Genome-wide association studies in sunflower : towards sclerotinia sclerotiorum and diaporthe/phomopsis resistance breeding

Diseases caused by necrotrophic fungi, such as the cosmopolitan Sclerotinia sclerotiorum and the Diaporthe/Phomopsis complex, are among the most destructive diseases of sunflower worldwide. The lack of complete resistance combined with the inefficiency of chemical control makes assisted breeding the best strategy for disease control. In this work, we present an integrated genome-wide association (GWA) study investigating the response of a diverse panel of sunflower inbred lines to both pathogens. Phenotypic data for Sclerotinia head rot (SHR) consisted of five disease descriptors (disease incidence, DI; disease severity, DS; area under the disease progress curve for DI, AUDPCI, and DS, AUDPCS; and incubation period, IP). Two disease descriptors (DI and DS) were evaluated for two manifestations of Diaporthe/Phomopsis: Phomopsis stem canker (PSC) and Phomopsis head rot (PHR). In addition, a principal component (PC) analysis was used to derive transformed phenotypes as inputs to a univariateGWA (PC-GWA). Genotypic data comprised a panel of 4269 single nucleotide polymorphisms (SNP), generated via genotyping-by-sequencing. The GWA analysis revealed 24 unique marker–trait associations for SHR, 19 unique marker–trait associations for Diaporthe/Phomopsis diseases, and 7 markers associated with PC1 and PC2. No common markers were found for the response to the two pathogens. Nevertheless, epistatic interactions were identified between markers significantly associated with the response to S. sclerotiorum and Diaporthe/Phomopsis. This suggests that, while the main determinants of resistance may differ for the two pathogens, there could be an underlying common genetic basis. The exploration of regions physically close to the associated markers yielded 364 genes, of which 19 were predicted as putative disease resistance genes. This work presents the first simultaneous evaluation of two manifestations of Diaporthe/Phomopsis in sunflower, and undertakes a comprehensive GWA study by integrating PSC, PHR, and SHR data. The multiple regions identified, and their exploration to identify candidate genes, contribute not only to the understanding of the genetic basis of resistance, but also to the development of tools for assisted breeding.Instituto de BiotecnologíaFil: Filippi, Carla Valeria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Filippi, Carla Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Corro Molas, Andres. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Anguil. Agencia de Extensión Rural General Pico; ArgentinaFil: Dominguez, Matías. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino; ArgentinaFil: Colombo, Denis Nahuel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Anguil; ArgentinaFil: Heinz, N. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Manfredi; ArgentinaFil: Troglia, Carolina Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Maringolo, Carla Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Quiroz, Facundo Jose. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Alvarez, Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Manfredi; ArgentinaFil: Lia, Veronica Viviana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Lia, Veronica Viviana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Lia, Veronica Viviana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Paniego, Norma Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Complete genome sequence of the plant pathogen Ralstonia solanacearum strain ciat-078, isolated in Colombia, obtained using Oxford Nanopore Technology

Moko is one of the main diseases affecting banana and plantain in Colombia. Here, we report the genome sequence of the causal agent, the bacterium Ralstonia solanacearum (Smith) strain CIAT-078, collected in 2004 from affected plantains in central-west Colombia. The assembled genome was obtained using Oxford Nanopore Technology

El cloze: su uso en la lectura comprensiva

El “cloze” consiste en un procedimiento para evaluar la comprensión lectora. Para eso se modifica un texto seleccionado, borrando sistemáticamente palabras que el alumno debe completar. Se vio la necesidad de aplicar esta metodología ya que observamos en evaluaciones escritas que la mayoría de los alumnos no colocan ningún signo de ortografía, lo cual no permite interpretar lo que escribieron ni a los alumnos entenderlo. Este test resultó útil para hacer un primer diagnóstico del grupo de alumnos de la asignatura. Objetivos: Determinar si se efectuaron inferencias o no y la coherencia global del párrafo luego de agregar las palabras faltantes en el texto.Facultad de Odontologí

Reflections on understanding academic texts

Nos propusimos evaluar la comprensión lectora en estudiantes de Fisiología a través de la preparación de un resumen para fomentar el desarrollo de competencias en dicha temática, A tal fin, se seleccionaron, al azar, 90 estudiantes de Fisiología de la Facultad de Odontología - UNLP, a los que se les entregaron fotocopias del Capítulo 55 del libro Bases Fisiológicas de la Práctica Médica; y se les solicitó la realización de un resumen, con la particularidad que constituya una síntesis de la comprensión de cada alumno sobre el tema, y los mismos fueron evaluados cuantitativamente. Las variables a considerar fueron: a) Copias textuales de fragmentos del capítulo, b) Generalización simple, c) Selección de: de contenido del texto, destacándolo en diagramas y con tipografía distinta y d) Construcción: se decide la inclusión de una oración determinante para saber si la construcción es completa o no. Así tenemos: a) 30 copias (33,33 %); b) Generalización simple 27%, c) Selección: diagramas 6,66%, tipografía distinta 2%, d) Construcción completa 21%, construcción incompleta 8%. Una tercera parte de los estudiantes se copia, prácticamente la cuarta parte efectúa un proceso de construcción y otro tanto escribe una generalización simple, la selección de contenidos, llamó mucho la atención la presencia de diagramas.We set out to assess reading comprehension in Physiology students through the execution of a summary and encourage the development of reading comprehension skills. 90 Physiology students from the Faculty of Dentistry - UNLP were given 90 photocopies of Chapter 55 of the book Physiological Bases of Medical Practice. Next, they are asked to write a resume, with the particularity that the summary constitutes a synthesis of the understanding of each student on the subject. A quantitative analysis is carried out. The variables are: a) Verbatim copies of fragments of the chapter, b) Simple generalization, c) Selection of: text content, highlighting them in diagrams and with different typography and d) Construction: the inclusion of a determining sentence is decided to know if the construction is complete or not. Thus we have: a) 30 copies (33.33%); b) Simple generalization 27%, c) Selection: diagrams 6.66%, different typography 2%, d) Complete construction 21%, incomplete construction 8% A third of the students it is copied. Practically the fourth part carries out a construction process and the same number writes a simple generalization, the selection of contents, the presence of diagrams drew much attention.Facultad de Odontologí

Diversidad funcional y tabaco

Introducción: Las personas con Diversidad Funcional tienen mayor tendencia al consumo abusivo de sustancias exotóxicas adictivas, entre ellas en nuestro objeto de estudio, el tabaco. Con nuestro Proyecto de Extensión ¿Fumar es un Placer? Buscamos incorporar conocimientos para inducir cambio de hábitos con respecto al consumo de tabaco, higiene oral y dieta saludable en alumnos que concurren a Escuelas para adultos alfabetizándose en la ciudad de Berisso. Objetivos: incrementar por lo menos en un 50% el conocimiento de los riesgos que implica el consumo de tabaco a nivel sistémico y a nivel local.Facultad de Odontologí

Socioeconomic status impact on diet quality and body mass index in eight Latin American countries: ELANS study results

Poor health and diet quality are associated with living within a low socioeconomic status (SES). This study aimed to investigate the impact of SES on diet quality and body mass index in Latin America. Data from the “Latin American Health and Nutrition Study (ELANS)”, a multi-country, population-based study of 9218 participants, were used. Dietary intake was collected through two 24 h recalls from participants of Argentina, Brazil, Chile, Colombia, Costa Rica, Ecuador, Peru and Venezuela. Diet quality was assessed using the dietary quality score (DQS), the dietary diversity score (DDS) and the nutrients adequacy ratio (NAR). Chi-squared and multivariate-variance analyses were used to estimate possible associations. We found that participants from the low SES consumed less fruits, vegetables, whole grains, fiber and fish and seafood and more legumes than those in the high SES. Also, the diet quality level, assessed by DQS, DDS and NAR mean, increased with SES. Women in the low SES also showed a larger prevalence of abdominal obesity and excess weight than those in the middle and high SES. Health policies and behavioral-change strategies should be addressed to reduce the impact of socioeconomic factors on diet quality and body weight, with gender as an additional level of vulnerability.UCR::Vicerrectoría de Docencia::Salud::Facultad de Medicina::Escuela de MedicinaUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias de la Salud::Centro de Investigación en Neurociencias (CIN)UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Sociales::Instituto de Investigaciones Psicológicas (IIP

Relato de nuestra experiencia post-pandemia

Introducción: Como equipo extensionista nuestras prácticas en salud se han enfocado en las consecuencias del consumo de tabaco. Nuestros destinatarios son estudiantes Adultos de la Localidad de Berisso, que concurren a las Escuelas N° 703, 708, 707, 710. Nuestro grupo de trabajo valora la importancia que tiene la preservación de la salud y desarrollamos actividades de protección y prevención, ya que el consumo de tabaco es un factor de riesgo determinante en distintas enfermedades. Pero dejar de fumar no es nada fácil. Nuestro proyecto se encuentra enmarcado en una enseñanza con perfil extensionista en la que, los alumnos y docentes se involucran y comprometen con la comunidad. A su vez, utiliza la interdisciplinariedad para que el proyecto se nutra y amplíe, expresando distintas visiones de como atacar el problema. Como equipo realizamos todos los esfuerzos necesarios para que el trabajo se adecue a la realidad con objetivos factibles/viables, adaptándonos a las diferentes realidades complejas de los sujetos. Si reconocemos que es un hábito difícil de abandonar, debemos procurarle a esta comunidad herramientas para la detección temprana de posibles lesiones ocasionadas por el tabaco. En estos talleres haremos prevalecer el respeto hacia nuestros semejantes y estamos dispuestos a dialogar y evacuar dudas a todos aquellos destinatarios que nos acerquen sus inquietudes. Consideramos que el primer nivel de atención es la auto-atención o autocuidado en donde sea la misma Comunidad y las personas las que toman las decisiones y acciones sobre su propia salud, por lo que nuestras intervenciones estarán focalizadas en empoderar a los destinatarios en la construcción colectiva de nuevos saberes para una mejor toma de decisiones sobre salud. Por eso, proponemos el autoexamen de la cavidad bucal para la identificación de una mucosa sana de otra con lesiones.Facultad de Odontologí