14 research outputs found

    Kinetic modulation of bacterial hydrolases by microbial community structure in coastal waters

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    In this study, we hypothesized that shifts in the kinetic parameters of extracellular hydrolytic enzymes may occur as a consequence of seasonal environmental disturbances and would reflect the level of adaptation of the bacterial community to the organic matter of the ecosystem. We measured the activities of enzymes that play a key role in the bacterial growth (leucine aminopeptidase, β- and α-glucosidases) in surface coastal waters of the Eastern Cantabrian Sea and determined their kinetic parameters by computing kinetic models of distinct complexity. Our results revealed the existence of two clearly distinct enzymatic systems operating at different substrate concentrations: a high-affinity system prevailing at low substrate concentrations and a low-affinity system characteristic of high substrate concentrations. These findings could be the result of distinct functional bacterial assemblages growing concurrently under sharp gradients of high-molecular-weight compounds. We constructed an ecological network based on contemporaneous and time-delayed correlations to explore the associations between the kinetic parameters and the environmental variables. The analysis revealed that the recurring phytoplankton blooms registered throughout the seasonal cycle trigger the wax and wane of those members of the bacterial community able to synthesize and secrete specific enzymes.his work has been supported by projects EFICIENCIA (CTM2006-08023) and CAMBIO (CTM2010-19308), co-financed by Ministry of Science and Innovation of the Spanish Government and European FEDER founds, the Basque Government (Grant to Research Group IT1657-22) and by the UPV/EHU (Grant to Research Group GIU10/17). Naiara Abad was supported by a scholarship from the Basque Government and currently by the grant Margarita Salas from the European Union—NextGenerationEU through the UPV/EHU. Zuriñe Baña and Ainhoa Uranga were financed by scholarships from the UPV/EHU

    BioViewMed, a visual tool to support expansion of search string using semantic knowledge

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    Presentamos una herramienta que ofrece una ayuda visual a la adición de términos en la cadena de búsqueda, en pre-recuperación, controlada por el usuario y guiada por la información contenida en ontologías.We present a tool that offers a visual aid to the addition of terms in the search string in pre-recovery, user-controlled and guided by the information contained in ontologies.Este trabajo ha sido parcialmente financiado por ERDF (TIN2009-14057-C03-03)

    Do you really know what do you want to search? Visually guided expansion of search string using ontologies and concepts graphs

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    Múltiples trabajos hablan de la escasez de términos usados en las cadenas de búsqueda, lo que dificulta que se discriminen eficientemente los documentos de interés del usuario. Los buscadores devuelven miles de documentos recuperados, produciéndose resultados inadecuados, sin una conexión semántica con la consulta y escasamente relacionados con las necesidades del usuario. Este hecho se agrava en un ámbito biomédico donde el paciente no suele dominar el vocabulario especializado necesario para la precisa definición de sus necesidades de información. Presentamos un método de expansión y enriquecimiento de la cadena de búsqueda mediante la creación de un modelo visual esquemático, un grafo de conceptos relacionados semánticamente con la ayuda de ontologías como UMLS y Freebase.Many reports talk about the shortage of terms commonly used in the search strings, making it difficult to effectively discriminate relevant documents from the user. Search engines return thousands of documents recovered, leading to inadequate results, with no semantic connection with the consultation and little to do with the user's needs. This is heightened in a biomedical field where the patients does not usually dominate the specialized vocabulary needed for the precise definition of their information needs. We present a method of expansion and enrichment of the search string by creating a visual model diagram, a graph of semantically related concepts with the help of ontologies as UMLS and Freebase.Este trabajo ha sido parcialmente financiado por ERDF (TIN2009-14057-C03-03)

    Descripción del doctorado en Óptica y Optometría en España un camino hacia la excelencia académica y profesional

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    Estudio observacional diseñado para describir las características demográficas y sociales de los doctores en Óptica y Optometría en España, así como las características intrínsecas del propio doctorado, las dificultades existentes en la obtención de la tesis doctoral y las posteriores salidas profesionales.Los datos se obtuvieron mediante una encuesta que contestaron 39 doctorados. Se observó que la proporción entre hombres y mujeres que finalizaron el doctorado es muy parecida a la existente entre el colectivo de colegiados de Óptica y Optometría. La forma más frecuente de acceder fue mediante el estudio de un Máster Oficial de dos años (120 créditos ECTS), la edad media de inicio fue de 35 años con una duración aproximada de 4 años. Las emociones experimentadas por los doctorandos a lo largo de sus estudios son compatibles con los signos y síntomas que experimentan las personas afectadas de “burnout” o depresión, en parte a consecuencia de los problemas derivados de conciliación familiar y de la sobrecarga de trabajo. Aun existiendo estos factores y la necesidad de realizar cambios importantes en los hábitos diarios a lo largo de todo el período de estudio,un 66,7% de los encuestados volverían a realizarlo.Peer ReviewedPostprint (published version

    Extending PubMed on Tap by means of MultiDocument Summarization

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    Access to biomedical databases from pockets and hand-held or tablet computers is a useful tool for health care professionals. PubMed on Tap is the standard application for PDA to retrieve information from Medline, the most important and consulted bibliographical database in the biomedical domain. In this paper we present a description of an intelligent information retrieval system that uses clustering and multidocument summarization techniques improving aspects of PubMed on Tap.No data (2008)UE

    Programa FARO: ayudando al desarrollo de la formación integral del estudiante

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    Actualmente, la acción tutorial de naturaleza académica en la educación superior tiende a expandirse, en la mayoría de las universidades, hacia formas de información y orientación personal que inciden en otros ámbitos como la integración en la vida universitaria, la elección de itinerarios formativos y conocimiento de posibles salidas profesionales. En definitiva, favorecer el desarrollo de la formación integral del estudiante. Por otro lado, existe una gran preocupación por disminuir la tasa de abandono en los estudios universitarios. Para lograr ambos objetivos, en la Escuela Politécnica Superior de la Universidad de Huelva se ha implantado un Plan de Acción Tutorial (programa FARO) en seis de sus titulaciones. En este trabajo se describe la estructura del programa y se presentan los resultados obtenidos mediante su evaluación desde la percepción de estudiantes y profesores. Este estudio se aborda de una forma cualitativa, por medio de entrevistas en profundidad, analizando su contenido y formulando las conclusiones obtenidas, y cuantitativa mediante cuestionarios realizados por los profesores-tutores y por los estudiantes que han participado en el programa. Del análisis de los resultados se han descubierto fortalezas y debilidades para mejorar y reorientar el programa FARO en sucesivos cursos.SIN FINANCIACIÓNNo data 200
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