Community ecology and functional potential of bacteria, archaea, eukarya and viruses in Guerrero Negro microbial mat

In this study, the microbial ecology, potential environmental adaptive mechanisms, and the potential evolutionary interlinking of genes between bacterial, archaeal and viral lineages in Guerrero Negro (GN) microbial mat were investigated using metagenomic sequencing across a vertical transect at millimeter scale. The community composition based on unique genes comprised bacteria (98.01%), archaea (1.81%), eukarya (0.07%) and viruses (0.11%). A gene-focused analysis of bacteria archaea, eukarya and viruses showed a vertical partition of the community. The greatest coverages of genes of bacteria and eukarya were detected in first layers, while the highest coverages of genes of archaea and viruses were found in deeper layers. Many genes potentially related to adaptation to the local environment were detected, such as UV radiation, multidrug resistance, oxidative stress, heavy metals, salinity and desiccation. Those genes were found in bacterial, archaeal and viral lineages with 6477, 44, and 1 genes, respectively. The evolutionary histories of those genes were studied using phylogenetic analysis, showing an interlinking between domains in GN mat.NASA’s Exobiology Program. Ref. 17-EXO17-2-013

El escape room como técnica de estudio para la asignatura de Microbiología I

La motivación es un elemento fundamental para el aprendizaje del alumnado. Sin embargo, gran parte del contenido al que a veces se enfrentan no resulta motivante y genera una falta de implicación. En este sentido, las estrategias metodológicas deberán ir enfocadas estimular la motivación del alumnado. Una de las estrategias de innovación es la gamificación. Este enfoque se utiliza para aplicar los conocimientos adquiridos de manera lúdica en contextos que, a priori, no lo son. La gamificación es una estrategia didáctica que permite mejorar la motivación y, en consecuencia, la experiencia del aprendizaje haciéndolo más atractivo. El objetivo de este proyecto es aplicar la gamificación en la asignatura de Microbiología I del Grado de Farmacia como herramienta motivadora. Para ello, se llevará a cabo un escape room al final del primer cuatrimestre, una vez finalizado el contenido de la asignatura con fecha cercana la realización del examen final, dónde los alumnos previamente inscritos realicen esta prueba en grupos de 4 ó 5 personas con una duración de aproximadamente 20 minutos. El enigma del escape room irá enfocado a conceptos relativos a la asignatura, y se considerará como una actividad voluntaria dentro de la asignatura de Microbiología I. De este modo, se pretende usar la actividad del escape room como una herramienta de estudio previa al examen para afianzar y mejorar los conocimientos adquiridos durante la asignatura y la preparación por parte del estudiante para su evaluación en el examen final. Para valorar los efectos de esta actividad, se evaluará el rol de los alumnos durante el desarrollo de la misma, así como si ésta ha sido resuelta. También se analizará el impacto de esta actividad en la calificación del examen final. Los alumnos también valorarán esta actividad y una autoevaluación con respecto a su aprendizaje

Biodegradation of olive washing wastewater pollutants by highly efficient phenol-degrading strains selected from adapted bacterial community

The bacterial community of an olive washing water (OWW) storage basin was characterized, by both cultivation and cultivation-independent methods. PCR-TGGE fingerprints analysis of different samples, taken along the olive harvesting season, revealed important variations of the bacterial community structure showing rapid establishment of prevalent bacterial populations. Several bacteria, isolated from OWW, were cultivated, in media containing increasing amounts of polyphenols, in order to select high phenol-degrading strains for the effluent pollutants reduction. Strains PM3 and PM15, affiliated to Raoultella terrigena and Pantoea agglomerans by 16S rRNA gene sequencing, were selected and used for OWW biological treatment under batch conditions in shake flasks cultures. The OWW content of phenols, BOD5, COD and colour, was reduced by 93, 91, 89 and 62%, respectively, permitting effluent disposal and/or reuse with no additional treatments.This research was supported by European project Algatec (FP7/SME/2008/1/232331)

Famílies botàniques de plantes medicinals

Facultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona. Ensenyament: Grau de Farmàcia, Assignatura: Botànica Farmacèutica, Curs: 2013-2014, Coordinadors: Joan Simon, Cèsar Blanché i Maria Bosch.Els materials que aquí es presenten són els recull de 175 treballs d’una família botànica d’interès medicinal realitzats de manera individual. Els treballs han estat realitzat per la totalitat dels estudiants dels grups M-2 i M-3 de l’assignatura Botànica Farmacèutica durant els mesos d’abril i maig del curs 2013-14. Tots els treballs s’han dut a terme a través de la plataforma de GoogleDocs i han estat tutoritzats pel professor de l’assignatura i revisats i finalment co-avaluats entre els propis estudiants. L’objectiu principal de l’activitat ha estat fomentar l’aprenentatge autònom i col·laboratiu en Botànica farmacèutica

Diversidad de microorganismos filamentosos en un biorreactor de membrana sumergida (MBR) para el tratamiento del agua residual urbana: relación entre la estructura de las comunidades microbianas y las variables del sistema

Tesis Univ. Granada. Departamento de MicrobiologíaEste trabajo ha sido desarrollado en el marco del Proyecto CTM2010- 17609/TECNO, financiado por el Plan Nacional de I+D+i (Programa Nacional de Proyectos de Investigación Fundamental) del Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO) y el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER)

Linking microbial diversity and population dynamics to the removal efficiency of pharmaceutically active compounds (PhACs) in an anaerobic/anoxic/aerobic (A2O) system

The removal efficiencies (REs) of nineteen pharmaceutically active compounds (PhACs) (six antibiotics-clarithromycin, ofloxacin, sulfadiazine, sulfamethazine, sulfamethoxazole and trimethoprim -, four β-blockers -atenolol, metoprolol, propranolol and sotalol-, two antihypertensives/diuretics -furosemide and hydrochlorothiazide-, three lipid regulators -bezafibrate, fenofibrate and gemfibrozil-, and four psychiatric medications -carbamazepine, diazepam, lorazepam and paroxetine) were ascertained in a pilot-scale anaerobic/anoxic/aerobic (A2O) system treating urban wastewater, long term operated during two experimental phases using different sets of environmental conditions and operating parameters. Illumina MiSeq sequencing was used to investigate the structure, diversity and population dynamics of bacteria, archaea and fungi communities in the activated sludge. The results showed that mixed liquor suspended solids (MLSS) and food-to-microorganisms ratio (F/M) were operational parameters significantly influencing the REs of five of the analyzed PhACs in the A2O system. Biota-environment (BIO-ENV) analysis revealed strong correlations between population shifts of the activated sludge community and the REs of PhACs of the different pharmaceutical families. Increased REs of clarithromycin, furosemide, bezafibrate and gemfibrozil were concomitant to higher relative abundances of bacterial phylotypes classified within the Rhodobacteraceae and Sphingomonadaceae (Alphaproteobacteria), while those of Betaproteobacteria, Chloroflexi and Methanomethylovorans (Euryarchaea) correlated positively with the REs of up to seven PhACs belonging to different therapeutic groups. © 2019 Elsevier LtdThis work was funded by Spanish Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO) and Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) (CTM2014-60131-P). MINECO is also acknowledged for personal grants to P. Maza-Márquez (postdoctoral fellow) and M.J. Gallardo-Altamirano (FPI program, BES-2015-073595). Regional Government of Murcia, Spain (ESAMUR) and Murcia Water Works (EMUASA) are acknowledged for their collaboration in this research project and provision of facilities at Murcia Este Wastewater Treatment Plant (Murcia, Spain).Peer reviewe