Synchronic study of the influence of ovine grazing and installation of protective fencing on the vegetation of the Luberon calcareous grassy areas (Provence, France)

Les auteurs étudient les effets sur la végétation de la mise en défens contre le pâturage ovin, sur une série de petits enclos grillagés, en deux sites du Parc naturel régional du Luberon (Provence, SE-France). Les deux sites présentent des problématiques légèrement différentes : dans le Petit Luberon, les enclos ont été posés lors de la reprise des activités pastorales qui avaient été interrompues ; dans le Grand Luberon, ils ont été posés alors que le pâturage n’a jamais cessé d’être pratiqué. Une approche synchronique a consisté à comparer l’intérieur de l’enclos avec l’extérieur, considérant que le milieu était homogène au moment de la pose. La comparaison est effectuée à plusieurs niveaux: la dérive physionomique, la dérive floristique et la dérive écologique. Pour cela deux méthodes complémentaires de traitement numérique sont utilisées. Un aspect patrimonial est également abordé sous l’angle de la biogéographie.The authors study the effects on vegetation caused by protective fencing against ovine grazing, on a series of small wire-fenced enclosures located on two sites of the Luberon regional nature Park (Provence, South-East France). The two sites present slightly different sets of problems : in the Petit Luberon massif, enclosures were put in place during the resumption of grazing activities, that were interrupted in the past ; in the Grand Luberon massif they were put in place on spots where grazing had never stopped being practised. A synchronic approach consisted in comparing the inside of the enclosure with the outside, taking into account that the environment was homogeneous at the time of the setting up. The comparison is made at several levels : physiognomic drift, floristic drift and ecological drift. In order to do so, two complementary numerical data processing methods are used. A patrimonial aspect is also dealt with

Burkholderia anthina sp. nov. and Burkholderia pyrrocinia , two additional Burkholderia cepacia complex bacteria, may confound results of new molecular diagnostic tools

Nineteen Burkholderia cepacia -like isolates of human and environmental origin could not be assigned to one of the seven currently established genomovars using recently developed molecular diagnostic tools for B. cepacia complex bacteria. Various genotypic and phenotypic characteristics were examined. The results of this polyphasic study allowed classification of the 19 isolates as an eighth B. cepacia complex genomovar ( Burkholderia anthina sp. nov.) and to design tools for its identification in the diagnostic laboratory. In addition, new and published data for Burkholderia pyrrocinia indicated that this soil bacterium is also a member of the B. cepacia complex. This highlights another potential source for diagnostic problems with B. cepacia -like bacteria.Peer Reviewedhttp://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/71564/1/j.1574-695X.2002.tb00584.x.pd

Modelling the distribution and compositional variation of plant communities at the continental scale

P. 978-990Aim: To investigate whether (1) environmental predictors allow to delineate the distri- bution of discrete community types at the continental scale and (2) how data complete- ness influences model generalization in relation to the compositional variation of the modelled entities.S

Échantillonnage, paramètres, hiérarchie, contraintes de l'information écologique, en vue de la protection des espaces : l'exemple des ZNIEFF en région Provence-Alpes-Côte d'Azur (P.A.C.A.)

The goal of the Environmental Ministry to establish zones of ecological, faunal and floral importance using a multidisciplinary approach in each region based on a common national methodology encountered several difficulties in the Provence-Alps-French Riviera (PACA) region due primarily to : - contraints for sampling and parameters to be sampled ; - problems of the size of the ZNIEFF (National Zones of Ecological, Faunal and Floral Importance), i.e. the scale, and the ecological links, the organizational level of information within each zone ; - reflexions on unit structure, and thus on the zoning considering the differences which exist, particularly for fauna, between the biology of, for example, invertebrate populations and that of the large predatory birds. The authors who analyzed these constraints nevertheless propose a trial ranking of the ZNIEFF which includes : * either classic concepts for sectors with a large altitudinal range (altitudinal-spatial variability, exposure, topography, main dynamic units) or for geopedological structures (nature of rock, microtopography, soil catena)-(sector ZNIEFF) ; * or the concept of ecocomplexes for ZNIEFF which had microregional distributions where several interactive ecosystems were included within one zone and whose ecological ecosystems were well-characterized with levels of intrasystem or intersystem heterogeneities depending on the exchange or transfer situations. In conclusion, the authors examine several different points : - ZNIEFF and land management, particularly on the coastline where building and tourist pressures are high ; - ZNIEFF and non-usage often due to rural depopulation in a large number of territories where crucial problems of management and diversity need to be dealt with. An area for reflexion appears on how to manage diversity in new dynamic systems which are in the process of being installed (fruticeae and preforests) and which make highlyrich biological environments commonplace.L'objectif du Ministère de l'Environnement d'établir dans chaque région, par une approche multidisciplinaire, des zones naturelles d'intérêt écologique, faunistique et floristique, à partir d'une méthodologie nationale commune, a rencontré plusieurs difficultés en région PACA, liées principalement : - à des contraintes d'échantillonnage et de paramètres à échantillonner ; - à des problèmes de taille des ZNIEFF, et donc d'échelle, et, au sein de chacune d'elle, de mailles et de niveaux d'organisation de l'information ; - à des réflexions sur la structuration des unités et donc sur le zonage compte tenu des disparités existant, en particulier pour la faune, entre la biologie des populations d'invertébrés et celle de grands rapaces par exemple. Les auteurs, qui ont analysé ces contraintes, proposent néanmoins un essai de classement des ZNIEFF en prenant en compte : * soit des concepts classiques pour les secteurs de large amplitude altitudinale (variabilité altitudino-spatiale, exposition, topographie, principales unités dynamiques) ou pour les structures géopédologiques (nature de la roche, microtopographie, catena de sols) - (ZNIEFF sectorielles). * soit le concept d'écocomplexes pour les ZNIEFF répondant à des répartitions microrégionales et réunissant, dans une zone, plusieurs écosytèmes interactifs et dont les infrastructures écologiques sont bien caractérisées avec des niveaux d'hétérogénéités intrasystèmes ou intersystèmes suivant les situations d'échanges ou de transfert. En conclusion, les auteurs abordent diverses questions : - ZNIEFF et aménagement notamment sur le littoral où les pressions du bâti et la fréquentation sont fortes ; - ZNIEFF et non usage en raison souvent de la dépopulation de très nombreux territoires en déprise rurale où se posent des problèmes aigus de gestion pour le maintien de la diversité. Une réflexion se dessine : comment gérer la diversité dans les nouveaux systèmes dynamiques qui se mettent en place (fruticées et préforêts) qui banalisent des milieux biologiquement très riches ?Barbero Marcel, Brisse Henry, Quézel Pierre. Échantillonnage, paramètres, hiérarchie, contraintes de l'information écologique, en vue de la protection des espaces : l'exemple des ZNIEFF en région Provence-Alpes-Côte d'Azur (P.A.C.A.). In: Ecologia mediterranea, tome 15 n°3-4, 1989. pp. 33-46

La flore probable : un mode d'expression des gradients écologiques en France

Corrigendum à l'article [C. R. Biologies 336 (2013) 73-81 ; doi:10.1016/j.crvi.2013.02.003], C. R. Biologies (2013), http://dx.doi.org/10.1016/j.crvi.2013.05.002International audienceL'application du critère de fidélité des plantes aux plantes sur plus de quatre millions d'observations floristiques en France a permis de déterminer numériquement les plantes écologiquement discriminantes de 215 000 relevés phytosociologiques. Parmi ces plantes discriminantes, certaines sont absentes des relevés mais peuvent avoir une forte probabilité de présence : ces plantes sont appelées " plantes probables " et elles constituent la " flore probable " du territoire étudié. Trois exemples montrent que l'étude de la répartition géographique des plantes probables traduit les gradients de variables écologiques à l'échelle de la France de façon plus nette qu'à partir des seules observations botaniques. En effet, cette méthode permet de pallier les discontinuités d'observations de taxons dont l'absence peut être liée à des facteurs historiques et/ou anthropiques

The phytosociological database SOPHY as the basis of plant socio-ecology and phytoclimatology in France

Article available on; http://www.biodiversity-plants.de/biodivers_ecol/publishing/b-e.00074.pdf Special Volume: Vegetation databases for the 21st century, edited by Jürgen Dengler, Jens Oldeland, Florian Jansen, Milan Chytrý, Jörg Ewald, Manfred Finckh, Falko Glöckler, Gabriela Lopez-Gonzalez, Robert K. Peet & Joop H.J. SchaminéeInternational audienceThis article draws attention to the botanical and ecological database SOPHY (GIVD ID EU-FR-003), which is hosted at the University Paul Cézanne at Marseille, France. Initiated in the 1970es, this database was first dedicated to the study of the relationships between plants and climate (phytoclimatology) at the scale of France. In the early 1980s it was central to the development of socio-ecology, which studies the statistical relationships between plant species. At present the SOPHY database contains more than 200,000 plots located in France and in some areas close to the French border. The managers of the database have developed methods and algorithms dedicated to the control of data quality and to the characterisation of socio-ecology and phytoclimatology. The principles and results obtained in these two domains using the SOPHY database are presented

Les phytoclimats de France : classification probabiliste de 1874 bio-indicateurs du climat = The phytoclimates of France : probabilistic classification of 1874 bio-indicators of the climat

International audienceCet article présente une synthèse des relations entre plantes et climats à l'échelle de la France grâce à une classification probabiliste de 1874 taxons bio-indicateurs. Cette classification définit des groupes de plantes indicatrices des variables du climat, appelés phytoclimats, exprimant des gradients climatiques. Au total l'analyse a produit 210 groupes phytoclimatiques répartis en dix niveaux de synthèse. Les deux premiers nivaux de synthèse montrent une distinction entre deux grands phytoclimats témoignant de l'effet des masses marines et de l'altitude. L'analyse du troisième niveau de synthèse de la classification montre des phytoclimats particuliers qui seraient difficilement identifiables par la seule étude de la superposition entre territoires floristiques et climatiques. Cette classification permet ainsi de sélectionner des taxons indicateurs du climat dont le suivi ou l'estimation de la répartition devrait montrer l'effet des changements climatiques globaux sur les écosystèmes = This article presents a synthesis of the relationships between plants and climates at the scale of France, based on a probabilistic classification of 1874 bio-indicators. This classification defines plants groups that indicate the climate, named phytoclimates, expressing the climatic gradients in France. This classification shows 210 phytoclimatic groups distributed into ten cluster levels. The analysis of the various hierarchical levels shows two main phytoclimates testifying the importance of the marine masses and the altitude. The analysis of the third hierarchical level underlines particular phytoclimates which would not be easily recognizable by only analysing the overlapping of floristic and climatic territories. This classification allows one to select taxa that are indicators of the climate. The distribution monitoring or modeling of these taxa should show the effects of the global change on the ecosystem