Micorrizas arbusculares asociadas al pasto angleton (Dichathium aristatum Benth) en fincas ganaderas del municipio de Tolú, Sucre-Colombia

RESUMEN Objetivo. El presente estudio consistió en caracterizar el porcentaje de colonización de hongos formadores de micorrizas arbusculares (HMA); asociados a la rizósfera del pasto Angleton (Dichanthium aristatum) Benth de fincas ganaderas del municipio de Tolú, departamento de Sucre, Colombia. Materiales y métodos. Se muestrearon en total 35 fincas ganaderas, de las cuales se tomaron 10 muestras de suelo con raíces por finca a una profundidad de 20 cm. De cada muestra se aislaron esporas de HMA, se hizo separación de morfotipos y su respectiva identificación a través de claves taxonómicas. De las raíces colectadas se determinó el porcentaje de colonización utilizando métodos de coloración. Resultados. Los ANAVA multifactorial entre las variables densidad de esporas/100 g de suelo y porcentaje de colonización en función a zonas y corregimiento mostraron diferencias altamente significativas. Los resultados obtenidos indican que el 92% de las especies encontradas corresponden a características de hongos HMA similares al género Glomus, el 4% al género Gigaspora y el 4% restante a Paraglomus. Conclusiones. Este estudio preliminar realizado en el Caribe colombiano muestra la diversidad, densidad poblacional y el porcentaje de colonización de HMA asociadas al pasto Angleton en condiciones de siete corregimientos pertenecientes a dos zonas agrológicas del municipio de Tolú, departamento de Sucre

Colonización de hongos formadores de micorrizas arbusculares en raíces de pasto colosoana y angletón en cinco localidades del departamento de Sucre

The present study was carried out during the second half of 2015 in livestock five localities of the Department of Sucre, Colombia, established with pastures colosoana (Bothriochloa pertusa (L) A. Camus) and angletón (Dichanthium aristatum Benth), with the objective of determining the percentage of colonization arbuscular mycorrhizal (AMF) in roots of these two species of pastures. Soils with presence of root samples were collected from five locations of the department of Sucre, from which it was determined the percentage of colonization in roots by HMA. The results of analysis of variance for percentage of colonization in roots of grasses colosoana and angletón (p value=0.000), respectively), finding the greatest percentage of colonization to the pasture colosoana (36.9±79.09%) regarding the angletón grass (33.3±72.72%) in five areas evaluated. The results show that both pastures is colonized by HMA.El presente estudio se realizó durante el segundo semestre de 2015 en fincas ganaderas de cinco localidades del departamento de Sucre, Colombia, establecidas con pastos colosoana (Bothriochloa pertusa (L) A. Camus) y angletón (Dichanthium aristatum, Benth), con el objetivo de determinar el porcentaje de colonización de hongos formadores de micorrizas arbusculares (HMA) en raíces de estas dos especies de pasturas. Las muestras de suelos con presencia de raíces fueron colectadas de cinco localidades del departamento de Sucre, a partir de la cuales se determinó el porcentaje de colonización en raíces por HMA. Los resultados de análisis de varianza para porcentaje de colonización en raíces de pastos colosoana y angletón (p value = 0,000), respectivamente), encontrándose los mayores porcentaje de colonización para el pasto colosoana (36.9±79.09%) con respecto al pasto angletón (33.3±72.72%) en las cinco localidades evaluados. Los resultados obtenidos demuestra que ambas pasturas esta colonizadas por HMA

Bioactividad de extracto de Annona muricata y aceites esenciales de Citrus aurantium contra Phytophthora cinnamomi

The aim of this research was determining raised antifungal activity in vitro against P. cinnamomi essential oils of fresh sour orange leaves collected in the municipalities of Sincelejo, Sampués and La Union and dichloromethane extracts of dried leaves collected soursop in the municipalities of La Union and Sincelejo, Sucre department. Direct seeding method was used to determine the bioactivity of oils and extracts. Essential oil concentrations of 15 uL/mL, 17,5 uL/mL and 20 uL/mL were prepared and plant extracts concentrations of 0,05 g/mL, 0,07 g/mL, 0,1 g/mL and 0,5 g/mL were prepared. Finding that for all essential oils and extracts the concentration that showed similar results with the positive control (Agrifos) was 20 uL/mL and 0,5 g/mL respectively. With regard to the chromatographic profiles Sampués essential oils and La Unión as major metabolite they showed the Linalool, while the collected Sincelejo Linalyl anthranilate showed. Plant extracts for soursop was the major metabolite Phytol. It is demonstrated that essential oils of bitter orange leaves and extracts of soursop leaves can be constituted as an agroecological alternative for the biocontrol of P. cinnamomi.El objetivo de esta investigación fue determinar la actividad antifúngica in vitro contra P. cinnamomi de aceites esenciales de hojas frescas de naranja agria recolectada en los municipios de Sincelejo, Sampués y La Unión, y de extractos en diclorometano de hojas secas de guanábana recolectadas en los municipios de Sincelejo y La Unión, departamento de Sucre. Se utilizó el método de siembra directa para determinar la bioactividad de los aceites y extractos. Para los aceites esenciales se prepararon concentraciones de 15 µL/mL, 17,5 µL/mL y 20 µL/mL y para los extractos vegetales se prepararon concentraciones de 0,05 g/mL, 0,07 g/mL, 0,1 g/mL y 0,5 g/mL. Encontrándose que para todos los aceites esenciales y extractos la concentración que mostró resultados similares al control positivo (Agrifos) fue de 20 µL/mL y 0,5 g/mL respectivamente. Con respecto a los perfiles cromatográfico los aceites esenciales de Sampués y La Unión mostraron como metabolito mayoritario al Linalool, mientras que el recolectado en Sincelejo mostró al Antranilato de linalilo. Para los extractos vegetales de guanábana el metabolito mayoritario fue el Fitol. Queda demostrado que los aceites esenciales de hojas naranja agria y extractos de hojas de guanábana se pueden constituir como una alternativa agroecológica para el biocontrol de P. cinnamomi

Characterization of AGN and their hosts in the Extended Groth Strip: a multiwavelength analysis

We have employed a reliable technique of classification of Active Galactic Nuclei (AGN) based on the fit of well-sampled spectral energy distributions (SEDs) with a complete set of AGN and starburst galaxy templates. We have compiled ultraviolet, optical, and infrared data for a sample of 116 AGN originally selected for their X-ray and mid-infrared emissions (96 with single detections and 20 with double optical counterparts). This is the most complete compilation of multiwavelength data for such a big sample of AGN in the Extended Groth Strip (EGS). Through these SEDs, we are able to obtain highly reliable photometric redshifts and to distinguish between pure and host-dominated AGN. For the objects with unique detection we find that they can be separated into five main groups, namely: Starburst-dominated AGN (24 % of the sample), Starburst-contaminated AGN (7 %), Type-1 AGN (21 %), Type-2 AGN (24 %), and Normal galaxy hosting AGN (24 %). We find these groups concentrated at different redshifts: Type-2 AGN and Normal galaxy hosting AGN are concentrated at low redshifts, whereas Starburst-dominated AGN and Type-1 AGN show a larger span. Correlations between hard/soft X-ray and ultraviolet, optical and infrared luminosities, respectively, are reported for the first time for such a sample of AGN spanning a wide range of redshifts. For the 20 objects with double detection the percentage of Starburst-dominated AGN increases up to 48%.Comment: 38 pages, 8 figures, 5 tables. Accepted by A

In silico whole-genome screening for cancer-related single-nucleotide polymorphisms located in human mRNA untranslated regions

BACKGROUND: A promising application of the huge amounts of genetic data currently available lies in developing a better understanding of complex diseases, such as cancer. Analysis of publicly available databases can help identify potential candidates for genes or mutations specifically related to the cancer phenotype. In spite of their huge potential to affect gene function, no systematic attention has been paid so far to the changes that occur in untranslated regions of mRNA. RESULTS: In this study, we used Expressed Sequence Tag (EST) databases as a source for cancer-related sequence polymorphism discovery at the whole-genome level. Using a novel computational procedure, we focused on the identification of untranslated region (UTR)-localized non-coding Single Nucleotide Polymorphisms (UTR-SNPs) significantly associated with the tumoral state. To explore possible relationships between genetic mutation and phenotypic variation, bioinformatic tools were used to predict the potential impact of cancer-associated UTR-SNPs on mRNA secondary structure and UTR regulatory elements. We provide a comprehensive and unbiased description of cancer-associated UTR-SNPs that may be useful to define genotypic markers or to propose polymorphisms that can act to alter gene expression levels. Our results suggest that a fraction of cancer-associated UTR-SNPs may have functional consequences on mRNA stability and/or expression. CONCLUSION: We have undertaken a comprehensive effort to identify cancer-associated polymorphisms in untranslated regions of mRNA and to characterize putative functional UTR-SNPs. Alteration of translational control can change the expression of genes in tumor cells, causing an increase or decrease in the concentration of specific proteins. Through the description of testable candidates and the experimental validation of a number of UTR-SNPs discovered on the secreted protein acidic and rich in cysteine (SPARC) gene, this report illustrates the utility of a cross-talk between in silico transcriptomics and cancer genetics

Actividad in vitro de bacterias endófitas promotoras de crecimiento asociadas con pasto colosoana en el municipio de Corozal, Sucre

The objective of study was evaluated in vitro binding activity of nitrogen and phosphate bacteria endophytic solubilizated isolated from different tissues of colosoana grass in the districts of the municipality of Corozal, Sucre Department. Collected sample of roots stems and leaves of colosoana pasture from different farms. Of each tissue previously disinfected is made isolation in the middle of cultivation of bacteria endophytic, to which is les determined it density population of bacteria endophytic by means of count in UFC / g of tissue and is carried out separation of morphs by shape, color, size and appearance in media of crops. Each isolated morphotype was evaluated in vitro binding activity of nitrogen and phosphate solubilizing specific crops media. Are observed differences significant for density population of bacteria with respect to tissue, with higher values in root (1x1011 g/ root), followed of the stem (1.82x1010 g/stem) and with leaf density sheets (1.15x1010 g/leaf). The results of the identification kit API20E confirmed the presence of bacteria endophytes Pseudomonas aeruginosa and Stenotrophomonas maltophilia with ability to fix nitrogen and solubilize phosphates.El presente estudio tuvo como objetivo evaluar in vitro la actividad fijadora de nitrógeno y solubilizadora de fosfato de bacterias endófitas aisladas de diferentes de tejidos de pasto colosoana en los corregimientos del municipio de Corozal, departamento de Sucre. Se colectaron muestra de raíz, tallos y hojas de pasto colosoana. De cada tejido previamente desinfectado se realizó aislamiento en medio de cultivo para bacterias endófitas, a las cuales se les determinó la densidad poblacional por medio de conteo en UFC/ g de tejido y se separación de morfotipos por forma, color, tamaño y apariencia en medios de cultivos. A Cada morfotipo aislado se le evaluó in vitro su actividad fijadora de nitrógeno y solubilizadora de fosfato en medios de cultivos específicos. Se observaron diferencias significativas para densidad poblacional de bacterias con respecto a tejido, con mayores valores en raíz (1x1011 g/ raíz), seguida del tallo (1.82x1010 g/tallo) y menor densidad en hojas (1.15x1010 g/hoja). Los resultados de la identificación con kit API20E confirmaron la presencia de las bacterias endófitas Pseudomona aeuroginosa y Stenotrophomonas maltophilia con capacidad de fijar nitrógeno y solubilizar fosfatos

Presencia de bacterias rizosféricas resistentes a mercurio en suelos del sur de Bolívar, Colombia

The objective of the present study was to isolate rhizospheric bacteria from samples from the Santa Cruz Mine, department of Bolívar, in order to evaluate in vitro resistance activity at different concentrations of mercury. The samples were collected randomly from different sites near the Santa Cruz gold mine, from which they isolated rhizospheric bacteria. The resistance capacity of bacteria at different concentrations of mercury in the form of mercury chloride (HgCl2) at concentrations of 50 ppm, 100 ppm, 150 ppm, 200 ppm and 250 ppm was evaluated in vitro; also the bacteria resistant to this metal were used to evaluate the ability to promote growth in plants. The results showed that the bacterium identified as Pseudomonas luteola, resisted in vitro at 200 ppm of mercury chloride (HgCl2), and qualitatively had the ability to produce siderophores and biologically fix nitrogen. P luteola was isolated from the rhizosphere near the Santa Cruz mine in the department of Bolívar, Colombia, with soils with high concentrations of mercury and extremely acidic soil reaction.El objetivo del presente estudio fue aislar bacterias rizosféricas de muestras provenientes de la Mina de Santa Cruz, departamento de Bolívar, con el propósito de evaluar in vitro la actividad de resistencia a diferentes concentraciones de mercurio. Las muestras fueron recolectadas aleatoriamente de diferentes sitios de cerca de la mina de oro Santa Cruz, a partir de la cuales de aislaron bacterias rizosférico. Se evaluó in vitro la capacidad de resistencias de las bacterias a diferentes concentraciones de mercurio en forma de cloruro de mercurio (HgCl2) a concentraciones de 50 ppm, 100 ppm, 150 ppm, 200 ppm y 250 ppm; así mismo las bacterias resistentes a este metal se utilizaron para evaluar la capacidad de promoción de crecimiento en las plantas. Los resultados mostraron que la bacteria identificada como Pseudomonas luteola, resistió in vitro a 200 ppm de cloruro de mercurio (HgCl2), y cualitativamente tuvo la capacidad de producir sideróforos y fijar biológicamente nitrógeno. P luteola fue aislada de la rizósfera cerca de la mina de Santa Cruz en el departamento de Bolívar, Colombia, con suelos con altas concentraciones de mercurio y con reacción del suelo extremadamente acida

Diversidad de micorrizas arbusculares en agroecositemas de pastura del departamento de sucre

The objective of this study was to compare the diversity of arbuscular mycorrhizae associated colosoana grass (Bothriochloa pertusa (L) A. Camus) and angletón (Dichanthium aristatum, Benth) present in livestock farms in the municipalities of Corozal and Tolú, Department of Sucre, Colombia. Was determined density esporas/100gr soil and roots percentage of colonization in both species of grass. From the isolated morphotypes proceeded to the species identification using taxonomic keys. The results of analysis of variance for density g of soil spores/100 show highly significant difference between pasture and locality. The highest density of spores found was 1160 ± 6233 and 2643 ± 444 g soil spores/100 respectively for colosoana and angleton in the municipalities of Corozal and Tolú. The percentage of colonization showed highly significant difference between pasture and locality. The Tukey test showed highly significant difference between the percentage of colonization for colosoana and angleton in the municipalities of Corozal and Tolú. A total of 32 morphotypes were isolated MA, 15 for Corozal and the rest in the Tolú. There is a high diversity of MA associated with these two pastures in different edaphoclimatic conditions, the department but there are still studies to predict dispersal patterns and location of these specific agroecosystems mycorrhizae in pastures in the department of Sucre.El objetivo del presente estudio fue comparar la diversidad de micorrizas arbusculares asociadas al pasto colosoana (Bothriochloa pertusa (L) A. Camus) y angletón (Dichanthium aristatum, Benth) presentes en fincas ganaderas de los municipios de Corozal y Tolú, Departamento de Sucre, Colombia. Se determinó la densidad de esporas/100gr suelo y el porcentaje de infección en raíces en ambas especies de pasto. A partir de los morfotipos aislados se procedió a la identificación de especies de MA, utilizando claves taxonómicas. Los resultados del análisis de varianza para densidad de esporas/100 g de suelo de muestran diferencia altamente significativa entre pasturas y localidad. La mayor densidad de esporas encontrada fue de 1160 ± 6233 y 444 ± 2643 esporas/100 g de suelo, respectivamente para colosoana y angletón en el municipio de Corozal. EL porcentaje de colonización mostró diferencia altamente significativa entre pastura y localidad. La prueba de Tukey mostró diferencia altamente significativa entre el porcentaje de colonización para la especie colosoana y angletón en los municipios de Corozal y de Tolú. Un total de 32 morfotipos MA fueron aislados, 15 para el municipio de Corozal y el resto en el municipio de Tolú. Existe una alta diversidad de MA asociadas a estas dos pasturas en condiciones edafoclimaticas diferentes, del departamento pero aún faltan estudios que permita predecir los patrones de dispersión y localización de estas micorrizas en agroecosistemas específicos de pasturas en el departamento de Sucre

A comprehensive asteroseismic modelling of the high-amplitude delta Scuti star RV Arietis

We present a comprehensive asteroseismic study of the double-mode high-amplitude delta Scuti star HD 187642 (RV Arietis). The modelling includes some of the most recent techniques: 1) effects of rotation on both equilibrium models and adiabatic oscillation spectrum, 2) non-adiabatic study of radial and non-radial modes, 3) relationship between the fundamental radial mode and the first overtone in the framework of Petersen diagrams. The analysis reveals that two of the observed frequencies are very probably identified as the fundamental and first overtone radial modes. Analysis of the colour index variations, together with theoretical non-adiabatic calculations, points to models in the range of [7065,7245] K in effective temperature and of [1190, 1270] Myr in stellar age. These values were found to be compatible with those obtained using the three other asteroseismic techniques.Comment: accepted for publication in A&