Vine microbiome: a deep analysis of the natural microbial community of Vitis vinifera L.

Doutoramento em BiologiaA vinha, Vitis vinifera L., abriga naturalmente um ecossistema microbiano complexo ou microbioma, tais como microrganismos neutros, fitopatogenos ou benéficos. Entre os fitopatogenos, aqueles implicados nas doenças do lenho da videira (GTDs) são responsáveis pelas doenças mais destrutivas, para o qual não existem tratamentos altamente eficazes. Por outro lado, os microrganismos benéficos (BCAs) podem desempenhar papéis específicos na proteção das plantas contra estes agentes. Neste sentido, o atual desafio consiste em compreender como estes BCAs interagem com a planta e qual o seu potencial biotecnológico para o desenvolvimento de novas estratégias de proteção da planta. Neste contexto, o objetivo deste estudo visou primeiramente analisar profundamente as comunidades microbianas associadas com a videira ao longo do seu ciclo de crescimento até à fermentação do vinho e, em seguida, compreender as interações entre vinha-BCAs-GTDs. Para isso, dois potenciais BCAs isolados da videira foram testados contra diferentes espécies de Botryosphaeriaceae e, em seguida, caracterizados relativamente ao seu potencial de colonização, de indução dos mecanismos de defesa da planta, na presença ou não do fitopatogeno (D. seriata F98.1), e análise do respetivo genoma. Os resultados demonstraram que o microbioma da videira é altamente dinâmico ao longo do ciclo de crescimento da planta. Como esperado, a biodiversidade microbiana é maior nos solos, e estas comunidades diferem significativamente daquelas presentes nas folhas e mostos vínicos. Contudo, alguns destes microrganismos são partilhados, o que sugere a existência de um microbioma comum. Diferentes isolados foram obtidos, pertencendo na sua maioria ao género Bacillus, Streptomyces e Aureobasidium. A videira é naturalmente colonizada por microrganismos com potencial antagonista de várias espécies de Botryosphaeriaceae. Entre estes, destacam-se os isolados Streptomyces sp. Fito_S127B e A. pullulans Fito_F278, que foram selecionados como potenciais BCAs. Estes microrganismos produzem diferentes enzimas extracelulares importantes para as atividades de controlo biológico e são capazes de colonizar com sucesso a videira: Fito_S127B coloniza a rizosfera, enquanto que Fito_F278 coloniza desde as raízes até às folhas. A inoculação artificial da videira com D. seriata F98.1 mostrou que o comprimento das lesões necróticas causadas pelo fitopatogeno são significativamente reduzidas na presença de Fito_S127B. Em contrapartida, a espécie Fito_F278 foi menos eficaz. Estes BCAs ativaram algumas respostas de defesa específicas da videira, o que permitiu uma resposta mais rápida e sólida da planta contra o agente fitopatogénico. A análise do genoma destes microrganismos permitiu averiguar diferentes genes que codificam compostos bioativos altamente importantes para o controlo biológico. De uma forma geral, este estudo abrange novos conhecimentos relativos à estrutura das comunidades microbianas associadas à videira e às suas interações. Para além disso, destaca que a videira ostenta naturalmente microrganismos com um controlo biológico promissor e que estes podem promover respostas de defesa importantes na planta. Neste sentido, estes resultados permitem não só uma melhor compreensão das interações da videira-BCAs-GTDs, mas também representam um forte contributo e avanço para o desenvolvimento de novas estratégias da gestão da vinha, tais como as doenças do lenho.Vitis vinifera L. is a widely cultivated fruit crop, that naturally harbours a complex microbial ecosystem or plant microbiome, such as neutral, phytopathogenic or beneficial microorganisms. Among phytopathogens, those implied in Grapevine Trunk Diseases (GTDs) are responsible for the most destructive diseases worldwide, and currently no highly effective treatments are available. Beneficial microorganisms (BCAs) may play specific roles on plant protection against phytopathogens though, the present challenge is to understand how such BCAs interact with plant and their biotechnological potential for development of innovation strategies. In this context, the aim of this study was firstly to unveil the microbial communities associated with grapevine along its growth cycle until wine fermentation and, secondly, to better understand the grapevine – BCAs – GTDs interactions. Two potential BCAs isolated from grapevine were tested against Botryosphaeriaceae species and then deep characterized, namely for their colonisation potential, induction of defence mechanisms in grapevine, in the presence or not of D. seriata F98.1, and their genome analysis. Results showed that grapevine microbiome was very dynamic along the growth cycle. As expected, the microbial biodiversity was higher in soils, and these microbial communities differed significantly from those of leaves and wine musts. A proportion of microbial communities was shared within these structures, suggesting the existence of a core microbiome. Several isolates were then obtained from grapevine which mostly belonged to Bacillus, Streptomyces and Aureobasidium genera. Some of them significantly decreased in vitro the mycelium growth of several Botryosphaeriaceae species, such as Streptomyces sp. Fito_S127B and A. pullulans Fito_F278 which were highly effective and thus selected as potential BCAs. These strains showed to produce a high range of extracellular enzymes with biocontrol value, and were able to successfully colonize grapevine: Fito_S127B was an epiphyte from rhizosphere, while Fito_F278 colonised grapevine from roots to leaves. The artificial inoculation of green stems with D. seriata F98.1 on cutting plants showed that the necrotic lesions length caused by the pathogen was significantly reduced by Fito_S127B, in contrast to Fito_F278, which was less effective. Furthermore, these BCAs activated some specific defence responses of grapevine, allowing a more rapid and solid response of plant against the pathogen. The genome analysis also showed that these BCAs strains are an important source of bioactive compounds of biocontrol value. Overall, this study brought new insights on the structure of microbial communities of grapevine and their interactions. Moreover, highlighted that grapevine is a natural source of microorganisms with a promising biocontrol against GTDs, and that they can promote plant defence responses. Thus, these findings provide not only a better understand of the grapevine- BCAs- GTDs interactions but also a strong contribution to future GTDs management strategy

Caracterização da pele com estrias Albas, in vivo, com ultrassom de alta resolução e rlastografia supersonic shear imaging

The High resolution ultrasound (HRUS) and supersonic shear imaging (SSI) elastography are non-invasive, non-ionizing, and easy-to-use methods for analysis of the skin . However, researches are rare using the methods for the study of skin with dermal striae (DS). The study proposed the use of the USAR to identify in vivo dermal lesions (DL) due to the presence of DS and to measure the thicknesses of the skin without and with DS using 2D images and the use of SSI to measure and compare values of Young’s modulus (E) on the skin without and with DS. The work comprised two stages. In phase I, skin 2D images without and with DS of ten volunteers were used to measure and compare their thicknesses. In phase II, skin elastography images without and with DS of the eleven volunteers were used to obtain E values at 0 °, 45 °, 90 °and 315 ° to the skin tension lines (STL). DL caused for DS appeared in 2D images as poor echo areas. A statistically significant reduction in dermis thickness was found (value-p<0.05) in the presence of DS. The mean E values for LTPs were higher in normal skin at 45°(57,72±26,49 kPa) and 90°(55,40±12,04 kPa) and for DS were also at 45° (40,15±12,26 kPa) and 90° (38,33±14,36 kPa). HRUS and SSI have been shown to be promising techniques in the study of the skin with DS and for non-invasive evaluating therapeutic protocols for DS treatmentO Ultrassom de alta resolução (USAR) e a elastografia supersonic shear imaging (SSI) são técnicas não invasivas, não ionizantes e de fácil manuseio empregadas para estudo da pele. Porém, são raras as pesquisas usando os métodos para o estudo da pele com estrias dérmicas (ED). O estudo propôs a utilização do USAR para identificar, in vivo, lesões dérmicas (LD) devido a presença de ED e mensurar as espessuras das camadas sem e com estrias por meio de imagens 2D e da SSI para mensurar e comparar os valores do módulo de Young (E) na pele sem e com ED. Na fase I, imagens 2D da pele sem e com ED de dez voluntários foram usadas para medir e comparar as suas espessuras. Na fase II, elastogramas da pele sem e com ED de onze voluntários foram usados para obter valores de E à 0°, 45°, 90° e 315° às linhas de tensão da pele (LTP). LD apareceram em imagens 2D como áreas pobres de eco. Uma redução estatisticamente significativa na espessura da derme foi encontrada (valor-p <0,05) na presença de EDs. Os valores médios de E em relação à LTPs foram mais elevados na pele normal a 45°(57,72±26,49 kPa) e a 90°(55,40±12,04 kPa) e, com ED, foram também a 45° (40,15±12,26 kPa) e a 90° (38,33±14,36 kPa). O USAR e a SSI mostraram serem técnicas promissoras para o estudo da pele com ED e para avaliar de modo não invasivo protocolos terapêuticos para o tratamento de ED

Shame Memories and Depression Symptoms: The Role of Cognitive Fusion and Experiential Avoidance

Previous studies have suggested that shame memories can have a pervasive impact on depression symptoms, and avoidant-focused processes may play a mediating role. In addition, it is stated in Acceptance and Commitment Therapy (ACT) literature that experiential avoidance is a consequence of cognitive fusion. This study aims to explore the role of cognitive fusion and experiential avoidance in the relationship between shame memories (with caregivers and traumatic shame memories with others) and depression symptoms. In order to do that, we used Structural Equation Modeling to conduct a path analysis in a sample of 181 subjects of the general population. Our results add new information on the processes through which shame memories impacts on both experiential avoidance and depression symptoms. It is suggested that shame memories are not itself pervasive, but the entanglement with painful internal experiences (cognitive fusion) and/or the attempts to control them (experiential avoidance). This suggests the importance of planning an intervention that targets these processes when dealing with shame memories, particularly in patients with depression symptoms

Incidência de fitoplâncton tóxico na costa catarinense: impacto na saúde pública e no meio ambiente

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia AmbientalO processo de ocupação desordenada das áreas litorâneas e a exploração irracional dos recursos naturais resultaram em forte impacto sócio-ambiental, evidenciado pela degradação da qualidade ambiental dos ecossistemas marinhos. Um evento característico de ocorrer como conseqüência do desequilíbrio no ecossistema marinho, são as florações de microalgas produtoras de toxinas. As florações são comuns em locais de cultivo de moluscos e estes se tornam vetores de enfermidades que causam várias formas de intoxicações no homem, tornando-se um sério problema de saúde pública. Além disso, o excessivo crescimento de microalgas pode ocasionar uma absorção de nutrientes da água podendo causar a morte dos organismos aquáticos. Santa Catarina é responsável por 93% da produção de moluscos no contexto nacional. No entanto, pouco se sabe sobre microalgas produtoras de toxinas e seus efeitos tóxicos. Neste sentido, a verificação da ocorrência de microalgas tóxicas e de suas toxinas, bem como os testes de citotoxicidade e genotoxicidade propostos neste estudo, podem colaborar para melhor compreensão do fenômeno das florações de microalgas e elucidar alguns mecanismos de ação tóxica, que levam estas toxinas a alterar a fisiologia celular causando diversas patologias, em especial o câncer. As análises da ocorrência de fitoplâncton tóxico revelaram que Santa Catarina requer um abrangente programa de monitoramento, uma vez que várias espécies de microalgas tóxicas estão presentes em 17 dos 21 pontos amostrados. Os resultados dos parâmetros físico-químicos e biológicos estão de acordo com a legislação brasileira (Conama 357/2005) exceto para os índices de coliformes fecais (E. coli) e totais. Foi observado que os mexilhões Perna perna alimentados com Prorocentrum lima aumentaram a freqüência de micronúcleos e lesões nucleares em seus hemócitos. Os resultados dos testes de citotoxicidade e genotoxicidade mostraram que as toxinas ácido ocadáico e ácido domóico diminuem a viabilidade celular, causam danos nas membranas, alterações nos lisossomos, diminuição da atividade metabólica das mitocôndrias e induzem apoptose em células de adenocarcinoma de intestino grosso humano (Caco-2)

Reconhecimento emocional de faces no envelhecimento normal versus envelhecimento patológico

O presente trabalho tem como objectivo verificar a sensibilidade e especificidade da recentemente criada base de expressão emocional de faces (Gandra-BARTA), às alterações na capacidade de reconhecimento emocional de faces em função do envelhecimento normal versus patológico. Pretende-se também determinar a capacidade discriminativa da prova entre indivíduos cognitivamente incólumes e sujeitos com diagnóstico provável de doença de Alzheimer. A prova é constituída por 59 fotografias, onde são expressas 6 emoções básicas (alegria, tristeza, nojo, raiva, medo e surpresa) e neutras. Fizeram parte da amostra 43 participantes:17 do grupo de controlo (idades entre 60 e 82); e 26 do grupo clinico com diagnóstico provável de demência (idades entre 60 e 96). Os grupos não diferem entre si quanto ao género, idade e escolaridade. Os resultados obtidos no MoCA e na GDS diferem significativamente entre os grupos. Os sujeitos do grupo de demência são mais lentos a realizar a prova e apresentam menor número de acertos comparativamente ao grupo de controlo. Foram observados resultados significativamente inferiores na identificação das emoções raiva, nojo, alegria, surpresa e nas expressões sem carga emocional, por parte do grupo de demência. A base de faces revela uma sensibilidade de 100% e uma especificidade de 88,5%

Contributos da escrita criativa na fomentação da criatividade e no gosto pela escrita e leitura: Uma investigação-ação no 1º CEB

Dissertação de Mestrado em Educação Artística apresentada na Escola Superior de Educação do Instituto Politécnico de Viana do CasteloNuma sociedade global cada vez mais competitiva em que aos avanços tecnológicos se dão a um nível frenético, acredita-se que a escola, para alcançar os objetivos e metas educacionais a que se propõe, tenha que adaptar as metodologias de ensino aprendizagem tornando-as apelativas para as crianças. A leitura e a escrita são competências elementares a adquirir pelas crianças no ensino básico, assim como o desenvolvimento da criatividade é essencial para que as crianças desenvolvam uma consciência crítica e ativa das suas aprendizagens. Nesse contexto, promover o gosto pela leitura e escrita de uma forma criativa, apelando também ao desenvolvimento da criatividade das crianças, tornou-se o desejo inerente à construção deste estudo investigativo. A presente dissertação expõe um trabalho investigativo no âmbito da promoção da criatividade e do gosto pela leitura e escrita, construído nos moldes de uma oficina de escrita criativa - aplicando metodologias de estudo e práticas da poesia concreta e experimental - em contexto escolar, nomeadamente, em três turmas do 1º ciclo do ensino básico (2º, 3º e 4º anos de escolaridade), pertencentes ao Centro Escolar de Vila Cova. O tipo de metodologia utilizado foi a investigação-ação. A investigação neste campo recorre a diversos instrumentos de recolha de dados, privilegiando questionários e entrevistas. Verificou-se, através dos resultados obtidos, que a oficina de escrita implementada contribui para promover o desenvolvimento criativo das crianças em estudo, assim como o seu gosto pela leitura e escrita. Neste sentido, este estudo parece ser uma proposta válida, capaz de servir de exemplo de boas práticas de ensino fomentadoras da criatividade e promotoras da escrita e leitura nas crianças do ensino básico.In an increasingly competitive global society in which the technological advances occur at a frenetic level , it is believed that the school to achieve the educational goals and objectives that are proposed , has to adapt teaching methodologies learning making them appealing for children. Reading and writing are basic skills to be acquired by children in primary education, and the development of creativity is essential for children to develop a critical and active awareness of their learning. In this context, promote a love of reading and writing in a creative way, also calls for the development of creativity of children, became the desire inherent in the construction of this investigative study. This dissertation presents a investigative work in the context of promoting creativity and the love of reading and writing, built along the lines of a creative writing workshop - applying methodologies of study and practice of concrete and experimental poetry - in schools, in particular, three classes of the 1st cycle of basic education (2nd, 3rd and 4th years of schooling), belonging to the school Centre Vila Cova. The type of methodology used was research - action. Research in this field use of several instruments for data collection, focusing on questionnaires and interviews. It was verified by the results obtained, the writing workshop implemented contributes to promoting the creative development of children in the study, as well as their love of reading and writing. Thus, this study seems to be a valid proposal, able to serve as an example of good practice in teaching fomenting creativity and promoters of reading and writing in primary school children

Ferramentas de machine learning na gestão de doenças crónicas: uma scoping review

Background: the implementation of technologies based on Artificial Intelligence (AI) in the health sector, in particular machine learning (ML), has had a significant transformational effect. Their use improves disease prediction, classification and diagnosis, benefiting both users and healthcare professionals. Objective: to map ML tools for chronic disease management, with relevance to nursing care for people with chronic diseases. Methodology: scoping review based on the recommendations of the Joanna Briggs Institute. The MEDLINE Complete via PUBMED, CINAHL Complete via EBSCO, SCOPUS, OpenGrey, RCAAP and DART-Europe databases were used, with no time limit. Results: seven articles were included and 9 AI tools associated with chronic disease management were identified, namely chronic kidney disease, chronic obstructive pulmonary disease, hepatitis C, heart failure and chronic venous insufficiency. Conclusion: the tools identified have the potential to contribute to improving nursing care, particularly in identifying risk factors associated with chronic diseases, detecting exacerbations early, continuously monitoring and evaluating the effectiveness of treatment and supporting clinical decision-making.Marco contextual: La implantación de tecnologías basadas en Inteligencia Artificial (IA) en el sector sanitario, en particular el aprendizaje automático (AM), ha tenido un importante efecto transformador. Su uso mejora la predicción, clasificación y diagnóstico de enfermedades, beneficiando tanto a los usuarios como a los profesionales sanitarios. Objetivo: Mapear las herramientas de ML para la gestión de enfermedades crónicas, con relevancia para los cuidados de enfermería a personas con enfermedades crónicas. Metodología: Revisión de alcance basada en las recomendaciones del Instituto Joanna Briggs. Se utilizaron las bases de datos MEDLINE Complete vía PUBMED, CINAHL Complete vía EBSCO, SCOPUS, OpenGrey, RCAAP y DART-Europe, sin límite de tiempo. Resultados: Se incluyeron siete artículos y se identificaron 9 herramientas de IA asociadas a la gestión de enfermedades crónicas, a saber, la enfermedad renal crónica, la enfermedad pulmonar obstructiva crónica, la hepatitis C, la insuficiencia cardiaca y la insuficiencia venosa crónica. Conclusión: Las herramientas identificadas tienen potencial para contribuir a la mejora de los cuidados de enfermería, especialmente en la identificación de factores de riesgo asociados a enfermedades crónicas, la detección precoz de exacerbaciones, el seguimiento continuo y la evaluación de la eficacia del tratamiento y el apoyo a la toma de decisiones clínicas.Enquadramento: a implementação de tecnologias baseadas em Inteligência Artificial (IA) na área da saúde, nomeadamente o machine learning (ML), tem causado um efeito transformacional significativo. A sua utilização melhora a previsão de doenças, classificação e diagnóstico, beneficiando os utentes e os profissionais de saúde. Objetivo: mapear as ferramentas de ML para a gestão de doenças crónicas, com relevância para os cuidados de enfermagem à pessoa com doença crónica. Metodologia: scoping review com base nas recomendações do Instituto Joanna Briggs. A pesquisa foi efetuada nas bases de dados MEDLINE Complete via PUBMED, CINAHL Complete via EBSCO, SCOPUS, OpenGrey, RCAAP e DART-Europe, sem limite de temporal. Resultados: foram incluídos sete artigos e identificadas 9 ferramentas de ML associados à gestão de doenças crónicas nomeadamente doença renal crónica, doença pulmonar obstrutiva crónica, hepatite C, insuficiência cardíaca e insuficiência venosa crónica. Conclusão: as ferramentas identificadas têm potencial de contribuir para a melhoria dos cuidados de enfermagem, nomeadamente na identificação de fatores de risco associados a doenças crónicas, detetar precocemente exacerbações, monitorizar e avaliar continuamente a eficácia do tratamento e apoiar a tomada de decisões clínicas

Enhance access to pulmonary rehabilitation with a structured and personalized home-based program—reabilitAR: protocol for real-world setting

© 2021 by the authors. Licensee MDPI, Basel, Switzerland. This article is an open access article distributed under the terms and conditions of the Creative Commons Attribution (CC BY) license (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).Home-based models represent one of the solutions to respond to the poor accessibility of pulmonary rehabilitation (PR) services in patients with chronic respiratory disease (CRD). The main goal of this protocol is to present the implementation of the first nationwide home-based PR program—reabilitAR—in Portugal and the strategies to assess its benefits in patients with CRD. The program consists of 2 phases: a 12-week intensive phase and a 40-week maintenance phase (total: 52 weeks, 1 year). The intervention in both phases is composed of presential home visits and phone-call follow ups, including exercise training and the self-management educational program Living Well with COPD. Dyspnea, impact of the disease, emotional status, and level of dyspnea during activities of daily living are used as patient-reported outcomes measures. A one-minute sit-to-stand test is used as a functional outcome, and the number of steps as a measure of physical activity. To ensure safety, fall risk and the cognitive function are assessed. Data are collected at baseline, at 12 weeks, at 26 weeks and at 52 weeks. This is the first nationwide protocol on enhancing access to PR, providing appropriate responses to CRD patients’ needs through a structured and personalized home-based program in Portugal.info:eu-repo/semantics/publishedVersio