Identification and characterization of a Babesia bigemina thrombospondin-related superfamily member, TRAP-1 : a novel antigen containing neutralizing epitopes involved in merozoite invasion

Background: Thrombospondin-related anonymous protein (TRAP) has been described as a potential vaccine candidate for several diseases caused by apicomplexan parasites. However, this protein and members of this family have not yet been characterized in Babesia bigemina, one of the most prevalent species causing bovine babesiosis. Methods: The 3186-bp Babesia bigemina TRAP-1 (BbiTRAP-1) gene was identified by a bioinformatics search using the B. bovis TRAP-1 sequence. Members of the TRAP and TRAP-related protein families (TRP) were identified in Babesia and Theileria through a search of the TSP-1 adhesive domain, which is the hallmark motif in both proteins. Structural modeling and phylogenetic analysis were performed with the identified TRAP proteins. A truncated recombinant BbiTRAP-1 that migrates at approximately 107 kDa and specific antisera were produced and used in Western blot analysis and indirect fluorescent antibody tests (IFAT). B-cell epitopes with neutralizing activity in BbiTRAP-1 were defined by enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA) and invasion assays. Results: Three members of the TRAP family of proteins were identified in B. bigemina (BbiTRAP-1 to -3). All are type 1 transmembrane proteins containing the von Willebrand factor A (vWFA), thrombospondin type 1 (TSP-1), and cytoplasmic C-terminus domains, as well as transmembrane regions. The BbiTRAP-1 predicted structure also contains a metal ion-dependent adhesion site for interaction with the host cell. The TRP family in Babesia and Theileria species contains the canonical TSP-1 domain but lacks the vWFA domain and together with TRAP define a novel gene superfamily. A variable number of tandem repeat units are present in BbiTRAP-1 and could be used for strain genotyping. Western blot and IFAT analysis confirmed the expression of BbiTRAP-1 by blood-stage parasites. Partial recognition by a panel of sera from B. bigemina-infected cattle in ELISAs using truncated BbiTRAP-1 suggests that this protein is not an immunodominant antigen. Additionally, bovine anti-recombinant BbiTRAP-1 antibodies were found to be capable of neutralizing merozoite invasion in vitro. Conclusions: We have identified the TRAP and TRP gene families in several Babesia and Theileria species and characterized BbiTRAP-1 as a novel antigen of B. bigemina. The functional relevance and presence of neutralization-sensitive B-cell epitopes suggest that BbiTRAP-1 could be included in tests for future vaccine candidates against B. bigemina.Instituto de BiotecnologíaFil: Montenegro, Valeria Noely. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Paoletta, Martina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Jaramillo Ortiz, Jose Manuel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Suarez, Carlos Esteban. Washington State University. Department of Veterinary Microbiology and Pathology; Estados Unidos. United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service (USDA-ARS). Animal Disease Research Unit; Estados UnidosFil: Wilkowsky, Silvina Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Choroid Plexus Papilloma of the Fourth Ventricle: A Pediatric Patient.

Choroid plexus papilloma is a low-frequency entity in both the adult and pediatric populations. Its clinical presentation is very variable as it depends on its location and length. We must always do the differential diagnosis between papilloma and other intraventricular pathologies. This article is about a case report of a pediatric patient with a Choroid plexus papilloma located in the fourth ventricle, a location that is atypical for the pediatric population

Tendencias de investigación emergentes en cafés especiales: un análisis bibliométrico

Contextualization: The specialty coffee market has increased in popularity due to its characteristics related to improvement and exclusivity in its sensory quality factors through different processes and determined actors. Through diverse processes and specific actors, it is aimed to guarantee excellence in each stage of the production chain of specialty coffees. It involves aspects such as the best temperature, altitude, and soil conditions selection, as well as the importance of harvesting, roasting, preparation, and enjoyment, which directly influences the quality experience. Knowledge gap: In relation to the field of knowledge on coffee, the application of literature reviews is deficient, mainly through bibliometric analysis techniques. Additionally, there is no document addressing the topic of specialty coffees or exhaustively describing the different lines of research and indicators. Purpose: This research aims to synthesize the academic literature related to the specialty coffee area through a bibliometric analysis. Hence, a historical search related to the field of knowledge is necessary to determine different indicators describing the current state of scientific production. Methodology: 417 documents were collected from the Scopus database for review. Different indicators are built to describe the main topics concerning production, authors, journals, countries, and most cited articles. Additionally, bibliometric networks are built to identify trends. Finally, the future lines of research are described through a qualitative analysis. Results and conclusions: Results reveal how the production and marketing context decisively influence research, especially considering that Brazil is the leading academic producer in this field. Through indicators and bibliometric networks, the lines of research that analyze the physicochemical components, the sensory quality of coffee, the market, and the consumption and governance of specialty coffees are recognized.Contextualización: el mercado de cafés especiales ha aumentado su popularidad debido a sus características relacionadas con una mejora y una exclusividad en sus factores sensoriales de calidad, a través de diferentes procesos y actores determinados, con los que se busca garantizar la excelencia en cada etapa de la cadena productiva de los cafés especiales. Esto implica aspectos como la selección de las mejores condiciones de temperatura, altitud y suelo, así como la importancia de la recolección, el tueste, la preparación y el disfrute, los cuales influyen directamente en la experiencia de calidad. Vacío de conocimiento: con relación al campo de conocimiento de los cafés, es deficiente la aplicación de revisiones de literatura, especialmente mediante técnicas de análisis bibliométrico. Adicionalmente, no se encuentra ningún documento que aborde la temática de cafés especiales y describa de forma exhaustiva las diferentes líneas de investigación e indicadores. Propósito: esta investigación pretende sintetizar la literatura académica relacionada con el campo de los cafés especiales por medio de un análisis bibliométrico, por lo que se hace necesaria una búsqueda histórica en relación con el campo de conocimiento para determinar diferentes indicadores que describan el estado actual de la producción científica.  Metodología: para la revisión se recolectaron 417 documentos de la base de datos Scopus. Se construyeron diferentes indicadores que describen los principales tópicos en relación con la producción, autores, revistas, países y artículos más citados, además, se construyen redes bibliométricas para identificar tendencias. Finalmente, mediante un análisis cualitativo se describen futuras líneas de investigación.  Resultados y conclusiones: los resultados revelan cómo el contexto de producción y comercialización influye de manera determinante en la investigación, especialmente considerando que Brasil ostenta el liderazgo como principal productor académico en este campo. A través de indicadores y redes bibliométricas, se reconocen líneas de investigación que analizan los componentes fisicoquímicos, la calidad sensorial del café, el mercado, consumo y gobernanza de los cafés especiales

N-Glycosylation in piroplasmids : Diversity within simplicity

N-glycosylation has remained mostly unexplored in Piroplasmida, an order of tick-transmitted pathogens of veterinary and medical relevance. Analysis of 11 piroplasmid genomes revealed three distinct scenarios regarding N-glycosylation: Babesia sensu stricto (s.s.) species add one or two N-acetylglucosamine (NAcGlc) molecules to proteins; Theileria equi and Cytauxzoon felis add (NAcGlc)2-mannose, while B. microti and Theileria s.s. synthesize dolichol-P-P-NAcGlc and dolichol-P-P-(NAcGlc)2 without subsequent transfer to proteins. All piroplasmids possess the gene complement needed for the synthesis of the N-glycosylation substrates, dolichol-P and sugar nucleotides. The oligosaccharyl transferase of Babesia species, T. equi and C. felis, is predicted to be composed of only two subunits, STT3 and Ost1. Occurrence of short N-glycans in B. bovis merozoites was experimentally demonstrated by fluorescence microscopy using a NAcGlc-specific lectin. In vitro growth of B. bovis was significantly impaired by tunicamycin, an inhibitor of N-glycosylation, indicating a relevant role for N-glycosylation in this pathogen. Finally, genes coding for N-glycosylation enzymes and substrate biosynthesis are transcribed in B. bovis blood and tick stages, suggesting that this pathway is biologically relevant throughout the parasite life cycle. Elucidation of the role/s exerted by N-glycans will increase our understanding of these successful parasites, for which improved control measures are needed.Instituto de PatobiologíaFil: Florin-Christensen, Mónica. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patobiología; ArgentinaFil: Florin-Christensen, Mónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rodriguez, Anabel Elisa. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patobiología; ArgentinaFil: Rodriguez, Anabel Elisa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Suarez, Carlos Esteban. Washington State University. College of Veterinary Medicine. Department of Veterinary Microbiology and Pathology; Estados UnidosFil: Suarez, Carlos Esteban. United States Department of Agricultural-Agricultural Research Service. Animal Disease Research Unit; Estados UnidosFil: Ueti, Massaro W. Washington State University. College of Veterinary Medicine. Department of Veterinary Microbiology and Pathology; Estados UnidosFil: Ueti, Massaro W. United States Department of Agricultural-Agricultural Research Service. Animal Disease Research Unit; Estados UnidosFil: Delgado, Fernando Oscar. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patobiología; ArgentinaFil: Delgado, Fernando Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Echaide, Ignacio Eduardo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; ArgentinaFil: Schnittger, Leonhard. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patobiología; ArgentinaFil: Schnittger, Leonhard. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Body condition estimation on cows from depth images using Convolutional Neural Networks

BCS (“Body Condition Score”) is a method used to estimate body fat reserves and accumulated energy balance of cows. BCS heavily influences milk production, reproduction, and health of cows. Therefore, it is important to monitor BCS to achieve better animal response, but this is a time-consuming and subjective task performed visually by expert scorers. Several studies have tried to automate BCS of dairy cows by applying image analysis and machine learning techniques. This work analyzes these studies and proposes a system based on Convolutional Neural Networks (CNNs) to improve overall automatic BCS estimation, whose use might be extended beyond dairy production. The developed system has achieved good estimation results in comparison with other systems in the area. Overall accuracy of BCS estimations within 0.25 units of difference from true values was 78%, while overall accuracy within 0.50 units was 94%. Similarly, weighted precision and recall, which took into account imbalance BCS distribution in the built dataset, show similar values considering those error ranges.Fil: Rodríguez Alvarez, Juan Maximiliano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Arroqui, Mauricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Mangudo, Pablo. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires; ArgentinaFil: Toloza, Juan Manuel. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Jatip, Daniel Esteban. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires; ArgentinaFil: Rodriguez, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Instituto Superior de Ingeniería del Software. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Instituto Superior de Ingeniería del Software; ArgentinaFil: Teyseyre, Alfredo Raul. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Instituto Superior de Ingeniería del Software. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Instituto Superior de Ingeniería del Software; ArgentinaFil: Sanz, Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Zunino Suarez, Alejandro Octavio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Instituto Superior de Ingeniería del Software. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Instituto Superior de Ingeniería del Software; ArgentinaFil: Machado, Claudio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Mateos Diaz, Cristian Maximiliano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Instituto Superior de Ingeniería del Software. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Instituto Superior de Ingeniería del Software; Argentin

Brucella neotomae Infection in Humans, Costa Rica

Several species of Brucella are known to be zoonotic, but B. neotomae infection has been thought to be limited to wood rats. In 2008 and 2011, however, B. neotomae was isolated from cerebrospinal fluid of 2 men with neurobrucellosis. The nonzoonotic status of B. neotomae should be reassessed

Küpers clinical prediction score in a case series of primary aldosteronism

Background: Primary aldosteronism is a disorder due to excessive aldosterone production in the presence of low renin levels. It is an underdiagnosed pathology despite its simple screening. Establishing the unilateral or bilateral location represents the greatest diagnostic challenge and is crucial to define the therapeutic approach. Adrenal venous catheterization (AVC) is the best test to establish the location, but it is invasive and expensive. New predictive markers of laterality are being developed. Case series presentation: We present a case series of 8 patients diagnosed with primary aldosteronism due to arterial hypertension with hypokalaemia, elevated aldosterone-renin ratio and compatible computed tomography. 4 patients underwent adrenal venous catheterization. Conclusion: In patients who underwent catheterization as well as in those who did not, the Küpers score adequately predicted lateralization in 75% of cases and it could be a useful tool to discriminate unilateral from bilateral aldosteronism.Introducción: El hiperaldosteronismo primario es un desorden debido a una producción excesiva de aldosterona en presencia de niveles bajos de renina. Es una patología infradiagnosticada a pesar de su simple tamizaje. Definir la localización unilateral o bilateral representa el más importante desafío diagnóstico y es crucial para el abordaje terapéutico. El cateterismo venoso adrenal (CVA) es la mejor prueba para establecer la localización, pero es invasivo y costoso. Nuevos marcadores predictivos de unilateralidad se encuentran en desarrollo. Presentación de serie de casos: Presentamos una serie de casos de 8 pacientes diagnosticados con hiperaldosteronismo primario debido a hipertensión arterial con hipocalemia, radio aldosterona-renina elevado y tomografía compatible. 4 pacientes fueron sometidos a cateterismo venoso adrenal. Conclusión: Tanto en los pacientes que fueron sometidos a cateterismo venoso adrenal como en los que no, el score de Küpers predijo adecuadamente la lateralidad en 75% de los casos y puede ser una herramienta útil para diferenciar el hiperaldosteronismo unilateral del bilateral

Síndrome de Sjögren: identificación de nuevos biomarcadores y mecanismos moleculares implicados en su fisiopatogénesis

El Síndrome de Sjögren (SS) es una enfermedad autoinmune de carácter sistémico, que afecta principalmente al sistema glandular exocrino, generando un funcionamiento anormal de las glándulas lacrimales y salivales. Objetivo: proporcionar una actualización sobre la identificación de nuevos biomarcadores y mecanismos moleculares implicados en la fisiopatogénesis del SS. Método: Revisión narrativa de la literatura en diferentes bases de datos, mediante la búsqueda de términos descritos incluidos en los tesauros MESH y DeCs, para artículos publicados a partir del año 2018. Resultados: presentamos evidencia que destaca la identificación de nuevos biomarcadores y mecanismos implicados en la fisiopatogénesis del SS, describiendo las vías de: linfocitos B, catepsina S, cistatina C, quimioquina C-X3-C modificada de ligando 1, quimiocina regulada por activación del timo, células T, proteína morfogenética ósea 6, estimulación del receptor de oxitocina, receptor de zinc, calponina-3. Conclusión: los avances en la tecnología facilita el análisis detallado de la genética y fisiopatogénesis del SS, impulsando el desarrollo de terapias específicas. La búsqueda de biomarcadores no invasivos responde a las limitaciones de los métodos existentes y la invasividad de las biopsias salivales, prometiendo mejoras diagnósticas y terapéutica

Study protocol and rationale of the “Cogniaction project” a cross-sectional and randomized controlled trial about physical activity, brain health, cognition, and educational achievement in schoolchildren

Background: Education and health are crucial topics for public policies as both largely determine the future wellbeing of the society. Currently, several studies recognize that physical activity (PA) benefits brain health in children. However, most of these studies have not been carried out in developing countries or lack the transference into the education field. The Cogni-Action Project is divided into two stages, a cross-sectional study and a crossover-randomized trial. The aim of the first part is to establish the associations of PA, sedentarism, and physical fitness with brain structure and function, cognitive performance and academic achievement in Chilean schoolchildren (10–13 years-old). The aim of the second part is to determinate the acute effects of three PA protocols on neuroelectric indices during a working memory and a reading task. Methods: PA and sedentarism will be self-reported and objectively-assessed with accelerometers in a representative subsample, whilst physical fitness will be evaluated through the ALPHA fitness test battery. Brain structure and function will be assessed by magnetic resonance imaging (MRI) in a randomized subsample. Cognitive performance will be assessed through the NeuroCognitive Performance Test, and academic achievement by school grades. In the second part 32 adolescents (12–13 year-old) will be cross-over randomized to these condition (i) “Moderate-Intensity Continuous Training” (MICT), (ii) “Cooperative High-Intensity Interval Training” (C-HIIT), and (iii) Sedentary condition. Neuroelectric indices will be measures by electroencephalogram (EEG) and eye-tracking, working memory by n-back task and reading comprehension by a reading task

La enseñanza del metabolismo: retos y oportunidades

En el marco del Proyecto de Innovación Educativa de la Universidad de Málaga PIE15-163, cuya descripción y resultados incluimos, decidimos que esta era una excelente oportunidad para reflexionar acerca de la enseñanza del metabolismo y de poner por escrito dichas reflexiones en un libro. Quisimos y pudimos contar con la colaboración de buena parte de los compañeros del Departamento de Biología Molecular y Bioquímica que apoyaron con su firma el proyecto PIE15-163 y extendimos nuestra invitaciones a otros compañeros de dentro y fuera de la Universidad de Málaga. Del Departamento de Biología Molecular y Bioquímica de la Universidad de Málaga hemos recibido aportaciones de los catedráticos Victoriano Valpuesta Fernández, Ana Rodríguez Quesada y Antonio Heredia Bayona, los profesores titulares María Josefa Pérez Rodríguez, José Luis Urdiales Ruiz e Ignacio Fajardo Paredes y la investigadora postdoctoral y profesora sustituta interina Beatriz Martínez Poveda. De otros departamentos de la Universidad de Málaga hemos contado con las aportaciones de la catedrática del Departamento de Especialidades Quirúrgicas, Bioquímica e Inmunología Pilar Morata Losa, del catedrático del Departamento de Lenguajes y Ciencias de la Computación José Francisco Aldana Montes y los componentes de su grupo de investigación Khaos Ismael Navas Delgado, María Jesús García Godoy, Esteban López Camacho y Maciej Rybinski, del catedrático Ángel Blanco López, del Área de Conocimiento de Didáctica de las Ciencias Experimentales y del Doctor en Ciencias Químicas y actual doctorando del Programa de Doctorado "Educación y Comunicación Social" Ángel Luis García Ponce. De fuera de la Universidad de Málaga, hemos contado con las aportaciones del catedrático de la Universidad de La Laguna Néstor V. Torres Darias, de la catedrática de la Universitat de les Illes Balears Pilar Roca Salom y de sus compañeros los profesores Jorge Sastre Serra y Jordi Oliver, de los catedráticos de la Universidad de Granada Rafael Salto González y María Dolores Girón González y su colaborador el Dr. José Dámaso Vílchez Rienda, del profesor titular de la Universidad de Alcalá Ángel Herráez, del investigador postdoctoral de la Universidad de Erlangen (Alemania) Guido Santos y del investigador postdoctoral de la empresa Brain Dynamics Carlos Rodríguez Caso.Hemos estructurado los contenidos del libro en diversas secciones. La primera presenta el Proyecto en cuyo marco se ha gestado la iniciativa que ha conducido a la edición del presente libro. La segunda sección la hemos titulado "¿Qué metabolismo?" e incluye diversas aportaciones personales que reflexionan acerca de qué metabolismo debe conocer un graduado en Bioquímica, en Biología, en Química, en Farmacia o en Medicina, así como una aportación acerca de qué bioquímica estructural y enzimología son útiles y necesarias para un estudiante que vaya a afrontar el estudio del metabolismo. La tercera sección, "Bases conceptuales", analiza las aportaciones del aprendizaje colaborativo, el contrato de aprendizaje y el aprendizaje basado en la resolución de casos prácticos a la mejora del proceso enseñanza-aprendizaje dentro del campo de la Bioquímica y Biología Molecular, más concretamente en el estudio del metabolismo. La cuarta sección se titula "Herramientas", es la más extensa e incluye las diversas aportaciones centradas en propuestas concretas de aplicación relevantes y útiles para la mejora de la docencia-aprendizaje del metabolismo. Sigue una sección dedicada a presentar de forma resumida los "Resultados" del proyecto PIE15-163. El libro concluye con una "coda final" en la que se reflexiona acerca del aprendizaje de la Química a la luz de la investigación didáctica.Patrocinado por el Proyecto de Innovación Educativa de la Universidad de Málaga PIE15-16