Caractérisation des levures avec des télomères humains et essais de complémentation entre la télomérase de levure et la télomérase humaine chez Saccharomyces cerevisiae

Les télomères, structures nucléoprotéiques présentes aux extrémités terminales des chromosomes linéaires, ont pour rôle essentiel de maintenir la stabilité des génomes eucaryotes. Chez la levure bourgeonnante Saccharomyces cerevisiae, l'ADN télomérique consiste en la répétition de la séquence irrégulière [TG1-3/C1-3A] alors que [T2AG3/C3TA2] est l'unité répétitive présente chez la plupart des télomères de cellules de mammifères. La maintenance de ces répétitions télomériques est assurée par une enzyme spécialisée: la télomérase. Cette ribonucléoprotéine, conservée au cours de l'évolution, comprend une unité catalytique associée à une unité ARN où une courte séquence est utilisée comme matrice pour l'ajout de répétitions télomériques spécifiques à l'espèce. In vitro, seules ces deux composantes sont essentielles pour l'activité télomérase alors que in vivo ce processus est plus complexe et requiert d'autres protagonistes. De précédents travaux ont montré que la simple substitution de la séquence matrice ARN de S. cerevisiae par une séquence matrice humaine permettait l'addition de répétitions télomériques humaines aux extrémités endogènes des chromosomes de levures. [Résumé abrégé par UMI

Réplication des télomères humanisés chez la levure Saccharomyces cerevisiae

Des cellules de levures dont les chromosomes se finissent par des répétitions télomériques humaines, peuvent être conçues en remplaçant simplement la séquence matrice ARN originale de la télomérase (TLC1) par une séquence matrice humaine (tlc1h). Dans ces levures dites « humanisées », les télomères sont courts mais stables avec une extension télomérique humaine 3' simple brin. Néanmoins, ces séquences humaines inhabituelles au niveau des télomères de Saccharomyces cerevisiae engendrent différentes réponses cellulaires. Après la substitution initiale de la séquence matrice de TLC1, les répétitions télomériques levures sont graduellement remplacées par les répétitions humaines qui sont reconnues comme un dommage par la cellule : la protéine Rad53p est phosphorylée. Cette activation de Rad53p est synonyme d'activation des points de contrôle du cycle cellulaire et en effet un délai en phase G2/M du cycle cellulaire est observé. L'accumulation en G2/M augmente avec le degré d'humanisation des télomères, et le phénotype terminal observé aux générations les plus avancées est un réarrangement chromosomique suite aux fusions entre télomères. La réintroduction d'une copie originale de TLC1 comme unique matrice ARN dans une levure qui était précédemment humanisée montrerait que le bloc télomérique humain distal, et plus précisément le simple brin télomérique humain T[indice inférieur 2]AG[indice inférieur 3], serait le signal responsable de la phosphorylation de Rad53p, tandis qu'un bloc [T[indice inférieur 2]AG[indice inférieur 3]/C[indice inférieur 3]TA[indice inférieur 2]] à un site interne ne déclenche ni l'activation de Rad53p, ni les points de contrôle du cycle cellulaire. Tandis que les phénotypes associés à l'activation des points de contrôles du cycle cellulaire n'apparaissent seulement qu'aux générations avancées, la télomérase devient essentielle aussitôt que la cellule de levure contient tlc1h comme matrice ARN unique. L'abolition de l'expression de tlc1h ou l'expression d'un mutant catalytique de la télomérase mène à une perte immédiate de la viabilité sans sénescence. Cela suggère une augmentation dramatique de la fréquence des évènements de raccourcissements critiques des télomères qui doivent être surmontés par une télomérase active. Nous nous sommes dès lors demandé si les répétitions télomériques humaines causaient des problèmes pour la machinerie de réplication de l'ADN chez la levure. En effet, les analyses de gel à deux dimensions ont révélé des intermédiaires de réplication non conventionnels indiquant qu'un télomère humanisé cause une pause au niveau de la fourche de réplication. En accord avec cette observation, la mutation de certains gènes impliqués dans la stabilité ou la progression des fourches cause une augmentation de la sensibilité des levures humanisées aux agents endommageant l'ADN. Ces derniers résultats expliqueraient le rôle obligatoire de la télomérase chez la levure humanisée qui viendrait compenser la perte des répétitions télomériques suite à la pause voire l'écroulement de la fourche de réplication

La micro finance en Guinée : articulations entre finance formelle et informelle et lutte contre la pauvreté au Fouta Djalon

This research focusing on micro finance covers the Middle Guinea area or Fouta Djalon, one of the four natural regions of Guinea. The main objective is to review how micro finance helps to articulate formal finance (banks) and informal finance (tontines, village banks, etc.) in order to provide sustainable financial services in rural areas and to examine the effect on the fight against poverty. At both regional (West Africa) and national levels (Guinea), we noted that the various financial sectors operate in a relatively flexible partitioned context. The micro finance sector, the latest financial sector, is now a strong alternative in the collection of savings and financing of local activities through innovative mechanisms established mainly on the basis of the proximity to local populations. However, we have shown how two visions of micro finance are continuing to compete: the social one, based on the goodwill of donors, so heavily dependent on donors; and the other, commercial, institutional one, based on the willingness to build a real functional autonomy of the MFI technically, financially and in human terms. In addition, we have shown how the debate on the relationship between micro finance and poverty is not yet settled, as the impact on the field is challenging for researchers and funders regarding the effectiveness of micro finance as a tool for effective poverty reduction. The question remains how micro finance can be an element of de-partitioning through an articulation between formal finance and informal finance. To answer this question, we identified two arguments which are the two parts of the thesis. The first part outlines the diversity of modes of financing in West Africa, articulating the link between micro finance and poverty, repeating the theoretical debates that continue to clash on this issue, and presents the challenge in articulating financial services as a solution for breaking down barriers and improving the provision of such services. The second part shows empirical examples of nexus between banking, micro finance and informal finance through the practices of users, but states some concerns about the future of this activity in the region.Cette recherche qui porte sur la micro finance a comme zone d’étude la Moyenne Guinée ou Fouta Djallon, une des quatre régions naturelles de la Guinée. L’objectif principal est d’analyser la façon dont la micro finance contribue à articuler la finance formelle (banques) et la finance informelle (tontines, banques villageoises, etc.) pour fournir des services financiers durables en milieu rural et d’étudier son incidence sur la lutte contre la pauvreté. Tant au plan régional (Afrique de l’Ouest) qu’au plan national guinéen, nous avons souligné que les différents secteurs financiers fonctionnent dans un contexte de cloisonnement relativement souple. Le secteur de la micro finance, le dernier né des secteurs financiers, constitue aujourd’hui une alternative forte dans la collecte de l’épargne et le financement des activités locales à travers des mécanismes novateurs établis essentiellement sur la base de la proximité avec les populations locales. Pourtant, nous montrons comment deux visions de la micro finance continuent à s’affronter : l’une sociale, fondée sur le bon vouloir des donateurs, donc fortement dépendante des bailleurs de fonds; l’autre, commerciale, institutionnelle, fondée sur la volonté de construire une véritable autonomie fonctionnelle de l’IMF, à la fois aux plans, technique, financier et humain. Par ailleurs, nous avons montré comment le débat sur le lien entre micro finance et pauvreté n’est pas encore tranché, tant les impacts sur le terrain interpellent les chercheurs et les bailleurs de fonds sur l’efficacité de la micro finance comme outil de réduction effective de la pauvreté. La question demeure de voir comment la micro finance peut être un élément de décloisonnement à travers une articulation entre finance formelle et finance informelle. Pour répondre à cette question, nous avons identifié deux arguments qui constituent les deux parties de la thèse. La première partie expose la diversité des modes de financement en Afrique de l’Ouest, fait le lien entre micro finance et pauvreté, en reprenant les débats théoriques qui continuent à s’affronter sur cette question et présente la problématique de l’articulation entre services financiers comme solution de décloisonnement et d’amélioration de la fourniture des dits services. La deuxième partie montre des exemples empiriques d’articulation entre banque, micro finance et finance informelle à travers les pratiques des usagers et formule quelques préoccupations sur le devenir de cette activité dans la région

Identificació i anàlisi dels compostos orgànics del combretum micranthum (kinkeliba)

Aquest treball és el fruit de la identificació i l’anàlisi dels compostos lipídics del Combretum micranthum conegut com a kinkeliba. En aquesta anàlisi hem pogut destacar la gran presència d’alcans, alcohols, àcids, terpenoides i esterols com el β- sitosterol( un compost important en la biomedicina) i també a part de la presència de la vitamina E comú de les plantes verdes, s’ha pogut identificar la vitamina K de gran importància que serveix com a cofactor en l'activació de la proteïna en el cos humà.Este trabajo es el fruto de la identificación y análisis de los compuestos lipídicos del Combretum micranthum conocido como kinkeliba. En este análisis hemos podido destacar la gran presencia de alcanos, alcoholes, ácidos, terpenoides y esteroles como el β- sitosterol (un compuesto importante en la biomedicina) y también aparte de la presencia de la vitamina E común de las plantas verdes, se ha podido identificar la vitamina K de gran calado que sirve como cofactor en la activación de la proteína en el cuerpo humano.This work is the result of the identification and analysis of the lipid compounds of Combretum micranthum known as kinkeliba. In this analysis we have been able to highlight the great presence of alkanes, alcohols, acids, terpenoids and sterols such as β-sitosterol (an important compound in biomedicine) and also apart from the presence of vitamin E common to green plants, we have been able to identify the very important vitamin K which serves as a cofactor in protein activation in the human body

The telomeric transcriptome of Schizosaccharomyces pombe

Eukaryotic telomeres are transcribed into telomeric repeat-containing RNA (TERRA). Telomeric transcription has been documented in mammals, birds, zebra fish, plants and budding yeast. Here we show that the chromosome ends of Schizosaccharomyces pombe produce distinct RNA species. As with budding yeast and mammals, S. pombe contains G-rich TERRA molecules and subtelomeric RNA species transcribed in the opposite direction of TERRA (ARRET). Moreover, fission yeast chromosome ends produce two novel RNA species: C-rich telomeric repeat-containing transcripts (ARIA) and subtelomeric transcripts complementary to ARRET (αARRET). RNA polymerase II (RNAPII) associates with pombe chromosome ends in vivo and the telomeric factor Rap1 negatively regulates this association, as well as the cellular accumulation of RNA emanating from chromosome ends. We also show that the RNAPII subunit Rpb7 and the non-canonical poly(A) polymerases Cid12 and Cid14 are involved in the regulation of TERRA, ARIA, ARRET and αARRET transcripts. We confirm the evolutionary conservation of telomere transcription, and reveal intriguing similarities and differences in the composition and regulation of telomeric transcripts among model organism

Outcome of surgical management of genital prolapse in the obstetric gynecology department of the Ignace Deen Hospital in Conakry, Guinea

Background: Each year several patients are operated on for genital prolapse in our department, but no study has yet been done to analyse the results. The objective of this study was to highlight the operating techniques used and to analyse the anatomical and functional outcomes.Methods: It was an observational, longitudinal, prospective and descriptive study which took place over a period of 2 years in the department of obstetrics and gynecology of the Ignace Deen hospital de Conakry in Guinea. This study focused on patients operated on in the department for genital prolapse.Results: During the study period, 67 patients underwent genital prolapse surgery in the department. The operating techniques used are the triple perineal operation or, associated with colposuspension and/or Richter or Mc Call, Richardson's operation, Rouhier's operation and promonto-fixation. This study recorded in the follow up a case of recurrence of hysterocele one year after a Richardson operation, a correction of all digestive and sexual functional disorders and a correction of 81.25% of functional urinary disorders. The intraoperative complications were a rectal wound, two bladder wounds and three cases of hemorrhage requiring blood transfusion. The post-operative results were good in 98.5% of the cases.Conclusions: The lower approach is the main route used for surgical treatment of prolapse. The anatomical and functional results obtained are encouraging

Prevalence and awareness of diabetes in Guinea: findings from a WHO STEPS

Aims: The aim of the present study was to determine the prevalence of diabetes, and to assess its awareness and related risk factors among adult Guineans.Methods: A population-based cross-sectional survey was conducted on 1 100  adults (46.6% women) aged 35–64 years from Lower Guinea, during September to December 2009, using the WHO STEPwise approach of surveillance of chronic  disease risk factors. Data were collected in three steps: demographic and  behavioural risk factors, blood pressure and anthropometric measurements, and fasting blood cholesterol and glucose testing. A multi-stage cluster sample design was applied to generate nationwide representative data.Results: The mean age of all participants was 47.3 years (SD 8.8), similarly in  Conakry, rural Lower Guinea and urban Lower Guinea. The prevalence of diabetes was 5.7% (95% CI 4.0–8.1). Among participants with diabetes, only 44.0% were aware of their status. In multivariable logistic regression analysis, determinants of diabetes prevalence were urban residency, male sex, age group 45–64 years, increased waist circumference, hypertension and hypercholesterolemia. Male sex, rural residency, age group 45–54 years, no formal education, waist circumference, hypertension and hypercholesterolemia were independent predictors of screen-detected diabetes.Conclusion: The present study found a high prevalence and low awareness of  diabetes, suggesting the need for appropriate actions to strengthen primary  healthcare approaches towards non-communicable diseases in Guinea.Keywords: Diabetes, epidemiology, Guine

Use of Viremia to Evaluate the Baseline Case Fatality Ratio of Ebola Virus Disease and Inform Treatment Studies: A Retrospective Cohort Study.

BACKGROUND: The case fatality ratio (CFR) of Ebola virus disease (EVD) can vary over time and space for reasons that are not fully understood. This makes it difficult to define the baseline CFRs needed to evaluate treatments in the absence of randomized controls. Here, we investigate whether viremia in EVD patients may be used to evaluate baseline EVD CFRs. METHODS AND FINDINGS: We analyzed the laboratory and epidemiological records of patients with EVD confirmed by reverse transcription PCR hospitalized in the Conakry area, Guinea, between 1 March 2014 and 28 February 2015. We used viremia and other variables to model the CFR. Data for 699 EVD patients were analyzed. In the week following symptom onset, mean viremia remained stable, and the CFR increased with viremia, V, from 21% (95% CI 16%-27%) for low viremia (V < 104.4 copies/ml) to 53% (95% CI 44%-61%) for intermediate viremia (104.4 ≤ V < 105.2 copies/ml) and 81% (95% CI 75%-87%) for high viremia (V ≥ 105.2 copies/ml). Compared to adults (15-44 y old [y.o.]), the CFR was larger in young children (0-4 y.o.) (odds ratio [OR]: 2.44; 95% CI 1.02-5.86) and older adults (≥ 45 y.o.) (OR: 2.84; 95% CI 1.81-4.46) but lower in children (5-14 y.o.) (OR: 0.46; 95% CI 0.24-0.86). An order of magnitude increase in mean viremia in cases after July 2014 compared to those before coincided with a 14% increase in the CFR. Our findings come from a large hospital-based study in Conakry and may not be generalizable to settings with different case profiles, such as with individuals who never sought care. CONCLUSIONS: Viremia in EVD patients was a strong predictor of death that partly explained variations in CFR in the study population. This study provides baseline CFRs by viremia group, which allow appropriate adjustment when estimating efficacy in treatment studies. In randomized controlled trials, stratifying analysis on viremia groups could reduce sample size requirements by 25%. We hypothesize that monitoring the viremia of hospitalized patients may inform the ability of surveillance systems to detect EVD patients from the different severity strata