Functional effects of SKIL overexpression in prostate cancer cell lines

Background and aims: Prostate cancer is among the most common malignancies in the world affecting millions of men worldwide. Molecular mechanisms behind the prostate cancer are still poorly understood. Genomic copy-number alterations and gene fusions are common in prostate cancer and for example TMPRSS2-ERG gene fusion is one of the common known subtypes of prostate cancer. Previously we found TMPRSS2-SKIL gene fusion from clinical sample collected from prostate cancer patient. This patient was also negative for ETS fusions so this predicts that this cancer may be caused by TMPRSS2-SKIL gene fusion. The aim of this study was to generate prostate cancer cell lines with stable SKIL overexpression and to investigate whether SKIL overexpression would have any effect on the phenotype of the cells. Methods: Plasmid with SKIL and control plasmid without it were ordered from Addgene. DU-145 and RWPE-1 were transfected either with SKIL plasmid or with control plasmid. Then cell were let to grow with geneticin® selective antibiotic (Gibco) to select only the cells with plasmid. With DU-145 cells after selection single cell clones were created by using very low cells/ml dilution. Both mRNA and proteins were collected from both cell lines and RT-qPCR were performed for mRNAs and western blotting for proteins. Proliferation assays were performed for both cell lines using microscopy and digital image analysis. Invasion assays were performed for both cell lines using BD BioCoat Matrigel Invasion Chambers (BD Biosciences). Results: In this study we created cell lines with stable transfections of SKIL and control plasmid. We showed that SKIL is overexpressed in mRNA level when compared to control cells. Expression levels were differentiating quite a lot between DU-145 single cell clones. However we failed to show that this expression is also carried to protein level (in both DU-145 and RWPE-1 cells). We showed that SKIL overexpression does not induce any proliferation difference but it induces invasion in RWPE-1 cells and with some DU-145 clones. Conclusion: Our results showed that it is possible for SKIL overexpression to induce different phenotype for cell lines used. In this case there was clear difference with RWPE-1 cells and with some DU-145 cells. This indicates that it is be possible that SKIL overexpression alone could induce prostate cancer growth. However there were no clear SKIL overexpression in protein level and this leaves questions about mechanisms which cause the phenotype. Further investigations needs to be carried out to find out precise functions of SKIL and it’s overexpression in prostate cancer

LawSampo Portal and Data Service for Publishing and Using Legislation and Case Law as Linked Open Data on the Semantic Web

Publisher Copyright: © 2022 Copyright for this paper by its authors.This paper argues for the idea of publishing legislation and case law as Linked Open Data (LOD) on the Semantic Web, to cater several user groups, including the general public, legislators, lawyers, researchers of legal informatics, and application developers. To support the argument, the proof-of-concept system LawSampo - Finnish Legislation and Case Law on the Semantic Web is introduced, including a semantic portal and a LOD service. Based on the Sampo Model, the main novelty of LawSampo is the provision of heterogenous distributed legal data through multiple application perspectives for faceted searching and exploring the data and for data analysis in legal informatics.Peer reviewe

Kulttuuriympäristöjen ja maisemien visuaalisen seurannan menetelmät

Kulttuuriympäristöjen ja maisema-alueiden arvoja ja tehtävien toimenpiteiden vaikutuksia on selvitetty yleisesti valokuvien ja niiltä tehtyjen muutosarviointien avulla. Tässä hankkeessa selvitettiin, miten uudet kuvausmenetelmät, kuten panoraamakuvaus ja droonin käyttö kuvauksissa soveltuvat visuaalisen seurannan lähdeaineistoksi. Kuvausmenetelmänä panoraamakuvaus todettiin hyvin käyttökelpoiseksi. Niiden ottaminen on helppoa ja niitä voi suositella korvaamaan perinteistä yksittäiskuvien ottamista. Droonilla tehtävien pallopanoraamakuvausten todettiin olevan hyvä lisä kohteiden seurantaa. Kuvausten toteutus on nopeaa ja korkealta otettu laaja-alainen kuva antaa lisätietoa maantasalta tehtäviin kuvauksiin. Droonilla saatavista erityiskuva-aineistoista käyttökelpoisimpia ovat pistepilviaineistot ja 3D-pintamalliaineistot, jotka mahdollistavat uuden tarkastelutavan visuaalisessa seurannassa. Erillisaineistojen kuvaaminen maastossa ja aineistojen jatkokäsittely on kuitenkin paljon aikaa vievää niin, että erillisaineistojen tarvetta kannattaa harkita huolella eikä niistä välttämättä ole hyötyä yleisluonteisissa visuaalisissa seurannoissa. Hankesuunnitelmassa kuvausten tavoitteet määrittelevät, mitä ja millaisella laadulla kuva-aineistoja tarvitaan. Kunnollisen kuvaussuunnitelman avulla voidaan maastotöiden toteutuksessa välttää odottamattomia lisätöitä

Eri poluilla työllisyyteen : Suomen sosiaaliturvajärjestelmän erityispiirteet ja ongelmakohdat kansainvälisessä vertailussa

Raportti tuottaa tutkittua tietoa toimeentuloturvaetuuksien ja palveluiden yhteensovittamisen haasteista Suomessa, Ruotsissa, Tanskassa, Alankomaissa ja Iso-Britanniassa. Se kartoittaa miten työttömiä koskevia sosiaaliturvan ongelmakohtia on ratkaistu vertailumaissa, ja miten ratkaisut toimivat toimeentulon ja työllistymisen näkökulmasta. Raportissa analysoidaan, mitkä vertailumaiden sosiaaliturvajärjestelmien piirteet voisivat olla hyödynnettävissä Suomen sosiaaliturvauudistuksessa. Aineistoina analyyseissa hyödynnetään aiempaa tutkimuskirjallisuutta, vinjetti- ja asiantuntijahaastatteluja sekä EU-Silc, EUROMOD, UKMOD ja OECD TaxBEN aineistoja. Vertailumaiden ratkaisujen toimivuutta testataan mikrosimuloinnilla. Analyysin perusteella etuuksien ja palveluiden yhteensovittaminen on haaste kaikissa tutkimuksen maissa. Palvelujen ja etuuksien yhteensovittaminen on vaikeaa, koska järjestelmien tavoitteet ovat erilaisia ja hallinnon rakenteet ovat jäykkiä. Eri maissa ratkaisuja haetaan hallinnonalat poikkileikkaavista toimintamalleista sekä asiakaslähtöisestä aktivoinnista. Suomen kannalta keskeisiä oppeja ovat yksilön ja yhteiskunnan sosiaaliturvaa koskevia oikeuksien ja velvollisuuksien tasapainottaminen, palvelupolkujen kehittäminen monipolkuisemmiksi sekä varhaisempi ja oikea-aikaisempi palvelutarjonta. Näin helpotetaan siirtymiä etuuksien, palveluiden ja työllisyyden välillä.Tämä julkaisu on toteutettu osana valtioneuvoston selvitys- ja tutkimussuunnitelman toimeenpanoa. (tietokayttoon.fi) Julkaisun sisällöstä vastaavat tiedon tuottajat, eikä tekstisisältö välttämättä edusta valtioneuvoston näkemystä

Lähisuhdeväkivalta koronapandemian aikana vauvaperheiden vanhemmilla ja Nollalinjan auttavan puhelimen keskusteluissa

Lähisuhdeväkivalta on maailmanlaajuinen vakava sosiaalinen ja terveydellinen ongelma. Tutkimukset osoittavat, että lähisuhdeväkivalta on tyypillisesti lisääntynyt yhteiskunnal- listen kriisien, kuten pandemioiden aikana (Peterman 2020). Myös koronapandemian ja sen seurauksena tulleet rajoitukset ovat lisänneet sekä lähisuhdeväkivallan riskitekijöiden määrää että naisten kokemaa parisuhdeväkivaltaa (Cambell 2020; Hamadani ym. 2020).Suomessa ei vielä tällä hetkellä ole saatavilla väestötason tietoa siitä, miten koronapan- demia on vaikuttanut lähisuhdeväkivallan määrään, muotoihin tai vakavuuteen. Sen si- jaan lähisuhdeväkivaltapalvelujen käytöstä on saatavilla tietoa. Valtion rahoittamissa ja ohjaamissa turvakotipalveluissa ja Nollalinja auttavassa puhelimessa on näkynyt vaihtelua palvelun käytön määrissä. Vaikuttaa siltä, että pandemian alkuvaiheessa (talvi/kevät 2020)palvelut eivät ole tavoittaneet kaikkia apua tarvitsevia. Myöhemmässä pandemian vaiheessa (kesä/syksy 2020) palveluiden käyttö on normalisoitunut ja jopa kasvanut ai- empiin vuosiin verrattuna. Tämä saattaa olla seurausta sekä varsinaisen avun tarpeen kasvusta että sen patoutumisesta kevään aikana (Hietamäki ym. 2020b).Syyskuussa 2020 käynnistyneessä Koronapandemian vaikutukset lähisuhdeväkivallan kokemuksiin ja palveluiden käyttöön (KOVÄ) -tutkimushankkeessa tutkitaan koronapan- demian ja siihen liittyvien rajoitustoimien vaikutuksia lähisuhdeväkivallan esiintymiseen, kokemuksiin, avun hakemiseen, palveluihin ohjaamiseen ja palveluiden saatavuuteen. Tutkimuksen aineistona ovat turvakodeista ja väkivaltaa kokeneille tarkoitetuista avopal- veluista lähisuhdeväkivaltaan apua hakeneille suunnatut kyselyt ja haastattelut sekä Nollalinjan auttavan puhelimen ja turvakotipalveluiden toiminnasta kertyvät raportit ja kuvaukset.Tässä julkaisussa käytämme aineistoina Nollalinjan auttavan puhelimen työntekijöiden täyttämää anonyymia sähköistä palvelunseurantalomaketta sekä vauvaperheiden van- hemmille suunnatun FinLapset-kyselytutkimuksen syyskuussa 2020 poimittua väliaika- aineistoa.Julkaisussa kuvataan parisuhdeväkivallan esiintyvyyttä vauvaperheissä ja tarkastellaan, onko koronapandemialla tai sen arkielämää koskevilla rajoitustoimilla yhteyttä parisuh- deväkivallan kokemuksiin. Lisäksi raportoidaan Nollalinjan auttavaan puhelimeen soitet- tujen puheluiden määriä ja koronapandemian esiintymistä puheluissa kolmena ajankoh- tana: ennen koronapandemian alkamista, koronapandemiaan liittyvien rajoitusten aikana sekä tiukempien rajoitusten purkamisen jälkeen.</div

Finnish Parliament on the Semantic Web: Using ParliamentSampo Data Service and Semantic Portal for Studying Political Culture and Language

Peer reviewe

Finnish Parliament on the Semantic Web: Using ParliamentSampo Data Service and Semantic Portal for Studying Political Culture and Language

Peer reviewe