Syndromic Surveillance for Bioterrorism-related Inhalation Anthrax in an Emergency Department Population

Objective: To utilize clinical data from emergency department admissions and published clinical case reports from the 2001 bioterrorism-related inhalation anthrax (IA) outbreak to develop a detection algorithm for syndromic surveillance. Methods: A comprehensive review of case reports and medical charts was undertaken to identify clinical characteristics of IA. Eleven historical cases were compared to 160 patients meeting a syndromic case definition based on acute respiratory failure and the presence of mediastinal widening or lymphadenopathy on a chest radiograph. Results: The majority of syndromic group patients admitted were due to motor vehicle accident (52%), followed by fall (10%), or other causes (4%). Positive culture for a gram positive rod was the most predictive feature for anthrax cases. Among signs and symptoms, myalgias, fatigue, sweats, nausea, headache, cough, confusion, fever, and chest pain were found to best discriminate between IA and syndromic patients. When radiological findings were examined, consolidation and pleural effusions were both significantly higher among IA patients. A four step algorithm was devised based on combinations of the most accurate clinical features and the availability of data during the course of typical patient care. The sensitivity (91%) and specificity (96%) of the algorithm were found to be high. Conclusions: Surveillance based on late stage findings of IA can be used by clinicians to identify high risk patients in the Emergency Department using a simple decision tree. Implications for public health: Monitoring pre-diagnostic indicators of IA can provide enough credible evidence to initiate an epidemiological investigation leading to earlier outbreak detection and more effective public health response

PatientExploreR: an extensible application for dynamic visualization of patient clinical history from electronic health records in the OMOP common data model.

MotivationElectronic health records (EHRs) are quickly becoming omnipresent in healthcare, but interoperability issues and technical demands limit their use for biomedical and clinical research. Interactive and flexible software that interfaces directly with EHR data structured around a common data model (CDM) could accelerate more EHR-based research by making the data more accessible to researchers who lack computational expertise and/or domain knowledge.ResultsWe present PatientExploreR, an extensible application built on the R/Shiny framework that interfaces with a relational database of EHR data in the Observational Medical Outcomes Partnership CDM format. PatientExploreR produces patient-level interactive and dynamic reports and facilitates visualization of clinical data without any programming required. It allows researchers to easily construct and export patient cohorts from the EHR for analysis with other software. This application could enable easier exploration of patient-level data for physicians and researchers. PatientExploreR can incorporate EHR data from any institution that employs the CDM for users with approved access. The software code is free and open source under the MIT license, enabling institutions to install and users to expand and modify the application for their own purposes.Availability and implementationPatientExploreR can be freely obtained from GitHub: https://github.com/BenGlicksberg/PatientExploreR. We provide instructions for how researchers with approved access to their institutional EHR can use this package. We also release an open sandbox server of synthesized patient data for users without EHR access to explore: http://patientexplorer.ucsf.edu.Supplementary informationSupplementary data are available at Bioinformatics online

Νευρομηχανική τεκμηρίωση του βαθμού αστάθειας της μονοποδικής όρθιας στάσης επί ελαστικού ιμάντος

ΕΙΣΑΓΩΓH. Ο ορθοστατικός έλεγχος αναφέρεται στη λειτουργία της διατήρησης της σωματικής σταθερότητας σε στατικές ή σε δυναμικές συνθήκες. Η μείωση της επιφάνειας της βάσης στήριξης και η εισαγωγή βαθμών αστάθειας λόγω ιδιαιτερότητας της επιφάνειας στήριξης διαταράσσει και στο σύστημα ορθοστατικού ελέγχου. Ο ιμάντας ισορροπίας αποτελεί μια επιφάνεια στήριξης που εισάγει αστάθεια σε πολλαπλές κατευθύνσεις χωρίς όμως να είναι τεκμηριωμένος ο βαθμός αστάθειας του συγκριτικά με άλλες ασταθείς επιφάνειες. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η τεκμηρίωση του βαθμού αστάθειας του ιμάντα μέσω της σύγκρισης του με άλλες ασταθείς επιφάνειες καθώς και τη σταθερή επιφάνεια του εδάφους κατά τη μονοποδική όρθια στάση. ΜΕΘΟΔΟΣ. Δεκαπέντε υγιή φυσικά δραστήρια άτομα (ηλικίας 25.9 ± 3.5 ετών, σωματικού αναστήματος 172.9 ± 7.4 cm, σωματικής μάζας 68.7 ± 10 kg και με ΔΜΣ 22.9 ± 2.1 kg/m2, με προηγούμενη εμπειρία σε ασκήσεις μονοποδικής όρθιας στάσης και απουσία συμβάντος τραυματισμού στα κάτω άκρα του τελευταίους 6 μήνες) εκτέλεσαν προσπάθειες μονοποδικής όρθιας στάσης στη σταθερή επιφάνεια του εδάφους και σε 4 ασταθείς επιφάνειες (αφρώδες στρώμα, φουσκωτός δίσκος, περιστρεφόμενος δίσκος και ιμάντας ισορροπίας) (κυρίαρχο κάτω άκρο, 3 προσπάθειες των 30δευτ σε κάθε επιφάνεια). Η συλλογή δεδομένων (συχνότητα δειγματοληψίας 200 Hz) πραγματοποιήθηκε μέσω της λειτουργίας G-Force Meter της εφαρμογής κινητού τηλεφώνου Physics Toolbox (λειτουργικό σύστημα android), η οποία προσφέρει δεδομένα γραμμικής επιτάχυνσης στον τρισδιάστατο χώρο μέσω του αδρανειακού αισθητήρα που είναι ενσωματωμένος στο κινητό τηλέφωνο. Για κάθε επιφάνεια, και στις 3 διευθύνσεις του χώρου (Χ: πλάγια, Υ: κατακόρυφη, Ζ: προσθιοπίσθια), υπολογίστηκε η μέγιστη (max) και η μέση (average) γραμμική επιτάχυνση καθώς και η μεταβλητότητα της (CV%). Για τη στατιστική ανάλυση εφαρμόσθηκε μονοπαραγοντική ανάλυση διασποράς επαναληπτικών μετρήσεων (5 επίπεδα κύριου παράγοντα) και ενδοζευγικές συγκρίσεις μεταξύ των τύπων επιφανειών (SPSS v.25.0, p < 0,05). ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ. Στον ιμάντα, και για τις 3 χωρικές διευθύνσεις, εμφανίστηκαν οι μεγαλύτερες τιμές επιτάχυνσης (μέγιστης και μέσης) καθώς και της μεταβλητότητας αυτής (CV%), συγκριτικά με όλες τις άλλες επιφάνειες. Όλες οι διαφορές μεταξύ του ιμάντα και των υπολοίπων επιφανειών ήταν στατιστική σημαντικές (p ≤ 0.05), εκτός από τη μέγιστη τιμής της πλάγιας επιτάχυνσης για τον περιστρεφόμενο δίσκο και τη μεταβλητότητα αυτής για το αφρώδες στρώμα καθώς και τη μέση και μέγιστη κατακόρυφη επιτάχυνση για τον περιστρεφόμενο δίσκο και τη μεταβλητότητα αυτής κατά τη σύγκριση του ιμάντα με όλες τις άλλες επιφάνειες. ΣΥΜΠΕΡΑΣΜΑΤΑ. Κατά τη μονοποδική όρθια στάση, επί ιμάντος εμφανίζονται οι μεγαλύτερες μέγιστες επιταχύνσεις και μέσες επιταχύνσεις συγκριτικά με τις άλλες εξεταζόμενες επιφάνειες. Το ίδιο φαίνεται να ισχύει και για τη μεταβλητότητα της επιτάχυνσης επί ιμάντος με εξαίρεση την υψηλότερη μεταβλητότητα κατά μονοποδική στάση στον περιστρεφόμενο δίσκο. Τα αποτελέσματα επιβεβαιώνουν την ερευνητική υπόθεση ότι η επιφάνεια του ιμάντα είναι ικανή να διαταράσσει σε μεγαλύτερο βαθμό τη μονοποδική όρθια στάση από τις υπόλοιπες επιφάνειες ασταθούς στήριξη και την αναδεικνύουν ως ένα ισχυρό προπονητικό εργαλείο για μια εναλλακτική και συμπληρωματική προσέγγιση για τη βελτίωση ή αποκατάσταση του ορθοστατικού ελέγχου.ΟΧ

Syndromic Surveillance during Pandemic (H1N1) 2009 Outbreak, New York, New York, USA

We compared emergency department and ambulatory care syndromic surveillance systems during the pandemic (H1N1) 2009 outbreak in New York City. Emergency departments likely experienced increases in influenza-like-illness significantly earlier than ambulatory care facilities because more patients sought care at emergency departments, differences in case definitions existed, or a combination thereof

Red blood cell alloantibody titration - Does the titration method matter?

Background: Red blood cell (RBC) alloantibody titration is a quasi-quantitative method to assess antibody concentration and is considered a useful means of estimating maternal alloimmunization during pregnancy. Traditionally, titration is performed using conventional tube test (CTT). The gel microcolumn agglutination-based method (GMA) has been proven reliable for many immunohematology tests. Our study compared CTT with GMA of two different, commercially available GMA systems for RBC alloantibody titration. Methods: Serum samples with significant RBC-alloantibodies were evaluated in our study. Each sample was titrated concurrently with CTT, with ID-DiaMed-GmbH, Cressier, Switzerland (GMA1), and with DG Gel Coombs Diagnostic Grifols, Passeig Fluvial, Spain (GMA2). Results: One hundred thirty-seven titration tests including 50 anti-D, 25 anti-Kell, 10 anti-E, 9 anti-Jka, 8 anti-c, 5 anti-Cw, 5 anti-Fya, 7 anti-M, 6 anti-Kpa, 3 anti-Lua, 1 anti-e, 3 anti-G, and 2 anti-Cha were performed and evaluated. Samples tested by CTT versus GMA1 and GMA2 generated mostly equal or higher titers by GMAs. The results of both comparisons were in good agreement (W = 0.91, p < 0.0001, and W = 0.92, p < 0.0001, respectively). For all antibody specificities, the mean absolute difference in titers ranged from 1 - 3 for both GMA1 and GMA2 versus CTT. Samples tested by GMA1 vs. GMA2 were in almost perfect agreement (W = 0.95, p < 0.0001). Conclusions: Although both GMAs were found slightly more sensitive than CTT for alloantibody titration, the differences were not significant and the agreement between all methods was very good, possibly indicating GMA as a suitable alternative to CTT in RBC antibody titration. © 2020 Verlag Klinisches Labor GmbH. All rights reserved