Avanços na compreensão dos padrões evolutivos em Myrtaceae : estudo de caso do complexo de espécies Eugenia involucrata através de uma abordagem integrativa

Myrtaceae inclui espécies vegetais com ampla distribuição mundial, sendo a Oceania e as regiões Neotropicais seus centros de diversidade. Na região Neotropical, a família é mais representada pela tribo Myrteae, com 29 gêneros e 2164 espécies de plantas frutíferas com significativa importância ecológica e econômica. A problemática na sistemática dentro de Myrteae limitou os estudos dentro deste grupo. A tribo inclui grandes gêneros com complexos crípticos de espécies, como Eugenia involucrata DC., uma espécie amplamente difundida e com alta variabilidade morfológica. Assim, a compreensão dos padrões evolutivos de Myrteae é de interesse. O principal objetivo deste estudo é fornecer uma visão geral da evolução das Myrtaceae Neotropicais e desvendar a história evolutiva de um complexo de espécies de Myrteae (Eugenia involucrata) através de uma abordagem integrativa baseada em genética de populações, filogeografia e morfometria. No capítulo II desta tese produzimos um artigo de revisão que contempla estudos de Filogenia, Biogeografia, Genética de Populações, Filogeografia, Citogenética e Genômica de Myrtaceae Neotropicais. A partir da análise desses artigos, evidenciamos avanços significativos na pesquisa e algumas áreas de pesquisa negligenciadas. Também detectamos que algumas espécies apresentam dificuldade de manutenção da diversidade intraespecífica devido a atividades antrópicas. Por um lado, identificamos um aumento no número de estudos filogenéticos baseados em marcadores moleculares nos últimos anos, contribuindo para a compreensão dos padrões macroevolutivos. Por outro lado, encontramos uma carência de estudos abrangendo aspectos microevolutivos, como estudos filogeográficos, os quais foram realizados apenas para duas espécies. No capítulo III, realizamos um estudo de diversidade genética e estrutura populacional de E. involucrata no sul da Floresta Atlântica. Também realizamos uma análise da morfometria geométrica foliar dessa espécie a partir de imagens de exsicatas. As análises populacionais com marcadores moleculares nucleares (ITS) e plastidiais (matK, trnC-ycf6, psbA-trnH, trnS-trnG) revelaram que as populações de E. involucrata no sul da distribuição apresentam uma alta diversidade genética e não estão geneticamente estruturadas. A análise das imagens de exsicatas de E. involucrata mostraram que alguns grupos de plantas apresentaram diferenças no formato das folhas. Em conjunto, esses resultados contribuirão para a compreensão dos processos micro e macroevolutivos na tribo Myrteae, e desvendarão a história evolutiva de E. involucrata. Particularmente para mostrar se a variabilidade fenotípica deste complexo está associada a algum fator ambiental ou genético.Myrtaceae includes plant species with worldwide distribution, with Oceania and Neotropical regions being its centers of diversity. In the Neotropical region, the family is more represented by the Myrteae tribe, with 29 genera and 2164 species of fruit plants with significant ecological and economic importance. The systematic problem within Myrteae limited the studies within this group. The tribe includes large genera with cryptic species complexes, such as Eugenia involucrata DC., a widespread species with high morphological variability. Thus, understanding the evolutionary patterns of Myrteae is of interest. The main objective of this study is to provide an overview of the evolution of Neotropical Myrtaceae and to unravel the evolutionary history of a Myrteae species complex (Eugenia involucrata) through an integrative approach based on population genetics, phylogeography and morphometry. In chapter II of this thesis we produced a review article that includes studies of Phylogeny, Biogeography, Population Genetics, Phylogeography, Cytogenetics and Genomics of Neotropical Myrtaceae. From the analysis of these articles, we evidenced significant advances in research and some neglected research areas. We also detected that some species have difficulties in maintaining intraspecific diversity due to anthropic activities. On the one hand, we have identified an increase in the number of phylogenetic studies based on molecular markers in recent years, contributing to the understanding of macroevolutionary patterns. On the other hand, we found a lack of studies covering microevolutionary aspects, such as phylogeographic studies, which were carried out only for two species. In chapter III, we carried out a study of genetic diversity and population structure of E. involucrata in the southern Atlantic Forest. We also performed an analysis of the leaf morphometry of this species from images of exsiccates. Population analyzes with nuclear (ITS) and plastid (matK, trnC-ycf6, psbA-trnH, trnS-trnG) molecular markers revealed that E. involucrata populations in the southern range have a high genetic diversity and are not genetically structured. The analysis of exsiccates images of E. involucrata, showed that some groups of plants showed differences in leaf shape. Together, these results will contribute to the understanding of micro and macroevolutionary processes in the Myrteae tribe, and will reveal the evolutionary history of E. involucrata. Particularly to show if the phenotypic variability of this complex is associated with some environmental or genetic factor

Visualizing test diversity to support test optimisation

Diversity has been used as an effective criteria to optimise test suites for cost-effective testing. Particularly, diversity-based (alternatively referred to as similarity-based) techniques have the benefit of being generic and applicable across different Systems Under Test (SUT), and have been used to automatically select or prioritise large sets of test cases. However, it is a challenge to feedback diversity information to developers and testers since results are typically many-dimensional. Furthermore, the generality of diversity-based approaches makes it harder to choose when and where to apply them. In this paper we address these challenges by investigating: i) what are the trade-off in using different sources of diversity (e.g., diversity of test requirements or test scripts) to optimise large test suites, and ii) how visualisation of test diversity data can assist testers for test optimisation and improvement. We perform a case study on three industrial projects and present quantitative results on the fault detection capabilities and redundancy levels of different sets of test cases. Our key result is that test similarity maps, based on pair-wise diversity calculations, helped industrial practitioners identify issues with their test repositories and decide on actions to improve. We conclude that the visualisation of diversity information can assist testers in their maintenance and optimisation activities

Manipulation of Magnetic Skyrmions by Superconducting Vortices in Ferromagnet-Superconductor Heterostructures

Dynamics of magnetic skyrmions in hybrid ferromagnetic films harbors novel physical phenomena and holds promise for technological applications. In this work, we discuss the behavior of magnetic skyrmions when coupled to superconducting vortices in a ferromagnet-superconductor heterostructure. We use numerical simulations and analytic arguments to reveal broader possibilities for manipulating the skyrmion-vortex dynamic correlations in the hybrid system, that are not possible in its separated constituents. We explore the thresholds of particular dynamic phases, and quantify the phase diagram as a function of the relevant material parameters, applied current and induced magnetic torques. Finally, we demonstrate the broad and precise tunability of the skyrmion Hall-angle in presence of vortices, with respect to currents applied to either or both the superconductor and the ferromagnet within the heterostructure

Genomic selection in rubber tree breeding: A comparison of models and methods for managing G×E interactions

Several genomic prediction models combining genotype × environment (G×E) interactions have recently been developed and used for genomic selection (GS) in plant breeding programs. G×E interactions reduce selection accuracy and limit genetic gains in plant breeding. Two data sets were used to compare the prediction abilities of multienvironment G×E genomic models and two kernel methods. Specifically, a linear kernel, or GB (genomic best linear unbiased predictor [GBLUP]), and a nonlinear kernel, or Gaussian kernel (GK), were used to compare the prediction accuracies (PAs) of four genomic prediction models: 1) a single-environment, main genotypic effect model (SM); 2) a multienvironment, main genotypic effect model (MM); 3) a multienvironment, single-variance G×E deviation model (MDs); and 4) a multienvironment, environment-specific variance G×E deviation model (MDe). We evaluated the utility of genomic selection (GS) for 435 individual rubber trees at two sites and genotyped the individuals via genotyping-by-sequencing (GBS) of single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Prediction models were used to estimate stem circumference (SC) during the first 4 years of tree development in conjunction with a broad-sense heritability (H2) of 0.60. Applying the model (SM, MM, MDs, and MDe) and kernel method (GB and GK) combinations to the rubber tree data revealed that the multienvironment models were superior to the single-environment genomic models, regardless of the kernel (GB or GK) used, suggesting that introducing interactions between markers and environmental conditions increases the proportion of variance explained by the model and, more importantly, the PA. Compared with the classic breeding method (CBM), methods in which GS is incorporated resulted in a 5-fold increase in response to selection for SC with multienvironment GS (MM, MDe, or MDs). Furthermore, GS resulted in a more balanced selection response for SC and contributed to a reduction in selection time when used in conjunction with traditional genetic breeding programs. Given the rapid advances in genotyping methods and their declining costs and given the overall costs of large-scale progeny testing and shortened breeding cycles, we expect GS to be implemented in rubber tree breeding programs

The effect of corporate and business strategies on the post-acquisition changes to a management control system: a case study of a successful Brazilian experience

A great number of merger and acquisitions (M&A) have taken place in the last decades, but studies have shown that many of them turn out to be unsuccessful transactions from the perspective of value generation. The post-acquisition management control system (MCS) has been pointed out in the literature as key both for strategy implementation and for the success of these transactions. The objective of the research herein described was to analyse the effect of the corporate and business strategies on the changes to an acquired company’s MCS. The analysis supports three major conclusions: (1) changes to the acquired company’s MCS were derived from the new results-oriented strategy introduced by the acquirer with the intent of turning the acquired company in the world leader in its industry within 10 years; (2) the implementation of such strategy implied modifications in production, financial and quality controls; and (3) there is a strong link between the post-acquisition MCS and the success of the new strategy introduced by the acquirer in the acquired company. The results of this field study expand the knowledge on the topic, contributing to reducing the research gap in the management literature

O equilíbrio da matriz de transporte de cargas : ainda uma utopia

Orientador : José Eduardo Pécora Júnior.Artigo (especialização) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Sociais Aplicadas, Curso de Especialização MBA em Gerenciamento de Sistemas LogísticosInclui referênciasResumo : A oferta disponível de infraestrutura de transportes condiciona o processo da tomada de decisão pelo modal a usar. Uma infraestrutura eficiente, competitiva e equilibrada proporciona ganhos de escala e redução de preços. Entretanto, a infraestrutura de transportes é apontada como o fator mais problemático que inibe a competitividade global do Brasil. Com a finalidade de prover a infraestrutura com projetos adequados e capazes de aumentar a oferta de transporte, o Ministério dos Transportes lançou em 2007 a primeira versão do Plano Nacional de Logística e Transportes. Neste contexto, o objetivo principal deste artigo é verificar se a contribuição atual dos modais permitirá alcançar uma matriz de transportes de cargas eficiente, competitiva e equilibrada. Para isto foi realizada pesquisa bibliográfica em sites do Ministério dos Transportes, da ANAC, da ANTAQ, da ANTT, do DNIT, da Transpetro e da CNT, a fim de obter dados sobre o transporte de cargas efetuado por cada modal, a partir de 2005. Da análise dos dados disponíveis foi possível avaliar a condição atual da oferta de transporte

Emprego de metodologia de modelagem e simulação na operação da linha férrea singela Cascavel-Guarapuava

Orientador : Prof.Dr. José Eduardo Pécora JúniorDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Tecnologia, Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Produção. Defesa: Curitiba, 2016Inclui referências : f. 88-94Área de concentração: Pesquisa operacionalResumo: Ampliar infraestrutura de transporte de carga requer elevados recursos financeiros. Entretanto, antes de se ampliar a infraestrutura para adequar o nível de oferta de transporte de carga à demanda, indica-se realizar simulação para verificar se a capacidade da infraestrutura está efetivamente esgotada. O uso de simulação é oportuno, dado o baixo investimento necessário e a inexistência de impacto na operação da infraestrutura. Atualmente, a matriz de transporte brasileira é desequilibrada e dependente do modal rodoviário, portanto, uma maior participação do modal ferroviário é desejável para ajustar a matriz de transporte de carga. No Estado do Paraná, um grande produtor e exportador de grãos, o modal ferroviário participa do transporte da safra de grãos para exportação. A linha férrea Cascavel-Guarapuava, concessão da Estrada de Ferro Paraná Oeste S. A. – Ferroeste –em 2013, transportou 166.332 t das 7.510.000 t de soja exportadas pelo Estado do Paraná. Neste contexto, o objetivo do presente trabalho de pesquisa é investigar o cenário em que ocorre a exaustão em 2015 da capacidade do transporte de cargas, em trens/dia, da linha férrea singela Cascavel-Guarapuava. Para isto, é empregado modelagem, simulação e exploração de cenários, bem como o software de simulação baseado em eventos SIMUL8. Os resultados obtidos na simulação indicam existência de Capacidade Disponível na linha férrea Cascavel-Guarapuava de aproximadamente de 4 a 5 trens/dia. Além disso, são apresentados os trechos ferroviários que restringem a Capacidade Prática da ferrovia.Abstract: Expand cargo transport infrastructure requires large financial resources. However, before expanding the infrastructure to suit the cargo transport offer to meet the demand requirements, it is better to simulate to verify whether infrastructure's capacity is effectively exhausted. It's appropriate to use simulation, given the low investment required and no impact on the operation’s infrastructure. Nowadays, Brazilian transport matrix is unbalanced and it is highly dependent of road transportation. Therefore, it is desirable to improve use of rail transport to balance cargo transport matrix. In Paraná State, a great producer and exporter of grains, the railways transport grains to exportation. The Railway Cascavel-Guarapuava is a concession of Estrada de Ferro Paraná Oeste S. A. - Ferroeste – and in 2013, transported 166,332 tons of the total 7.51 million t soya exported by Paraná State. In this context, the objective of this research is to investigate the scenario of exhaustion of cargo transportation's capacity – trains/day – of Railway Cascavel-Guarapuava at 2015. Modeling, simulation, scenarios experiment and use of discrete event based simulation software – SIMUL8 – will be able to reach this goal. The results of the simulation show that there is Available Capacity of approximately 4 to 5 trains/day on Railway Cascavel-Guarapuava. Further, it was identified railroad tracks bottleneck, which limit Practical Capacity of the railway

Estudo da interação genótipo x ambiente e validação de marcadores microssatélites associados a QTLs para conteúdo de óleo e proteína em soja

A soja é uma das culturas de maior importância mundial devido ao óleo e proteína extraídos de suas sementes. Devido a esta importância, tivemos como objetivo a avaliação de linhagens do programa de Melhoramento Genético da Qualidade da soja na UFV no estado de Minas Gerais, quanto aos caracteres conteúdos de óleo e proteína, assim como para adaptabilidade e estabilidade das linhagens em três ambientes, sendo as últimas avaliadas pelas metodologias de Eberhart e Russell e Centróides. Juntamente a este, também se objetivou selecionar marcadores microssatélites associados à QTLs para conteúdo de óleo e proteína nestas linhagens. Para tal, um total de 56 locus de marcadores SSR, associados a conteúdo de óleo e proteína, foram utilizados. Assim, com relação as análises de adaptabilidade e estabilidade, foram selecionadas as linhagens 13, 18, 90, 148, 152, 172, 204, 206, 174 e 120 , para o caráter conteúdos de óleo, e as linhagens 124, 158 e 143, para proteína. Assim, na análise de agrupamento formou-se 21 grupos das 208 linhagens, com as 92, 184, Msoy 6101 e 192 apresentando maior dissimilaridade genotípica. Já para as análises de associação, não foi verificada associação a 1 e 5% de significância por meio da correção de Bonferroni. Todavia, foram selecionados os alelos 3 do marcador Satt 239 e 1 e 2 do Satt 539, para conteúdo de óleo, enquanto o alelo 1 do Satt 263, e o 3 do Satt 463, para conteúdo de proteína.Soy is one of the most important crops worldwide due to the oil and extracted protein from its seeds. Due to this importance, our objective was the evaluation of strains of soybean, from Quality Breeding program at UFV in the state of Minas Gerais, from oil and protein content as well as adaptability and stability of the lines in three environments, the latter being evaluated by the methods of Eberhart and Russell and Centróides. Also, we aimed to select SSR markers associated with QTLs for oil content and protein in these strains. A total of 56 locus of SSR markers, were used. Regarding the analysis of adaptability and stability, the strains 13, 18, 90, 148, 152, 172, 204, 206, 174 and 120. We selected for oil content, and the lines 124, 158 and 143, for protein. The grouping analysisformed 21 groups of 208 limhagens, with 92, 184, 6101 and 192 Msoy showing greater dissimilarity genotype. The association analyzes did not reveal any association at 1 and 5% significance level using the Bonferroni correction. However, allele 3 was selected alleles in marker 239, and alleles 1 and 2 at Satt 539, for oil, while allele 1 at Satt 263, and allele 3 at Satt 463 for protein content