389,505 research outputs found
Anisotropic flow from Lee-Yang zeroes: a practical guide
We present a new method to analyze anisotropic flow from the genuine
correlation among a large number of particles, focusing on the practical
implementation of the method.Comment: 4 pages; contribution to Quark Matter 2004, Oakland, January 11-17,
200
Comparison of chemical profiles and effectiveness between Erxian decoction and mixtures of decoctions of its individual herbs : a novel approach for identification of the standard chemicals
Acknowledgements This study was partially supported by grants from the Seed Funding Programme for Basic Research (Project Number 201211159146 and 201411159213), the University of Hong Kong. We thank Mr Keith Wong and Ms Cindy Lee for their technical assistances.Peer reviewedPublisher PD
Gus Lee
Augustus Samuel Mein-Sun Lee was born in San Francisco on August 8, 1946, the only son of Tsung-Chi Lee and Da-Tsien Tsu. His three sisters had been born in mainland China and accompanied his mother on the difficult trek across China to India and then to the United States in 1944. There, the family rejoined Tsung-Cbi, wbo had once been a major in the Kuomintang army and who, since 1939, had been working in San Francisco for the Bank of Canton. When Gus was only five, his mother died of breast cancer, and his father, two years later, married a severe Pennsylvania Dutch woman. Gus grew up in the Panhandle and the Haight, a predominantly African American area of San Francisco, and he had a difficult time becoming accepted. He joined the Young Men\u27s Christian Association (YMCA) and learned to box
Cloud for Gaming
Cloud for Gaming refers to the use of cloud computing technologies to build
large-scale gaming infrastructures, with the goal of improving scalability and
responsiveness, improve the user's experience and enable new business models.Comment: Encyclopedia of Computer Graphics and Games. Newton Lee (Editor).
Springer International Publishing, 2015, ISBN 978-3-319-08234-
Correction of the definition of mass-flow parameter in dynamic inflow modelling
No abstract available
Lesiones estructurales del esmalte en la linea neonatal en ninos de 1 a 2 anos nacidos entre los anos 2006-2008 en el Hospital San Jose de Parral segun tipo de parto
100 p.Introducción: La salida del feto desde el vientre materno puede ser llevada a cabo mediante tres procesos, el parto vaginal, la cesárea y el fórceps. Desde el punto de vista odontológico, la protección y vigilancia del período gestacional es muy importante, ya que en este período comienza la odontogénesis. En esta etapa las estructuras dentales tienen un patrón de crecimiento único y gran estabilidad metabólica, por lo que es posible determinar las anomalías en la forma y estructura de los dientes según el periodo de desarrollo en que se han producido. Dentro de los factores ambientales que pueden afectar a las piezas dentarias en formación, durante el periodo neonatal se encuentran la hipoxia, hipocalcemia, nacimiento prematuro y el tipo de parto, entre otras. Este último factor será analizado específicamente dentro del presente estudio. Objetivo general: Determinar la prevalencia de lesiones estructurales de esmalte en la línea neonatal en niños de 1-2 años nacidos en el Hospital de Parral entre los años 2006-
2008 en los distintos tipos de parto. Método: Se realizó un estudio explicativo prospectivo, en el cual se observó la prevalencia de lesiones estructurales de esmalte (LEE) en la línea neonatal de las piezas temporales del sector anterior, mediante un examen clínico.
La población estudiada se constituyó por 155 niños, de los cuales 60 niños conformaron el grupo 1 nacidos por parto espontáneo, 46 niños conformaron el grupo 2 nacidos por cesárea electiva, 35 niños conformaron el grupo 3 nacidos por cesárea electiva y por último 14 niños conformaron el grupo 4 nacidos por fórceps.
Con la finalidad de saber si existe relación entre los tipos de parto y la presencia de
lesiones estructurales del esmalte en la línea neonatal se aplicó el test Chi- Cuadrado y para
determinar si el género era una variable confundente dentro del estudio se realizó un
modelo de Regresión Logística Binaria.Resultados: La prevalencia de lesiones estructurales del esmalte prenatal para el grupo 1
fue de 48%, para el grupo 2 de 30%, para el grupo 3 fue de 74% y para el grupo 4 43%. A
través del cálculo de Chi-Cuadrado, él cual dio como resultado un valor p= 0,000 se pudo
establecer que por lo menos los grupos 1, 2 y 3 se encuentran relacionados con la presencia
de LEE en la línea neonatal. En cuanto a la relación existente entre la presencia de lesiones
estructurales de esmalte en la línea neonatal y el género de los niños examinados, luego de
aplicar el modelo de Regresión Logística Binaria se obtuvo como resultado un valor p=
0,473. Según el maxilar afectado por la presencia de lesiones estructurales del esmalte en la
línea neonatal de piezas temporales, en el grupo 1, se observó una mayor prevalencia de
presencia de LEE en el maxilar (65,5%) con respecto a la mandíbula (3,4%). La presencia
de LEE en maxilar y mandíbula a la vez se observó en el 31% de los niños. En el grupo 2,
se observó una mayor prevalencia de presencia de LEE en el maxilar (85,7%) con respecto
a la mandíbula (7,1%). La presencia de LEE en maxilar y mandíbula a la vez se observó
en el 7,1% de los niños. En el grupo 3, se observó una mayor prevalencia de presencia de
LEE en el maxilar (61,5%) con respecto a la mandíbula (34,6%). La presencia de LEE en
maxilar y mandíbula a la vez se observó en el 3,8% de los niños. En el grupo 4, se observó
una mayor prevalencia de presencia de LEE en el maxilar (66,7%) con respecto a la mandíbula (0%). La presencia de LEE en maxilar y mandíbula a la vez se observó en el 33,3% de los niños. Según las piezas dentarias afectadas por la presencia de lesiones estructurales del esmalte en la línea neonatal de piezas temporales, en el grupo 1, se
observó una mayor prevalencia de LEE en las piezas 5.1 (22%), 6.1 (21%) y 6.2 (14%). En
el grupo 2, se observó una mayor prevalencia de LEE en las piezas 5.1 (28%), 6.1 (20%) y
5.2 (14%). En el grupo 3, se observó una mayor prevalencia de LEE en las piezas 5.1
(20%), 6.1 (20%) y 6.2 (18%). En el grupo 4, se observó una mayor prevalencia de presencia de LEE en las piezas 6.1 (21%), 5.2 (17%) y 5.1 y 6.2 (14%). El riesgo relativo de presentar LEE en la línea neonatal para el grupo de niños nacidos por cesárea de urgencia en relación a aquellos nacidos por cesárea electiva fue de 2.23. El riesgo relativo calculado para el grupo de cesárea de urgencia en relación con el grupo de parto espontáneo fue de 1.47. Por último el riesgo relativo para el grupo de parto espontáneo en relación con el grupo de cesárea de electiva fue de 1.56.Conclusiones: Finalizado el presente estudio, se confirma parte de la hipótesis planteada
al inicio, respecto a la mayor prevalencia de presencia de lesiones estructurales de esmalte
en la línea neonatal existente en niños nacidos por cesárea de urgencia en relación a los
grupos cesárea electiva y parto espontáneo. En tanto que la prevalencia de LEE en la línea
neonatal encontrada para el grupo de niños nacidos por fórceps fue similar a la encontrada
para el parto espontáneo, pero los valores encontrados indican solo una descripción , ya
que el tamaño muestral para este grupo fue insuficiente. A través del cálculo de Chi-Cuadrado, él cual dio como resultado un valor p= 0,000 se pudo establecer que por lo menos los grupos 1, 2 y 3 se encuentran relacionados con la
presencia de lesiones estructurales de esmalte en la línea neonatal. En cuanto a la relación
existente entre la presencia de LEE en la línea neonatal y el género de los niños examinados, luego de aplicar el modelo de Regresión Logística Binaria se obtuvo como resultado un valor p= 0,473 lo que indica que no existe relación entre estas dos variables, por lo tanto el género no puede ser considerado como una variable confundente. Según el maxilar afectado por la presencia de LEE en la línea neonatal, se pudo concluir que en los 4 grupos el maxilar fue la estructura que presentó mayor prevalencia de LEE. Según las piezas dentarias afectadas por la presencia de lesiones estructurales del esmalte en la línea neonatal se concluir que en los cuatro grupos la pieza más afectada fue la pieza 5.1 con un 33,5% de prevalencia, seguido por la pieza 6.1 con un 32.3% de prevalencia. En cuanto al Riesgo Relativo: Los niños nacidos por cesárea de urgencia presentan 2.23 veces más
posibilidades de presentar LEE que niños nacidos por cesárea de electiva. Por otra parte
los niños nacidos por cesárea de urgencia tienen 1.47 veces más posibilidades de presentar LEE que niños nacidos por parto normal. Por último los niños nacidos por parto espontáneo tienen 1.56 veces más posibilidades de que presentar LEE que niños nacidos por cesárea electiva.
Palabras claves: Lesiones estructurales de esmalte (LEE), línea neonatal, parto
espontáneo, cesárea electiva, cesárea de urgencia, fórceps y piezas temporales
Russell Lee
Intended to be used with the Indiana Farm Security Administration Photographs Digital Collection - [LINK]http://www.ulib.iupui.edu/IFSAP[/LINK].A short biography and bibliography of works about Russell Lee
The phylogenic characterisation of a new pathogenicity island (LEE) of strain RW1374 (O103:H2) and other STEC strains
Deckblatt-Impressum
Inhaltsverzeichnis
Verzeichnis der verwendeten Abkürzungen
Einleitung
Schrifttum
Material und Methoden
Ergebnisse
Diskussion
Zusammenfassung
Summary
Literaturverzeichnis
Danksagung
SelbständigkeitserklärungDie Locus of Enterocyte Effacement-Pathogenitätsinsel (LEE-PAI) stellt ein
bedeutendes Virulenzmerkmal enteropathogener Bakterien dar. Das Auftreten
dieser genetischen Insel im Verlauf der Entwicklungsgeschichte LEE-positiver
Enterobakterien wirft jedoch noch immer Fragen auf. In der vorliegenden Arbeit
konnten die Ergebnisse der PCR-Analysen und DNS-DNSHybridisierungen
verschiedener LEE-positiver Bakterien (E. coli, C. rodentium, E. alvei)
hinsichtlich ihres LEE-Insertionsortes in pheU, pheV oder selC eine bereits
formulierte Hypothese bestätigen, die besagt, dass der LEE mehrfach und zu
verschiedenen Zeiten in unterschiedliche klonale Linien enteropathogener und
enterohämorrhagischer E. coli inseriert ist. Diese Aussage wird von der
Erkenntnis unterstützt, dass verschiedene Bakterienarten, Stämme
unterschiedlicher klonaler Cluster und Pathovare unterschiedlichen Ursprungs
denselben Intimintyp exprimieren. Die verschiedenartigen Intimintypen beruhen
dabei auf einer Mosaikstruktur infolge LEE-interner Rekombinationsereignisse.
Das negative Hybridisierungsergebnis mit der Intimin-Sonde eines humanen AE-
positiven DEC-Stammes lässt jedoch vermuten, dass es sich hierbei um einen
Mobilisierungsprozess des Intimin-Gens handelt, in dessen Folge es anstelle
eines kompletten LEE nur zur Ausbreitung des Intimin-Gens unter den
Enterobakterien kommt. Mittels Hybridisierungsmethoden konnte zudem gezeigt
werden, dass entgegen der bisher vertretenen Ansicht die EPEC2-Stämme einen im
pheV-Locus inserierten LEE besaßen. Die DEC 9-Klone des EHEC2-Clusters besaßen
einen im pheU-Locus inserierten LEE. Jedoch weisen laut Literaturdaten die
Stämme dieser beiden unterschiedlichen Cluster denselben Intimintyp (β) auf.
Dahingegen besaßen die DEC 8-Klone des EHEC2-Clusters einen im pheV-Locus
inserierten LEE, weisen aber einen θ-Intimintyp auf. Diese Ergebnisse lassen
die Vermutung zu, dass zwei unterschiedliche LEEtragende Elemente entweder
gleichzeitig von verschiedenen Zellen eines EPEC2/EHEC2-Urstammes oder einzeln
von den Urstämmen aufgenommen wurden. Die Vermutung einer Korrelation zwischen
Intimintyp und LEE-Insertionsort wurde nicht nur durch die
Hybridisierungsergebnisse mit den humanen E. coli-Stämme bestätigt, sondern
auch von den Ergebnissen, die mit den bovinen E. coli-Stämme erzielt wurden.
Ein großer Teil dieser Stämme besaß einen im pheU-Locus inserierten LEE sowie
einen β-Intimintyp. Dasselbe traf auch auf einen C. rodentium-Stamm (DBS125)
zu. Ebenso besaßen alle E. alvei-Stämme einen im pheU-Locus inserierten LEE,
weisen jedoch einen α-Intimintyp auf. Die Beschreibung möglicher neuer
phylogenetischer Linien AE-positiver Bakterien beruhte auf einen scheinbaren
Zusammenhang zwischen LEE-Insertionsort und Intimintyp. Für die Entwicklung
weiterer klonaler E. coli-Linien spricht die Ermittlung eines gemeinsamen
LEEInsertionsortes (pheU oder pheV) verschiedener boviner EHEC-Stämme, die
alle denselben neuen Intimintyp (ε oder ζ) aufweisen. Durchgeführte PCR-
Analysen der LEE-Insertionsorte der E. coli-Stämme ergaben weiterhin, dass bei
der Mehrzahl der untersuchten Stämme neben dem LEE eine zweite genomische
Insel im korrespondierenden pheV- bzw. pheU-Locus inseriert ist. Das daraus
entwickelte Integrationsmodell einer genetischen Insel verifiziert das von
Hacker und Kaper (51) aufgestellte Evolutionsmodell von Pathogenitätsinseln.
Der PAI-Vorläufer inserierte vermutlich in einen oder mehrere E. coli-Urstämme
und entwickelte und verbreitete sich parallel mit der Evolution der einzelnen
phylogenetischen Linien, wie wir sie heute kennen. Der LEE wurde erst
aufgenommen, nachdem die ursprüngliche genomische Insel inseriert war. Am
Stabilisierungsprozess einer PAI sind häufig Mutationen und Deletionen an den
Verbindungspunkten zwischen PAI und tRNS-Gen beteiligt. Ein Hinweis auf diese
Deletionen an der rechten LEE-PAI flankierenden Seite konnten ebenfalls die
Hybridisierungsergebnisse der LEE-positiven Stämme aufgrund fehlender
Hybridisierungssignale liefern. Ein genetisches Element kann theoretisch auf
drei verschiedenen Wegen (Konjugation, Transformation, Transduktion) von einer
Bakterienzelle aufgenommen werden. Der LEE des bovinen EHEC-Stammes RW1374
besitzt u.a. Merkmale, die vermuten lassen, dass der LEE via konjugativer
Transposition erworben wurde. In einem durchgeführten Konjugationsexperiment,
für dessen Zweck das Intimin-Gen (eae) des LEERW1374 mittels eines
Insertionsplasmides markiert wurde, konnte der LEE jedoch nicht mobilisiert
werden. Dennoch kann nicht ausgeschlossen werden, dass er einst mittels
Konjugation übertragen wurde. Eine beidseitige Markierung der in pheV
inserierten LEE-PAI des Stammes RW1374 wurde unter Verwendung von
Insertionsplasmiden mit Erkennungssequenzen für die selten schneidende
Restriktionsendonuklease NotI durchgeführt, um die Insel zu isolieren. Es
gelang jedoch nur mittels homologer Rekombination eine einseitige Markierung
der pheV-Insel. Die linke pheV flankierende Region wurde mit dem Plasmid
pSG76-A, die rechte pheV flankierende Region mit dem Plasmid pST76-A markiert.
Auch gelang die Klonierung der LEE-PAI des Stammes RW1374 in einen apathogenen
E. coli K12-Stamm nicht. Ebenfalls scheiterte die Übertragung beider Methoden
auf einen anderen E. coli- (3030A-86) und C. rodentium-Stamm (DBS100). Die
pathogenen Eigenschaften der einseitig markierten Stämme von RW1374
(RW1374::pSG76-A und RW1374::pST76-A) sowie eines am Intimin-Gen
mutagenisierten Stammes (RW1374::eaepST76-A) wurden in einem Zellkulturtest
(FAS-Test) charakterisiert. Es konnte gezeigt werden, dass eine einseitige
Markierung an den Flanken der LEE-PAI keinerlei Einfluss auf die Ausbildung
der für LEE-positive Bakterien typischen Attaching und Effacing-Läsionen hat.
Hingegen löste der am Intimin-Gen mutagenisierte RW1374 keine AE-Läsionen in
der HEp2-Zellkultur aus. Dieses Ergebnis bestätigte, dass eae-Mutanten ihre
Fähigkeit verlieren, eine vollständige AE-Läsion auszulösen.The locus of enterocyte effacement pathogenicity island (LEE PAI) is a major
virulence feature in enteropathogenic bacteria. The origin and spread of that
genomic island during the evolutionary history of enterobacteria is poorly
understood, therefore one of the major issue of this report consists in
unravelling parts of the LEE history. In the present study, LEE insertion
sites in various pathogens (E. coli, C. rodentium, E. alvei) unravelled by PCR
analysis and hybridisation confirms that the island inserted at multiple
occasions into various sites during the evolution of enteropathogenic and
enterohemorrhagic E. coli lineages. The fact that different kind of bacteria,
strains of various clonal clusters and pathotypes of different origin express
the same intimin type but have different LEE location strongly supports this
hypothesis. By the way, the various intimin types are based on a mosaic
structure due to LEE internal recombination. However, the negative result of
hybridisation with the intimin probe of a human AE positive DEC strain
suggests that this might be due to a specific mobilisation process of the
intimin gene which only results in the spread of the intimin gene instead of
the entire LEE. Contrary to the current opinion it was shown by hybridisation
that EPEC2 strains possess a LEE inserted in pheV locus. DEC clones 9 of EHEC2
displayed a LEE inserted in pheU. However, strains of these different clonal
clusters have the same intimin type (β), while Dec clones 8 of EHEC2 displayed
a LEE inserted in pheV but have intimin type θ. These results imply that two
divergent LEE bearing elements might have been acquired either simultaneously
by different cells from a common ancestral strain of EPEC2/EHEC2 lineages or
separately by its progenitors. Human E. coli as well as bovine E. coli results
confirmed a direct relationship between intimin type and LEE insertion sites.
Most of the bovine strains possessed a LEE inserted in pheU and have a β
intimin type. The same was true for one C. rodentium strain (DBS125). All E.
alvei strains displayed a LEE inserted in pheU, too, but they have an α
intimin type. The description of a possible new phylogenetic lineage of AE
positive pathogens is based on an apparent correlation between LEE insertion
site and intimin type. The investigation of a common LEE insertion site (pheU
or pheV) of various bovine EHEC strains which all express a common intimin
type (ε or ζ) indicates the evolution of further clonal lineages of E. coli.
PCR analysis of LEE insertion sites in E. coli strains revealed that most of
the strains possessed a second genomic island in addition to the LEE PAI
inserted in the corresponding pheU and pheV locus, respectively. Hence, we
developed a model of integration of a genomic island in pheV and pheU gene.
This scenario fits well into the model of evolution of PAIs presumed by Hacker
and Kaper (51). A putative PAI precursor integrated presumably in one or few
E. coli ancestors, evolved and disseminated in parallel with evolution of the
contemporary phylogenetic lineages of E. coli. LEE was apparently acquired
after the primary genomic island was integrated. Mutations and deletions on
the junctions between PAI and transfer-RNA gene are often involved in PAIs
stabilisation. An indication of such deletions at the right LEE flanking
region deliver the results of hybridisation due to absent hybridisation
signals. A genomic element can be acquired by a bacterial cell in three
different ways (conjugation, transformation, transduction), in theory. The LEE
of the bovine EHEC strain RW1374 possesses features which are congruent with
the acquisition of the LEE via conjugative transposition. The intimin (eae)
gene of the LEERW1374 was marked with an insertion plasmid to mobilize the
LEE. It was not possible to mobilize the LEE in an accomplished conjugation
experiment, however this does not rule out a formerly transfer of the LEE via
conjugation. Methods to mark both sides of the pheV inserted LEE PAI of RW1374
were used to isolate this island. For this purpose we used insertion plasmids,
that carry recognition sites for the rare cutting restriction enzyme NotI.
Nevertheless, only one side of the pheV located island was successfully marked
via homolog recombination. pSG76-A was introduced on the left pheV flanking
region, and pST76-A was introduced on the right pheV flanking region. Also
cloning of the LEE PAI of RW1374 in a non-pathogenic E. coli K12 strain was
not achieved. Application of these two methods to another E. coli (3030A-86)
and another C. rodentium (DBS100) strain failed, too. However, the pathogenic
properties of the partial marked strains RW1374::pSG76-A and RW1374::pST76-A
as well as the intimin mutated strain RW1374::eaepST76-A were characterised in
a cell culture assay (FAS test). It was shown that a partial marking of the
LEE PAI flanking regions has no influence on attaching and effacing lesions
typical for LEE containing pathogens. On the contrary, the intimin mutated
strain failed to form AE lesions in HEp2 cell culture. This result indicated
that intimin-mutated strains lost their ability to form AE lesions
- …