Informe final del proyecto: Diseño racional de vectores para la implementación de Pseudomonas y Arthrobacter psicrófilas en la construcción de bibliotecas metagenómicas funcionales especialmente diseñadas para la identificación de enzimas psicrófilas

La metagenómica funcional es una técnica que permiten acceder a la información genética de una comunidad sin la necesidad de cultivar en el laboratorio cada una de las bacterias que la componen. Se basa en la obtención de la información genética de la comunidad (ADN metagenómico), el cual se introduce en una bacteria de laboratorio (hospedero). El hospedero por excelencia es Escherichia coli, quien debe reconocer e interpretar correctamente el fragmento de ADN metagenómico introducido, y así adquirir nuevas capacidades (ej., actividades enzimáticas). Uno de los grandes sesgos de la técnica es que E. coli no siempre es capaz de reconocer e interpretar el ADN introducido, y por lo tanto no es capaz de producir nuevas enzimas de interés. Para sortear este problema se está avanzando en el uso de hospederos distintos a E. coli. Para poder introducir fragmentos de ADN en una bacteria, debemos tener las herramientas moleculares necesarias que nos permitan trabajar con esa bacteria. En este proyecto nos propusimos diseñar algunas de estas herramientas para poder usar como hospederos alternativos a Pseudomonas y Arthrobacter aisladas de la Antártida. Estas bacterias tienen la particularidad de crecer a bajas temperaturas (bacterias psicrófilas). ¿Por qué bacterias psicrófilas? Porque nos interesa buscar actividades enzimáticas que puedan funcionar a bajas temperaturas (enzimas psicrófilas). Las enzimas psicrófilas pueden trabajar a temperatura ambiente, siendo muy codiciadas en algunos procesos biotecnológicos. ¿Por qué? Porque realizar un proceso a temperatura ambiente es más económico porque no se precisa energía para calentar los reactores. Nuestra hipótesis de trabajo es que al usar hospederos psicrófilos en una aproximación de metagenómica funcional aumentaremos la probabilidad de identificar enzimas psicrófilas de interés biotecnológico.Agencia Nacional de Investigación e Innovació

Metabolic Syndrome as a Cardiovascular Disease Risk Factor: Patients Evaluated in Primary Care

To estimate the prevalence of metabolic syndrome (MS) in a population receiving attention in primary care centers (PCC) we selected a random cohort of ostensibly normal subjects from the registers of 5 basic-health area (BHA) PCC. Diagnosis of MS was with the WHO, NCEP and IDF criteria. Variables recorded were: socio-demographic data, CVD risk factors including lipids, obesity, diabetes, blood pressure and smoking habit and a glucose tolerance test outcome. Of the 720 individuals selected (age 60.3 ± 11.5 years), 431 were female, 352 hypertensive, 142 diabetic, 233 pre-diabetic, 285 obese, 209 dyslipemic and 106 smokers. CVD risk according to the Framingham and REGICOR calculation was 13.8 ± 10% and 8.8 ± 9.8%, respectively. Using the WHO, NCEP and IDF criteria, MS was diagnosed in 166, 210 and 252 subjects, respectively and the relative risk of CVD complications in MS subjects was 2.56. Logistic regression analysis indicated that the MS components (WHO set), the MS components (IDF set) and the female gender had an increased odds ratio for CVD of 3.48 (95CI%: 2.26–5.37), 2.28 (95%CI: 1.84–4.90) and 2.26 (95%CI: 1.48–3.47), respectively. We conclude that MS and concomitant CVD risk is high in ostensibly normal population attending primary care clinics, and this would necessarily impinge on resource allocation in primary care

Treatment with tocilizumab or corticosteroids for COVID-19 patients with hyperinflammatory state: a multicentre cohort study (SAM-COVID-19)

Objectives: The objective of this study was to estimate the association between tocilizumab or corticosteroids and the risk of intubation or death in patients with coronavirus disease 19 (COVID-19) with a hyperinflammatory state according to clinical and laboratory parameters. Methods: A cohort study was performed in 60 Spanish hospitals including 778 patients with COVID-19 and clinical and laboratory data indicative of a hyperinflammatory state. Treatment was mainly with tocilizumab, an intermediate-high dose of corticosteroids (IHDC), a pulse dose of corticosteroids (PDC), combination therapy, or no treatment. Primary outcome was intubation or death; follow-up was 21 days. Propensity score-adjusted estimations using Cox regression (logistic regression if needed) were calculated. Propensity scores were used as confounders, matching variables and for the inverse probability of treatment weights (IPTWs). Results: In all, 88, 117, 78 and 151 patients treated with tocilizumab, IHDC, PDC, and combination therapy, respectively, were compared with 344 untreated patients. The primary endpoint occurred in 10 (11.4%), 27 (23.1%), 12 (15.4%), 40 (25.6%) and 69 (21.1%), respectively. The IPTW-based hazard ratios (odds ratio for combination therapy) for the primary endpoint were 0.32 (95%CI 0.22-0.47; p < 0.001) for tocilizumab, 0.82 (0.71-1.30; p 0.82) for IHDC, 0.61 (0.43-0.86; p 0.006) for PDC, and 1.17 (0.86-1.58; p 0.30) for combination therapy. Other applications of the propensity score provided similar results, but were not significant for PDC. Tocilizumab was also associated with lower hazard of death alone in IPTW analysis (0.07; 0.02-0.17; p < 0.001). Conclusions: Tocilizumab might be useful in COVID-19 patients with a hyperinflammatory state and should be prioritized for randomized trials in this situatio

Informe final del proyecto: Diseño racional de vectores para la implementación de Pseudomonas y Arthrobacter psicrófilas en la construcción de bibliotecas metagenómicas funcionales especialmente diseñadas para la identificación de enzimas psicrófilas

La metagenómica funcional es una técnica que permiten acceder a la información genética de una comunidad sin la necesidad de cultivar en el laboratorio cada una de las bacterias que la componen. Se basa en la obtención de la información genética de la comunidad (ADN metagenómico), el cual se introduce en una bacteria de laboratorio (hospedero). El hospedero por excelencia es Escherichia coli, quien debe reconocer e interpretar correctamente el fragmento de ADN metagenómico introducido, y así adquirir nuevas capacidades (ej., actividades enzimáticas). Uno de los grandes sesgos de la técnica es que E. coli no siempre es capaz de reconocer e interpretar el ADN introducido, y por lo tanto no es capaz de producir nuevas enzimas de interés. Para sortear este problema se está avanzando en el uso de hospederos distintos a E. coli. Para poder introducir fragmentos de ADN en una bacteria, debemos tener las herramientas moleculares necesarias que nos permitan trabajar con esa bacteria. En este proyecto nos propusimos diseñar algunas de estas herramientas para poder usar como hospederos alternativos a Pseudomonas y Arthrobacter aisladas de la Antártida. Estas bacterias tienen la particularidad de crecer a bajas temperaturas (bacterias psicrófilas). ¿Por qué bacterias psicrófilas? Porque nos interesa buscar actividades enzimáticas que puedan funcionar a bajas temperaturas (enzimas psicrófilas). Las enzimas psicrófilas pueden trabajar a temperatura ambiente, siendo muy codiciadas en algunos procesos biotecnológicos. ¿Por qué? Porque realizar un proceso a temperatura ambiente es más económico porque no se precisa energía para calentar los reactores. Nuestra hipótesis de trabajo es que al usar hospederos psicrófilos en una aproximación de metagenómica funcional aumentaremos la probabilidad de identificar enzimas psicrófilas de interés biotecnológico.Agencia Nacional de Investigación e Innovació