373 research outputs found
Las TIC como herramienta en las situaciones de emergencia.
El uso de las TIC en las operaciones de emergencia puede mejorar la rapidez de su respuesta y mejorar la coordinación entre los diferentes agentes involucrados. Sin ellas, la logística de la ayuda de emergencia sería mucho más dificultosa y las consecuencias, a menudo, mucho más graves al no poder prevenir el advenimiento de algunas catástrofes. Además, los medios de comunicación electrónicos, como la TV o Internet, son un medio para dar o quitar visibilidad e importancia a una emergencia.Peer Reviewe
Structure/function study of the proteasome: characterization of Rpn5 sumoylation and development of proteolytic chimeras
El sistema ubicuitina-proteasoma és una via reguladora central en l'homeòstasi de proteïnes. Funciona específicament etiquetant proteïnes amb ubicuitina i enviant-les al proteasoma per a la seva degradació. Aleshores, el proteasoma reconeix l'etiqueta mitjançant receptors d'ubicuitina, desplega la proteïna diana i la degrada tallant-la en petits pèptids. Dos sub-complexos proteasòmics principals controlen el procés de degradació de proteïnes: el centre proteolític del proteasoma està contingut en una estructura proteica cilindrica en forma cilíndrica anomenada partícula nucli (PC). Per altra banda, la partícula reguladora (PR) conté receptors d'ubicuitina, enzims deubicuitinitzants i ATPases que fan la força de tracció necessària per desplegar els substrats.
La forma en què el proteasoma captura, desplega i degrada la proteïna requereix que el complex experimenti una sèrie de canvis d'estat conformacional amb l'objectiu de passar d'un estat de repòs, en el qual la majoria dels centres catalítics romanen inactius o no compromesos, a un estat totalment actiu on les proteïnes són fàcilment processades i degradades.
En el context del proteasoma, Rpn5 (PSMD12 en humans) és una subunitat integrant de la tapa de la partícula reguladora, funcionant com a bastida per al muntatge d'aquest subcomplex, i en proteasomes madurs es situa en contacte amb la base i la tapa per transmetre els canvis de moviment que permeten el funcionament del proteasoma.
En aquest projecte hem caracteritzat la SUMOilació de Rpn5 en llevats, un esdeveniment descrit inicialment en PSMD12 humà, per tal d'entendre les seves implicacions biològiques i relacions estructura/funció. Hem determinat que Rpn5 està preferentment SUMOilat a la lisina 147. Utilitzant una fusió Smt3-Rpn5 com a model per a aquesta modificació posterior a la traducció, hem detectat que els proteasomes SUMOilats adopten una configuració inusual, amb quantitats disminuïdes de partícula central. Sorprenentment, però, es mantenen les capacitats de degradació del substrat dels proteasomes, cosa que suggereix un augment compensatiu de l'estat d'activació entre els proteasomes SUMOilats. Quan s’han analitzat les implicacions biològiques d'aquesta troballa, vam trobar diferències en les proteïnes que interaccionen amb el proteasoma, cosa que indica un canvi de preferència de substrat pels proteasomes SUMOilats. A més, en assajos fenotípics, la sumoilació del proteasoma es va relacionar amb una sensibilitat al zenc. Al mateix temps, a les soques amb deficiència de l’enzim deubicuitinitzant Ubp6, la SUMOilació Rpn5 va rescatar fenotips intrínsecs, cosa que indica una interacció entre la SUMOilació Rpn5 i la regulació dels enzims deubicuitinitzants associats al proteasoma. És important destacar que vam obtenir una estructura crio-EM amb 8Å de resolució de proteasomes SUMOilats, que va revelar que aquests proteasomes modificats amb SUMO estaven preferentment en estat activat.
Paral·lelament a la caracterització de la SUMOilació d’Rpn5, aquest projecte va explorar la viabilitat d'utilitzar components del proteasoma com a receptors per a degradadors quimèrics de tipus protac. Els protacs tradicionals consisteixen en molècules bifuncionals unides per un enllaç, amb l'objectiu d'aproximar una ubicuitina lligasa (E3) i una proteïna a degradar. Després de la formació d'un complex ternari, la proteïna objectiu és ubicuitilada i després reconeguda i degradada pel proteasoma. En un experiment de prova de concepte, vam desenvolupar el compost RBM3-300, una molècula capaç de guiar la inosina monofosfat deshidrogenasa 2 (IMPDH2) a la seva degradació pel proteasoma. Després de 72 h de tractament amb el compost a una concentració de 10 µM, vam poder determinar una reducció dels nivells d'IMPDH2 en cultius de mamífer. A més, vam determinar les constants d'afinitat d'aquest compost principal, amb altres que contenen diferents característiques químiques, cap als seus receptors de proteïnes mitjançant ressonància plasmònica de superfície.
Finalment, com a segona prova de concepte, vam fer un assaig de degradació amb proteasomes que tenien una proteïna de fusió sensible a la glutamina i gliadina de blat com a model d'un substrat ric en glutamina. Vam trobar que la combinació d'això amb l'ablació mitjançada per CRISPR dels extrems N-terminals de la subunitat alfa que tanquen la partícula central, dona lloc a proteasomes que han vist augmentada la processivitat d'aquests substrats.El sistema ubiquitina-proteasoma es una vía reguladora central en la homeostasis de proteínas. Funciona específicamente etiquetando proteínas con ubiquitina y enviándolas al proteasoma para su degradación. Entonces, el proteasoma reconoce la etiqueta mediante receptores de ubiquitina, despliega la proteína diana y la degrada cortándola en pequeños péptidos. Dos sub-complejos proteasómicos principales controlan el proceso de degradación de proteínas: el centro proteolítico del proteasoma está contenido en una estructura proteica cilíndrica con forma cilindrica denominada partícula núcleo (PN). Por otro lado, la partícula reguladora (PR) contiene receptores de ubiquitina, enzimas deubiquitinizantes y ATPasas que realizan la fuerza de tracción necesaria para desplegar los sustratos.
La forma en que el proteasoma captura, despliega y degrada la proteína requiere que el complejo experimente una serie de cambios de estado conformacional con el objetivo de pasar de un estado de reposo, en el que la mayoría de los centros catalíticos permanecen inactivos o no comprometidos, a un estado totalmente activo en el que las proteínas son fácilmente procesadas y degradadas.
En el contexto del proteasoma, Rpn5 (PSMD12 en humanos) es una subunidad integrante de la tapa de la partícula reguladora, funcionando como andamio para el montaje de este subcomplejo, y en proteasomas maduros se sitúa en contacto con la base y la tapa para transmitir los cambios de movimiento que permiten el funcionamiento del proteasoma.
En este proyecto hemos caracterizado la SUMOilación de Rpn5 en levaduras, un evento descrito inicialmente en PSMD12 humano, para entender sus implicaciones biológicas y sus relaciones estructura/función. Hemos determinado que Rpn5 está preferentemente SUMOilado en la lisina 147. Utilizando una fusión Smt3-Rpn5 como modelo para esta modificación posterior a la traducción, detectamos que los proteasomas SUMOilados adoptan una configuración inusual, con cantidades disminuidas de partícula central. Sorprendentemente, sin embargo, se mantienen las capacidades de degradación del sustrato de los proteasomas, lo que sugiere un aumento compensativo del estado de activación entre los proteasomas SUMOilados. Cuando se analizaron las implicaciones biológicas de este hallazgo, encontramos diferencias en las proteínas que interaccionan con el proteasoma, indicando un cambio de preferencia de sustrato por los proteasomas SUMOilados. Además, en ensayos fenotípicos, la SUMOilación del proteasoma se relacionó con una sensibilidad en el Zn. Al mismo tiempo, en las cepas con deficiencia de deubiquitilasa UBP6, la sumoilación Rpn5 rescató fenotipos intrínsecos, lo que indica una interacción entre la SUMOilación Rpn5 y la regulación de las enzimas deubiquitilantes asociadas al proteasoma. Es importante destacar que obtuvimos una estructura crio-EM con 8Å de resolución de proteasomas SUMOilados, que reveló que estos proteasomas modificados con SUMO estaban preferentemente en estado activado.
Paralelamente a la caracterización de la SUMOilación de Rpn5, este proyecto exploró la viabilidad de utilizar componentes del proteasoma como receptores para degradadores quiméricos de tipo protac. Los protacs tradicionales consisten en moléculas bifuncionales unidas por un enlace, con el objetivo de aproximar una ubiquitina ligasa (E3) y una proteína a degradar. Tras la formación de un complejo ternario, la proteína objetivo es ubiquitilada y después reconocida y degradada por el proteasoma. En un experimento de prueba de concepto, desarrollamos el compuesto RBM3-300, una molécula capaz de guiar la inosina monofosfato deshidrogenasa 2 (IMPDH2) hacia su degradación por el proteasoma. Después de 72 h de tratamiento con el compuesto a una concentración de 10 µM, pudimos determinar una reducción de los niveles de IMPDH2 en cultivos de mamífero. Además, determinamos las constantes de afinidad de este compuesto principal, con otras que contienen distintas características químicas, hacia sus receptores de proteínas mediante resonancia plasmónica de superficie.
Por último, como segunda prueba de concepto, realizamos un ensayo de degradación con proteasomas que tenían una proteína de fusión sensible a la glutamina y gliadina de trigo como modelo de un sustrato rico en glutamina. Encontramos que la combinación de ello con la ablación intermediada por CRISPR de los extremos N-terminales de la subunidad alfa que cierran la partícula núcleo, da lugar a proteasomas que han visto aumentada la procesividad de estos sustratos.The Ubiquitin-Proteasome System is a central regulatory pathway for protein homeostasis. It functions specifically tagging proteins with ubiquitin and sending them to the proteasome for their degradation. The proteasome then recognizes the ubiquitin tag by means of receptors, unfolds the target protein and degrades it by cutting it into small peptides. Two main proteasomal subassemblies control protein degradation process: the core particle, the proteolytic centre of the proteasome enclosed in the barrel-shaped cylinder, and the regulatory particle, which contains ubiquitin receptors, deubiquitinating factors and ATPases that do the pull force to unfold substrates.
The way in which the proteasome engages, unfolds and degrades protein requires the complex to undergo a series of conformational state shifts with the objective of shifting from a resting state, in which most of catalytic centres remain inactive or unengaged, to a fully active state, un which proteins are readily processed and degraded.
In the context of the proteasome, Rpn5 (PSMD12 in humans) is placed in the lid of the regulatory particle, working as a scaffolding for the assembly of this subcomplex, and in mature proteasomes it contacts base and lid to transmit the motion changes that enable the functioning of the proteasome.
In this project we have characterized Rpn5 sumoylation in yeast, an event initially described in human PSMD12, in order to understand its biological and mechanistical implications. We have determined that Rpn5 is preferentially SUMOylated in Lysine 147. Using a Rpn5-Smt3 fusion as a model for this post translational modification, we detected that SUMOylated proteasomes adopt an unusual configuration, with decreased amounts of core particle. Surprisingly, however, the substrate degrading capabilities of the proteasomes were maintained, suggestive of a compensative increased state of activation among SUMOylated proteasomes. When looking at the biological implications of this finding, we found differences in the proteasome interacting proteins, indicating a change of substrate preference by SUMOylated proteasomes. Additionally, in phenotypic assays, proteasome sumoylation was related to a Zn sensitivity. At the same time, in UBP6 deubiquitylase-defficient strains, Rpn5 sumoylation rescued intrinsic phenotypes, indicating an interplay between Rpn5 SUMOylation and the regulation of proteasome-associated deubiquitylating enzymes. Importantly, we obtained an 8Å resolution cryo-EM structure of SUMOylated proteasomes, which revealed that these SUMO modified proteasomes were preferentially in an activated state.
In parallel to the characterization of Rpn5 SUMOylation, this project explored the feasibility of using proteasome components as receptors for protac-like chimeric degraders. Traditional protacs consist in bifunctional molecules joined by a linker, with the objective of bringing together an E3 ubiquitin ligase and a protein to be degraded. Upon formation of a ternary complex, the target protein is ubiquitylated and then recognised and degraded by the proteasome. In a proof-of-concept experiment, we developed lead compound RBM3-300, a molecule capable of targeting inosine monophosphate dehydrogenase 2 (IMPDH2) to its degradation by the proteasome. After 72h of treatment with 10µM compound, we could determine a reduction of IMPDH2 levels in mammalian cultures. Additionally, we determined the affinity constants of this lead compound, with others containing different chemistries, towards their protein receptors using surface plasmon resonance.
Finally, as a second proof of concept, we challenged proteasomes bearing a glutamine-sensing fusion with the degradation wheat gliadin as model of a glutamine rich substrate. We found that combining this with CRISPR mediated ablation of the alpha subunit N-terminal ends that gate the Core Particle, results in engineered proteasomes that have increased processivity of these substrates
The Potential of Proteolytic Chimeras as Pharmacological Tools and Therapeutic Agents
The induction of protein degradation in a highly selective and efficient way by means of druggable molecules is known as targeted protein degradation (TPD). TPD emerged in the literature as a revolutionary idea: a heterobifunctional chimera with the capacity of creating an interaction between a protein of interest (POI) and a E3 ubiquitin ligase will induce a process of events in the POI, including ubiquitination, targeting to the proteasome, proteolysis and functional silencing, acting as a sort of degradative knockdown. With this programmed protein degradation, toxic and disease-causing proteins could be depleted from cells with potentially effective low drug doses. The proof-of-principle validation of this hypothesis in many studies has made the TPD strategy become a new attractive paradigm for the development of therapies for the treatment of multiple unmet diseases. Indeed, since the initial protacs (Proteolysis targeting chimeras) were posited in the 2000s, the TPD field has expanded extraordinarily, developing innovative chemistry and exploiting multiple degradation approaches. In this article, we review the breakthroughs and recent novel concepts in this highly active discipline
Pequeños pueblos, grandes deudas
Treball Final de Grau en Periodisme. Codi: PE0932.Curs: 2014/2015En España hay una larga lista de Comunidades Autónomas endeudadas, la segunda de ellas es la Comunitat Valenciana con casi 50 millones de euros según el diario Expansión. Este dato y el creciente éxodo rural que experimentábamos en los pueblos de alrededor de la Provincia de Castellón hizo centrar nuestras miradas en la Comarca del Alto Palancia, donde se encuentra el cuarto Ayuntamiento más endeudado de España, Navajas. Esta acotación nos hizo darnos cuenta de que, como este pueblo, hay muchos de la Comarca que siguen su camino, y por el contrario, algunos que se libran del lastre de la deuda. Pero ¿qué medidas se han tomado para corregir el camino de estos pueblos? Pues bien, el Partido Popular implantó a finales del año 2013 la Ley de Sotenibilidad y Racionalización de las Entidades y Administraciones Locales. Esta nueva norma, muy comentada y criticada, pretende poner un techo de deuda a los Ayuntamientos para impedir que sobrepasen los límites. Eso sí, se hace anteponiendo un control por parte de las Diputaciones frente a las acciones de los propios Ayuntamientos. Una vez conocida esta situación, nuestro reportaje trata de mostrar una serie de objetivos:
- Explicar cuál es la situación de los pueblos de la Comarca del Alto Palancia.
- Exponer en qué consiste esta ley y cuáles son los puntos más importantes de la misma. Así como enfatizar en el motivo por el cual se implantó.
- Hacer un breve balance del año en el que lleva implantada la norma.
- Mostrar si se cumple la hipótesis entre el éxodo rural y la deuda. Barajando incluso si algunos de estos pueblos podrían desaparecer.
Estos son los objetivos claros que queremos mostrar en el reportaje de manera que quede lo más didáctico e informativo posible de cara al público objetivo que podría consumir este proyecto audiovisual
The Economic crisis and immigration: Romanian citizens in the ceramic tile district of Castello (Spain)
Between 2001 and 2007 an exceptional number of immigrants arrived in the province of Castelló (Spain), the majority of whom were from Romania, attracted by the plentiful employment prospects offered by a model of production based on the intensive labour requirements of the ceramic tile and construction industries. The effects of the international economic crisis have been particularly serious in the area of Castelló, where employment has fallen by 20% in just three years. Immigrations flows from Romania have fallen, while the number of those leaving has increased, and migration plans have been modified although the size of the immigrant stock has not fallen significantly due to continued family reunification. The differential between the Spanish and Romanian welfare states, the degree of adaptation in the host society and the strategies developed by the immigrant population explain why returning migrant numbers remain moderate and migratory circulation has increased
Cómo y qué enseñar de la biodiversidad en la alfabetización científica
The purpose of this article is to approach the didactic treatment of biodiversity conservation issues from the double perspective of scientific literacy and environmental education. We attempt to provide ideas on how articulating their respective theoretical speeches with practice in biological education; understanding the need to fit principles and goals that characterize them, with the processes of teaching and learning concepts, values, processes and techniques; significantly necessary to develop of citizenship, critical interpretation and based decision-making capacities, related to the political proposals and measures on biodiversity conservation.El presente artículo pretende abordar el tratamiento didáctico de la problemática sobre la conservación de la diversidad biológica desde la doble perspectiva de la alfabetización científica y la educación ambiental. A través de él proponemos ideas para concretar los respectivos discursos teóricos en la práctica educativa de la enseñanza de la biología. Partimos de la necesidad de ajustar los principios y metas que los caracterizan, con los procesos de enseñanza y aprendizaje significativo de los conceptos, valores, procesos y técnicas. Todos ellos son necesarios para el desarrollo, por parte de la ciudadanía, de la capacidad de interpretación crítica y de toma de decisiones fundamentadas sobre conservación de la biodiversidad
Cómo y qué enseñar de la biodiversidad en la alfabetización científica
El presente artículo pretende abordar el tratamiento didáctico de la problemática sobre la conservación de la diversidad biológica desde la doble perspectiva de la alfabetización científica y la educación ambiental. A través de él proponemos ideas para concretar los respectivos discursos teóricos en la práctica educativa de la enseñanza de la biología. Partimos de la necesidad de ajustar los principios y metas que los caracterizan, con los procesos de enseñanza y aprendizaje significativo de los conceptos, valores, procesos y técnicas. Todos ellos son necesarios para el desarrollo, por parte de la ciudadanía, de la capacidad de interpretación crítica y de toma de decisiones fundamentadas sobre conservación de la biodiversidad.The purpose of this article is to approach the didactic treatment of biodiversity conservation issues from the double perspective of scientific literacy and environmental education. We attempt to provide ideas on how articulating their respective theoretical speeches with practice in biological education; understanding the need to fit principles and goals that characterize them, with the processes of teaching and learning concepts, values, processes and techniques; significantly necessary to develop of citizenship, critical interpretation and based decision-making capacities, related to the political proposals and measures on biodiversity conservation
Análisis del tratamiento didáctico de la biodiversidad en los libros de texto de Biología y Geología en Secundaria
Los libros de texto están considerados como un elemento orientador, cuando no determinante, en la toma de decisiones en el proceso de enseñanza-aprendizaje. Dado su gran peso específico, resulta razonable pensar que un tratamiento inadecuado por su parte de la noción de biodiversidad y su problemática, esté en la base de la falta de competencias por parte de la ciudadanía para interpretar las informaciones, propuestas y actuaciones políticas sobre gestión del patrimonio natural; así como para tomar decisiones fundamentadas al respeto. En este trabajo, se describe una investigación sobre el tratamiento que dan los libros de texto a la biodiversidad
Grafting melons onto potential cucumis spp. rootstocks
Cucumís
melo
is
an
economically
importar]t
crop.
Its
culture
is
hampered
by
differen
t
types
of
soil
stresses.
Grafting
melons
onto
different
resistant
cucurbits
belonging
to
the
genera,
Cucurbíta,
Lagenaría,
Luffa,
etc.
have
been
successfully
used
to
avoid
these
problems.
However,
me
Ion
quality
has
been
nega.tively
modified
as
a
consequence
of
grafting.
In
general,
variation
in
fruit
shape,
seed
cavity
and
sugar
content
have
been
observed.
The
use
of
rootstocks
more
genetically
c\oser
to
the
melon
scions
could
be
useful
to
obtain
fru
i
ts
with
better
quality
from
melon
grafted
plantsPostprint (published version
- …