Coordination, combination and extension of balanced samples

The cube method allows the selection of balanced samples on several auxiliary variables with equal or unequal inclusion probabilities. Practical implementation of the cube method has raised questions concerning the selection of a multi-phase balanced sampling design, the rebalancing of an unbalanced sampling design by completing it with another sample, the selection of a balanced sample from an unbalanced sample and the coordination of balanced samples. This paper provides a complete solution of all these problem

Effect of Calcium-Channel Blockade on the Aldosterone Response to Sodium Depletion and Potassium Loading in Man

Angiotensin II (Ang II) and potassium (K+) increase aldosterone (Aldo) production in vitro via Ca2+-dependent mechanisms. To determine the effects of Ca2+ antagonism in vivo, we examined the influence of nifedipine on the Aldo response to Na+ depletion and K+ loading in 11 healthy subjects. On the fifth day of a low-Na+/high-K+ diet (10 mmol Na+/100 mmol K+) the subjects were randomly given either nifedipine 30 mg po or placebo, and on the sixth day they received the alternative drug. KCl in 5% glucose was infused on days 5 and 6 from 10:00 to 12:00 AM(0.6 mmol/kg over 2 hours). Dexamethasone was given to suppress adrenal corticotrophic hormone. Plasma renin activity (PRA) and plasma Aldo were determined every 20 minutes. Nifedipine induced a rise in heart rate at 60 minutes but did not change blood pressure. During KCl/glucose infusions, plasma glucose increased significantly, but plasma K+ remained stable. PRA, but not baseline plasma Aldo, was stimulated by nifedipine. KCl provoked a significant and similar Aldo rise (P < .01) under placebo and nifedipine. Baseline Aldo/PRA ratio was reduced under nifedipine when compared to placebo (P < .01), whereas during KCl infusions this ratio was similarly elevated under placebo and nifedipine. We conclude that acute inhibition of slow Ca2+ channels does not interfere with K+-induced Aldo secretion in man, suggesting that adaptive mechanisms operate in vivo. Am J Hypertens 1988;1:245-24

Quel cadre légal pour une consommation durable ?

La consommation constitue un sujet tabou en droit. En Suisse, le cadre légal responsabilise chaque citoyen·ne en faisant primer l’initiative privée et les choix individuels sur l’intervention de l’État. Or, face aux crises environnementales et climatiques, la consommation durable relève essentiellement d’un choix libre du consommateur. Pour que ses choix soient responsables et éclairés, le législateur devrait fixer un cadre qui oriente l’ensemble de la chaîne de production et de commercialisation, depuis les modèles d’affaires jusqu’aux produits que ce soit sur la durée de vie de ceux-ci, leur impact environnemental ou leur dangerosité. Jusqu’ici ce sont essentiellement des mécanismes incitatifs qui ont été mis en place ; pour qu’ils exercent l’effet collectif attendu, ils devraient être complétés par des règles plus strictes. Théoriquement, le droit suisse offre déjà la possibilité d’agir pour mettre en place un cadre de vie durable. L’État pourrait ainsi intervenir sur les modes de production et de consommation ; il en va non seulement de la préservation de la biocapacité de la terre, mais également de l’égalité de traitement entre les producteurs et commerçants, afin d’éviter que celles et ceux qui souhaitent se montrer exemplaires ne soient discriminés dans le jeu de la concurrence.Cite as: Favre, Anne-Christine (2023) : Quel cadre légal pour une consommation durable ?, in : Académie suisse des sciences humaines et sociales : Wege zu einem nachhaltigen Konsum | Vers une consommation durable, (Swiss Academies Communications, 18, 5), pp. 78-84. https://doi.org/10.5281/zenodo.815855

Impact of the distance choice on clustering gene expression data using graph decompositions

The study of gene interactions is an important research area in biology and grouping genes with similar expression profiles to clusters is a first step towards a better understanding of their functional relationships. In Kaba et al. 2007, a new clustering approach was presented, using gene interaction graphs to model this data, and decomposing the graphs by means of clique minimal separators. A clique separator is a clique whose removal increases the number of connected components of the graph; the decomposition is obtained by repeatedly copying a clique separator into the components it defines, until only subgraphs with no clique separators are left: these subgraphs will be our clusters. The advantage of our approach is that this decomposition can be computed efficiently, is unique, and yields overlapping clusters. For that, the similarity between each pair of genes is estimated by a distance function, then a family of gene interaction graphs is constructed by choosing several thresholds, where an edge is added between two genes if their distance is below the threshold. Hereby, both the choice of the distance function and of the threshold influences the construction of the gene interaction graphs. In Kaba et al. 2007, several criteria are developed to select thresholds in an appropriate way. Here we discuss the impact of the choice of the distance function; our results suggest that this choice does not effect the final decomposition of the gene interaction graphs into clusters

Reversible inactivation of the transcriptional function of P53 protein by farnesylation

BACKGROUND: The use of integrating viral vectors in Gene therapy clinical trials has pointed out the problem of the deleterous effect of the integration of the ectopic gene to the cellular genome and the safety of this strategy. We proposed here a way to induce the death of gene modified cells upon request by acting on a pro-apoptotic protein cellular localization and on the activation of its apoptotic function. RESULTS: We constructed an adenoviral vector coding a chimeric p53 protein by fusing p53 sequence with the 21 COOH term amino acids sequence of H-Ras. Indeed, the translation products of Ras genes are cytosolic proteins that become secondarily associated with membranes through a series of post-translational modifications initiated by a CAAX motif present at the C terminus of Ras proteins. The chimeric p53HRCaax protein was farnesylated efficiently in transduced human osteosarcoma p53-/- cell line. The farnesylated form of p53 resided mainly in the cytosol, where it is non-functional. Farnesyl transferase inhibitors (FTIs) specifically inhibited farnesyl isoprenoid lipid modification of proteins. Following treatment of the cells with an FTI, p53HRCaax underwent translocation into the nucleus where it retained transcription factor activity. Shifting p53 into the nucleus resulted in the induction of p21(waf1/CIP1 )and Bax transcription, cell growth arrest, caspase activation and apoptosis. CONCLUSION: Artificial protein farnesylation impaired the transcriptional activity of p53. This could be prevented by Farnesyl transferase inhibition. These data highlight the fact that the artificial prenylation of proteins provides a novel system for controlling the function of a transactivating factor

Use and comparison of different internal ribosomal entry sites (IRES) in tricistronic retroviral vectors

BACKGROUND: Polycistronic retroviral vectors that contain several therapeutic genes linked via internal ribosome entry sites (IRES), provide new and effective tools for the co-expression of exogenous cDNAs in clinical gene therapy protocols. For example, tricistronic retroviral vectors could be used to genetically modify antigen presenting cells, enabling them to express different co-stimulatory molecules known to enhance tumor cell immunogenicity. RESULTS: We have constructed and compared different retroviral vectors containing two co-stimulatory molecules (CD70, CD80) and selectable marker genes linked to different IRES sequences (IRES from EMCV, c-myc, FGF-2 and HTLV-1). The tricistronic recombinant amphotropic viruses containing the IRES from EMCV, FGF-2 or HTLV-1 were equally efficient in inducing the expression of an exogenous gene in the transduced murine or human cells, without displaying any cell type specificity. The simultaneous presence of several IRESes on the same mRNA, however, can induce the differential expression of the various cistrons. Here we show that the IRESes of HTLV-1 and EMCV interfere with the translation induced by other IRESes in mouse melanoma cells. The IRES from FGF-2 did however induce the expression of exogenous cDNA in human melanoma cells without any positive or negative regulation from the other IRESs present within the vectors. Tumor cells that were genetically modified with the tricistronic retroviral vectors, were able to induce an in vivo anti-tumor immune response in murine models. CONCLUSION: Translation of the exogenous gene is directed by the IRES and its high level of expression not only depends on the type of cell that is transduced but also on the presence of other genetic elements within the vector

Douleur, sédation et delirium : évaluation des patients sous sédation profonde aux soins intensifs

Introduction&nbsp;: Aux soins intensifs (SI), une sédation profonde peut être indiquée pour la gestion de la défaillance aiguë d’organes, mais une fois que le patient est non réactif, les cliniciens ne disposent pas d’outils validés pour évaluer la douleur, la profondeur de sédation et le delirium. La pupillométrie et l’électro-encéphalogramme (EEG) simplifié sont des nouveaux outils de mesures quantifiées prometteurs, mais très peu d’évidence est disponible quant à leur pertinence aux SI. Les objectifs étaient : 1) de valider la dilatation pupillaire comme mesure diagnostique de la douleur (mesures avant-pendant-après un soin (non-) douloureux)&nbsp;; 2) d’identifier une potentielle relation entre la constriction pupillaire et la survenue de delirium&nbsp;; 3) d’examiner une potentielle association entre un niveau de sédation très profonde (évalué par l’EEG simplifié) et la survenue de delirium.&nbsp; Méthode&nbsp;: Ce projet de recherche a inclus trois études observationnelles. Les analyses principales ont été&nbsp;: 1) la différence de la moyenne du pourcentage de la dilatation pupillaire pendant une procédure nocive par rapport à avant&nbsp;; 2) un modèle de régression logistique multivariable en entrant la constriction pupillaire au jour 3 comme variable d’intérêt, et le score SOFA jour 3, la dose cumulée de fentanyl et la dose cumulée de sédatifs comme co-variables&nbsp;; 3) une analyse de régression multivariable avec le pourcentage de temps passé avec une sédation excessive comme variable d’intérêt et le fentanyl, le propofol et le midazolam cumulés comme co-variables. Résultats&nbsp;: Nos résultats suggèrent que les deux outils pourraient fournir des informations cliniques pertinentes. Les principaux constats sont que&nbsp;: 1) la dilatation pupillaire a augmenté pendant les procédures nocives par rapport à la ligne de base avec une différence moyenne de 31,66%&nbsp;; 2) Après ajustement en fonction de la défaillance des organes (score SOFA) et de la dose cumulée d’analgésie et de sédation, les patients présentant une constriction pupillaire inférieure avaient un risque accru de développer un delirium des soins intensifs (OR 1,057; IC 95% 1,007-1,113) au jour 3 de la ventilation mécanique&nbsp;; 3) après ajustement de la dose cumulée d’analgésie et de sédation, les patients avec une proportion de temps plus importante avec une sédation excessive entre le jour 1 et le jour 3 de la maladie critique étaient plus à risque de développer un delirium (OR 1,014; IC 95%&nbsp; 1,001-1,027). Discussion et conclusion&nbsp;: La pupillométrie et l’EEG simplifié sont des outils qui pourraient contribuer à l’amélioration de la gestion de la douleur, de la sédation et du delirium chez une population très à risque.Introduction&nbsp;: Aux soins intensifs (SI), une sédation profonde peut être indiquée pour la gestion de la défaillance aiguë d’organes, mais une fois que le patient est non réactif, les cliniciens ne disposent pas d’outils validés pour évaluer la douleur, la profondeur de sédation et le delirium. La pupillométrie et l’électro-encéphalogramme (EEG) simplifié sont des nouveaux outils de mesures quantifiées prometteurs, mais très peu d’évidence est disponible quant à leur pertinence aux SI. Les objectifs étaient : 1) de valider la dilatation pupillaire comme mesure diagnostique de la douleur (mesures avant-pendant-après un soin (non-) douloureux)&nbsp;; 2) d’identifier une potentielle relation entre la constriction pupillaire et la survenue de delirium&nbsp;; 3) d’examiner une potentielle association entre un niveau de sédation très profonde (évalué par l’EEG simplifié) et la survenue de delirium.&nbsp; Méthode&nbsp;: Ce projet de recherche a inclus trois études observationnelles. Les analyses principales ont été&nbsp;: 1) la différence de la moyenne du pourcentage de la dilatation pupillaire pendant une procédure nocive par rapport à avant&nbsp;; 2) un modèle de régression logistique multivariable en entrant la constriction pupillaire au jour 3 comme variable d’intérêt, et le score SOFA jour 3, la dose cumulée de fentanyl et la dose cumulée de sédatifs comme co-variables&nbsp;; 3) une analyse de régression multivariable avec le pourcentage de temps passé avec une sédation excessive comme variable d’intérêt et le fentanyl, le propofol et le midazolam cumulés comme co-variables. Résultats&nbsp;: Nos résultats suggèrent que les deux outils pourraient fournir des informations cliniques pertinentes. Les principaux constats sont que&nbsp;: 1) la dilatation pupillaire a augmenté pendant les procédures nocives par rapport à la ligne de base avec une différence moyenne de 31,66%&nbsp;; 2) Après ajustement en fonction de la défaillance des organes (score SOFA) et de la dose cumulée d’analgésie et de sédation, les patients présentant une constriction pupillaire inférieure avaient un risque accru de développer un delirium des soins intensifs (OR 1,057; IC 95% 1,007-1,113) au jour 3 de la ventilation mécanique&nbsp;; 3) après ajustement de la dose cumulée d’analgésie et de sédation, les patients avec une proportion de temps plus importante avec une sédation excessive entre le jour 1 et le jour 3 de la maladie critique étaient plus à risque de développer un delirium (OR 1,014; IC 95%&nbsp; 1,001-1,027). Discussion et conclusion&nbsp;: La pupillométrie et l’EEG simplifié sont des outils qui pourraient contribuer à l’amélioration de la gestion de la douleur, de la sédation et du delirium chez une population très à risque

Coherent x-ray wavefront reconstruction of a partially illuminated Fresnel zone plate

International audienceA detailed characterization of the coherent x-ray wavefront produced by a partially illuminated Fresnel zone plate is presented. We show, by numerical and experimental approaches, how the beam size and the focal depth are strongly influenced by the illumination conditions, while the phase of the focal spot remains constant. These results confirm that the partial illumination can be used for coherent diffraction experiments. Finally, we demonstrate the possibility of reconstructing the complex-valued illumination function by simple measurement of the far field intensity in the specific case of partial illumination