Câncer hereditário associado aos genes TP53, BRCA1 e BRCA2 : análises genômicas, funcionais e clínicas

Aspectos genômicos, funcionais e clínicos de síndromes de predisposição hereditária ao câncer associadas aos genes TP53, BRCA1 e BRCA2 foram abordados nesta tese. No contexto do gene TP53, em que mutações germinativas causam Síndrome de Li-Fraumeni (SLF), nosso objetivo principal foi estudar as consequências funcionais e clínicas de algumas mutações encontradas em famílias brasileiras, especialmente a mutação fundadora R337H. Nossos resultados demostram que células normais (fibroblastos) de indivíduos portadores de mutações em TP53 caracterizam-se por alterações redox, com altos níveis de espécies reativas de oxigênio (ERO) associados a um processo persistente de reparo de DNA, provavelmente devido a um aumento do dano oxidativo. Também foi observada alta atividade no reparo de sítios apurínicos e apirimidínicos (sítios abásicos), um tipo de dano de DNA causado, principalmente, por ERO. Devido a bem estabelecida relação entre estresse oxidativo e inflamação, 28 marcadores inflamatórios, incluindo citocinas, quimiocinas e fatores de crescimento, foram dosados em plasma de indivíduos portadores da mutação R337H e controles. Um aumento significativo na dosagem de IL-12, bem como uma tendência de maiores níveis de IL-8, IL-17 e IFN-y foram encontrados no grupo R337H, sugerindo atividade inflamatória. A fim de verificar o impacto de substâncias antioxidantes sobre o fenótipo bioquímico de estresse oxidativo, indivíduos portadores da mutação R337H e controles foram suplementados com N-acetilcisteína, Idebenona e Coenzima Q10, e parâmetros oxidativos foram avaliados antes e após o período de suplementação (14 dias). Nossos resultados apontam para um efeito da Coenzima Q10 e Idebenona na correção bioquímica de estresse oxidativo, visto que a suplementação com ambas substâncias foi capaz de diminuir os níveis de lipoperoxidação lipídica. Além dos estudos funcionais e clínicos acerca da mutação R337H, análises moleculares relacionadas ao papel de genes modificadores de fenótipo e de uma nova variante associada a SLF foram realizadas. Observamos que 7/129 (5.4%) indivíduos com fenótipo clínico de SLF/LFL e negativos para mutações em regiões codificantes de TP53 são portadores de uma nova variante germinativa rara, rs78378222[C]. Achados adicionais relacionados a conservação evolutiva e impacto funcional desta 10 variante, tanto em fibroblastos quanto em tumores, confirmam sua patogenicidade e apontam para um mecanismo de haploinsuficiência de p53. Além disso, também foi observado a contribuição de um polimorfismo na região promotora do gene MDM2 (SNP309) na idade do primeiro diagnóstico de câncer em portadores da mutação R337H. Já em relação ao conjunto de resultados relacionados à BRCA1 e BRCA2 apresentados nesta tese, 39 tumores de mama de pacientes com mutações germinativas nos genes BRCA1 (n=29) e BRCA2 (n=10) foram sequenciados no intuito de identificar o perfil de variação no número de cópias de DNA e mutações somáticas. A partir do sequenciamento massivo e paralelo foi possível concluir que a grande maioria destes tumores apresenta perda do alelo selvagem de BRCA1 ou BRCA2, sendo que este parece ser um evento inicial na carcinogênese da maioria destas neoplasias. Além disso, mutações clonais em TP53 foram observadas em uma parcela significativa dos casos, sendo estas, provavelmente, anteriores a perda do alelo selvagem de BRCA1/2. A identificação de tumores que preservam o alelo selvagem de BRCA1 ou BRCA2, ou ainda que perdem este de maneira subclonal, levanta questões sobre o impacto de novas drogas que apresentam como alvo terapêutico os mecanismos de recombinação homóloga.In this work, we aimed to study genomic, functional and clinical aspects of cancer predisposition syndromes associated to germline mutations in the TP53, BRCA1 and BRCA2 genes. With regard to TP53, in which germline mutations are associated to Li-Fraumeni syndrome (LFS), we were mainly interested in understanding the clinical and biological consequences of TP53 germline mutations found in Brazilian families, with special attention to R337H mutation. Our results show that normal cells (fibroblasts) from LFS subjects have an hyperoxic phenotype characterized by high reactive oxygen species (ROS) levels, associated to a tendency for slower DNA repair and more persistent DNA damage. Interestingly, all mutant p53 fibroblasts showed higher repair activity of apurinic/pyrimidinic (AP) sites, a DNA lesion caused mainly by intensive ROS exposure. Given the well-described relationship between oxidative stress and inflammation, we then simultaneously quantified 25 cytokines, chemokines and growth factors in plasma of R337H mutation carriers and controls. We found significant higher levels of IL-12, as well as a tendency for increased IL-8, IL-17 and IFN-y, in mutation carriers when compared to controls, suggesting inflammatory activation. In order to verify the impact of antioxidants on oxidative stress, we supplemented R337H mutation carriers and controls with Nacetylcysteine, Idebenone and Coenzyme-Q10 and oxidative parameters were measured before and after supplementation period (14 days). Our findings highlight to a benefit of supplementation with Coenzyme Q10 and Idebenone, since that both were able to decrease lipid peroxidation in R337H mutation carriers group. In addition to functional e clinical studies presented here, we also aimed to study the impact of genetic modifiers on clinical manifestation of R337H carriers as well as the contribution of a new rare TP53 germline variant in LFS. In this context, we observed that 7 out of 129 (5.4%) subjects with clinical phenotype without TP53 germline mutations in the TP53 coding regions were carriers of a new functional variant, the rs78378222[C]. Further results related to the evolutionary conservation and functional impact of rs78378222[C] in both fibroblasts and in tumors confirm the pathogenicity of this variant and suggest a mechanism of haploinsufficiency. Finally, polymorphism analysis revealed an impact of the 12 MDM2 SNP309 on age at first tumor in R337H mutation carriers. Regarding BRCA1 and BRCA2, we sequenced 39 breast tumors from patients carrying BRCA1 (n=29) and BRCA2 (n=10) germline mutations in order to determine the repertoire of copy number alterations and somatic mutations of these tumors. By using ultra-deep sequencing of bulk-tumor and normal tissue, we observed that most of these tumors were characterized by somatic inactivation of BRCA1 and BRCA2 wild-type allele, which were likely to be an early genetic event in carcinogenesis. Moreover, TP53 somatic mutations were highly recurrent and all clonal, and we concluded that they likely precede BRCA1 or BRCA2 inactivation, as the latter was subclonal in some cases. The identification of tumors that preserved the BRCA1 or BRCA2 wild-type allele at all, or in which loss of the wildtype allele was restricted to subpopulations of cancers cells, raises concerns regarding response to drugs targeting homologous recombination deficiency in these tumors

Processos de nasalização em lung’ie

This study describes and analyzes the vocalic nasality triggered by nasal elements in coda and onset in Lung’Ie, a Portuguese-based Creole spoken in São Tomé and Príncipe. We observed the language’s phonotactic behavior, investigating the occurrence of vocalic nasalization processes according to its segmental and suprasegmental aspects. In this regard, we took into account the lexical stress and the possibility of segmental resyllabification. We designed a perceptual test in order to identify the way by which the coda nasality was perceived by native speakers. Thus, by omitting a consonant in the onset position of the following syllable in relation to the syllable that has nasalization, speakers understood the nasal tail as a full consonant [n]. Nasal consonant in coda was therefore resyllabified into an onset position. This syllabic restructuration is an indication of a biphonemic interpretation of nasality in Lung’Ie (AGOSTINHO, 2015; BALDUINO et al., 2015; BANDEIRA, 2017). The phonotactic analysis indicates lexical stress as an essential factor for the realization of the nasalization process triggered by the onset. Nasalization processes by coda, on the other hand, are possible in stressed and unstressed syllables. The importance of stress in the application of this process supports a mixed suprasegmental system in Lung’Ie constituted by lexical stress and tones, whereas the stress is the main suprasegmental category (AGOSTINHO, 2015), and not a tonal system (MAURER, 2009).Este artigo descreve e analisa a nasalidade vocálica produzida por coda e onset nasal em lung’Ie, língua crioula falada em São Tomé e Príncipe. Assim, observamos o comportamento fonotático da língua, investigando a aplicação dos processos de nasalização conforme o acento lexical e a possibilidade de ressilabificação dos segmentos. Ademais, através de um teste perceptivo, visamos identificar o modo que a nasalidade engatilhada por coda é concebida em lung’Ie. Nesse caso, os resultados indicam que, com a exclusão da consoante em onset da sílaba seguinte à sílaba que continha nasalização, os falantes compreendiam o apêndice nasal como uma consoante plena [n] ressilabificada na posição de onset nasal, reforçando, portanto, a interpretação bifonêmica da nasalidade no lung’Ie (AGOSTINHO, 2015). A análise fonotática, por sua vez, indica que o acento é primordial para o engatilhamento da nasalização a partir de onset silábico, ao passo que a nasalização em coda pode ocorrer independentemente da maior proeminência lexical envolvida. O acento como fator importante na concretização deste processo sugere a existência de um sistema suprassegmental misto em lung’Ie, constituído por tom e acento, sendo o acento a categoria suprassegmental mais importante (AGOSTINHO, 2015)

Sobre a nova concepção dos microssistemas jurídiconormativos e a existência de um microssistema recursal no processo civil brasileiro

O presente trabalho pretende apontar a mudança de percepção dos microssistemas normativos, de modo que que sua concepção tradicional (dispositivos extraídos a partir de diferentes fontes normativas) se encontra ultrapassada. Assim, a existência de um microssistema não fica limitada a essa ideia, mas também permite intercâmbio de normas situadas dentro do mesmo corpo legislativo, de modo que os microssistemas não precisam ter seus núcleos situados fora dos códigos, podendo até mesmo estarem totalmente inseridos neles, passando a constituir um verdadeiro bloco normativo. Em síntese, não havendo vedação expressa na legislação, devese admitir o diálogo normativo, mediante subsidiariedade e supletivismo. A partir dessas premissas, foram identificados os já consagrados microssistemas e alguns “novos”, indicados pela doutrina. Além disso, o trabalho pretendeu demonstrar a possibilidade (e a necessidade) de se reconhecer a existência de um microssistema recursal, que permite o intercâmbio de normas previstas para determinadas espécies recursais, de modo a garantir mais coerência e mais mecanismos de alcance dos objetivos pretendidos (princípios processuais) diante de cada um dos institutos analisados

Cidades médias : o potencial de biodiversidade e o acesso humano à natureza

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Arquitetura e Urbanismo, Programa de Pós Graduação em Arquitetura e Urbanismo, 2019.Em caráter exploratório, a tese examina a relação cidade e meio ambiente, partindo do pressuposto que o urbanismo contemporâneo e a sustentabilidade do meio ambiente urbano não dialogam (Franco, 2001). Discutem-se aspectos de biodiversidade urbana, serviços ecossistêmicos culturais, desenho urbano e biofilia, tendo as cidades médias brasileiras como base de estudo. A metodologia está estruturada em três seções: (a) reflexão teórica da literatura concernente ao tema; (b) categorização das cidades médias pelo potencial de biodiversidade; e (c) análise espacial dos serviços ecossistêmicos culturais (SEC) para verificação do acesso humano. Busca-se identificar, a partir da abordagem desenvolvida, o potencial de biodiversidade nas cidades médias brasileiras por meio do acesso humano à natureza, para a amostra de 21 estudos de caso. É interesse responder a duas questões de pesquisa: (1) é possível relacionar serviços ecossistêmicos culturais e desenho urbanos no que diz respeito à preservação? (2) e em que medida as cidades médias brasileiras promovem acesso humano à natureza e à biofilia, o que permitiria qualificá-las como mais sustentáveis? Os resultados apontam que os assentamentos investigados apresentam potencial alto a médio de biodiversidade e níveis satisfatórios de acesso aos serviços ecossistêmicos culturais que traduzem o acesso à natureza. Não se pode asseverar, porém, que as cidades médias são de todo mais sustentáveis, mas não se mostra improcedente afirmar que a natureza, por meio dos serviços ecossistêmicos, se faz bastante presente nestes assentamentos. Entende-se que os resultados obtidos se alinham à literatura existente (Cardoso, 2011; Uchyama et al., 2015 e Raudsepp & Peterson, 2016), o que consolida a estratégia de investigação e contribui com futuras pesquisas relacionadas aos serviços ecossistêmicos, em especifico aqueles de natureza cultural.In an exploratory character, the thesis examines the relationship between city and environment, assuming that contemporary urbanism and the sustainability of the urban environment do not dialogue (Franco, 2001). Aspects of urban biodiversity, cultural ecosystem services, urban design and biophilia are discussed, with the Brazilian middle cities as the basis of study. The methodology is structured in three sections: (a) theoretical reflection of the literature concerning the theme; (b) categorization of medium-sized cities by biodiversity potential; and (c) spatial analysis of cultural ecosystem services (CES) for verification of human access. Based on this approach, the aim is to identify the potential of biodiversity in Brazilian medium-sized cities through human access to nature, for the sample of 21 case studies. It is interesting to answer two research questions: (1) Is it possible to relate cultural ecosystem services and urban design with respect to preservation? (2) and to what extent do Brazilian medium-sized cities promote human access to nature and biophilia, which would qualify them as more sustainable? The results indicate that the investigated settlements present high to medium potential of biodiversity and satisfactory levels of access to the cultural ecosystem services that translate the access to the nature. It cannot be asserted, however, that medium-sized cities are more sustainable at all, but it is not unfounded to claim that nature, through ecosystem services, is quite present in these settlements. It is understood that the results are in line with the existing literature (Cardoso, 2011; Uchyama et al., 2015 and Raudsepp & Peterson, 2016), which consolidates the research strategy and contributes to future research related to ecosystem services, in particular those of a cultural nature

Memória para existir, poder para eternizar : a Parada Preta de São Paulo-SP como performance museal afetada e bruta

Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciência da Informação, 2020.Ao pensarmos Museologias e museus que tenham como base o combate às opressões é possível enxergar que ainda pouco é pautado quando se fala do lugar interseccional de corpos LGBTQ negros. Esses corpos historicamente têm suas presenças, histórias e ancestralidades esquecidas pela maioria dos espaços de memória e são grandes agentes na construção do Brasil. No intuito de buscar no campo museológico brasileiro algumas táticas de esquecimento e de resistência, este trabalho parte de pesquisas bibliográficas, de escrita autoetnográfica e de entrevistas para analisar a Parada Preta de São Paulo–SP na ótica das Performances Museais Afetadas e Brutas, conceito inspirado nas reflexões da museóloga Girlene Chagas Bulhões. A pesquisa evidenciou novos caminhos para o pensar e fazer museológico, apresentando as potências e possibilidades da comunidade Afro LGBTQ e reconhecendo a Parada Preta como uma performance museal afetada e bruta.When we think of Museologies and museums based on the fight against oppression, it is possible to see that little is still guided when talking about the intersectional place of black LGBTQ bodies. These bodies historically have their presences, histories and ancestry forgotten by most memory spaces and are great agents in the construction of Brazil. In order to seek in the Brazilian museological field these tactics of forgetfulness and resistance, this work is based on bibliographic research, autobiographical writing and interviews to analyze the Parada Preta de São Paulo-SP from the perspective of Raw and Affected Museal Performances, a concept inspired by the reflections of the museologist Girlene Chagas Bulhões. The research showed new ways to think and make museological, presenting the powers and possibilities of the Afro LGBTQ community and recognizing the Parada Preta as an raw and affected museum performance

Factors Influencing the Insertion and the Support in Collaborative Networks of Organizations / Fatores que Influenciam a Inserção e o Apoio em Redes Colaborativas de Organizações

Some organizations reach its objectives by establishing strategic partnerships, forming collaborative networks. Thus, this research presents in this work a study on two separate networks: network A and network B, located both in the Southern Brazil, in comparison with the results obtained by Becker et al (2009). The objective was to identify from participating companies, the influencing factors of maintenance and of insertion in collaborative networks. This is a study of multiple cases. As the surveyed elements were measured only once, it is understood that the research has cross-sectional study of feature, and identifies the qualitative and quantitative way. As result it was found that in both networks, as well as the results of Becker et al (2009), the question "corporate culture" is obstacle to the development of networks, more considerably. The similarities of the results obtained demonstrates the maturity of the network participants at different locations

Human papillomavirus vaccination in national immunization programs: impact and perspectives

Human Papillomaviruses are present in virtually all cases of cervical cancer and are also linked with anogenital warts and other precancerous lesions which can be primarily prevented by HPV vaccination. We searched the PubMed, Scopus, Web of Science and Embase databases (between January 1st, 2011 and February 28th, 2017) and WHO (World Health Organization) and countries’ health organizations websites for data on HPV vaccination programs and its effectiveness. For the review on the Brazilian Immunization program, we additionally searched SciELO database and websites of the Brazilian Ministry of Health and the Information System of the National Immunization Program (SI-PNI). As of April 2017, about 40% of the countries had introduced HPV vaccines in their national immunization programs, targeting almost always children and teenage females between 9 and 13 years of age. Most of these are high-income countries but low- and middle-income countries are recently implementing the vaccination program with financial support of public and private organizations. Since the introduction of HPV vaccination, numerous articles present data on its effectiveness in real world supporting the effectiveness of an immunization program in the prevention of HPV infection and related diseases in both genders. The Brazilian HPV vaccination program began in 2014 for 9-13 years old girls and has recently been expanded to include boys and young males. This review aims to update information on HPV vaccination programs worldwide highlighting the Brazilian immunization program. Data on the impact and effectiveness of HPV vaccines on infection and related diseases is presented. Moreover, the reasons for different coverage rates, reflected in low-vaccine uptake, are discussed. Finally, the present review addresses the socioeconomic barriers as well as the key determinants of long-term program success and strategies to improve access and adherence to HPV vaccination.O Papilomavírus Humano (HPV) está presente em praticamente todos os casos de câncer do colo do útero e também em verrugas anogenitais e outras lesões pré-cancerígenas diversas, que podem ser prevenidos primariamente via vacinação. Até abril de 2017, cerca de 40% dos países já haviam introduzido a vacina de HPV em seus programas nacionais de imunização, tendo por alvo quase sempre meninas entre 9 e 13 anos de idade. A maioria desses países são de alta renda, mas países de média e baixa renda têm implementado recentemente programas de vacinação com o apoio de organizações de financiamento públicas e privadas. Desde a introdução da vacinação de HPV, inúmeros artigos apresentam dados sobre sua efetividade no mundo real, apoiando a efetividade de um programa de imunização na prevenção da infecção e na redução das doenças relacionadas ao HPV em ambos os sexos. O programa brasileiro de vacinação contra o HPV iniciou-se em 2014 para meninas de 9 a 13 anos de idade e, recentemente, foi ampliado para meninos. Este artigo de revisão visa atualizar os dados de implementação de vacina de HPV em diferentes países do mundo, enfatizando o programa brasileiro. Além disso, são apresentados os dados de impacto e efetividade da vacina de HPV em relação à redução de infecções e doenças causados pelos tipos de HPV contidos nas vacinas. Ainda, são apontadas as razões para as diferentes taxas de cobertura e dificuldades observadas na implementação dos programas, considerando barreiras sociais e econômicas. Finalmente, são discutidos os principais determinantes de sucesso a longo prazo e estratégias para melhorar o acesso e a aderência aos programas de vacinação

CORRELAÇÃO ENTRE ANOMALIAS DE CÓDIGO E PADRÕES DE PROJETO

A pesquisa tem como objetivo propor uma estratégia de classificação de smells (anomalias). Para isso, vamos selecionar alguns smells de livros de autores já conceituados como Brown et al. (1998), Fowler (1999), e os trabalhos de Marinescu (Lanza, Marinescu, 2005)