Fast tomographic reconstruction on multicore computers

Abstract Summary: Tomo3D implements a multithreaded vectorized approach to tomographic reconstruction that takes full advantage of the computer power in modern multicore computers. Full resolution tomograms are generated at high speed on standard computers with no special system requirements. Tomo3D has the most common reconstruction methods implemented, namely weighted Back-projection (WBP) and simultaneous iterative reconstruction technique (SIRT). It proves to be competitive with current graphic processor unit solutions in terms of processing time, in the order of a few seconds with WBP or minutes with SIRT. The program is compatible with standard packages, which easily allows integration in the electron tomography workflow. Availability: http://www.cnb.csic.es/%7ejjfernandez/tomo3d Contact: [email protected] Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online

Eficacia de Dieta Atlántica y Dieta Mediterránea en mujeres en edad fértil con síndrome de ovario poliquístico en el Área Sanitaria de Ferrol

[Resumen] El síndrome del ovario poliquístico (SOP) afecta hasta a un 21% de las mujeres españolas. Se trata de un síndrome clínico, donde el hiperandrogenismo y la resistencia a la insulina tienen un papel fundamental. De esta manera, los signos y síntomas más comunes son el hirsutismo, la oligoanovulación, la aparición de una morfología ovárica poliquística y el aumento de peso. Considerando los beneficios de la Dieta Mediterránea (DM) y la Dieta Atlántica (DA) en la prevención del sobrepeso y las enfermedades cardiovasculares, se considera necesario instaurar programas educativos que modifiquen y fomenten hábitos saludables para las mujeres en edad fértil con síndrome de ovario poliquístico. Objetivo: Comparar la eficacia de una intervención basada en dieta mediterránea respecto a una intervención basada en dieta atlántica para mantener o alcanzar un Índice de Masa Corporal (IMC) lo más próximo posible al normopeso. Metodología: Se realizará un estudio de tipo cuantitativo, cuasiexperimental y transversal en la población femenina en edad fértil con síndrome de ovario poliquístico en el área sanitaria de Ferrol. A través de cuestionarios validados se recogerá la adherencia a la DM, la adherencia a la DA y el nivel de actividad física en 120 sujetos seleccionados aleatoriamente de 10 centro de Atención Primaria del Área Sanitaria de Ferrol, también seleccionados aleatoriamente. Se realizarán 3 sesiones educativas programadas con los pacientes y una vez finalizada la intervención se volverán a medir los parámetros correspondientes a los 18 meses para valorar su efectividad.[Resumo] A síndrome de ovario poliquístico afecta ata a un 21% das mulleres españolas. Trátase dunha síndrome clínica, onde o hiperandroxenismo e a resistencia á insulina teñen un papel fundamental. Desta maneira, os signos e síntomas máis común son o hirsutismo, a oligoanovulación, a aparición dunha morfoloxía ovárica poliquística e o aumento de peso. Considerando os beneficios da Dieta Mediterránea (DM) e da Dieta Atlántica (DA) na prevención do sobrepeso e das enfermedades cardiovasculares, considérase preciso instaurar programas educativos que modifiquen e fomenten hábitos saudable para as mulleres en idade fértil con síndrome de ovario poliquístico. Obxectivo: Comparar a eficacia dunha intervención basada na dieta mediterránea respeto a unha intervención basada na dieta atlántica para manter ou acadar un índice de masa corporal (IMC) o máis próximo posible ao normopeso. Metodoloxía: Realizarase un estudo de tipo cuantitativo, cuasiexperimental e transversal na población femenina en idade fértil con síndrome do ovario poliquístico na area sanitaria de Ferrol. Empregando cuestionarios validados, recollerase a adherencia á DM, a adherencia á DA e o nivel de actividade física en 120 suxetos seleccionados aleatoriamente de 10 centros de Atención Primaria da área sanitaria de Ferrol, tamén seleccionados aleatoriamente. Realizaranse 3 sesións educativas programadas cas pacientes e unha vez rematada a intervención, volveranse medir os parámetros correspondentes aos 18 meses para valorar a súa efectividade.[Abstract] Polycystic ovary syndrome (PCOS) affects up to 21% of Spanish women. It is a clinical syndrome, where hyperandrogenism and insulin resistance play a fundamental role. Thus, the most common signs and symptoms are hirsutism, oligoanovulation, the appearance of polycystic ovarian morphology, and weight gain. Considering the benefits of the Mediterranean Diet (MD) and the Atlantic Diet (AD) in the prevention of overweight and cardiovascular diseases, it is considered necessary to establish educational programs that modify and promote healthy habits for women of childbearing age with polycystic ovary syndrome. Objective: To compare the efficacy of an intervention based on the Mediterranean diet with respect to an intervention based on the Atlantic diet to maintain or achieve a Body Mass Index (BMI) as close as possible to normal weight. Methodology: A quantitative, quasi-experimental and cross-sectional study will be carried out in the female population of childbearing age with polycystic ovary syndrome in the Ferrol Health Area. Through validated questionnaires, adherence to DM, adherence to AD and the level of physical activity will be collected in 120 subjects randomly selected from 10 Primary Care centers in the Ferrol Health Area, also randomly selected. Three scheduled educational sessions will be held with the patients and once the intervention is over, the parameters corresponding to 18 months will be measured again to assess their effectiveness.Traballo fin de grao (UDC.FEP). Enfermaría. Curso 2021/202

Intervenciones basadas en terapias de tercera generación en trastornos de la conducta alimentaria

En los últimos años ha crecido el interés por conocer si las terapias de tercera generación pueden ser una opción eficaz en el tratamiento de los trastornos de la conducta alimentaria, interés debido en parte, a las limitaciones en la mejoría y remisión de estos trastornos con las terapias validadas hasta la actualidad. El objetivo de este trabajo es realizar una revisión sistemática de la literatura científica sobre la evidencia de la eficacia que existe hasta la actualidad de este tipo de terapias para los trastornos de la conducta alimentaria. En concreto se han investigado las siguientes intervenciones: terapia de aceptación y compromiso, terapia dialéctica comportamental, terapia centrada en la compasión e intervenciones basadas en mindfulness. Para localizar los estudios a analizar se hizo una búsqueda en diferentes bases de datos electrónicas seleccionando aquellos artículos de investigaciones empíricas con un diseño de ensayo controlado aleatorizado, ensayo no controlado o estudio piloto en los que se hubiera aplicado una de las terapias mencionadas a una muestra de población clínica con diagnóstico de algún trastorno de la conducta alimentaria. Se encontraron y analizaron un total de 19 artículos. Según los resultados la eficacia de estas terapias aún no cuenta con una alta y rigurosa evidencia, pero se muestran una opción prometedora ya que son superiores a la condición de lista de espera y parecen ser un complemento que mejora los tratamientos habituales. Una mayor investigación con estudios controlados aleatorizados es necesaria.2019-2

Ana Ozores, protagonista de La Regenta, de Leopoldo Alas: personalidad y determinismo

Traballo Fin de Grao en Lingua e Literatura Españolas. Curso 2018-2019El elevado número de personajes que se materializan en "La Regenta" (1884-1885) es uno de los aspectos que esbozan la realidad social que Clarín pretende mostrar a través de su obra. A pesar de que la novela no responda de manera rigurosa a los preceptos del natauralismo de Émile Zola, lo cierto es que el determinismo tiene un papel fundamental en la construcción de las distintas criaturas literarias sobre todo en lo relativo a Ana Ozores. Su figura es indiscutiblemente significativa en "La Regenta". A pesar de que Leopoldo Alas perfila e individualiza con gran minuciosidad cada uno de sus personajes, el caso de Ana Ozores es sobresaliente, tanto que la convierte en la protagonista de su gran novela. En este Trabajo de Fin de Grado se realizará un análisis del complejo mundo interior de Ana Ozores, para comprobar no solo cómo su psicología afecta al desarrollo de su propia historia, sino también cómo, en buena parte, su carácter y su conducta están determinados por el medio físico y moral de Vetusta. Además, se estudiará la repercusión de ese microcosmos, reflejo de la sociedad decimonónica, en la protagonista, mujer condicionada por esa époc

Fisiología de la reproducción del lenguado senegalés (Solea senegalensis): mecanismos endocrinos y aplicaciones en acuicultura

Memoria de tesis doctoral presentada por Maria Josep Agulleiro Gozalbo para obtener el título de Doctora en Ciencias Biológicas por la Universitat de València (UV), realizada bajo la dirección del Dr. Joan Cerdà Luque del Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC) y el Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentaria (IRTA)El presente trabajo se puede dividir en tres partes. En la primera parte, o Introducción General, se resume el estado actual de conocimientos sobre los mecanismos endocrinos implicados en la reproducción de teleósteos, y se introduce al lector en los beneficios y problemas de la acuicultura de peces planos, especialmente del lenguado senegalés (Solea senegalensis). En la segunda parte, Capítulos 2 y 3, se describen los cambios estacionales de las principales hormonas, moléculas y receptores que intervienen en el proceso de crecimiento ovárico en el lenguado. Y en la tercera parte, Capítulos 4 y 5, se diseñan y aplican métodos hormonales para controlar la reproducción del lenguado en condiciones de cautividad. El objetivo principal de la presente tesis ha sido profundizar en el conocimiento de la endocrinología de la reproducción en teleósteos, y particularmente en el lenguado senegalés. Esta especie posee actualmente un alto interés comercial para la acuicultura marina mediterránea, pero su fisiología reproductiva es todavía muy desconocida, lo que imposibilita mejorar su producción y calidad a nivel industrial. Por ello, el objetivo final de este trabajo ha sido desarrollar métodos para controlar la reproducción del lenguado en condiciones de cautividad los cuales puedan ser transferidos a la industriaPeer Reviewe

Animación 3D: Pillow

El objetivo principal de este Trabajo de Final de Grado es la realización de una animación desde cero, hecha con un workflow profesional y que cuente una historia. El trabajo incluye un estudio sobre el mundo de la animación, de tal forma como una parte práctica dónde se explica todo el proceso del cortometraje y su resultado final. Uno de los principales objetivos ha sido poder mostrar los conocimientos adquiridos en la etapa universitaria, con el fin de poder lograr una mejora en las técnicas de animación y obtener un buen showreel digno de una animadora junior que pueda servir como carta de presentación para el mundo laboral

Salir de closet del aula : nuevas coordenadas y líneas estratégicas respecto de la implementación transversal de la ESI en la formación docente

En el presente trabajo buscamos socializar dos aspectos que nos revisten interés a la luz de los saberes de la experiencia: 1) socializar los alcances y desafíos del abordaje de la Educación Sexual Integral en la formación docente ante el trazado de una nueva agenda de la ESI y la necesidad estratégica de salir del closet del aula, a partir de las transformaciones epistémicas a más de 15 años de sancionada la ley, saberes situados provocados y trastocados por la incorporación de la unidad curricular ESI en la formación docente de la provincia del Chubut; 2) reconocer y evaluar la interrupción de los modos de abordaje entrelazados dentro del campo de la práctica profesional docente; particularmente la vinculación entre la formación docente y el abordaje de la ESI por parte de estudiantes que se encuentran en formación y realizan sus prácticas pedagógicas en escuelas asociadas, que permitían a su vez, un desarrollo de la ESI de manera situada, y un diálogo entre las didácticas generales y las específicas. Interrupción provocada por la suspensión de actividades educativas presenciales en el marco de las medidas adoptadas por la propagación del COVID-19, y la reconfiguración de las experiencias formativas frente a la educación virtual o a distancia. Con respecto al primer aspecto, referir que en el año 2012 se incorporó como espacio curricular en la Formación Docente Inicial en la provincia del Chubut, el Taller de Educación Sexual Integral (ESI). A partir de ello, los Institutos Superiores de Formación Docente fueron incorporando en las distintas ofertas formativas Talleres de ESI. En un inicio, dicha incorporación implicó sin duda una ruptura en el devenir organizacional, en línea con poner en cuestión las lógicas desde las cuales se piensa la formación de formadorxs. Entendemos que la condición de posibilidad del trabajo en ESI implica el compromiso colectivo respecto de la deconstrucción del curriculum en clave feminista-crítica; y esto, implica salir del closet del aula, formar equipos de trabajo e implicancia estratégica, y tensionar la ESI más allá de la ESI. Con respecto al segundo aspecto, a partir de la sistematización de experiencias de articulación entre los talleres de ESI con el campo de la práctica profesional (principalmente en el profesorado de educación primaria), es que reconocemos como central establecer vinculaciones entre aquellos contenidos referidos a la ESI, los géneros y las sexualidades, con los saberes propios del oficio que comienzan a desarrollarse mediante la inserción paulatina de lxs estudiantes. Desde ya que esto no es una cuestión menor, y menos aún una tarea fácil; implica realizar un trabajo colectivo y colaborativo que potencie la reflexión, la toma de decisiones y la elaboración y desarrollo de proyectos educativos. Ambos aspectos han sido interpelados y tensionados por la situación educativa provocada por la pandemia de COVID-19, y es menester trazar un estado de situación que nos permita desde la formación docente, volver a construir alianzas estratégicas de abordaje para el sostenimiento de la ESI en todos los niveles educativos.Fil: Agulleiro, Manuel . Universidad Nacional de la Patagonia San Juan Bosco.Fil: González, Fabiana . Universidad Nacional de la Patagonia San Juan Bosco

Fisiología de la reproducción del lenguado senegalés (Solea senegalensis): mecanismos endocrinos y aplicaciones en acuicultura.

RESUMEN En el presente trabajo investigamos algunos de los mecanismos endocrinos implicados en el crecimiento oocitario del lenguado senegalés (Solea senegalensis), así como el desarrollo de métodos para el control de su reproducción en cautividad. La tesis se dividió en tres partes diferentes: (i) Capítulo 1: Introducción General donde se resume el estado actual de conocimientos sobre los mecanismos endocrinos implicados en la reproducción de teleósteos, y se introduce al lector en los beneficios y problemas actuales de la acuicultura de peces planos, especialmente del lenguado senegalés (Solea senegalensis); (ii) Capítulos 2 y 3, donde se investiga el proceso de vitelogénesis en el lenguado senegalés. En el Capítulo 2, se caracteriza el ADN complementario de ambas isoformas del receptor de lipoproteínas de muy baja densidad/vitelogenina (Vtg), vtgr, y de una nueva proteína de unión a ácidos grasos (FABP), FABP11, encontrada exclusivamente en peces teleósteos. El análisis de expresión de estos genes en ovario de lenguado senegalés, sugiere que el nivel de los transcritos de vtgr puede ser utilizado como marcador molecular para determinar el número de oocitos reclutados en vitelogénesis, mientras que los niveles de expresión de fabp11 pueden funcionar como un marcador molecular muy útil para determinar los procesos celulares y factores ambientales que regulan el proceso de la atresia folicular. En el Capítulo 3, se valida un ELISA homologo para determinar la concentración de Vtg en plasma. Mediante este análisis se correlacionan las variaciones anuales de Vtg con los niveles de 17-estradiol, índice gonadosomático y porcentaje de oocitos en diferente estadio de desarrollo oocitario; y (iii) Capítulos 4 y 5, donde se investiga la aplicación de diferentes métodos hormonales para inducir a la ovulación y a la espermiación en lenguado senegalés en condiciones de cautividad. En el Capítulo 4, se tratan machos y hembras con un agonista de la hormona liberadora de gonadotropinas (GnRHa), tanto mediante inyecciones sucesivas como mediante implantes de liberación sostenida. El tratamiento con GnRHa resulta eficaz para inducir la ovulación y la puesta en hembras F1 incapaces de reproducirse en cautividad. En cambio, el mismo tratamiento con GnRHa en machos es aparentemente ineficaz para aumentar la producción de esperma y/o estimular la espermatogénesis. En el Capítulo 5, el tratamiento de machos adultos con GnRHa en combinación con 11-ketoandrostenediona (OA), precursor de 11-ketotestosterona (11-KT), acelera la espermatogénesis y aumenta los niveles plasmáticos de los metabolitos 5β-reducidos de 17α,20β-dihidroxi-4-pregnan-3-ona (17,20βP), esteroide implicado en la maduración del esperma en salmónidos. Además, la motilidad del esperma producido por los machos tratados con GnRHa+OA, se ve duplicada respecto al esperma producido por el grupo control o el grupo tratado sólo con GnRHa. Por tanto, el tratamiento de machos de lenguado senegalés con GnRHa+OA puede ser empleado como potencial terapia hormonal para mejorar disfunciones reproductivas de machos de lenguado senegalés en condiciones de cautividad. En resumen, la presente tesis ha contribuido a profundizar en el conocimiento de los mecanismos endocrinos implicados en la gametogénesis del lenguado senegalés, y ha establecido algunos protocolos para la inducción de la ovulación y la espermiogénesis a través de terapias hormonales en esta especie de elevado interés comercial. __________________________________________________________________________________________________The present work was aimed at the investigation of some endocrine mechanisms involved in oocyte growth in the Senegalese sole (Solea senegalensis), as well as to develop methods for the control of reproduction of this species in captivity. The thesis was divided into three separate parts: (i) Chapter 1, a General Introduction where it was reviewed the endocrine regulation of reproduction in teleosts, and it introduced the reader into the significance and current problems in the culture of flatfish, particularly the Senegalese sole; (ii) Chapters 2 and 3, in which it was investigated the vitellogenic process of Senegalese sole. In chapter 2, it is described the isolation of complementary DNAs encoding two isoforms of very low-density lipoprotein/vitellogenin receptor (VtgR) and a novel fatty acid-binding protein (FABP), FAB11. The analysis of expression of these genes suggested that the the level of vtgr transcripts in the ovary may be used as a functional marker to quantify the number of oocytes recruited for vitellogenesis, while that of fabp11 may be a very useful molecular marker for determining cellular events and environmental factors that regulate follicular atresia. In chapter 3, an homologous EIA to quantify plasma vitellogenin was developed, and annual plasma levels of vitellogenin were correlated with changes in plasma 17-estradiol, gonadosomatic index, and percentage of oocyte at different developmental stage in the ovary; and (iii) Chapters 4 and 5, in which it was investigated the induction of ovulation and spermiation in Senegalese sole. In chapter 4, males and females were treated with gonadotropin-releasing hormone agonist (GnRHa). Treatment was able to induce ovulation and spawning of F1 females that often fail to reproduce. However, this treatment was ineffective in males. Further studies were performed in chapter 5, where GnRHa treatment in combination with a biosynthetic precursor of 11-ketotestosterone, stimulated spermatogenesis, increasing the production of conjugated forms of 17,20-dihydroxy-4-pregnen-3-one, enhancing the motility of spermatozoa by 2-fold. In conclusion, the present work has contributed with novel information on the endocrine mechanisms involved in gametogenesis in Senegalese sole, and has established some protocols for the induction of ovulation and spermiation in this species through hormonal therapies

New insights into molecular pathways associated with flatfish ovarian development and atresia revealed by transcriptional analysis

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The Senegalese sole (<it>Solea senegalensis</it>) is a marine flatfish of increasing commercial interest. However, the reproduction of this species in captivity is not yet controlled mainly because of the poor knowledge on its reproductive physiology, as it occurs for other non-salmonid marine teleosts that exhibit group-synchronous ovarian follicle development. In order to investigate intra-ovarian molecular mechanisms in Senegalese sole, the aim of the present study was to identify differentially expressed genes in the ovary during oocyte growth (vitellogenesis), maturation and ovarian follicle atresia using a recently developed oligonucleotide microarray.</p> <p>Results</p> <p>Microarray analysis led to the identification of 118 differentially expressed transcripts, of which 20 and 8 were monitored by real-time PCR and in situ hybridization, respectively. During vitellogenesis, many up-regulated ovarian transcripts had putative mitochondrial function/location suggesting high energy production (NADH dehydrogenase subunits, cytochromes) and increased antioxidant protection (selenoprotein W2a), whereas other regulated transcripts were related to cytoskeleton and zona radiata organization (zona glycoprotein 3, alpha and beta actin, keratin 8), intracellular signalling pathways (heat shock protein 90, Ras homolog member G), cell-to-cell and cell-to-matrix interactions (beta 1 integrin, thrombospondin 4b), and the maternal RNA pool (transducer of ERBB2 1a, neurexin 1a). Transcripts up-regulated in the ovary during oocyte maturation included ion transporters (Na⁺-K⁺-ATPase subunits), probably required for oocyte hydration, as well as a proteinase inhibitor (alpha-2-macroglobulin) and a vesicle calcium sensor protein (extended synaptotagmin-2-A). During follicular atresia, few transcripts were found to be up-regulated, but remarkably most of them were localized in follicular cells of atretic follicles, and they had inferred roles in lipid transport (apolipoprotein C-I), chemotaxis (leukocyte cell-derived chemotaxin 2,), angiogenesis (thrombospondin), and prevention of apoptosis (S100a10 calcium binding protein).</p> <p>Conclusion</p> <p>This study has identified a number of differentially expressed genes in the ovary that were not previously found to be regulated during ovarian development in marine fish. Specifically, we found evidence, for the first time in teleosts, of the activation of chemoattractant, angiogenic and antiapoptotic pathways in hypertrophied follicular cells at the onset of ovarian atresia.</p

Molecular and Functional Characterization of Elovl4 Genes in Sparus aurata and Solea senegalensis Pointing to a Critical Role in Very Long-Chain (>C24) Fatty Acid Synthesis during Early Neural Development of Fish

Very long-chain fatty acids (VLC-FA) play critical roles in neural tissues during the early development of vertebrates. However, studies on VLC-FA in fish are scarce. The biosynthesis of VLC-FA is mediated by elongation of very long-chain fatty acid 4 (Elovl4) proteins and, consequently, the complement and activity of these enzymes determines the capacity that a given species has for satisfying its physiological demands, in particular for the correct development of neurophysiological functions. The present study aimed to characterize and localize the expression of elovl4 genes from Sparus aurata and Solea senegalensis, as well as to determine the function of their encoded proteins. The results confirmed that both fish possess two distinct elovl4 genes, named elovl4a and elovl4b. Functional assays demonstrated that both Elovl4 isoforms had the capability to elongate long-chain (C20–24), both saturated (SFA) and polyunsaturated (PUFA), fatty acid precursors to VLC-FA. In spite of their overlapping activity, Elovl4a was more active in VLC-SFA elongation, while Elovl4b had a preponderant elongation activity towards n-3 PUFA substrates, particularly in S. aurata, being additionally the only isoform that is capable of elongating docosahexaenoic acid (DHA). A preferential expression of elovl4 genes was measured in neural tissues, being elovl4a and elovl4b mRNAs mostly found in brain and eyes, respectively.info:eu-repo/semantics/publishedVersio