Detection and Diversity Evaluation of Tetracycline Resistance Genes in Grassland-Based Production Systems in Colombia, South America

Grassland-based production systems use ∼26% of land surface on earth. However, there are no evaluations of these systems as a source of antibiotic pollution. This study was conducted to evaluate the presence, diversity, and distribution of tetracycline resistance genes in the grasslands of the Colombian Andes, where administration of antibiotics to animals is limited to treat disease and growth promoters are not included in animals’ diet. Animal (ruminal fluid and feces) and environmental (soil and water) samples were collected from different dairy cattle farms and evaluated by PCR for the genes tet(M), tet(O), tetB(P), tet(Q), tet(W), tet(S), tet(T), otr(A), which encode ribosomal protection proteins (RPPs), and the genes tet(A), tet(B), tet(D), tet(H), tet(J), and tet(Z), encoding efflux pumps. A wide distribution and high frequency for genes tet(W) and tet(Q) were found in both sample types. Genes tet(O) and tetB(P), detected in high frequencies in feces, were detected in low frequencies or not detected at all in the environment. Other genes encoding RPPs, such as tet(M), tet(S), and tet(T), were detected at very low frequencies and restricted distributions. Genes encoding efflux pumps were not common in this region, and only two of them, tet(B) and tet(Z), were detected. DGGE–PCR followed by comparative sequence analysis of tet(W) and tet(Q) showed that the sequences detected in animals did not differ from those coming from soil and water. Finally, the farms sampled in this study showed more than 50% similarity in relation to the tet genes detected. In conclusion, there was a remarkable presence of tet genes in these production systems and, although not all genes detected in animal reservoirs were detected in the environment, there is a predominant distribution of tet(W) and tet(Q) in both animal and environmental reservoirs. Sequence similarity analysis suggests the transmission of these genes from animals to the environment

Modelo de valoración de la satisfacción de los usuarios del sistema de información de costos

The satisfaction of internal users with the information provided by cost systems is rarely assessed. Nevertheless, cost information systems fulfill an important function in business management because they show indicators that are essential for controlling and making decisions regarding resources and production processes, servuction, management, marketing, and distribution. There are tools, such as cost auditing, that can be used to assess the reliability of the data provided by a cost information system. However, they cannot measure information users’ satisfaction. Therefore, this paper proposes a model questionnaire to measure internal users’ satisfaction of cost information systems. This instrument can examine the reliability and transparency of such systems to meet the information needs of all the key departments in decision-making and core processes at companies. This study adopted a qualitative approach and a descriptive method based on a literature review. Additionally, the design (systematization) of the questionnaire was submitted to validation by experts, which showed a strong correlation (Cronbach’s alpha = 0.951). The results revealed that the questionnaire presented here is useful to determine internal users’ satisfaction degree of a cost information system. Said questionnaire is also a low-cost tool for an early assessment of that satisfaction, which can provide clear evidence of the operation of the cost information system and elements to establish if a cost audit is needed. With the above, is get a tool with high level of consistency and reliability that favour to assurance information for tend to be quality in strategic decision-making. In addition, the validation with experts inferred that the tool adequately measures the degree of satisfaction of the internal users of the cost information system.La satisfacción de los usuarios internos sobre la información entregada por los sistemas de costeo, rara vez es evaluada. Esta información cumple una función importante en la administración de las organizaciones, pues muestra indicadores que son transcendentales para el control y la toma de decisiones sobre los recursos y procesos de producción, servucción, administración, mercadeo y distribución. Existen instrumentos como la auditoría de costos que evalúan la confiabilidad de los datos suministrados por el sistema de costos. No obstante, estas no pueden medir el grado de satisfacción de los usuarios de la información. Por ello, el propósito de este documento fue plantear un modelo de cuestionario para el grado de satisfacción del usuario interno del sistema de información de costos. Este instrumento pueda examinar la confiabilidad y transparencia para el cumplimiento de las necesidades de información de cada uno de los departamentos claves en los procesos decisionales y misionales de las empresas. Este estudio se desarrolló bajo un enfoque cualitativo, con método descriptivo, soportado con una revisión de literatura. Además, el diseño (sistematización) del cuestionario se sometió a una validación por expertos, mostrando una correlación fuerte (Alfa de Cronbach = 0,951). Los resultados mostraron que el cuestionario presentado es útil para determinar el grado de satisfacción del usuario interno del sistema de información de costos. Dicho cuestionario presentado aquí es una herramienta de bajo costo, para evaluar en primera instancia la satisfacción, cuestión que podría dar indicios claros sobre el funcionamiento del sistema de información de costos y proveer elementos para establecer la necesidad de una auditoría de costos. Con esto se obtiene un instrumento con un alto nivel de consistencia y confiabilidad que favorece el aseguramiento de la información para propender a la calidad en la toma de decisiones estratégicas. Además, la validación con expertos infiere que la herramienta mide de manera adecuada el grado de satisfacción de los usuarios internos del sistema de información de costos

Boletín Económico Regional : Centro, I trimestre de 2014

Los resultados logrados por la economía de la región Centro durante el primer trimestre de 2014 no fueron homogéneos. De esta manera, se registró un comportamiento bastante positivo en las captaciones y colocaciones del sistema financiero, al igual que en el mercado inmobiliario donde se revirtió la tendencia decreciente, así como en el mercado laboral al reducirse la tasa de desempleo. Los resultados fueron favorables, aunque en menor magnitud que los anteriores, en el otorgamiento de créditos por parte de Finagro, en el área aprobada para construcción, en la actividad comercial, incluida la venta de vehículos nuevos, y en la producción de sal. Entre tanto, la variación del nivel de precios fue disímil, mientras que arrojaron un balance desfavorable los principales cultivos transitorios por el desajuste climático, las exportaciones e importaciones, así como la extracción de petróleo

Boletín Económico Regional : Centro, IV trimestre de 2014

En 2014 algunas actividades económicas de la región Centro presentaron resultados no muy alentadores. De esta manera, el área para construcción experimentó una reducción anual, al igual que la extracción de petróleo, así como las exportaciones e importaciones; también aumentó el desempleo en Ibagué y Florencia y se produjo un alza generalizada en los niveles de inflación. No obstante, se registraron avances en sectores como el financiero, donde captaciones y colocaciones lograron una importante elevación anual, así como en el apalancamiento otorgado por Finagro. En el último trimestre del año, el incremento de las lluvias permitió que repuntaran las siembras y mejorara el desarrollo vegetativo de los principales cultivos transitorios; el comercio mostró en el Tolima un crecimiento lento, mientras que la venta de vehículos nuevos en Tolima, Huila y Caquetá reportó un aumento anual significativo

Boletín Económico Regional : Centro, I trimestre de 2015

En el primer trimestre de 2015 la economía de la región Centro presentó resultados diversos en sus indicadores; tal es el caso del financiamiento al sector agropecuario que logró un avance significativo, así como el área licenciada para construcción, en especial la destinada a la edificación de unidades residenciales, mientras que las operaciones del sistema financiero obtuvieron un crecimiento real. Fueron favorables, aunque en menor magnitud que las anteriores, las ventas al exterior de bienes no tradicionales y la producción de sal que se extrae en Cundinamarca. De otro lado, el comercio interno registró estabilidad, aunque la comercialización de vehículos avanzó positivamente. En contraste, cayó la explotación de petróleo, el transporte de pasajeros, al igual que las importaciones, mientras que la tasa de desempleo en las ciudades capitales se mantuvo por encima de la media nacional

Boletín Económico Regional : Centro, IV trimestre de 2015

En el último trimestre de 2015, y prácticamente durante el año, la economía de la región Centro presentó resultados disímiles. Así, la actividad edificadora logró crecer de manera importante tanto trimestral como anualmente, consiguiendo superar el promedio nacional; entre tanto, los créditos de Finagro, aunque avanzaron en el año, se estancaron en los tres últimos meses; la producción de petróleo se redujo de manera generalizada, y la de sal cayó, al igual que las exportaciones y las importaciones. El comercio se situó durante el trimestre en terreno negativo al descender el valor de las ventas, al igual que lo ocurrido en la comercialización de vehículos nuevos. Los usuarios del transporte terrestre salidos de Ibagué y Neiva mostraron una reducción en el agregado anual, y la movilización de viajeros aéreos en vuelos nacionales avanzo en términos anuales (2,5%)

Boletín Económico Regional : Centro, IV trimestre de 2006

Análisis del desarrollo de la estructura económica de la región Centro Sur de Colombia conformada por los departamentos de Tolima, Cundinamarca, Huila y Caquetá durante el período 2005-2006

Caracterización de la reacción citoquímica de Mycobacterium tuberculosis con rojo neutro : correlación con el contenido de sulfolípido /

Consultable des del TDXTítol obtingut de la portada digitalitzadaCARACTERIZACIÓN DE LA REACCIÓN CITOQUÍMICA DE Mycobacterium tuberculosis CON ROJO NEUTRO. CORRELACIÓN CON EL CONTENIDO DE SULFOLÍPIDO La virulencia de M. tuberculosis se ha relacionado con diversas características fenotípicas y entre las menos exploradas se encuentran las reacciones citoquímicas con diferentes colorantes básicos. Los estudios más prometedores en este campo han sido los que describen la tinción de las cepas virulentas de M. tuberculosis con rojo neutro (RN). El principal objetivo de este trabajo ha sido evaluar el papel desempeñado por los glicolípidos de pared, especialmente sulfolípidos (SL), en la tinción de las cepas virulentas de M. tuberculosis con RN. Además, se planteó conocer la región genómica de la cepa virulenta H37Rv implicada en la fijación de RN (RN+). Se compararon los perfiles glicolipídicos de la superficie de cepas RN+ y RN- de M. tuberculosis mediante cromatografía en columna de intercambio iónico (DEAE) y de capa fina (CCF). También se purificaron diferentes fracciones glicolípidicas de la superficie y se analizó su capacidad de fijar RN (NRA). No se encontró una relación directa entre el contenido de SL, PL y PIM, y el carácter RN+ de M. tuberculosis. Simultáneamente se buscaron las condiciones óptimas para la tinción de micobacterias con RN en tubo de ensayo, y se desarrolló un método para fijar colonias de micobacteria en placas de agar Middlebrook 7H10-OADC modificado. Una combinación de los dos anteriores permitió desarrollar una técnica para la tinción con RN de colonias de micobacteria en placa de cultivo. Adicionalmente se desarrolló un método para la detección rápida de SL en cepas de M. tuberculosis por medio de cromatografía en capa fina de dos dimensiones (CCF-2D), y otro para diferenciar M. tuberculosis H37Ra, de H37Rv y aislados clínicos mediante tinción citoquímica. Por otra parte se construyó una genoteca M. tuberculosis H37Rv en el cósmido «shuttle» pYUB18, la que se transformó en la cepa RN- Mycobacterium smegmatis mc2155 y se cribó mediante tinción con RN en placas de cultivo. Se identificaron tres colonias RN+ de M. smegmatis mc2155, a partir de las cuales se dedujo mediante secuencia nucleotídica, complementación de M. smegmatis mc2155 y análisis de restricción, que la región del genoma de M. tuberculosis H37Rv comprendida entre los marcos abiertos de lectura Rv0570 a Rv0577 estarían posiblemente implicados en el carácter RN+ de las cepas de M. smegmatis mc2155 que fijaron RN.The M. tuberculosis virulence has been correlated with different phenotypic markers, being the cytochemical reactions with basic dyes the less explored. In this field, the most promising studies have been the staining of M. tuberculosis virulent strains with neutral red (RN). The main objective of this work has been to study the role of cell-surface glycolipids, mainly sulfolipids (SL) in the staining of the virulent strains of M. tuberculosis with NR. Additionally, the genomic region possibly involved in the RN+ phenotype of M. tuberculosis H37Rv was searched. The glycolipidic cell-surface profiles of M. tuberculosis strains that fix or not RN (RN+, or RN-) were compared through ionic interchange column chromatography (DEAE) and thin layer chromatography (CCF). Also, different cell-surface glycolipidic fractions were purified, and their ability for NR fixation (NRA) was analyzed. No direct correlation between the RN+ phenotype and the SL, phospholipids and phosphatidilinositolmannosides (PIM) content were found. The best conditions for NR staining of M. tuberculosis cells in screw-cap tubes were optimized. At the same time a method for fixation of mycobacterial colonies in Middlebrook 7H10-OADC modified agar was developed. These results allowed the design a technique for NR staining of colonies growth in agar plates. In addition, a method for rapid detection of SL in M. tuberculosis strains by two-dimensional thin layer chromatography (CCF-2D), and other for the differentiation between M. tuberculosis H37Ra from H37Rv and clinical isolates, were developed. By the other hand, a library of M. tuberculosis H37Rv was constructed in the «shuttle» cosmid pYUB18 and transformed in the (RN-) Mycobacterium smegmatis mc2155 strain. Three RN+ colonies of M. smegmatis mc2155 (pYUB18::H37Rv) were found by NR staining. Using DNA sequence, complementation of M. smegmatis mc2155, and enzyme restriction analysis, that the M. tuberculosis H37Rv genomic region within the open reading frames Rv0570 to Rv0577 could be possibly involved in the RN+ phenotype of the M. smegmatis mc2155 (pYUB18::H37Rv) that fixed NR

Estado Actual, Retos y Algunos Aportes de la Investigación en el Estudio de la Tuberculosis

La tuberculosis (TB) es una de las enfermedades infecciosas que causa el mayor número de muertes. Aproximadamente dos mil millones de personas se encuentra infectadas por Mycobacterium tuberculosis, una micobacteria que cada año produce cerca de ocho millones de nuevos casos de TB y dos millones de muertes al rededor del mundo. En las últimas décadas la incidencia de las infecciones producidas por micobacterias ha aumentado de forma dramática, en especial las causadas por M. tuberculosis. La Organización Mundial de la Salud, en su informe anual del 2006 alerta que a pesar de los avances realizados a nivel global para controlar las infecciones causada por micobacterias, su incidencia continúa aumentando, y la considera junto con la malaria y el SIDA como las denominadas ¿enfermedades ligadas a la pobreza¿. El diseño de una nueva vacuna más eficiente que la actual BCG, el desarrollo de métodos de diagnóstico rápido, la búsqueda de nuevos agentes antituberculosos y el control de la TB latente son las prioridades actuales de la investigación en este campo. En Colombia las infecciones por micobacterias se consideran un importante problema de salud pública. El informe del Instituto Nacional de Salud de 2006, ¿Vigilancia de la Resistencia de Mycobacterium tuberculosis a los Medicamentos. Colombia 2004-2005¿, alerta sobre un incremento sostenido de la TB en Colombia a partir del año 1997. Para el 2005 la tasa de incidencia se valoró en 22 casos por 100.000 habitantes, pero desafortunadamente existe un alto subregistro por lo que supondría que en nuestro país la incidencia de TB podría realmente alcanzar hasta 53 casos por 100.000 habitantes. La incidencia de las infecciones por micobacterias se incrementa principalmente por la coinfección con el virus de inmunodeficiencia humana (VIH), la aparición de cepas de micobacterias resistentes a los compuestos antituberculosos, en especial las extremadamente resistentes (XDR) y la TB latente. En Colombia en el año 2008 se reportó el primer caso de TB causado por la cepa XDR Beijing, que ha producido graves epidemias en muchos de los países que se ha detectado, lo que sitúa al país en alerta sanitaria frente a la TB multiresistente. Aproximadamente solo un 10% de las personas infectadas de TB desarrollan la enfermedad, permaneciendo la micobacteria en estado latente en el resto de la población. Anualmente entre el 8-10% de la población con infección latente desarrolla TB activa debido principalmente a la coinfección con VIH. En la actualidad se conoce muy poco sobre la fisiología y los mecanismos moleculares relacionados con el metabolismo del bacilo latente, su capacidad para neutralizar la acción de los agentes quimioterapeúticos, la naturaleza de su regulación EDITORIAL Estado ac tua l, retos y algunos aportes de la investigac ión en el estudio de la tuberculosis NOVA - Publicac ión Científica EN CIENCIAS BIOMÉDICAS - ISSN:1794-2470 Vo l.6 No. 9 ENERO - JUNIO DE 2008:101-212 12 genética, así como la interacción hospedero-patógeno que permite su persistencia en la lesión tuberculosa o granuloma. Se han observado importantes alteraciones en la microestructura de la pared celular y en la tinción de Ziehl-Neelsen de las micobacterias latentes, que sugieren posibles cambios en la composición lipídica de la pared celular, incluidos glicolípidos, que tienen un papel relevante en la modulación de la respuesta inmune y en la virulencia de las micobacterias. Los análisis genómicos han mostrado una variedad de genes relacionados con la entrada de la micobacteria al estado latente, entre ellos dos un regulador trascripcional global que se sobreexpresa en condiciones experimentales de latencia. El tratamiento contra la TB consiste básicamente en una combinación de fármacos que utilizados de forma correcta controlan la enfermedad. Sin embargo, el abandono del mismo por parte de los pacientes, las fallas en el suministro y calidad de los antibióticos durante su prolongada duración, han propiciado la aparición de cepas de micobacteria resistentes a los antibióticos. Entre las micobacterias, incluidos los patógenos humanos M. tuberculosis y el oportunista M. avium, existe un elevado porcentaje de cepas que presenta resistencia a los antibióticos. El nivel de resistencia que presentan las micobacterias depende de factores fisiológicos como el estado de aerobiosis o anaerobiosis, factores genéticos como la adquisición horizontal de genes de resistencia, mutaciones, etc. que constituyen la denominada resistencia adquirida; y finalmente la resistencia intrínseca, innata, o natural. Esta última incluye la barrera de permeabilidad formada por la muy hidrofóbica pared celular de las micobacterias, los mecanismos de resistencia endógenos mediados por las bombas de eflujo, y cualquier otro mecanismo que confiera un nivel de resistencia basal frente a los antibióticos. En la actualidad el fenómeno de cepas de M. tuberculosis extremadamente resistente a los antibióticos (XDR-TB) obliga al diseño de nuevos fármacos, de lo contrario las opciones clínicas de tratamiento serán muy limitadas en el futuro. Tampoco existen fármacos amables para controlar la TB latente. La búsqueda de nuevas alternativas terapéuticas para el control de la TB requiere el conocimiento de nuevas dianas celulares esenciales y el entendimiento de sus mecanismos de acción. Este objetivo implica conocer las bases moleculares, la evolución y diseminación de la resistencia, la persistencia y la latencia las micobacterias, lo que facilitaría el diseño de nuevos fármacos efectivos para controlar las diferentes formas de infección tuberculosa. Actualmente el grupo de Bioquímica y Biología Molecular de las Micobacterias (BBMM) de la Universidad Nacional de Colombia contribuye al estudio de los mecanismos moleculares relacionados con la infección y diagnóstico de las micobacterias. La aproximación experimental desarrollada por nuestro grupo de investigación consiste básicamente en el estudio de componentes genéticos y estructurales relacionados con la latencia de las micobacterias, la búsqueda de nuevas dianas terapéuticas, evaluación de nuevos antituberculosos y el estudio de los mecanismos de resistencia de las micobacterias a los antibióticos. Respecto al diagnóstico nuestro trabajo se ha enfocado en el desarrollo de un método para detectar y diferenciar Mycobacterium colombiense, una micobacteria no tuberculosa perteneciente al complejo M. avium (MAC) la que está relacionada con una alta incidencia de infección en pacientes son SIDA en Bogotá. Hasta el momento no existe un método de diagnóstico rápido y fácil para diferenciar M. colombiense de las demás micobacterias del MAC, el que podría ser aplicado en pacientes con sospecha de micobacteriosis en nuestro país. 13 En el estudio de nuevos antituberculosos el grupo investiga en la potencial utilidad de péptidos antibióticos para el control de las micobacterias. El resultado de nuestras investigaciones ha mostrado que algunos péptidos de respuesta innata de diferentes organismos poseen actividad antimicobacteriana. En la actualidad estudiamos el mecanismo de acción de estos péptidos contra las micobacterias, y en un futuro utilizar la ingeniería de péptidos para incrementar su actividad. Por otra parte, también investigamos la búsqueda de nuevas dianas terapéuticas. Estudiamos enzimas relacionadas con la homeostasis celular como posibles blancos terapéuticos para el diseño y/o búsqueda de nuevos compuestos antituberculosos. En el estudio de la infección latente trabajamos en la búsqueda de marcadores lipídicos de la pared micobacteriana asociados a condiciones experimentales de latencia. La idea es relacionar las variaciones estructurales de la micobacteria hipóxica, forma experimental de latencia, con antígenos que caractericen las bacterias latentes. Utilizando técnicas cromatográficas hemos encontrado variaciones en el contenido glicolipídico de M. tuberculosis crecido en condiciones de hipoxia respecto a bacterias crecidas en completa aireación, lo que sugiere posibles cambios estructurales en la pared celular y en la virulencia de las micobacterias en condiciones experimentales de latencia. La identificación de componentes estructurales asociados al estado latente de las micobacterias ayudaría a conocer los mecanismos utilizados por M. tuberculosis para persistir en las lesiones tuberculosas y hacerse invisible al sistema inmune. Los marcadores lipídicos relacionados a las micobacterias latentes podrían ser utilizados para desarrollar estrategias encaminadas a estimular el sistema inmune y de esta forma lograr combatir de una manera más efectiva la infección latente por micobacterias. Para finalizar, los esfuerzos en salud pública y en la investigación clínica y básica relacionada con las infecciones causadas especialmente por M. tuberculosis, redundarán en el bienestar de las comunidades afectadas, las que se concentran principalmente en países en vías de desarrollo como el nuestro, en los que todavía se requiere de mucho trabajo para el control de la TB y en general de las infecciones causadas por micobacterias

Mycobacterium tuberculosis P-Type ATPases: Possible Targets for Drug or Vaccine Development

Tuberculosis (TB) has been the biggest killer in the human history; currently, Mycobacterium tuberculosis (Mtb) kills nearly 2 million people each year worldwide. The high prevalence of TB obligates the identification of new therapeutic targets and the development of anti-TB vaccines that can control multidrug resistance and latent TB infections. Membrane proteins have recently been suggested as key targets for bacterial viability. Current studies have shown that mycobacteria P-type ATPases may play critical roles in ion homeostasis and in the response of mycobacteria to toxic substances in the intraphagosomal environment. In this review, we bring together the genomic, transcriptomic, and structural aspects of the P-type ATPases that are relevant during active and latent Mtb infections, which can be useful in determining the potential of these ATPases as drug targets and in uncovering their possible roles in the development of new anti-TB attenuated vaccines