Big-data, a digital ocean in the Information Society

Inmersos en la revolución digital, generamos constantemente datos y la mayoría son almacenados. Es lo que se ha denominado los “datos grandes” o Big-data. Junto con el capital y la fuerza de trabajo, los datos se han convertido en un valor añadido para la economía que refleja un futuro con un paradigma revolucionario en el que la sociedad será dirigida por los datos. El futuro está en la investigación, tratamiento y aplicación de los datos que aportarán prosperidad a nuestra sociedad. En el presente artículo se recogen las normas y leyes que existen hoy en día en el Big-data y la regulación existente. Para analizar Big-data la solución pasa por el aprendizaje automático (Machine-Learning) que se ocupa de la construcción y el estudio de los algoritmos que pueden aprender a partir de datos. Existen muchas técnicas, como estadística descriptiva, clasificación o agrupamiento. En este artículo se recoge las tecnologías que se utilizan para almacenar y analizar los “Big-data”.Immersed in the digital revolution, we generate data consistently and most are stored. This is what has been called the Big-data. Along with capital and labor force data have become an added value to the economy that reflects a future with a revolutionary paradigm in which society will be directed by the data. The future is in research, treatment and application data that will bring prosperity to our society. In this article the rules and laws that exist today in the Big-data and existing regulations are collected. To analyze the Big-data passes through the machine learning that deals with the construction and study of algorithms that can learn from data solution. There are many techniques such as descriptive statistics, sorting or grouping. This article describes the technologies that are used to store and analyze the “Big data” is collected

Healthy lifestyle, metabolomics and incident type 2 diabetes in a population-based cohort from Spain

This work was supported by the Strategic Action for Research in Health sciences [PI10/0082, PI13/01848, PI14/00874, PI16/01402, PI11/00726, PI16/609, PI16/1512, PI18/287, PI19/319 and PI20/00896], the GUTMOM Project (JPI-A Healthy Diet for a Healthy Life INTIMIC-085, State Secretary of R + D + I PCIN-2017-117), the Cátedra de Epidemiología y Control del Riesgo Cardiovascular at UAM (#820024), the State Agency for Research (PID2019-108973RB-C21 and C22), the Valencia Government (GRUPOS 03/101; PROMETEO/2009/029 and ACOMP/2013/039), the Castilla-Leon Government (GRS/279/A/08) and European Network of Excellence Ingenious Hypercare (EPSS- 037093) from the European Commission; CIBER Fisiopatología Obesidad y Nutrición (CIBEROBN) (CIBER-02-08-2009, CB06/03 and CB12/03/30016). MSP holds a Ramón y Cajal contract (RYC-2018-025069-I) from the Ministry of Science, Innovation and Universities. MDV holds a “Predoctoral Training in Health Research” contract (FI20/00162) from the Carlos III Health Institute. MGP and ADR received the support of a fellowship from “la Caixa” Foundation (ID 100010434, fellowship codes LCF/BQ/IN18/11660001, and LCF/BQ/DR19/11740016, respectively). PO received the support of a Sara Borrell contract from the Carlos III Health Institute (reference CD16/00255). The Strategic Action for Research in Health Sciences, CIBEROBN are initiatives from Carlos III Health Institute Madrid and co-funded by the European Social Fund “The ESF - investing in your future”. The State Agency for Research and Carlos III Health Institute belong to the Spanish Ministry of Science and Innovation. The funding bodies had no role in the study design, data collection and analysis, interpretation of results, manuscript preparation or in the decision to submit this manuscript for publication.Background: The contribution of metabolomic factors to the association of healthy lifestyle with type 2 diabetes risk is unknown. We assessed the association of a composite measure of lifestyle with plasma metabolite profiles and incident type 2 diabetes, and whether relevant metabolites can explain the prospective association between healthy lifestyle and incident type 2 diabetes. Methods: A Healthy Lifestyle Score (HLS) (5-point scale including diet, physical activity, smoking status, alcohol consumption and BMI) was estimated in 1016 Hortega Study participants, who had targeted plasma metabolomic determinations at baseline examination in 2001–2003, and were followed-up to 2015 to ascertain incident type 2 diabetes. Results: The HLS was cross-sectionally associated with 32 (out of 49) plasma metabolites (2.5% false discovery rate). In the subset of 830 participants without prevalent type 2 diabetes, the rate ratio (RR) and rate difference (RD) of incident type 2 diabetes (n cases = 51) per one-point increase in HLS was, respectively, 0.69 (95% CI, 0.51, 0.93), and − 8.23 (95% CI, − 16.34, − 0.13)/10,000 person-years. In single-metabolite models, most of the HLS-related metabolites were prospectively associated with incident type 2 diabetes. In probit Bayesian Kernel Machine Regression, these prospective associations were mostly driven by medium HDL particle concentration and phenylpropionate, followed by small LDL particle concentration, which jointly accounted for ~ 50% of the HLS-related decrease in incident type 2 diabetes. Conclusions: The HLS showed a strong inverse association with incident type 2 diabetes, which was largely explained by plasma metabolites measured years before the clinical diagnosis.CIBER Fisiopatología Obesidad y NutriciónCastilla-Leon Government GRS/279/A/08European Network of Excellence Ingenious Hypercare EPSS- 037093State Agency for Research ACOMP/2013/039, GRUPOS 03/101, PROMETEO/2009/029Strategic Action for Research in Health sciences INTIMIC-085, PCIN-2017-117Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades RYC-2018-025069-IEuropean Commission EPSS-037093Instituto de Salud Carlos III CB06/03, CB12/03/30016, CD16/00255, CIBER-02-08-2009, PI10/0082, PI11/00726, PI13/01848, PI14/00874, PI16/01402, PI16/1512, PI16/609, PI18/287, PI19/319, PI20/00896Universidad Autónoma de Madrid 820024Agencia Estatal de Investigación PID2019-108973RB-C21“La Caixa” Foundation 100010434, LCF/BQ/DR19/11740016, LCF/BQ/IN18/1166000

Conformación tridimensional y reconocimiento molecular de biopolímeros : aplicación de RMN multidimensional y desarrollo de metodología de cálculo y estructural

El objetivo principal de la Tesis ha sido la exploración, el análisis y el perfeccionamiento de las técnicas más habituales utilizadas en la determinación de la estructura y dinámica de biopolímeros en disolución. En concreto, se han utilizado métodos teóricos y experimentales para obtener las estructuras de dos biopolímeros entre los grupos más numerosos de ellos: proteínas y ácidos nucleicos. La obtención de la estructura de una proteína de interés bioquímico por sus peculiaridades cinéticas mediante dos técnicas diferentes ha sido uno de los objetivos principales en la Tesis. La aplicación de las técnicas de modelización por homología y la realización de un análisis exhaustivo sobre los factores que afectan a la calidad del método permitirá aportar la obtención de mejores estructuras de proteínas mediante el uso de esta técnica. La determinación de la estructura de la Plastocianina mediante un método teórico como es la modelización por homología y otro experimental como es la RMN permitirá evaluar el grado de convergencia entre ambas y sopesar la validez de las técnicas teóricas como medio de ampliación de las estructuras de proteínas caracterizadas. La aplicación del formalismo libre de modelo de Lipari-Szabo al análisis de los procesos de relajación en RMN mediante la confección de un programa escrito en C permitirá aportar mayor objetividad al estudio de la dinámica de proteína mediante técnicas de RMN. El estudio de sistemas cuya dinámica ha sido analizada previamente mediante el uso de otros programas diferentes y la comparación con los resultados obtenidos permitirá conocer la validez tanto de la aproximación empleada como del algoritmo programado. El análisis de la dinámica de una proteína tan bien estudiada como el wt-BPTI (Inhibidor Básico de la Tripsina de Páncreas Bovina en forma nativa) frente a uno de sus mutantes constituye un ejemplo de análisis exhaustivo de la dinámica de una proteína mediante relajación en RMN. El desarrollo de las rutinas aplicadas en el programa HYPER para la obtención de restricciones de ángulos diedros en la cadena principal y en las cadenas laterales mediante la utilización de información de NOEs y constantes de acoplamiento escalar constituye un ejemplo de la dirección a seguir en el refinamiento de estructuras de RMN. La novedosa metodología utilizada en la determinación del ángulo diedro mediante el análisis de intensidades TOCSY (espectroscopía de correlación total) frente al tiempo de mezcla del experimento, incluso para residuos sin dos protones metilénicos como las treoninas y su aplicación a una proteína cuya estructura ya ha sido determinada, permite evaluar la importancia del desarrollo de metodologías similares en el refinamiento de estructuras por RMN. Por último, la determinación de la estructura de un oligonucleótido en disolución mediante RMN utilizando las técnicas de simulación de picos DQF-COSY (Espectroscopía de Correlación Escalar con Filtro de Doble Cuanto) y su comparación con la estructura determinada mediante rayos X, confirma el interés que presentan las estructuras en disolución de bio-polímeros y las sustanciales diferencias que pueden presentar frente a las estructuras cristalinas determinadas mediante difracción de rayos X. Asimismo, la estructura del d(CCGCGG) es un ejemplo de la influencia de la secuencia nucleotídica en la conformación local de cadenas de ADN

El impacto del Big-data en la Sociedad de la Información. Significado y utilidad”

Inmersos en la revolución digital, generamos constantemente datos y la mayoría son almacenados. Es lo que se ha denominado los “datos grandes” o Big-data. Junto con el capital y la fuerza de trabajo, los datos se han convertido en un valor añadido para la economía que refleja un futuro con un paradigma revolucionario en el que la sociedad será dirigida por los datos. El futuro está en la investigación, tratamiento y aplicación de los datos que aportarán prosperidad a nuestra sociedad. En el presente artículo se recogen las normas y leyes que existen hoy en día en el Big-data y la regulación existente. Para analizar Big-data la solución pasa por el aprendizaje automático (Machine-Learning) que se ocupa de la construcción y el estudio de los algoritmos que pueden aprender a partir de datos. Existen muchas técnicas, como estadística descriptiva, clasificación o agrupamiento. En este artículo se recoge las tecnologías que se utilizan para almacenar y analizar los “Big-data”

Effects of larval diet and metamorphosis cue on survival and growth of sea urchin post-larvae (Paracentrotus lividus; Lamarck, 1816)

In this study, we present the results of two experiments; in the first one we evaluated the effects of four larval dietary treatments on the survival and growth of the sea urchin Paracentrotus lividus, larvae and post-larvae. In the second experiment we have measured the effects of two different settlement substrates, combined with the presence of conspecifics, on metamorphosis, survival and growth of post-larvae. The microalgae dietary treatments consisted in: Dunaliella tertiolecta (Duna); 50% mixture of Isochrysis galbana and D. tertiolecta (ID); 50% mixture of Chaetoceros gracilis and D. tertiolecta (CD); 33% mixture of I. galbana, C. gracilis and D. tertiolecta (ICD). Although all dietary treatments resulted in a good survival at competence, significant difference in post-larval survival was observed between treatments, and indeed, only larvae fed Duna and CD survived to 180 days post settlement (DPS).  In the second experiment, the settlement substrates consisted in a film of cultured Ulvella lens or a naturally developing biofilm of diatoms, and the employed rearing water was either natural seawater or seawater previously exposed to P. lividus adults. At 10 DPS, larger (p<0.05) post-larvae were observed in the natural biofilm treatment, whilst the presence of conspecifics significantly increased larval settlement in both substrates (p<0.01).  These results indicate that it is important to consider the survival of post-larvae and juveniles to establish the efficiency of the dietary treatment on the hatchery production of P. lividus. Furthermore, it suggests that improved settlement protocols, such as the use of conspecifics, could contribute to increase hatchery outputs. Finally, it confirms the suitability of U. lens as settlement cue but also highlights that further research is required to establish its effectiveness for post-larvae first feedin

Estudio comparativo del tratamiento de aguas sucias en un buque ro-pax y en un crucero. Propuestas de optimización

El tratamiento de aguas residuales a bordo de los buques se ha convertido en un tema cada vez más importante en el mundo actual. A medida que la población mundial sigue creciendo, también aumenta la demanda de recursos como el agua limpia. La industria marítima, que incluye cruceros, cargueros y otras embarcaciones, genera una cantidad significativa de aguas residuales. Estas aguas residuales contienen contaminantes como aceite, productos químicos y materia biológica, que, si no se tratan adecuadamente, pueden ser perjudiciales para el medio ambiente. para mitigar el impacto ambiental de las aguas residuales, las embarcaciones deben contar con sistemas efectivos de tratamiento de aguas residuales. Los sistemas de tratamiento aseguran que las aguas residuales sean tratadas a un nivel que cumpla con los estándares necesarios y que sea segura para ser descargada en los océanos y mares. Sin embargo, la implementación de tales sistemas de tratamiento de aguas residuales requiere una cantidad significativa de inversión y esfuerzo. este trabajo tiene como objetivo centrarse en la importancia del sistema de tratamiento de aguas residuales a bordo de los buques, los diversos tipos de sistemas disponibles y los desafíos que implica implementarlos. Además, se proporcionará información sobre el trabajo que se ha realizado para mejorar los sistemas de tratamiento de aguas residuales a bordo de los buques, los desafíos que se han enfrentado y cómo se han superado. este trabajo, también considerará los marcos reguladores establecidos por varios países y organizaciones con respecto a la descarga de aguas residuales de los buques. El estudio ayudará a identificar áreas de mejora y posibles soluciones a los desafíos que se han encontrado hasta ahora. Al adoptar prácticas sostenibles en la industria marina, podemos ayudar a proteger los recursos hídricos del mundo para las generaciones futuras. no se puede subestimar la importancia del sistema de tratamiento de aguas residuales a bordo de los buques. Es un aspecto crítico para mantener la sostenibilidad de la industria marina, y este trabajo tiene como objetivo dar a conocer el progreso realizado y los desafíos que quedan por delante

Análisis de Lexnet. Plataforma electrónica para los órganos y operadores jurídicos

[ES] El objetivo del presente trabajo consiste en analizar Lexnet, la plataforma del ministerio de Justicia que proporciona la comunicación telemática entre los usuarios y los órganos judiciales. Para ello se realiza un examen detallado desde el punto de vista funcional y se compara dicha plataforma electrónica con las diferentes plataformas de intercambio de información judicial que existen en España: justicia.cat (Cataluña), Vereda (Cantabria), Avantius (Navarra y Aragón), justicia.sip ( País Vasco). Así pues, el trabajo identifica la situación actual de esta plataforma y la existencia de otras en nuestro país, y examina en profundidad Lexnet y su conexión con el usuario, especificando qué servicios ofrece telemáticamente y qué información proporciona a los operadores jurídicos. También se indaga sobre la evolución de Lexnet y se expone un plan de mejora con el fin de optimizar los recursos empleados.[EN] The objective of this work is to analyze Lexnet, the platform of the Ministry of Justice that provides telematic communication between users and judicial bodies. To do this, a detailed examination is carried out from a functional point of view and the electronic platform is compared with the different judicial information exchange platforms that exist in Spain: justice. Cat (Catalonia), Vereda (Cantabria), Avantius (Navarra and Aragon), Justicia.sip (Basque country). Thus, the work identifies the current situation of this platform and the existence of others in our country, and examines in depth Lexnet and its connection with the user, specifying what services it offers electronically and what information it provides to legal operators. The evolution of Lexnet is also investigated and an improvement plan is presented in order to optimize the resources used.Monleon Villalon, A. (2021). Análisis de Lexnet. Plataforma electrónica para los órganos y operadores jurídicos. Universitat Politècnica de València. http://hdl.handle.net/10251/165049TFG

Increasing aridity threatens the sexual regeneration of Quercus ilex(holm oak) in Mediterranean ecosystems

Knowledge of the recruitment of dominant forest species is a key aspect for forest conservation and the ecosystem services they provide. In this paper, we address how the simultaneous action of climate change and the intensity of land use in the past influence the recruitment of a forest species that depends on the provision of nurse plants to recruit. We compared the number of saplings (up to 15 years old) and juveniles (16 to 50 years old) of Quercus ilex in 17, 5.3 ha plots in the Iberian System (eastern Spain). We used a gradient of past deforestation intensity crossed with two levels of average annual precipitation, one of them at the lower limit of the species'' precipitation niche (semi-arid) and the other at the optimum (sub-humid). We also examined the association between recruits and nurse plants and the effect on this association of plot-scale factors, such as seed abundance (reproductive Q. ilex), microsites (nurse species and soil availability), and large herbivores. The increase in aridity in the last decades has drastically reduced the recruitment of new individuals in the forests of Q. ilex located in the lower limit of their precipitation niche, regardless of the intensity of past deforestation that they suffered. Recruitment in these climatic conditions depends almost exclusively on large trees and shrubs whose abundance may also be limited by aridity. The lack of regeneration questions the future of these populations, as the number of individuals will decrease over time despite the strong resistance of adult trees to disturbance and drought

Conformation and concerted dynamics of the integrin-binding site and the C-terminal region of echistatin revealed by homonuclear NMR

Echistatin is a potent antagonist of the integrins αvβ3, α5β1 and αIIbβ3. Its full inhibitory activity depends on an RGD (Arg-Gly- Asp) motif expressed at the tip of the integrin-binding loop and on its C-terminal tail. Previous NMR structures of echistatin showed a poorly defined integrin-recognition sequence and an incomplete C-terminal tail, which left the molecular basis of the functional synergy between the RGD loop and the C-terminal region unresolved. We report a high-resolution structure of echistatin and an analysis of its internal motions by off-resonance ROESY (rotating-frame Overhauser enhancement spectroscopy). The fulllength C-terminal polypeptide is visible as a β-hairpin running parallel to the RGD loop and exposing at the tip residues Pro43, His44 and Lys45. The side chains of the amino acids of the RGD motif have well-defined conformations. The integrin-binding loop displays an overall movement with maximal amplitude of 30◦. Internal angular motions in the 100–300 ps timescale indicate increased flexibility for the backbone atoms at the base of the integrin- recognition loop. In addition, backbone atoms of the amino acids Ala23 (flanking the R24GD26 tripeptide) and Asp26 of the integrin-binding motif showed increased angular mobility, suggesting the existence of major and minor hinge effects at the base and the tip, respectively, of the RGD loop. A strong network of NOEs (nuclear Overhauser effects) between residues of the RGD loop and the C-terminal tail indicate concerted motions between these two functional regions. A full-length echistatin– αvβ3 docking model suggests that echistatin’s C-terminal amino acids may contact αv-subunit residues and provides new insights to delineate structure–function [email protected]; [email protected]; [email protected]; [email protected]