Genome-Wide Transcriptional Reorganization Associated with Senescence-to-Immortality Switch during Human Hepatocellular Carcinogenesis

Cataloged from PDF version of article.Senescence is a permanent proliferation arrest in response to cell stress such as DNA damage. It contributes strongly to tissue aging and serves as a major barrier against tumor development. Most tumor cells are believed to bypass the senescence barrier (become "immortal") by inactivating growth control genes such as TP53 and CDKN2A. They also reactivate telomerase reverse transcriptase. Senescence-to-immortality transition is accompanied by major phenotypic and biochemical changes mediated by genome-wide transcriptional modifications. This appears to happen during hepatocellular carcinoma (HCC) development in patients with liver cirrhosis, however, the accompanying transcriptional changes are virtually unknown. We investigated genome-wide transcriptional changes related to the senescence-to-immortality switch during hepatocellular carcinogenesis. Initially, we performed transcriptome analysis of senescent and immortal clones of Huh7 HCC cell line, and identified genes with significant differential expression to establish a senescence-related gene list. Through the analysis of senescence-related gene expression in different liver tissues we showed that cirrhosis and HCC display expression patterns compatible with senescent and immortal phenotypes, respectively; dysplasia being a transitional state. Gene set enrichment analysis revealed that cirrhosis/senescence-associated genes were preferentially expressed in non-tumor tissues, less malignant tumors, and differentiated or senescent cells. In contrast, HCC/immortality genes were up-regulated in tumor tissues, or more malignant tumors and progenitor cells. In HCC tumors and immortal cells genes involved in DNA repair, cell cycle, telomere extension and branched chain amino acid metabolism were up-regulated, whereas genes involved in cell signaling, as well as in drug, lipid, retinoid and glycolytic metabolism were down-regulated. Based on these distinctive gene expression features we developed a 15-gene hepatocellular immortality signature test that discriminated HCC from cirrhosis with high accuracy. Our findings demonstrate that senescence bypass plays a central role in hepatocellular carcinogenesis engendering systematic changes in the transcription of genes regulating DNA repair, proliferation, differentiation and metabolism

Kronik bel ağrısı olan olgularda fizik tedavi ve rehabilitasyonun ağrı, özürlülük, depresif bulgular ve uyku kalitesi üzerine etkisi

GİRİŞ ve AMAÇ: Kişinin fiziksel fonksiyonunu, sosyal yaşamını, yaşam kalitesini olumsuz yönde etkileyen ve uyku düzenine kadar birçok aktivitesini etkileyen kronik bel ağrısında (KBA) fizik tedavi ve rehabilitasyon (FTR) sıklıkla tercih edilen nonfamakolojik bir tedavi seçeneğidir. Bu çalışma KBA olan olgularda fizik tedavi ve rehabilitasyon programının ağrı, özürlülük, depresif bulgular ve uyku kalitesi üzerine etkilerini incelemek amacıyla yapıldı YÖNTEM ve GEREÇLER: Bu çalışmaya Denizli ilindeki özel bir tıp merkezine en az altı aydır bel ağrısı şikâyeti nedeniyle başvuran ve FTR programına yönlendirilen 35 (K: 20, E: 15) olgu dahil edildi. Olgular haftada 5 gün toplam 15 seans FTR programına alındı. Olguların demografik verileri kaydedildi. Tedavi öncesi ve sonrasında olguların ağrı şiddeti Görsel Analog Skalası (GAS), özürlülük düzeyi Oswestry Disabilite İndeksi (ODİ) ve depresif bulgular Beck Depresyon Ölçeği (BDÖ) ile değerlendirildi. Uyku kalitesinin değerlendirilmesinde ise Pitsburg Uyku Kalitesi indeksi (PUKİ) kullanıldı. BULGULAR: Olguların yaş ortalaması 47,83± 14,35 (min: 27- max: 65) yıldır. Olguların tedavi öncesi ve sonrası GAS, BDI, OÖİ ve global PUKİ skorları karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı farklılık bulundu (p<0,05). Olguların tedavi sonrasında ağrı şiddeti, depresif bulguları ve özürlülük düzeyi anlamlı şekilde azaldı, minimal düzeyde bozukluk olan uyku kalitesinde ise anlamlı bir artış olduğu görüldü TARTIŞMA ve SONUÇ: Kronik bel ağrılı olgularda yüzeyel ve derin sıcaklık uygulamaları, fizik tedavi modaliteleri ve egzersiz eğitimini içeren FTR programlarının ağrıyı azaltıp bunun sonucunda da fonksiyonelliği arttırması nedeniyle etkili bir tedavi seçeneği olduğunu, ayrıca depresif bulgular ve uyku kalitesinde olumlu etkileri olabileceğini düşünüyoruz

Hematological involvement in pediatric systemic lupus erythematosus: A multi-center study

Introductio