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A Novel Deep Neural Network Technique for Drug–Target Interaction
The authors wish to acknowledge the financial support of the CoordenacAo de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior (CAPES). This research was supported by the High-Performance Computing Center at UFRN (NPAD/UFRN). This study was financed in part by the CoordenacAo de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior (CAPES)-Finance Code 001.Drug discovery (DD) is a time-consuming and expensive process. Thus, the industry
employs strategies such as drug repositioning and drug repurposing, which allows the application of
already approved drugs to treat a di erent disease, as occurred in the first months of 2020, during the
COVID-19 pandemic. The prediction of drug–target interactions is an essential part of the DD process
because it can accelerate it and reduce the required costs. DTI prediction performed in silico have used
approaches based on molecular docking simulations, including similarity-based and network- and
graph-based ones. This paper presents MPS2IT-DTI, a DTI prediction model obtained from research
conducted in the following steps: the definition of a new method for encoding molecule and protein
sequences onto images; the definition of a deep-learning approach based on a convolutional neural
network in order to create a new method for DTI prediction. Training results conducted with the
Davis and KIBA datasets show that MPS2IT-DTI is viable compared to other state-of-the-art (SOTA)
approaches in terms of performance and complexity of the neural network model. With the Davis
dataset, we obtained 0.876 for the concordance index and 0.276 for the MSE; with the KIBA dataset,
we obtained 0.836 and 0.226 for the concordance index and the MSE, respectively. Moreover, the
MPS2IT-DTI model represents molecule and protein sequences as images, instead of treating them as
an NLP task, and as such, does not employ an embedding layer, which is present in other models.Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior (CAPES) 001High-Performance Computing Center at UFRN (NPAD/UFRN
Poblamiento Paleoindio en el norte-centro de Chile: Evidencias, problemas y perspectivas de estudio
Este artículo presenta una revisión de las evidencias de sitios Paleoindios en el área comprendida entre el Norte Grande y Centro de Chile, caracterizando contextos, marco paleoambiental y relaciones culturales. Sólo se consideran contextos culturales asociados con fauna extinta y sitios con instrumentos líticos tipológicamente diagnósticos del periodo. Se discuten las evidencias y sus asociaciones culturales, los problemas interpretativos de los sitios a nivel regional, la existencia de ocupaciones anteriores a 11.500 años B.P. y algunos lineamientos para el estudio de los primeros poblamientos Paleoindios en el Norte-Centro de Chile
A circulação de referências na revista Educar em Revista e o campo educacional brasileiro (2000-2010)
The present study aims at analyzing the articles published in the period from 2000 to 2010 in one of the leading educational journals in Brazil, “Educar em Revista”, edited by the Department of Education of the Federal University of Paraná (UFPR). The goal is to depict the ensemble of authors who publish in this journal, as well as their affinities and networks, in order to obtain clues to help identify the current status of the Brazilian educational field, increasingly characterized by the culture of performativity based on intense competition. The leading hypothesis is that research articles published in major Brazilian journals can offer significant elements to understand the structure and dynamics of the field of education in the line proposed by Pierre Bourdieu. Methodological procedures were mobilized for the purpose of article examination and particular attention is paid to external referents present in the articles. Data is also collected based on bibliographical references, books, magazine articles, theses and dissertations and other sources mentioned in them. The assessment of biographical information and the authors ‘ curriculum completes the cycle. During the examining of “Educar em Revista” a change in the profile of the publication has been noted as it showed, between 2000 and 2005, a strong endogenous character, which was corrected in the last years of the study period, towards greater adequacy to the criteria for CAPES journal evaluation system. It has been noticed that both the editors as authors who publish in the journal seek to adjust to the new characteristics of the field, increasingly marked by performativity and competition.O presente estudo examina os artigos publicados no período entre 2000 e 2010 por uma das principais revistas pedagógicas brasileiras, Educar em Revista, editada pelo Setor de Educação da UFPR. O objetivo é caracterizar o conjunto dos autores que publicam nesse periódico, suas afinidades e redes de relações, de modo a obter indícios que ajudem a configurar o atual estado do campo educacional brasileiro, cada vez mais caracterizado pela cultura da performatividade, fundada em uma intensa competição. A hipótese principal é a de que a investigação dos artigos publicados nos principais periódicos brasileiros pode oferecer elementos significativos para compreender a estruturação e a dinâmica do campo educacional na linha proposta por Bourdieu. No exame dos artigos foram mobilizados procedimentos metodológicos em que é dada uma atenção particular aos referentes externos presentes nos artigos. Também são recolhidas informações presentes nas suas referências bibliográficas, registrando-se livros, artigos de revista, teses e dissertações e outras fontes ali mencionadas. Isso completa-se pelo levantamento de informações biográficas e curriculares dos autores. No exame de Educar em Revista constatou-se uma mudança do perfil da publicação, já que ela apresentava, no intervalo entre 2000 e 2005, um forte caráter endógeno, o que foi corrigido nos últimos anos do período estudado, no sentido de maior adequação aos critérios de avaliação dos periódicos utilizados pela Capes. Percebe-se que tanto os editores quanto os autores que publicam na revista procuram se ajustar às novas características do campo, cada vez mais marcado pela performatividade e pela competição
A utilização da técnica de Z-Scan para o estudo do vidro fosfato PANK dopado com íons Nd3+ e nanocristais de CdS
The characterization of doped glasses has been an important area for the development of photonic technologies. However, the development of nanoscience and the discovery of the quantic properties of nanocrystals, increased the number of researches in glass materials with interest in technological applications by the scientific community. This work aims to investigate the nonlinear refractive index of the phosphate glass matrix (P2O5 + Al2O3 + Na2O + K2O) doped with neodymium ions and CdS nanocrystals. This research characterizes a phosphate glass matrix, which is not well known in the literature with different dopants, in this case, rare earths and nanocrystals, which they show similar absorption peaks at ultraviolet. For a nonlinear optics characterization was used the Z-Scan technique, known to its simplicity and precision when compared to other techniques. Linear optical measurements were also made, such as optical absorption and lifetime, to calculate of non-linear optics properties. The results show there is an interaction between the dopants, capable of generating a variation in linear and nonlinear optical parameters under study.CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFAPEMIG - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas GeraisDissertação (Mestrado)A caracterização de materiais vítreos dopados tem sido uma área importante para o desenvolvimento de tecnologias fotônicas. Porém, com o desenvolvimento da nanociência e a descoberta das propriedades quânticas dos nanocristais, a quantidade de materiais vítreos a serem estudados aumentou de forma abrupta, o qual despertou um forte interesse da comunidade científica visando possíveis aplicações tecnológicas. O presente trabalho tem como objetivo investigar o índice de refração não linear da matriz vítrea a base de fosfato (P2O5 + AhO3 + Na2O + K2O) dopada com íons de neodímio e nanocristais de CdS. Destaca-se que a pesquisa corresponde à caracterização de uma matriz fosfata pouco conhecida na literatura, com dopantes de categorias distintas, sendo um Terra Rara e um nanocristal, nos quais apresentam picos de absorção próximos. Para a presente caracterização não linear, foi utilizada a técnica de Z-Scan, conhecido na literatura por sua simplicidade e precisão quando comparada com outras técnicas capazes de realizar a mesma medida. Medidas de absorção ótica e tempo de vida também foram feitas, pois fornecem parâmetros lineares para o cálculo das propriedades não lineares. Os resultados mostram que existe uma interação entre os dopantes, capaz de gerar uma variação nos parâmetros lineares e não lineares em estudo
Aspectos que influenciam na decis?o de compra virtual dos discentes do instituto federal da Para?ba Campus Guarabira-PB
Considerando o fato da Internet estar revolucionando o mercado atrav?s da tecnologia que permitiu o surgimento do Comercio Eletr?nico, esse trabalho tem como objetivo analisar os aspectos que influenciam os discentes do IFPB, Campus Guarabira, na realiza??o de compras. Para o alcance desse objetivo foi desenvolvida uma pesquisa quantitativa de car?ter descritivo utilizando como instrumento para coleta de dados um question?rio contendo 18 quest?es no total. As quest?es abordaram aspectos socioecon?micos dos respondentes, assim como itens que pudessem identificar os aspectos que influenciam nas suas decis?es de compras on-line. Os dados foram tabulados e analisados obtendo-se resultados que mostram que a maior parte dos discentes ? do sexo feminino, jovens e solteiros e que os aspectos que se destacam na decis?o de compras on-line s?o as opini?es de amigos, os coment?rios em redes sociais e o pre?o dos produtos e servi?os. Al?m disso, foi identificado que o meio de acesso mais utilizado para essas compras ? o telefone celular
Design of conformal cooling for plastic injection moulding by heat transfer simulation
Published ArticleThe cooling channels of a mold for plastic injection have to be as close as possible to the part geometry in order to
ensure fast and homogeneous cooling. However, conventional methods to manufacture cooling channels (drilling) can
only produce linear holes. Selective laser melting (SLM) is an additive manufacturing technique capable to manufacture
complex cooling channels (known as conformal cooling). Nevertheless, because of the high costs of SLM the benefits
of conformal collings are still not clear. The current work investigates two designs of conformal coolings: i) parallel
circuit; ii) serial circuit. Both coolings are evaluated against to traditional cooling circuits (linear channels) by CAE
simulation to produce parts of polypropylene. The results show that if the conformal cooling is not properly designed
it cannot provide reasonable results. The deformation of the product can be reduced significantly after injection but the
cycle time reduced not more than 6%
Instrumentação eletrônica em muleta canadense : monitoramento dinâmico de força e atitude
Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Faculdade UnB Gama (FGA), Engenharia Eletrônica, 2018.No cotidiano humano se insere lesões patológicas ou de dano físico, neste contexto pacientes com lesões em membros inferiores passam pelo uso da tecnologia assistiva, dentre ela, podemos citar o uso da muleta canadense, para reabilitação ou minimização dos efeitos oriundos de debilidades físicas. Ainda que adaptada, o uso por tempo prolongado e de forma incorreta geram danos devido a cargas excessivas aos membros superiores dos usuários. Estas consequências são, geralmente, mensuradas de forma visual e qualitativa pelos profissionais da área de saúde. O trabalho aqui apresentado tem por finalidade fornecer dados quantitativos relacionado ao uso de muletas do tipo canadense, estes dados serão a força aplicada no apoio de braço à superfície de contato, ângulo da muleta em relação a seu eixo de origem. Para aquisição destes dados foram usados sensores modulares de magnômetro, giroscópico e acelerômetro, todos em uma plataforma de circuito impresso com o microcontrolador ATmega328, viabilizando o baixo custo de projeto. Os resultados apresentados neste trabalho são: a variação dinâmica de força na ordem de 0kg f à aproximadamente 50kg f foi mensurada pelo sensor FSR indicando a convergência dos dados com o referencial teórico, outra contribuição inovadora deste trabalho se dar pelo geoposicionamento da muleta no espaço durante o deambular do usuário, indicado pelos ângulos de Euler. Por fim, o sistema a ser implementado tem por finalidade a pesquisa de forma exploratória do uso da muleta do tipo canadense referente a resposta durante a marcha e consequente armazenamento do dados de demabular do usuário, proporcionando de forma geral o mapeamento desta.In the human daily routine, pathological lesions or physical damage are included. In this context, patients with lesions on the lower limbs pass through the use of assistive technology. Among them, we can mention the use of the Canadian crutch for rehabilitation or minimization of the effects of physical weaknesses. Although adapted, the use for prolonged time and of incorrect form generate damages due to excessive loads to the superior members of the users. These consequences are usually measured visually and qualitatively by health professionals. The purpose of the present study is to provide quantitative data related to the use of Canadian type crutches. These data will be the force applied to the cradle to the contact surface, angle of the crutch relative to its axis of origin. For the acquisition of this data were used magnetometer, gyroscopic and accelerometer modular sensors, all in a printed circuit platform with the microcontroller ATmega328, allowing the low design cost. The results presented in this work are: the dynamic variation of force in the order of 0kg f to approximately 50kg f was measured by the FSR sensor indicating the convergence of the data with the theoretical reference, another innovative contribution of this work is given by the gearing of the crutch in the space during the user’s wandering, indicated by Euler’s angles. Finally, the system to be implemented has the purpose of exploratory exploration of the use of the Canadian type crutch in response to walking and consequent storage of the user’s deambular data, generally providing the mapping of the user
O GÊNERO EMBLEMÁTICO
In this article we will present the emblematic genre, creation of the Italian AndreaAlciati in 16th century (1531) that dominates the European society until the 18th, but disappearsin 19th century. We will also show the difficulty and the possibility of reading today, in21th century, texts, images and emblems of 17th century without having all the referential of thatmoment.Neste artigo apresentaremos o gênero emblemático, criação do italiano AndreaAlciati no século XVI (1531), que domina a sociedade europeia até o século XVIII, masdesaparece no século XIX. Mostraremos também a dificuldade e a possibilidade de ler hoje, noséculo XXI, textos, imagens e emblemas do século XVII sem se possuir todo o referencialdaquele momento
Fontes imagéticas na poética de Andreas Gryphius
Pretendemos refletir sobre a utilização de elementos imagéticos e suas fontes na Alemanha do século XVII e demonstrar que a literatura barroca não deve ser entendida como uma poética de experiências pessoais no sentido contemporâneo. Andreas Gryphius, como os artistas inseridos no contexto social do barroco alemão, estava imerso num mar de imagense tópicas, fazendo largo emprego dessas em seu trabalho poético. Para isso, utilizou como fonte de inspiração não só os auctoritas e os livros de emblemas que circulavam na Europa no século XVII, como também a Bíblia, já que o período também estava impregnado do elemento sacro
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