de la tesis.Espectrometría de masas, acoplada simultáneamente a la termogravimetría, es la técnica empleada para el análisis de los productos volátiles. Se aplica una herramienta estadística para analizar la influencia de la composición de las muestras en la descomposición térmica global y en la distribución de productos. Por medio de datos de calibración se estima la producción individual de los principales productos volátiles de la pirólisis. Consecutivamente, se incluye una aproximación de la evolución de dichos productos en el modelo cinético global.El estudio de las reacciones secundarias de pirólisis ha sido también parte importante en esta tesis. A través de la calorimetría diferencial se estudia el calor de reacción de la descomposición primaria y secundaria. Adicionalmente, se analizan los resultados provenientes de un estudio de espectroscopía infrarroja acoplada a termogravimetría, con el objeto de investigar la descomposición secundaria mediante la observación de los perfiles de evolución de los productos volátiles. Finalmente, se prueba y optimiza el desempeño del modelo cinético global para describir la descomposición térmica de muestras bajo condiciones que claramente favorecen la descomposición secundaria.En conjunto, este trabajo de investigación representa un estudio termocinético exhaustivo y profundo de la pirólisis de biomasa. La descomposición térmica se aborda a través de la observación de la interconexión entre los diferentes fenómenos químicos que conforman el proceso. La propuesta de aproximación cinética, que se constituye a lo largo de la tesis, contribuye al entendimiento del proceso como un todo. Puede ser también considerada como un primer paso hacia la aplicación de los modelos cinéticos de pirólisis a otros estudios, requiriéndose la incorporación adicional de fenómenos de transporte y otras consideraciones para su posterior aplicación.The abundant research literature on the field of biomass pyrolysis kinetics still leaves key issues unsolved. The exploitation of the information provided by thermogravimetry requires the establishing of appropriate models and evaluation strategies for the various biomass materials. The kinetic description of experiments measured at different conditions by exactly the same reaction kinetics is criticized due to some small, but inevitable systematic errors that depend on the experimental conditions. Practical models that predict the evolution of specific products of interest are still expected in the literature. Part of the chemical phenomena referred to the secondary interactions between the primary pyrolysis products has been traditionally avoided when modeling the pyrolytic process. The increased exploitation of herbaceous crops, in addition to the large quantity of woody residues that still remains largely unused, currently ask for a better description of the influence of the heterogeneities on biomass thermolysis.This thesis addresses all these issues in the context of fundamental research. The thermal behavior of biomass materials representative of carpentry residues (pine and beech), and an energy plantation (thistle) is studied by different thermoanalytical techniques, within the range of slow pyrolysis, including various pretreatments to eliminate inorganic matter and extractives. The first contribution aims at deeply observing the extent of systematic errors associated to the experimental part of the thermogravimetric studies. The thermal behavior of the same feedstock in different original equipments, under roughly equivalent experimental conditions, is statistically studied. Then, various approaches based on first and nth-order partial reactions in the summative model of pseudocomponents are employed in order to determine the best kinetic parameters that describe the experiments both at linear and stepwise heating programs and for experiments coming from different sources. A common set of activation energies, coming from the evaluation of water-washed samples, is applied for the kinetic description of all the types of experiments performed along this thesis.Mass spectrometry, simultaneously coupled to thermogravimetry, is used as the volatile product analysis technique. A chemometric tool is applied to help in elucidating the specific influence of the macromolecular composition of the samples on the thermal decomposition and on the product distribution. Making use of calibration data, we estimate the individual production of the major volatile species from slow pyrolysis. Then, an approximation of the vapor-phase product distribution is added to the kinetic mechanism.We are also interested in the study of the secondary biomass pyrolysis. Differential scanning calorimetry is the technique used to observe the information traced by the heat of pyrolysis on the primary and secondary decomposition. Additionally, we analyze results from a Fourier transform infrared spectroscopy device coupled with thermogravimetry, in order to assess the secondary phenomena by considering the evolution profiles of the volatile products, as well. Finally, we test the ability of the best kinetic approach, from the previous kinetic analysis, to describe the global mass loss under conditions that clearly favor secondary vapor-solid interactions.Overall, this research work represents a comprehensive and thorough thermokinetic study of biomass pyrolysis that approaches the thermal behavior by recognizing the connections between different chemical phenomena making up the pyrolytic process. The kinetic proposal, finally built up in this thesis, is a contribution for understanding the process as a whole. Additionally, it can be considered as a first step toward its extension to practical applications, where additional chemical and transport phenomena need to be incorporated

El autoritarismo de derecha, la orientación a la dominancia social, la empatía, y la orientación hacia los valores materiales como predictores del prejuicio intergrupal en Argentina

The study of individual differences in prejudice has received significant attention in the psychological literature. However, very little research has been published on Latin American countries. To address this gap, 300 residents from the general population in Mar del Plata, Argentina, were surveyed. The main objective of the study was to assess the contributions of right-wing authoritarianism (RWA), social dominance orientation (SDO), empathy, and materialistic value orientation (MVO) to the prediction of ethnic prejudice, heterosexism, hostile sexism, and benevolent sexism after controlling for impression management and socio demographic factors. Multiple regression analyses identified RWA as the most relevant variable predicting intergroup prejudice; as it contributed to the prediction of all dependent variables. The contributions of SDO, empathy, and MVO depended on the specific type of prejudice assessed. SDO and empathy made a significant statistical contribution to the prediction of ethnic prejudice and heterosexism; while a materialistic value orientation contributed only to the prediction of hostile sexism.El estudio de las diferencias individuales en el prejuicio ha recibido mucha atención en la literatura psicológica. Sin embargo, han sido muy pocas las publicaciones de investigaciones en Latinoamérica. Objetivo : evaluar las contribuciones del autoritarismo de derecha (RWA), la orientación a la dominancia social (SDO), la empatía, y la orientación hacia valores materiales (MVO) a la predicción del prejuicio étnico, el heterosexismo, el sexismo hostil, y el sexismo benevolente luego de controlar para el manejo de impresión y los factores socio-demográficos. Método: fueron encuestados 300 participantes en Mar del Plata, Argentina, con edad entre 19 y 71 años, a través de las Escalas de Autoritarismo de Derecha, Escala de Valores Materiales, y Actitudes hacia la Homosexualidad. Resultados: Los análisis de regresión múltiple identificaron al RWA como la variable más importante en la predicción de prejuicio intergrupal; ya que aportó a la predicción de todas las variables dependientes. Las contribuciones de SDO, empatía, y MVO dependieron del prejuicio evaluado. La SDO y la empatía aportaron estadísticamente a la predicción del prejuicio étnico y el heterosexismo; mientras que la orientación hacia los valores materiales solamente a la predicción del sexismo hostil.Fil: Díaz Lázaro, Carlos. Walden University; Estados UnidosFil: Castañeiras, Claudia Elena. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: Ledesma, Ruben Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: Verdinelli, Susana. Walden University; Estados UnidosFil: Rand, Avonelle. Walden University; Estados Unido