Physical and Sexual Violence, Mental Health indicators, and treatment seeking among street-based population groups in Tegucigalpa, Honduras

To establish the prevalence of exposure to physical and sexual violence, mental health symptoms, and medical treatment-seeking behavior among three street-based subpopulation groups in Tegucigalpa, Honduras, and to assess the association between sociodemographic group, mental health indicators, and exposure to violence

Detection and functional characterization of a 215 amino acid n-terminal extension in the xanthomonas type III effector XopD

This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License.-- et al.During evolution, pathogens have developed a variety of strategies to suppress plant-triggered mmunity and promote successful infection. In Gram-negative phytopathogenic bacteria, the so- alled type III protein secretion system works as a molecular syringe to inject type III effectors (T3Es) into plant cells. The XopD T3E from the strain 85-10 of Xanthomonas campestris pathovar vesicatoria (Xcv) delays the onset of symptom development and alters basal defence responses to promote pathogen growth in infected tomato leaves. XopD was previously described as a modular protein that contains (i) an N-terminal DNA-binding domain (DBD), (II) two tandemly repeated EAR (ERF-associated amphiphillic repression) motifs involved in transcriptional repression, and (iii) a C-terminal cysteine protease domain, involved in release of SUMO (small ubiquitin-like modifier) from SUMO-modified proteins. Here, we show that the XopD protein hat is produced and secreted by Xcv presents an additional N-terminal extension of 215 amino acids. Closer analysis of this newly identified N-terminal domain shows a low complexity region rich in lysine, alanine and glutamic acid residues (KAE-rich) with high propensity to form coiled-coil structures that confers to XopD the ability to form dimers when expressed in E. coli. The full length XopD protein identified in this study (XopD1-760) displays stronger repression of the opD plant target promoter PR1, as compared to the XopD version annotated in the public databases (XopD216-760). Furthermore, the N-terminal extension of XopD, which is absent in XopD216-760, is essential for XopD type III-dependent secretion and, therefore, for complementation of an Xcv mutant strain deleted from XopD in its ability to delay symptom development in tomato susceptible cultivars. The identification of the complete sequence of XopD opens new erspectives for future studies on the XopD protein and its virulence-associated functions in planta. © 2010 Canonne et al.J.C. was funded by a grant from the French Ministry of National Education and Research. Mass Spectrometry work was supported by grants from the Fondation pour la Recherche Médicale (FRM; ‘Grands Equipements’), the Toulouse Midi-Pyrénées Génopole, the Midi-Pyrénées Regional Council (grant CR07003760) and the GIS-IBISA (Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie). This work was supported by a French ANR-Jeunes Chercheurs grant (ANR JC08_324792) to S.R.Peer Reviewe

Self-assembly of ATP synthase subunit c rings

AbstractSubunit c of the H+ transporting ATP synthase is an essential part of its membrane domain that participates in transmembrane proton conduction. The annular architecture of the subunit c from different species has been previously reported. However, little is known about the type of interactions that affect the formation of c-rings in the ATPase complex. Here we report that subunit c over-expressed in Escherichia coli and purified in non-ionic detergent solutions self-assembles into annular structures in the absence of other subunits of the complex. The results suggest that the ability of subunit c to form rings is determined by its primary structure

Estabilización del talud en el tramo Loma larga – Canchaque de la carretera Irsa Norte en la provincia de Huancabamba, 2021

En la presente investigación que tiene como título “ESTABILIZACIÓN DEL TALUD EN EL TRAMO LOMA LARGA – CANCHAQUE DE LA CARRETERA IRSA NORTE EN LA PROVINCIA DE HUANCABAMBA, 2021”, se observa que en el talud existen desprendimientos de sedimentos rocosos que perjudican la transitabilidad de los vehículos y transeúntes; la cual es la principal y única carretera que conecta con la ciudad de canchaque; asimismo se realizó actividades como estudios topográficos, estudio de mecánica de suelos, máxima precipitación, impacto ambiental y se determinó el diseño del talud para dicha zona y así determinar la mejor solución. El objetivo principal de dicha tesis es estabilizar el talud en el tramo loma larga, para ello se realizó las actividades mencionadas anteriormente. En la investigación se realizó los siguientes procedimientos del método de investigación científica que se inicia en la identificación de la zona de estudio en el que se diferencian la variable dependiente “estabilización del talud” e independiente “estudio topográfico, estudio de impacto ambiental y diseño geométrico”. Asimismo, utilizamos el método de Bishop en el software Geo5 para determinar el factor de seguridad. Asimismo se realizó los siguientes estudios para determinar qué tipo de geomalla utilizaremos para así evitar los deslizamientos de dicho talud y hallamos el factor de seguridad en el cual no cumplía con el establecidoIn the present investigation that has as title ""STABILIZATION OF THE SLOPE IN THE SECTION LOMA LARGA - CANCHAQUE OF THE IRSA NORTH ROAD IN THE PROVINCE OF HUANCABAMBA, 2021”, it is observed that on the slope there are landslides of rocky sediments that harm the passability of vehicles and pedestrians; which is the main and only road that connects with the city of Canchaque; Likewise, activities such as topographic studies, soil mechanics studies, maximum precipitation, environmental impact were carried out, and the design of the slope for said area was determined, thus determining the best solution. The main objective of this thesis is to stabilize the slope in the Loma Larga section, for which the activities mentioned above were carried out. In the investigation, the following procedures of the scientific research method were carried out, which begins in the identification of the study area in which the dependent variable ""slope stabilization"" and independent ""topographic study, environmental impact study and geometric design are differentiated. ”. Also, we use Bishop's method in Geo5 software to determine the factor of safety. Likewise, the following studies were carried out to determine what type of geogrid we will use in order to avoid landslides of said slope and we found the safety factor in which it did not comply with the established one.Tesi

Deposición de carbono en las superficies de películas delgadas de Fe sumergidas en tolueno en condiciones ambientales

Las nanoestructuras han sido muy estudiadas debido a su importancia en aplicaciones tecnológicas y biomédicas, como por ejemplo el recubrimiento de los sensores y biosensores. Estas necesitan ser recubiertas para su protección y/o funcionalización. Un estudio sobre las superficies de nanopartículas magnéticas y esféricas (MNPs) de Fe y Ni reveló que el tolueno actúa como catalizador de reacciones de condensación de los componentes aromáticos formando estructuras gigantes, policíclicas e irregulares, creando así una especie de recubrimiento de carbono. También se ha estudiado la posibilidad de formar recubrimientos con carbono en películas de hierro y permalloy (FeNi) en tiempos largos de tratamiento de 1 año. En el presente trabajo, debido a los resultados anteriores para las películas delgadas de hierro, se ha estudiado el desarrollo del proceso de deposición del grafeno defectuoso a temperatura ambiente, sobre las superficies de las películas delgadas de hierro en periodos de entre unos días hasta medio año aproximadamente. Se ha hecho un estudio en función del tiempo de inmersión en tolueno de las propiedades estructurales y magnéticas de las películas de hierro depositadas sobre vidrio. Las películas de hierro han sido preparadas por el método de pulverización catódica y después sumergidas en tolueno. Las técnicas utilizadas para la caracterización estructural han sido, la difracción de Rayos-X, los estudios de microscopia electrónica de barrido (SEM) y la perfilómetría. La caracterización magnética se ha hecho con un magnetómetro de Kerr (MOKE) y un magnetómetro vibrante (VSM). Las muestras cristalizaban en el sistema cúbico FCC del grupo espacial Fm-3m, con parámetro de celda de 3.5922Ǻ. El tamaño de dominio coherente para los índices de Miller (110) ha ido aumentando a lo largo del tratamiento. Para el índice de Miller (211) el tamaño de dominio coherente ha disminuido. Este comportamiento se explica tendiendo en cuenta el modelo propuesto en la literatura científica del proceso de formación de las estructuras de grafeno defectuoso. El análisis de las imágenes de SEM y los correspondientes datos de la emisión de Rayos-X han confirmado la presencia del carbono en la superficie. La cantidad del carbono en la superficie de las películas de hierro aumenta con el incremento del tiempo de inmersión en tolueno. Ha sido posible detectar la presencia del carbono en la superficie después de 9 días de inmersión (por lo tanto, el proceso de las estructuras policíclicas e irregulares es relativamente rápido). La deposición del carbono no resulta en una formación de estructura uniforme, así que cuanto más largo es el tratamiento, más complicadas son las estructuras. Como resultado del tratamiento superficial durante aproximadamente medio año, se observa un aumento de rugosidad de un micrómetro aproximadamente. La diferencia entre las medidas de MOKE y VSM para el campo coercitivo y la remanencia, se explica teniendo en cuenta el proceso de oxidación de la superficie y la interacción de algunas partes de la película de hierro con el tolueno, que pueden causar la relajación de las tensiones. La imanación de saturación obtenida para las películas después del tiempo de tratamiento de 135 días es de 192 emu por gramo. La disminución de la imanación de saturación es debida a la oxidación de las películas por el contacto con la atmósfera y el tolueno. En un cálculo aproximado se ha llegado a la conclusión que dicha capa tiene un espesor de 50 nm, repartida en dos capas de 25 nm. De todo lo anterior y de la base de análisis de las propiedades estructurales y magnéticas de las películas delgadas de hierro sumergidas en tolueno para hacer el tratamiento superficial a temperatura ambiente, se concluye, que las estructuras policíclicas e irregulares de grafeno defectuoso se forman relativamente rápido. El tratamiento con el tolueno no causa muchos cambios en la estructura y en las propiedades magnéticas, se trata de procesos superficiales. La modificación in situ de películas de hierro en tolueno, puede ser candidato a método de protección y funcionalización de los sensores magnéticos

The FtsK-like motor TraB is a DNA-dependent ATPase that forms higher-order assemblies

TraB is an FtsK-like DNA translocase responsible for conjugative plasmid transfer in mycelial Streptomyces Unlike other conjugative systems, which depend on a type IV secretion system, Streptomyces requires only TraB protein to transfer the plasmid as dsDNA. The ?-domain of this protein specifically binds to repeated 8-bp motifs on the plasmid sequence, following a mechanism that is reminiscent of the FtsK/SpoIIIE chromosome segregation system. In this work, we purified and characterized the enzymatic activity of TraB, revealing that it is a DNA-dependent ATPase that is highly stimulated by dsDNA substrates. Interestingly, we found that unlike the SpoIIIE protein, the ?-domain of TraB does not confer sequence-specific ATPase stimulation. We also found that TraB binds G-quadruplex DNA structures with higher affinity than TraB-recognition sequences (TRSs). An EM-based structural analysis revealed that TraB tends to assemble as large complexes comprising four TraB hexamers, which might be a prerequisite for DNA translocation across cell membranes. In summary, our findings shed light on the molecular mechanism used by the DNA-translocating motor TraB, which may be shared by other membrane-associated machineries involved in DNA binding and translocation.Funding: This work was supported by the Spanish Ministerio de Economia y Competitividad (MINECO) grants BFU2016-78521-R (to E.C. and I.A.) and Deutsche Forschungsgemeinschaft SFB766 (to G.M)

Conjugation Inhibitors and Their Potential Use to Prevent Dissemination of Antibiotic Resistance Genes in Bacteria

Antibiotic resistance has become one of the most challenging problems in health care. Bacteria conjugation is one of the main mechanisms whereby bacteria become resistant to antibiotics. Therefore, the search for specific conjugation inhibitors (COINs) is of interest in the fight against the spread of antibiotic resistances in a variety of laboratory and natural environments. Several compounds, discovered as COINs, are promising candidates in the fight against plasmid dissemination. In this review, we survey the effectiveness and toxicity of the most relevant compounds. Particular emphasis has been placed on unsaturated fatty acid derivatives, as they have been shown to be efficient in preventing plasmid invasiveness in bacterial populations. Biochemical and structural studies have provided insights concerning their potential molecular targets and inhibitory mechanisms. These findings open a new avenue in the search of new and more effective synthetic inhibitors. In this pursuit, the use of structure-based drug design methods will be of great importance for the screening of ligands and binding sites of putative targets.