Sequence heterogeneity and phylogenetic relationships between the copia retrotransposon in Drosophila species of the repleta and melanogaster groups

Although the retrotransposon copia has been studied in the melanogaster group of Drosophila species, very little is known about copia dynamism and evolution in other groups. We analyzed the occurrence and heterogeneity of the copia 5'LTR-ULR partial sequence and their phylogenetic relationships in 24 species of the repleta group of Drosophila. PCR showed that copia occurs in 18 out of the 24 species evaluated. Sequencing was possible in only eight species. The sequences showed a low nucleotide diversity, which suggests selective constraints maintaining this regulatory region over evolutionary time. On the contrary, the low nucleotide divergence and the phylogenetic relationships between the D. willistoni/Zaprionus tuberculatus/melanogaster species subgroup suggest horizontal transfer. Sixteen transcription factor binding sites were identified in the LTR-ULR repleta and melanogaster consensus sequences. However, these motifs are not homologous, neither according to their position in the LTR-ULR sequences, nor according to their sequences. Taken together, the low motif homologies, the phylogenetic relationship and the great nucleotide divergence between the melanogaster and repleta copia sequences reinforce the hypothesis that there are two copia families

Escritura marginais : fragmentos de memórias da professora Malvina Tavares

O estudo apresentado evidencia as memórias de uma professora e tem como objetos de análise o diário íntimo1 de Julia Malvina Hailliot Tavares, escrito entre o final do século XIX até a década de 1930, e o caderno de Zilda Haussen, sua aluna, datado de 1927. Por meio deles foi possível confrontar o pessoal, íntimo e corriqueiro da vida doméstica, com fatos históricos e o contexto educacional de uma época. O diário pessoal é constituído por um tipo de escrita autobiográfica, desse modo a pesquisa considera as distintas dimensões da vida da autora, estabelecendo um paralelo entre vida privada, docência como profissão feminina nos primeiros anos da república e o contexto da educação nos anos finais do século XIX e início do século XX. Por ser representativos de uma época, a relevância de seus escritos também possibilitou um exercício interpretativo das existências de tantas outras mulheres, tantas outras vidas comuns, contemporâneas de Malvina Tavares.The study presents a teacher’s memories, and it aims at analyzing the personal diary of Julia Malvina Hailliot Tavares, written between the end of the 19th century and the 1930s, andthe notebook of her student Zilda Haussen, dated 1927. They enabled a confrontation between the personal, intimate and run-of-the-mill aspects of domestic life and historical facts and the educational context of an era. The personal diary is constituted by an autobiographic type of writing, thus the study looks at the distinct dimensions of the author’s life, establishing a parallel between private life, teaching as a female professional in the first years of the Republic and the context of education in the last years of the 19th century and the beginning of the 20thcentury. Since it is representative of an era, the relevance of her writings also enabled an interpretative exercise of the existence of many other women, many other common lives, that were Malvina Tavares’ contemporarie

PROJETO DE ENSINO PARA A MONITORIA DA DISCIPLINA DE QUÍMICA ORGÂNICA II REFERENTE AO CURSO DE ENGENHARIA QUÍMICA - 87

As monitorias da disciplina de química orgânica II foram realizadas no período entre agosto e dezembro de 2018, para a turma (2017) de engenharia química. Nesse período, foram realizadas diversas atividades com o intuito de ajudar os alunos a entenderem melhor a disciplina e aplicar seus conhecimentos nas provas com mais confiança. Dentre as atividades, estão as resoluções de exercícios feitos em sala de aula correlacionados ao que o docente passou, de revisões sobre o conteúdo. Foram feitos grupos de estudo para uma melhor performance no aprendizado (diálogo e troca de saberes entre os alunos), foi feito também um acompanhamento individual do monitor para com o aluno que precisasse de ajuda, e finalmente, um planejamento metódico feito com a orientadora da monitoria para traçar os objetivos com eficiência. Feito isso, os resultados foram bem promissores, a ponto de que a porcentagem referente às reprovações por nota foi quase nula

Aplicação de bioconservador potencialmente postbiótico produzido por fermentação semi-culturada para estender a validade comercial de matrizes temperadas resfriadas de frango

Orientadora: Profa. Dra. Ivonete Rossi BautitzCoorientador: Prof. Dr. André Fioravante GuerraDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Palotina, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. Defesa : Palotina, 21/12/2021Inclui referênciasResumo: Objetivou-se neste estudo avaliar o uso de conservador potencialmente pósbiótico (PPCP), produzido em um sistema de fermentação semiculturado com Lacticaseibacillus paracasei DTA 83 e Saccharomyces cerevisiae var. boulardii 17, para estender a validade comercial de linguiça frescal e cortes temperados de frango resfriados. Microrganismos associados com a deterioração dos derivados de frango foram estimulados ao crescimento por incubação em pares dos produtos em duas temperaturas diferentes, com coletas em diferentes tempos. O método turbidimétrico foi realizado para avaliar a susceptibilidade microbiana para o PPCP. PPCP foi adicionado nos derivados de frango para obter efeito inibitório parcial in situ sobre os microrganismos deteriorantes e estender a validade comercial. A triagem in vitro indicou inibição total do crescimento microbiano em concentrações acima de 3.0 % de PPCP. Embora esta concentração tenha apresentado notável potencial inibitório, a sua adição pode impactar o custo da formulação. Assim, a aplicação de doses com inibição microbiana parcial podem ser uma estratégia adequada para o uso de PPCP em derivados de frango. Os resultados demonstraram que o gerenciamento da cadeia de frio e co-utilização de PPCP estenderam a validade comercial dos derivados de frango, sugerindo uma alternativa tecnológica para bio-controlar o crescimento microbiano em matrizes cárneas.Abstract: This study aimed to evaluate the use of potentially postbiotic-containing preservative (PPCP), produced in a semi-culture fermentation system with Lacticaseibacillus paracasei DTA 83 and Saccharomyces cerevisiae var. boulardii 17, to extend the use-by date of raw chicken sausages and semifinished chicken products. Microorganisms associated with the spoilage of chicken products were stimulated to grow by pair incubation of the products at two different temperatures and with collection at different times. The turbidity method was performed to evaluate the microbial susceptibility to PPCP. PPCP was added in chicken products to obtain an in situ partial inhibitory effects on spoilage microorganisms to extend the use-by date. The in vitro trial showed total inhibition of the microbial growth by adding above 3.0% of PPCP. Although this concentration showed a remarkable inhibitory potential, its addition can severely impact the formulation cost. Thus, the application of doses with partial microbial inhibition may be a suitable strategy for the use of PPCP in chicken products. The results revealed that cold chain management and co-use of PPCP in chicken products extended the proposed use-by date, suggesting an alternative food preservation technology for the use of naturally derived compounds

Pacientes de longa permanência em um hospital psiquiátrico no sul do Brasil

OBJETIVO: Descrever as características demográficas, funcionamento social e qualidade de vida de uma população de pacientes recebendo cuidados de longa duração em hospital psiquiátrico. MÉTODOS: O estudo foi realizado em Porto Alegre, RS, em 2002. Foram avaliados 584 (96%) indivíduos sob hospitalização de longa duração usando quatro questionários validados (World Health Organization Quality of Life - Brief Social Behaviour Schedule, the Independent Living Skills Survey, the Brief Psychiatric Rating Scale) e um outro (Questionnaire for assessing Physical Disability Degree) para avaliar grau de incapacidade. RESULTADOS: O tempo médio de hospitalização foi de 26 anos (DP: 15,8) e 46,6% dos indivíduos não apresentavam incapacidade física. Os pacientes tiveram suas habilidades de funcionamento social e autonomia acentuadamente afetados. Poucos (27.7%) conseguiram responder o questionário de avaliação de qualidade de vida, apresentando importante comprometimento em todos os domínios. A Brief Psychiatric Rating Scale evidenciou prevalência baixa de sintomas positivos na população estudada. CONCLUSÕES: Os achados revelaram haver importante grau de comprometimento no funcionamento social, nível de autonomia e qualidade de vida dos idosos. Tais aspectos devem ser considerados no planejamento da internação de longa duração de pacientes idosos.OBJECTIVE: To describe the demographic profile, social functioning, and quality of life of a population of long-stay care patients in a psychiatric hospital. METHODS: A study was carried out in Porto Alegre, Southern Brazil, in 2002. A total of 584 (96%) long-stay patients were assessed by means of the following instruments: the World Health Organization Quality of Life, the Social Behavior Schedule, the Independent Living Skills Survey, the Brief Psychiatric Rating Scale and another instrument for assessing disability (Questionnaire for Assessing Physical Disability). RESULTS: The average hospital stay was 26 years (SD: 15.8) and 46.6% of inpatients had no physical disability. Patients had their social functioning skills and autonomy largely impaired. Few of them (27.7%) answered the instrument for assessing quality of life, and showed significant impairments in all domains. The Brief Psychiatric Rating Scale evidenced a low prevalence of positive symptoms in this population. CONCLUSIONS: The institutionalized population studied presented significantly impaired social functioning, autonomy, and quality of life. These aspects need to be taken into consideration while planning for their deinstitutionalization

POLÍTICAS PÚBLICAS DE EDUCAÇÃO SUPERIOR NA CONTEMPORANEIDADE E A FORMAÇÃO DOCENTE NA GRADUAÇÃO E NA PÓS-GRADUAÇÃO

Este artigo é resultado de uma pesquisa bibliográfica com a finalidade de fazer uma reflexão sobre as políticas públicas de educação superior no Brasil e a formação docente no ensino superior que são influenciadas pelas determinações legais em diferentes contextos sociais, políticos, econômicos e culturais que são merecedores de uma análise crítica e contextualizada. Inicialmente discorremos sobre a história da educação superior até os dias atuais. Caracterizamos a universidade como uma instituição que tem como funções principais o ensino, a pesquisa e extensão. Apresentamos alguns fundamentos da Leis de Diretrizes e Bases/96 que expõe um conjunto de princípios para a formação da graduação e pós-graduação. Observamos que essa lei não concebe o processo de formação para a docência no ensino superior como tal, mas apenas como preparação para o exercício do magistério. No que se refere aos cursos de pós-graduação dedicam-se exclusivamente a formação do pesquisador, deixando uma lacuna na formação e na profissão do docente. Apesar de vários avanços alcançados, a realidade educacional continua apresentado um quadro desolador, estando muito aquém dos benefícios que a educação promove para a sociedade e se encontra longe das promessas democráticas que ela encerra. Faz-se urgente o desenvolvimento de políticas públicas de educação superior voltadas para a formação do docente universitário envolvendo professores, alunos e instituições na busca de uma educação com qualidade e que promova a construção de uma sociedade mais justa. Palavras-chave: Políticas Públicas. Educação Superior. Formação de Professor

Metagenomic analysis of the begomovirus diversity in tomatoes in Central Brazil and impact of the Ty-1 tolerance gene on viral evolutionary dynamics

Tese (doutorado)—Univesidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2020.O tomateiro (Solanum lycopersicum L.) é uma das principais hortaliças cultivadas no Brasil. Até o início década de 1990, a ocorrência de doenças causadas por espécies de Begomovirus (família Geminiviridae) era esporádica no país. Entretanto, a partir deste período, um complexo extremamente diverso de espécies de begomovírus emergiu no cultivo do tomateiro, coincidindo com a ampla dispersão geográfica do vetor Bemisia tabaci MEAM 1 (Middle East-Asian Minor 1= biótipo B). A maioria dos begomovírus apresenta genoma bipartido e apresentam níveis variados de eficiência de transmissão pelo vetor. A utilização mais intensa de híbridos resistentes/tolerantes (principalmente com o gene Ty–1) é um potentical fator no processo de evolução deste grupo de vírus no Brasil. A metagenômica aliada ao Next-Generation Sequencing – NGS é uma das ferramentas mais eficientes para analisar, em larga escala, a diversidade de populações virais em diferentes condições ambientais. Neste contexto, o objetivo geral do presente trabalho foi conduzir estudos de metagenômica sobre a diversidade de begomovírus em tomateiro no Brasil. Os objetivos específicos foram: (a) conduzir estudos comparativos da diversidade de begomovírus infectando tomateiros com e sem o gene Ty–1 e (b) catalogar as espécies virais predominantes e/ou novas espécies de Begomovirus ocorrendo em tomateiros com e sem o gene Ty–1. Para isto, 107 amostras foram coletadas em campos de produção em Goiás (n=56), Distrito Federal (n=27) e Minas Gerais (n=24) entre os anos de 2002 e 2016. O DNA total das amostras foi extraído e submetido a PCR usando primers para detecção de begomovírus e também com primers para região genômica ligada ao gene Ty–1. Posteriormente as amostras foram submetidas a um enriquecimento via RCA (Rolling Circle Amplification) e divididas em dois pools: tomateiros sem o gene Ty–1 (n=64) e com o gene Ty–1 (n=43). Os dois pools foram sequenciados em uma plataforma Illumina HiSeq2500. As sequências obtidas foram montadas no programa CLC Genomics Workbench 11.0 e analisadas no Geneious 10.1. As sequências então foram comparadas com sequências virais presentes no GenBank utilizando o algoritmo BLASTn. Pares de primers específicos foram desenhados visando recuperar o genoma completo e confirmar a presença dos vírus em amostras individuais dentro de cada pool. Os resultados destas análises estão descritos no capítulo 2. Foi observada uma maior diversidade de espécies virais (n=14) no pool de amostras sem o gene Ty–1 em comparação com aquelas obtidas de plantas com gene Ty–1 (n=6). Observou-se uma aparente filtragem entre as espécies detectadas nos dois pools. Foi também observada uma grande frequência de infecções mistas nas amostras, tendo casos da ocorrência simultânea de até cinco espécies em uma única amostra. Três potenciais novas espécies foram detectadas, duas em amostras sem o gene Ty– 1 (MG-378 e GO-169) e uma em amostras contendo o gene Ty–1 (DF-640). Além disso, uma espécie do gênero Gemycircularvirus e um novo Alfasatélite foram detectados. Tomato golden vein virus (TGVV) foi uma das espécies amplamente detectadas nessas análises. Estudos conduzidos no capítulo 3, mostraram que TGVV e Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV) estão intimamente relacionados como indicado por análises empregando Sequence Demarcation Tool (SDT) e alinhamento MUSCLE. Dois grupos bem definidos foram identificados, consistentes com os critérios atuais para demarcação de espécies de Begomovirus, sendo também identificado um conjunto distinto características genômicas, biológicas e ecológicas específicas para cada espécie viral. Uma reavaliação dos isolados de TGVV e ToYVSV disponíveis no GenBank mostrou que uma grande fração está erroneamente classificada ao nível de espécie. A espécie Bean golden mosaic virus (BGMV) foi detectada em associação com tomateiro nas análises conduzidas no capítulo 1. No capítulo 4 a diversidade de 161 isolados classificados como BGMV foi catalogada comparando suas sequências completas com o DNA–A e DNA–B do isolado de referência. Análises filogenéticas e com SDT indicaram que os isolados descritos coletivamente como BGMV compreendem, de fato, duas espécies distintas: uma que engloba isolados de BGMV de Phaseolus vulgaris e de uma ampla gama de hospedeiros (incluindo o tomateiro) e uma espécie estreitamente relacionada (com identidade variando de 89 a 91% em comparação com o isolado de referência de BGMV) principalmente associada ao feijão-lima (P. lunatus). O capítulo 5 descreve as características moleculares de um Gemycircularvirus (2.189 nucleotídeos) identificado em associação com o tomateiro no Brasil Central. As análises mostraram que a espécie identificada compartilhou 99% de identidade com um vírus provisoriamente denominado como Plant-associated genomovirus 12 de Larrea tridentata. O capítulo 6 descreve duas novas espécies de Begomovirus que foram identificadas em amostras de Minas Gerais e Goiás. Os genomas virais completos foram clonados, sequenciados via Sanger e provisoriamente denominados Tomato golden net virus – ToGNV (2.649 nucleotídeos) e Tomato yellow net virus – ToYNV (2.636 nucleotídeos). Ambos os vírus exibiram a organização do DNA–A com características típicas das espécies de begomovírus do Novo Mundo. No entanto, nenhum componente cognato do DNA–B foi encontrado, indicando que ToGNV e ToYNV provavelmente compreendem um grupo peculiar de begomovírus neotropicais monopartidos.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico e Fundação de Apoio a Pesquisa do Distrito Federal (FAP/DF).Tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the main vegetable crops cultivated in Brazil. Until the early 1990s, the occurrence of diseases caused by Begomovirus species (family Geminiviridae) was sporadic in the country. However, from this period on, an extremely diverse complex of begomoviruses emerged in tomato fields, coinciding with the wide geographical dispersion of the Bemisia tabaci MEAM 1 (Middle East-Asian Minor 1 = biotype B). Most begomoviruses have a bipartite genome and have varying levels of transmission efficiency by the vector. The more intense use of resistant/tolerant hybrids (mainly with the Ty–1 gene) is a potentical factor in the evolution process of this group of viruses in Brazil. Metagenomics combined with Next-Generation Sequencing (NGS) is one of the most efficient tools for large scale analysis of the diversity of viral populations in different environmental conditions. In this context, the general objective of the present work was to conduct metagenomics studies on the diversity of begomoviruses in tomatoes in Brazil. The specific objectives were: (a) to carry out comparative studies of the begomovirus diversity infecting tomato plants with and without the Ty– 1 gene and (b) to catalog the predominant viral species and/or new begomoviruses occurring in tomato plants with and without the Ty–1 gene. For this, 107 samples were collected in production fields in Goiás (n = 56), Distrito Federal (n = 27) and Minas Gerais (n = 24) between the years 2002 and 2016. The total DNA of the samples was extracted and submitted to PCR using primers to detect begomovirus and also with primers for the genomic region linked to the Ty–1 gene. Subsequently, the samples were subjected to enrichment via RCA (Rolling Circle Amplification) and divided into two pools: tomatoes without the Ty–1 gene (n = 64) and with the Ty–1 gene (n = 43). The two pools were sequenced on an Illumina HiSeq 2500 platform. The obtained sequences were assembled using the CLC Genomics Workbench 11.0 program and analyzed in Geneious 10.1. The sequences were then compared to viral sequences present on GenBank using the BLASTn algorithm. Specific primer pairs were designed to recover the complete genome and confirm the presence of viruses in individual samples within each pool. The results of these analyzes are described in Chapter 2. A greater diversity of viral species (n = 14) was observed in the sample pool without the Ty – 1 gene compared to those obtained from plants with the Ty – 1 gene (n = 6). It was observed an apparent filtering effect among viral species detected in the two pools. A high frequency of mixed infections was also observed in the samples, with cases of the simultaneous occurrence of up to five species in a single sample. Three potential new species were detected, two in samples without the Ty–1 gene (MG-378 and GO-169) and one in samples containing the Ty–1 gene (DF-640). In addition, a species of the genus Gemycircularvirus and a new alpha-satellite were detected. Tomato golden vein virus (TGVV) was one of the species widely detected in these analyzes. Studies conducted in Chapter 3 have shown that TGVV and Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV) are closely related as indicated by analyzes using Sequence Demarcation Tool (SDT) and MUSCLE alignment. Two well-defined clusters were identified, consistent with the current criteria for demarcation of Begomovirus species. In addition, a distinct set of genomic, biological and ecological characteristics specific to each viral species was identified. A reassessment of the TGVV and ToYVSV isolates available on GenBank showed that a large fraction of them is erroneously classified at the species level. Bean golden mosaic virus (BGMV) was also detected in association with tomato in the analyzes carried out in Chapter 1. In Chapter 4 the diversity of 161 isolates classified as BGMV was cataloged by comparing their complete sequences with the DNA–A and DNA–B components of reference isolate. Phylogenetic and SDT analyzes indicated that the isolates collectively described as BGMV actually comprise two distinct species: one that encompasses isolates of BGMV from Phaseolus vulgaris and from a wide range of hosts (including tomato) and a closely related species (with identity ranging from 89 to 91% compared to the reference BGMV isolate), which were mainly associated with lima beans (P. lunatus). Chapter 5 describes the molecular characterization of a Gemycircularvirus (2,189 nucleotides) identified in association with tomato in Central Brazil. The analyzes showed that the gemycircularvirus shared 99% of identity with a virus tentatively named as Plant-associated genomovirus 12 of Larrea tridentata. Chapter 6 describes two new Begomovirus species that were identified in samples from Minas Gerais and Goiás states. The complete viral genomes were cloned, sequenced via Sanger and tentatively named as Tomato golden net virus – ToGNV (2,649 nucleotides) and Tomato yellow net virus – ToYNV (2,636 nucleotides). Both viruses exhibited DNA–A organization with typical features of the New World begomovirus species. However, no cognate components of DNA–B were found, indicating that ToGNV and ToYNV might comprise a peculiar group of monopartite neotropical begomoviruses

A literatura infantil na aprendizagem da leitura e escrita dos alunos do 4o ano do ensino fundamental

Anais do II Seminário Seminário Estadual PIBID do Paraná: tecendo saberes / organizado por Dulcyene Maria Ribeiro e Catarina Costa Fernandes — Foz do Iguaçu: Unioeste; Unila, 2014O presente texto apresenta uma síntese do trabalho realizado pelo Subprojeto de Pedagogia/UNIOESTE/Foz do Iguaçu do Programa Institucional de Bolsa de Iniciação à Docência (PIBID). O objetivo é desenvolver a leitura e escrita de alunos 4o ano do ensino fundamental de uma escola municipal da periferia desta cidade. Destacamos neste contexto a literatura infantil como um instrumento importante neste processo. Utilizamos como referencial para este trabalho as obras de Zilberman (1987); Simões (2000); Mello (2006), e outras. As literaturas infantis utilizadas foram criteriosamente selecionadas considerando a realidade social das crianças, levando-as a refletir sobre suas ações, estimulando o desenvolvimento social, emocional e cognitivo. Observamos que os alunos tiveram um significativo aproveitamento das aulas que demonstraram interesse, participaram com suas opiniões, interagirem entre si, exercitaram a leitura e a se empenharam na produção de texto

Para onde devem voar os pássaros depois do último céu? Identidade e (des) pertencimento em “Coming Home” e The Unbelonging

O presente estudo analítico aproxima dois textos de escritoras caribenhas que articulam a temática do movimento diaspórico à Inglaterra e o retorno à terra “ (des)pertencente”: o romance The Unbelonging, de Joan Riley, e o conto “ Coming Home”, de June Henfrey. Propõe-se uma análise de como são representados, nessas obras, o sentimento de (des)pertencimento, a busca por uma identidade cultural viável e o retorno à terra de origem, idealizada a partir do estrangeiro. Para tal, buscam-se aportes teóricos nos estudos de Homi Bhabha (1998) sobre o entre-lugar, em Stuart Hall (2003) e sua percepção cultural sobre o movimento diaspórico, bem como na abordagem de Chris Weedon (2004) sobre questões de identidade e pertencimento. A análise investigativa destes dois textos ficcionais permite uma melhor compreensão sobre as conseqüências da diáspora na vida das protagonistas, as quais transitam entre dois lugares, mas não pertencem a nenhum