Dissection of Host Cell Signal Transduction during Acinetobacter baumannii – Triggered Inflammatory Response

Infected airway epithelial cells up-regulate the expression of chemokines, chiefly IL-8, and antimicrobial molecules including β-defensins (BD). Acinetobacter baumannii is a cause of hospital-acquired pneumonia. We examined whether A. baumannii induced the expressions of IL-8 and BD2 by airway epithelial cells and the receptors implicated in bacterial detection. A549 and human primary airway cells released IL-8 upon infection. A. baumannii-infected cells also increased the expression of BD2 which killed A. baummannii strains. IL-8 induction was via NF-κB and mitogen-activated kinases p38 and p44/42-dependent pathways. A. baumannii engaged Toll-like receptor (TLR) 2 and TLR4 pathways and A549 cells could use soluble CD14 as TLRs co-receptor. A. baumannii lipopolysaccharide stimulated IL-8 release by A549 cells and sCD14 facilitated the recognition of the lipopolysaccharide. Mass spectrometry analysis revealed that A. baumannii lipid A structure matches those with endotoxic potential. These results demonstrate that airway epithelial cells produce mediators important for A. baumannii clearance

The Birthday

17 p., 6 figures and referencesNontypable Haemophilus influenzae (NTHi) is a Gram-negative, non-capsulated human bacterial pathogen, a major cause of a repertoire of respiratory infections, and intimately associated with persistent lung bacterial colonization in patients suffering from chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Despite its medical relevance, relatively little is known about its mechanisms of pathogenicity. In this study, we found that NTHi invades the airway epithelium by a distinct mechanism, requiring microtubule assembly, lipid rafts integrity, and activation of phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) signalling. We found that the majority of intracellular bacteria are located inside an acidic subcellular compartment, in a metabolically active and non-proliferative state. This NTHi-containing vacuole (NTHi-CV) is endowed with late endosome features, co-localizing with LysoTracker, lamp-1, lamp-2, CD63 and Rab7. The NTHi-CV does not acquire Golgi- or autophagy-related markers. These observations were extended to immortalized and primary human airway epithelial cells. By using NTHi clinical isolates expressing different amounts of phosphocholine (PCho), a major modification of NTHi lipooligosaccharide, on their surfaces, and an isogenic lic1BC mutant strain lacking PCho, we showed that PCho is not responsible for NTHi intracellular location. In sum, this study indicates that NTHi can survive inside airway epithelial cells.This work has been funded by grants from Instituto de Salud Carlos III (CP05-00027, PI06/1251, PI09/0130) and Fundación Mutua Madrileña to J.G. CIBERES is an initiative from Instituto de Salud Carlos III, Spain.Peer reviewe

Diverse mutations and structural variations contribute to Notch signaling deregulation in paediatric T-cell lymphoblastic lymphoma

Background T-cell lymphoblastic lymphoma (T-LBL) is an aggressive neoplasm closely related to T-cell acute lymphoblastic leukaemia (T-ALL). Despite their similarities, and contrary to T-ALL, studies on paediatric T-LBL are scarce and, therefore, its molecular landscape has not yet been fully elucidated. Thus, the aims of this study were to characterize the genetic and molecular heterogeneity of paediatric T-LBL and to evaluate novel molecular markers differentiating this entity from T-ALL. Procedure Thirty-three paediatric T-LBL patients were analyzed using an integrated approach, including targeted next-generation sequencing, RNA-sequencing transcriptome analysis and copy-number arrays. Results Copy number and mutational analyses allowed the detection of recurrent homozygous deletions of 9p/CDKN2A (78%), trisomy 20 (19%) and gains of 17q24-q25 (16%), as well as frequent mutations of NOTCH1 (62%), followed by the BCL11B (23%), WT1 (19%) and FBXW7, PHF6 and RPL10 genes (15%, respectively). This genetic profile did not differ from that described in T-ALL in terms of mutation incidence and global genomic complexity level, but unveiled virtually exclusive 17q25 gains and trisomy 20 in T-LBL. Additionally, we identified novel gene fusions in paediatric T-LBL, including NOTCH1-IKZF2, RNGTT-SNAP91 and DDX3X-MLLT10, the last being the only one previously described in T-ALL. Moreover, clinical correlations highlighted the presence of Notch pathway alterations as a factor related to favourable outcome. Conclusions In summary, the genomic landscape of paediatric T-LBL is similar to that observed in T-ALL, and Notch signaling pathway deregulation remains the cornerstone in its pathogenesis, including not only mutations but fusion genes targeting NOTCH1.We thank the centres of the Sociedad Espanola de Hematologia y Oncologia Pediatricas that submitted cases for consultation, to Noelia Garcia, Silvia Martin and Helena Suarez for their excellent technical assistance and to Nerea Dominguez for updating clinical data. We are indebted to the IDIBAPS Genomics Core Facility and to the HCB-IDIBAPS, the HospitaI Infantil Sant Joan de Deu and the Hospital Universitari Vall d'Hebron Tumour Biobanks, all integrated in the National Network Biobanks of ISCIII for the sample and data procurement. This work was supported by Asociacion Espanola Contra el Cancer (AECC CICPFI6025SALA and 'Ayudas Clinico Formacion AECC 2020' to Jaime Verdu-Amoros), Asociacion de aitas y amas para la humanizacion, socializacion e investigacion del Cancer Infantil y la divulgacion de la donacion de medula osea-La Cuadri del Hospi, Fondo de Investigaciones Sanitarias Instituto de Salud Carlos III (Miguel Servet Program I and II CP13/00159 and MSII18/00015; Itziar Salaverria), Generalitat de Catalunya Suport Grups de Recerca (2017-SGR-1107; Itziar Salaverria), and the European Regional Development Fund 'Una manera de fer Europa'. Joan Enric Ramis-Zaldivar was supported by a fellowship AGAUR FI-DGR 2017 (2017 FI_B01004) from Generalitat de Catalunya. Noelia Garcia has been continuously supported by Accio instrumental d'incorporacio de cientifics i tecnlegs PERIS 2016 (SLT002/16/00336) and PERIS 2020 (SL017/20/000204) from Generalitat de Catalunya. Julia Salmeron-Villalobos was supported by a fellowship from La Caixa (CLLEvolution-HR17-00221). This work was developed partially at the Centro Esther Koplowitz, Barcelona, Spain

Apoptosis, toll-like, RIG-I-like and NOD-like receptors are pathways jointly induced by diverse respiratory bacterial and viral pathogens

Lower respiratory tract infections are among the top five leading causes of human death. Fighting these infections is therefore a world health priority. Searching for induced alterations in host gene expression shared by several relevant respiratory pathogens represents an alternative to identify new targets for wide-range host-oriented therapeutics. With this aim, alveolar macrophages were independently infected with three unrelated bacterial (Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae, and Staphylococcus aureus) and two dissimilar viral (respiratory syncytial virus and influenza A virus) respiratory pathogens, all of them highly relevant for human health. Cells were also activated with bacterial lipopolysaccharide (LPS) as a prototypical pathogen-associated molecular pattern. Patterns of differentially expressed cellular genes shared by the indicated pathogens were searched by microarray analysis. Most of the commonly up-regulated host genes were related to the innate immune response and/or apoptosis, with Toll-like, RIG-I-like and NOD-like receptors among the top 10 signaling pathways with over-expressed genes. These results identify new potential broad-spectrum targets to fight the important human infections caused by the bacteria and viruses studied here.The authors gratefully acknowledge financial support from the “CIBER de Enfermedades Respiratorias” (CIBERES), an initiative of the “Instituto de Salud Carlos III” (ISCIII), Spain. Research activities in the participating laboratories received further funding from the following sources: Centro Nacional de Microbiología, ISCIII, PI15CIII/00024 and MINECO (SAF2015- 67033-R); Centro Nacional de Biotecnología, MINECO (BFU2014-57797-R); Hospital Universitari Germans Trias I Pujol, Spanish Society of Pneumology and Thoracic Surgery (SEPAR 054/2011); Departamento de Bioquímica y Biología Molecular I, MINECO (SAF2015-65307-R); Centro de Investigaciones Biológicas, MINECO (SAF2012-39444-C01/02); Fundación de Investigación Sanitaria de las Islas Baleares, MINECO (SAF2012-39841); Instituto de Agrobiotecnología, MINECO (SAF2015-66520-R); Instituto de Química Física Rocasolano, MINECO (BFU2015-70052-R) and the Marie Curie Initial Training Network GLYCOPHARM (PITN-GA- 2012-317297). Subprograma Estatal de Formación (BES-2013- 065355)

Threats on conservation associated to land-use in the terrestrial ecoregions of Argentina

Por su continuidad espacial y su relativa homogeneidad ecológica y biofísica, las ecorregiones son un nivel de organización apropiado para discutir y planificar iniciativas de conservación del ambiente a escala regional y nacional. Las interacciones complejas entre las características ecológicas de las ecorregiones, los cambios socioeconómicos locales y globales, y los cambios en el uso de la tierra ocasionan que las amenazas y la oportunidades para conservar dentro y entre ecorregiones se distribuyan de manera heterogénea. En este artículo realizamos un diagnóstico actualizado de las presiones de conservación asociadas al uso de la tierra en las distintas ecorregiones terrestres de la Argentina. Entendemos por presiones a las actividades antrópicas que modifican el estado de los recursos naturales e impactan sobre su funcionamiento. Luego de identificar las principales presiones por ecorregión realizamos un análisis de agrupamiento para identificar grupos de ecorregiones en función de la similitud de sus presiones. La ganadería comercial y la agricultura estuvieron dentro de las principales presiones asociadas al uso de la tierra en ocho y siete de las ecorregiones terrestres de la Argentina, respectivamente. Otras presiones de incidencia más específicas fueron muy relevantes en algunas ecorregiones, en especial en aquellas con limitantes para las actividades agropecuarias orientadas a los mercados globales. Identificamos cuatro grupos en función de la incidencia de las presiones asociadas al uso de la tierra: 1) Monte, Puna y Altos Andes; 2) Bosques Patagónicos; 3) Selva Paranaense y Selva de las Yungas, y 4) Campos y Malezales, Chaco Húmedo, Chaco Seco, Delta e Islas del Paraná, Espinal, Esteros del Iberá, Estepa Patagónica y Pampa. Este agrupamiento por presiones comunes de ecorregiones distantes en el espacio contribuiría a organizar geográficamente políticas de gestión de los recursos naturales integradas a nivel regional.Ecoregions are a suitable organization level for the discussion and planning of conservation initiatives at a regional level, due to their spatial continuity and ecological and biophysical homogeneity. The complex interactions between ecological characteristics of ecoregions, local and global socioeconomic changes and land-use change determine that threats and opportunities for conservation within and among ecoregions are unequally distributed. In this article, we performed an updated diagnosis of the main conservation issues associated with land-use change in the terrestrial ecoregions of Argentina. Also, in each ecoregion we identified the main conservation threats derived from land-use change (defined as the anthropic activities that modify the state of natural resources, impacting on their functioning) and organized ecoregions in groups according to their similarity in the incidence of the respective threats, through a cluster analysis. Commercial livestock production and agriculture were among the main threats associated with land-use change in eight and seven terrestrial ecoregions of Argentina, respectively. Other more local threats were also relevant in certain ecoregions, especially for those that are unsuitable for intensive land-uses. We identified four groups according to the incidence of the threats: 1) Monte, Puna and Altos Andes; 2) Bosques Patagónicos; 3) Selva Paranaense and Selva de las Yungas, and 4) Campos y Malezales, Chaco Húmedo, Chaco Seco, Delta e Islas del Paraná, Espinal, Esteros del Iberá, Estepa Patagónica and Pampa. Such grouping of distant ecoregions by common threats would contribute to spatially organize integrated natural resource management policies that go beyond administrative boundaries.Fil: Nanni, Ana Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Instituto de Ecología Regional; ArgentinaFil: Piquer Rodríguez, María. Freie Universität Berlin; AlemaniaFil: Rodriguez, Maria Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas; ArgentinaFil: Núñez Regueiro, Mauricio Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Bio y Geociencias del NOA. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Museo de Ciencias Naturales. Instituto de Bio y Geociencias del NOA; ArgentinaFil: Periago, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas; ArgentinaFil: Aguiar, Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; ArgentinaFil: Ballari, Sebastián A.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentina. Administración de Parques Nacionales. Parque Nacional "Nahuel Huapi"; ArgentinaFil: Blundo, Cecilia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Laboratorio de Investigaciones Ecológicas de las Yungas; ArgentinaFil: Derlindati, Enrique Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Bio y Geociencias del NOA. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Museo de Ciencias Naturales. Instituto de Bio y Geociencias del NOA; ArgentinaFil: Di Blanco, Yamil Edgardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina. Centro de Investigaciones del Bosque Atlántico; ArgentinaFil: Eljall, Ana. Fundación Vida Silvestre; ArgentinaFil: Grau, Hector Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Instituto de Ecología Regional; ArgentinaFil: Herrera, Lorena Paola. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Huertas Herrera, Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; ArgentinaFil: Izquierdo, Andrea Elisa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Instituto de Ecología Regional; ArgentinaFil: Lescano, Julián Norberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Diversidad y Ecología Animal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto de Diversidad y Ecología Animal; ArgentinaFil: Macchi, Leandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Instituto de Ecología Regional; ArgentinaFil: Mazzini, Flavia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Jujuy; ArgentinaFil: Milkovic, Mayra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Bio y Geociencias del NOA. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Museo de Ciencias Naturales. Instituto de Bio y Geociencias del NOA; ArgentinaFil: Montti, Lia Fernanda. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Instituto de Ecología Regional; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina. Centro de Investigaciones del Bosque Atlántico; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Geología de Costas y del Cuaternario. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto de Geología de Costas y del Cuaternario; ArgentinaFil: Paviolo, Agustin Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; ArgentinaFil: Pereyra, Mariana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Quintana, Ruben Dario. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigación e Ingeniería Ambiental. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación e Ingeniería Ambiental; ArgentinaFil: Quiroga, Verónica Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Diversidad y Ecología Animal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto de Diversidad y Ecología Animal; Argentina. Centro de Investigaciones del Bosque Atlántico; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; ArgentinaFil: Renison, Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas; ArgentinaFil: Beade Santos, Mario. Administración de Parques Nacionales; ArgentinaFil: Schaaf, Alejandro Alberto. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; ArgentinaFil: Gasparri, Nestor Ignacio. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Ecología Regional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Ecología Regional; Argentin

Role of age and comorbidities in mortality of patients with infective endocarditis

[Purpose]: The aim of this study was to analyse the characteristics of patients with IE in three groups of age and to assess the ability of age and the Charlson Comorbidity Index (CCI) to predict mortality. [Methods]: Prospective cohort study of all patients with IE included in the GAMES Spanish database between 2008 and 2015.Patients were stratified into three age groups:<65 years,65 to 80 years,and ≥ 80 years.The area under the receiver-operating characteristic (AUROC) curve was calculated to quantify the diagnostic accuracy of the CCI to predict mortality risk. [Results]: A total of 3120 patients with IE (1327 < 65 years;1291 65-80 years;502 ≥ 80 years) were enrolled.Fever and heart failure were the most common presentations of IE, with no differences among age groups.Patients ≥80 years who underwent surgery were significantly lower compared with other age groups (14.3%,65 years; 20.5%,65-79 years; 31.3%,≥80 years). In-hospital mortality was lower in the <65-year group (20.3%,<65 years;30.1%,65-79 years;34.7%,≥80 years;p < 0.001) as well as 1-year mortality (3.2%, <65 years; 5.5%, 65-80 years;7.6%,≥80 years; p = 0.003).Independent predictors of mortality were age ≥ 80 years (hazard ratio [HR]:2.78;95% confidence interval [CI]:2.32–3.34), CCI ≥ 3 (HR:1.62; 95% CI:1.39–1.88),and non-performed surgery (HR:1.64;95% CI:11.16–1.58).When the three age groups were compared,the AUROC curve for CCI was significantly larger for patients aged <65 years(p < 0.001) for both in-hospital and 1-year mortality. [Conclusion]: There were no differences in the clinical presentation of IE between the groups. Age ≥ 80 years, high comorbidity (measured by CCI),and non-performance of surgery were independent predictors of mortality in patients with IE.CCI could help to identify those patients with IE and surgical indication who present a lower risk of in-hospital and 1-year mortality after surgery, especially in the <65-year group

Papel del sistema inmune innato en el control de las neumonías causadas por Klebsiella pneumoniae

[spa] La activación de una respuesta inmune adecuada es importante para controlar la carga bacteriana, y por tanto, la infección en las neumonías causadas por Klebsiella pneumoniae. Los elementos claves de esta respuesta inmune parecen ser la secreción citoquinas y quimioquinas inflamatorias al parénquima pulmonar junto con el reclutamiento de neutrófilos. Por otro lado, numerosos trabajos apuntan la importancia del polisacárido capsular (CPS) para evitar la fagocitosis de K. pneumonaie por neutrófilos, macrófagos y células epiteliales. Por tanto, es razonable plantear que el CPS también puede modular la activación de respuestas inmunes. De hecho, los resultados de Lawlor y colaboradores (Infect. Inmun. 2006) sugieren que el CPS pudiera suprimir la activación de una respuesta inflamatoria. En este trabajo nos planteamos estudiar los mecanismos moleculares implicados en la interacción que se produce entre K. pneumoniae y el sistema inmune innato