Characterisation of a non-pathogenic and non-protective infectious rabbit lagovirus related to RHDV

The existence of non-pathogenic RHDV strains was established when a non-lethal virus named rabbit calicivirus (RCV) was characterised in 1996 in Italy. Since then, different RNA sequences related to RHDV have been detected in apparently healthy domestic and wild rabbits, and recently a new lagovirus was identified in Australia. We have characterised from seropositive healthy domestic rabbits a non-lethal lagovirus that differs from RHDV in terms of pathogenicity, tissue tropism and capsid protein sequence. Phylogenetic analyses have revealed that it is close to the Ashington strain and to the RCV, but distinct. We proved experimentally that it is infectious but non-pathogenic and demonstrated that, contrary to the other described non-pathogenic lagoviruses, it induces antibodies that do not protect against RHDV. Our results indicate the existence of a gradient of cross-protection between circulating strains, from non-protective, partially protective to protective strains, and highlight the extent of diversity within the genus Lagovirus

Evolution of microparasites in spatially and genetically structured host populations: The example of RHDV infecting rabbits

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Parallel adaptation of rabbit populations to myxoma virus.

In the 1950s the myxoma virus was released into European rabbit populations in Australia and Europe, decimating populations and resulting in the rapid evolution of resistance. We investigated the genetic basis of resistance by comparing the exomes of rabbits collected before and after the pandemic. We found a strong pattern of parallel evolution, with selection on standing genetic variation favoring the same alleles in Australia, France, and the United Kingdom. Many of these changes occurred in immunity-related genes, supporting a polygenic basis of resistance. We experimentally validated the role of several genes in viral replication and showed that selection acting on an interferon protein has increased the protein's antiviral effect.This work was supported by grants from the Programa Operacional Potencial Humano–Quadro de Referência Estratégica Nacional funds from the European Social Fund and Portuguese Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior to M.C. (IF/00283/2014/CP1256/CT0012), to P.J.E. (IF/00376/2015) and to J.M.A. (SFRH/BD/72381/2010). AM was supported by the European Research Council (grant 647787-LocalAdaptation). FJ was supported by the European Research Council (grant 281668). LL was supported by the European Research Council grant (339941-ADAPT). McFadden Lab is supported by National Institute of Health (NIH) grant R01 AI080607. S.C.G. holds a Sir Henry Dale Fellowship, co-funded by the Wellcome Trust and the Royal Society (098406/Z/12/Z)

Histo-Blood Group Antigens Act as Attachment Factors of Rabbit Hemorrhagic Disease Virus Infection in a Virus Strain-Dependent Manner

Rabbit Hemorrhagic disease virus (RHDV), a calicivirus of the Lagovirus genus, and responsible for rabbit hemorrhagic disease (RHD), kills rabbits between 48 to 72 hours post infection with mortality rates as high as 50–90%. Caliciviruses, including noroviruses and RHDV, have been shown to bind histo-blood group antigens (HBGA) and human non-secretor individuals lacking ABH antigens in epithelia have been found to be resistant to norovirus infection. RHDV virus-like particles have previously been shown to bind the H type 2 and A antigens. In this study we present a comprehensive assessment of the strain-specific binding patterns of different RHDV isolates to HBGAs. We characterized the HBGA expression in the duodenum of wild and domestic rabbits by mass spectrometry and relative quantification of A, B and H type 2 expression. A detailed binding analysis of a range of RHDV strains, to synthetic sugars and human red blood cells, as well as to rabbit duodenum, a likely gastrointestinal site for viral entrance was performed. Enzymatic cleavage of HBGA epitopes confirmed binding specificity. Binding was observed to blood group B, A and H type 2 epitopes in a strain-dependent manner with slight differences in specificity for A, B or H epitopes allowing RHDV strains to preferentially recognize different subgroups of animals. Strains related to the earliest described RHDV outbreak were not able to bind A, whereas all other genotypes have acquired A binding. In an experimental infection study, rabbits lacking the correct HBGA ligands were resistant to lethal RHDV infection at low challenge doses. Similarly, survivors of outbreaks in wild populations showed increased frequency of weak binding phenotypes, indicating selection for host resistance depending on the strain circulating in the population. HBGAs thus act as attachment factors facilitating infection, while their polymorphism of expression could contribute to generate genetic resistance to RHDV at the population level

Eimeria roobroucki Grès & Marchandeau & Landau 2002, n. sp.

Eimeria roobroucki n. sp. (Figs 1; 2) MATÉRIEL TYPE. — Il n’y a aucun moyen de conserver durablement les oocystes de coccidies; nous déposons donc une photographie d’oocyste excrété par le lapin n° 36 LV provenant d’Arjuzanx (MNHN P301 LV). HÔTE TYPE. — Oryctolagus cuniculus Linné, 1758. ÉTYMOLOGIE. — L’espèce est dédiée à A. Roobrouck qui nous a généreusement aidés pour la collecte du matériel. DISTRIBUTION. — L’espèce a été trouvée en France. DESCRIPTION DE L’ OOCYSTE (FIGS 1; 2) Les oocystes sont ellipsoïdes avec un léger aplatissement du côté du micropyle. Les côtés de l’oocyste sont parallèles sur presque toute leur longueur. Les mensurations moyennes sont 55 ± 2,7 µm de long et 33,7 ± 1,3 µm de large (mesure de 30 oocystes). La paroi externe est épaisse, lisse, de couleur brune. Cette paroi fragile se rompt très fréquemment lors des manipulations. Le micropyle ne présente pas d’épaississement en périphérie et mesure en moyenne 8 µm. Il n’y a pas de corps résiduel dans l’oocyste. Les sporocystes sont allongés. Les corps de Stieda sont minces en croissant et les sous-corps de Stieda forment des demi-disques clairs. Les corps résiduels dans les sporocystes sont volumineux, irréguliers plutôt allongés, et peuvent recouvrir la quasi-totalité d’un sporozoïte. DIAGNOSE DIFFÉRENTIELLE Nous comparons l’espèce avec les coccidies du lapin et du lièvre européens. Les espèces d’ Eimeria décrites chez Oryctolagus cuniculus Linné, 1758 Les 10 espèces d’ Eimeria d’ Oryctolagus répertoriées en France par Eckert et al. (1995) et les 12 autres espèces mentionnées par Pellerdy (1974), dans des élevages de lapins domestiques, ont toutes des oocystes de taille nettement inférieure à celle d’ Eimeria roobroucki n. sp. La plus grande est E. irresidua Kessel & Jankiewicz, 1931 qui est l’espèce se rapprochant le plus d’ E. roobroucki n. sp. Elle est comme cette dernière dépourvue de corps résiduel de l’oocyste et la forme générale « sub-rectangulaire » des oocystes se rapproche le plus de celle de notre description. Cependant, elle est nettement plus petite: 38,3 × 25,6 µm, selon Pellerdy (1974), 38,4 × 23,2 µm selon Norton et al. (1979), 39,2 × 23,1 µm selon Eckert et al. (1995). Les espèces d’ Eimeria décrites chez Lepus europaeus Linné, 1758 Pellerdy (1974) a répertorié 12 espèces d’ Eimeria chez le lièvre européen. Onze ont des tailles nettement inférieures à notre nouvelle espèce; seule E. stefanskii Pastuszko, 1961 est plus grande (59-68 × 32-37 µm); elle se différencie d’ E. roobroucki n. sp. par la présence d’un corps résiduel de l’oocyste et son absence dans les sporocystes. Parmi les espèces décrites plus récemment, la plus grande Eimeria parasite du lièvre est E. macrosculpta Sugar, 1978 chez Lepus europaeus. Celle-ci est l’espèce morphologiquement la plus proche d’ E. roobroucki n. sp. Son oocyste est décrit comme cylindrique et symétrique, ou ovoïde allongé, mesurant 46 × 26 µm. Outre la plus petite taille des oocystes et sporocystes, E. macrosculpta se différencie d’ E. roobroucki n. sp. par la présence de granulations sur la paroi externe du premier, la paroi du second étant lisse.Published as part of Grès, Virginie, Marchandeau, Stéphane & Landau, Irène, 2002, Description d'une nouvelle espèce d'Eimeria (Coccidia, Eimeridea) chez le lapin de garenne Oryctolagus cuniculus en France, pp. 203-207 in Zoosystema 24 (2) on pages 205-206, DOI: 10.5281/zenodo.539989

Description d'une nouvelle espèce d'Eimeria (Coccidia, Eimeridea) chez le lapin de garenne Oryctolagus cuniculus en France

Grès, Virginie, Marchandeau, Stéphane, Landau, Irène (2002): Description d'une nouvelle espèce d'Eimeria (Coccidia, Eimeridea) chez le lapin de garenne Oryctolagus cuniculus en France. Zoosystema 24 (2): 203-207, DOI: 10.5281/zenodo.539989

Les processus de la réintroduction : l’apport de l’expérimentation

Marchandeau Stéphane, Letty Jérôme, Aubineau Jacky, Clobert Jean. Les processus de la réintroduction : l’apport de l’expérimentation . In: Revue d'Écologie. Supplément n°7, 2000. pp. 119-122