A matter of attitude: Focusing on positive and active gradients to boost saliency maps

Saliency maps have become one of the most widely used interpretability techniques for convolutional neural networks (CNN) due to their simplicity and the quality of the insights they provide. However, there are still some doubts about whether these insights are a trustworthy representation of what CNNs use to come up with their predictions. This paper explores how rescuing the sign of the gradients from the saliency map can lead to a deeper understanding of multi-class classification problems. Using both pretrained and trained from scratch CNNs we unveil that considering the sign and the effect not only of the correct class, but also the influence of the other classes, allows to better identify the pixels of the image that the network is really focusing on. Furthermore, how occluding or altering those pixels is expected to affect the outcome also becomes clearer

Caracterización química y cuantificación del rendimiento de extracción de pigmento en siete accesiones mexicanas de Bixa orellana

Achiote (Bixa orellana) is a plant used for obtaining a natural dye rich on carotenoids (mainly bixin and norbixin); it is also the plant species with the highest content of tocotrienols in nature. In the present work, the pigment extraction yield of seven Mexican accessions of Bixa orellana was quantified. Also color parameters and content of tocotrienols, tocopherols, norbixin, bixin, total phenolic compounds and antioxidant capacity were evaluated in the corresponding annatto extracts. The highest percentage of pigment extraction yield was obtained with KOH (4.84%). Accessions 43 (L*= 4.01 ± 0.79, C*= 7.33 ± 1.07, h= 25.76 ± 6.35) and 50 (L*= 3.17 ± 0.64, C*= 6.81 ± 0.53, h= 26.41 ± 4.41) had the lowest color values, meaning these accessions had a darker and redder color. Four accessions showed the highest content of bixin: accession 48 (3.1%), 45 (2.6%) 43 (2.4%) and 47 (2.2%). Accession 50 had showed the highest content of total phenolic compounds and of tocotrienols (T3), mainly the isoform δ-T3 (5.03 ± 0.64 mg g−1 Seed Dry Weight), as well as the highest antioxidant capacity.El achiote (Bixa orellana) es una planta utilizada para obtener un colorante natural rico en carotenoides (principalmente bixina y norbixina); además, es la especie vegetal con el mayor contenido de tocotrienoles. En este trabajo, se determinó el rendimiento de extracción de pigmento de siete accesiones mexicanas de Bixa orellana. También se evaluaron los parámetros de color y el contenido de tocotrienoles, tocoferoles, norbixina, bixina, compuestos fenólicos totales y la capacidad antioxidante en extractos de annato. El mayor porcentaje de rendimiento de extracción de pigmento fue obtenido con KOH (4.847905%). Las accesiones 43 (L*= 4.01 ± 0.79, C*= 7.33 ± 1.07, h= 25.76 ± 6.35) y 50 (L*= 3.17 ± 0.64, C*= 6.81 ± 0.53, h= 26.41 ± 4.41) presentaron los valores más bajos de los párametros de color, lo que significa que estas accesiones tuvieron un color más oscuro y más rojo. Cuatro accesiones mostraron el mayor contenido de bixina: accesión 48 (3.1%), 45 (2.6%) 43 (2.4%) and 47 (2.2%). La accession 50 mostró el mayor contenido de compuestos fenólicos totales y de tocotrienoles (T3), principalmente la isoforma δ-T3 (5.03 ± 0.64 mg g-1 Peso Seco), así como también la mayor capacidad antioxidante.Fil: Raddatz Mota, D.. Universidad Autónoma Metropolitana; MéxicoFil: Pérez Flores, L. J.. Universidad Autónoma Metropolitana; MéxicoFil: Carrari, Fernando Oscar. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Insani, Ester Marina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Asis, Ramón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Córdoba. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología; ArgentinaFil: Mendoza Espinoza, J. A.. Universidad Nacional Autónoma de México; MéxicoFil: Díaz de León Sánchez, F.. Universidad Autónoma Metropolitana; MéxicoFil: Rivera Cabrera, F.. Universidad Autónoma Metropolitana; Méxic

The effect of foliar applications of a bio-stimulant derived from algae extract on the physiological behavior of lulo seedlings (Solanum quitoense cv. Septentrionale)

The effect of foliar applications of a bio-stimulant derived from algae extract on the physiological behavior of lulo seedlings (Solanum quitoense cv. Septentrionale). Cien. Inv. Agr. 43(1):25-37. Seaweed extracts are used as nutritional supplements, biostimulants, or biofertilizers in agriculture and horticulture to increase plant growth and yield. In this experiment, foliar applications of bio-stimulant derivate from seaweed extract were tested on plant growth, leaf gas exchange properties, and proline accumulation in lulo seedlings cultivated under greenhouse conditions. Lulo plants were split into four treatments: (i) plants with soil fertilizer; (ii) plants treated only with foliar bio-stimulant sprays; (iii) a combination of soil fertilizer plus a foliar bio-stimulant application; and (iv) a control treatment (without nutrient application). Lulo plants treated with soil fertilizer and foliar bio-stimulants increased growth, as this group of plants showed a higher total plant dry weight, stem diameters, and absolute growth rate. Lulo plants without soil fertilizater and treated with foliar bio-stimulant application had lower leaf gas exchange (photosynthesis, stomatal conductance, and plant transpiration) and leaf chlorophyll content. Foliar bio-stimulant sprays enhanced the partitioning of dry mass in floral cushions. In conclusión, the application of foliar bio-stimulant applications as a complement to soil fertilizer is a technique that can be employed in the cultivation of lulo because foliar sprays of these kinds of agrochemicals can enhance dry matter accumulation and blooming.Efecto de la aplicación foliar de un biostimulante de extracto de algas marinas sobre el comportamiento fisiológico de plántulas de lulo (Solanum quitoense cv. Septentrionale). Cien. Inv. Agr. 43(1):25-37. Extractos de algas marinas son usados como Fuente de nutrientes, biosetimulantes o biofertilizantes in la agricultura y horticultura con el propósito de incrementa el crecimiento y rendimiento de la planta. En este experimento, se evaluaron las aplicaciones foliar de un bioestimulante a base de un extracto de algas marinas sobre el crecimiento de la planta, propiedades de intercambio gaseoso de la hoja y producción de prolina en plántulas de lulo cultivadas bajo condiciones de invernadero. Las plantas de lulo fueron divididas en cuatro tratamientos: i) plantas con fertilización edáfica; ii) plantas tratas solamente vía foliar con el biostimulante iii) una combinación de fertilización edáfica y aplicación foliar de bioestimulante y iv) plantas control (sin ninguna aplicación de fertilizante y bioestimulante). Las plantas de lulo tratadas con fertilizante edáfico más aplicaciones foliares del bioestimulante mostraron una mayor altura de planta, peso seco total, diámetro del tallo y tasa absoluta de crecimiento. Plantas control presentaron una menor tasa fotosintética, conductancia estomática y transpiración. Asimismo, aplicaciones foliares del bioestimulante favoreció la aparición de botones florales. Los resultados obtenidos permiten concluir que el uso de un bioestimulante a base de extractos de algas marinas puede ser considerado como un complemento a la fertilización edáfica, ya que puede favorecer la acumulación de materia seca y floración

Efficient Removal of Heavy Metals from Aqueous Solutions Using a Bionanocomposite of Eggshell/Ag-Fe

Abstract: Eggshell and an easily synthesized bionanocomposite of eggshell with Ag-Fe nanoparticles demonstrated to be efficient adsorbent materials for the removal of lead, arsenic, and mercury from water. The natural material and the bionanocomposite were characterized by TEM and XRD. Ag-Fe nanoparticles vary from 1 to 100 nm in size. Equilibrium times of the adsorption systems were achieved between 4 and 8 h. The experimental adsorption data fitted the pseudo-second and Elovich models; therefore, the adsorption of heavy metals ions took place mainly by a chemical process. The adsorption capacity of eggshell in mg/g was 7.01 for As5+, 3.90 for Pb2+, and 1.51 for Hg2+, while the nanocomposite adsorption capacity was 17.7 for As5+, 27.8 for Pb2+ and 15.88 for Hg2+

Investigating potential inhibitory effect of Uncaria tomentosa (Cat's Claw) against the main protease 3CL pro of SARS-CoV-2 by molecular modeling

COVID-19 is a disease caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2. Presently, there is no effective treatment for COVID-19. As part of the worldwide efforts to find efficient therapies and preventions, it has been reported the crystalline structure of the SARS-CoV-2 main protease M pro (also called 3CL pro) bound to a synthetic inhibitor, which represents a major druggable target. The druggability of M pro could be used for discovering drugs to treat COVID-19. A multilevel computational study was carried out to evaluate the potential antiviral properties of the components of the medicinal herb Uncaria tomentosa (Cat's claw), focusing on the inhibition of M pro. The in silico approach starts with protein-ligand docking of 26 Cat's claw key components, followed by ligand pathway calculations, molecular dynamics simulations, and MM-GBSA calculation of the free energy of binding for the best docked candidates. The structural bioinformatics approaches led to identification of three bioactive compounds of Uncaria tomentosa (speciophylline, cadambine, and proanthocyanidin B2) with potential therapeutic effects by strong interaction with 3CL pro. Additionally, in silico drug-likeness indices for these components were calculated and showed good predicted therapeutic profiles of these phytochemicals. Our findings suggest the potential effectiveness of Cat's claw as complementary and/or alternative medicine for COVID-19 treatment

Diseño colaborativo basado en ThinkLets como apoyo a la enseñanza de la Programación

The incorporation of collaborative work in the educational field grows day by day, as do the number of research groups and projects associated with this topic; since the learning activities specified collaboratively promote communication, coordination, and negotiation within the groups. While this strategy's practical usefulness has been demonstrated at different training levels, not much emphasis has been placed on a fundamental part: the design of inherent collaborative processes. Collaboration Engineering highlights collaboration patterns and ThinkLets as primary design units, which has its primary objective reuse. This article presents a proposal for a collaborative activity to be implemented to support the teaching of initial programming courses at the university level, which bases its collaborative design on patterns and ThinkLets.La incorporación del trabajo colaborativo en el ámbito educativo crece día a día, al igual que el número de grupos de investigación y proyectos asociados a este tema, dado que las actividades de aprendizaje especificadas de forma colaborativa promueven la comunicación, la coordinación y la negociación al interior de los grupos. Si bien se ha demostrado la utilidad práctica de esta estrategia en diferentes niveles de formación, no se ha hecho mucho énfasis en una parte fundamental: el diseño de los procesos colaborativos inherentes. La Ingeniería de la Colaboración destaca para ello el uso de patrones de colaboración y de ThinkLets como unidades primarias de diseño, lo cual tiene como objetivo primordial la reutilización. Este artículo presenta una propuesta de actividad colaborativa a implementarse como apoyo en la enseñanza de cursos iniciales de Programación en el ámbito universitario, la cual basa su diseño colaborativo en la utilización de patrones y ThinkLets

Entidad paleozoica en la faja Amotape-Tahuin y Cordilleras Occidental (Perú) y Real (Ecuador)

En el marco del Proyecto Multinacional Andino y el Convento INGEMMET - DINAGE, se viene desarrollando el Mapa Geológico Integrado Perú - Ecuador, escala 1:500000 comprendido entre los paralelos 2°00' 00" a 6° 00' 00" Latitud Sur. Con la finalidad de evitar confusiones entre el marco geológico estratigráfico, tectónico estructural y el contexto fisiográfico de las cordilleras que se proyectan entre Perú y Ecuador, se. ha establecido para este trabajo Unidades Litotectonicas tales como la Unidad Amot~pe-Tahuín, la Unidad Terreno Olmos-Loja. la Unidad Vole. Sedimentaria de Zamora y la Unidad Escudo Guyanes-Faja SubandinaForeland. En el presente trabajo se describe las unidades del Paleozoico que afloran al Sur del Ecuador y Norte del Perú; en los terrenos Amotape- Tahuín y Olmos-Loja, con la finalidad de dar mayores alcances en lo que respecta a sus correlaciones estratigráficas y su marco tectónico-estructural. Los Andes Centrales al ingresar al área de influencia de la Deflexión de Huancabamba cambian su rumbo de NO - SE a N-S y luego NE- SO marcando así el paso a los Andes septentrionales. En este contexto presentan un sistema de fallas longitudinales y transversales destacando entre estas, la falla Jubones, que delimitan al norte dicha deflexión y al sur las fallas de Huaypira y Portachuelo, que controlaron la sedimentación de la Cuenca Lancones-Alamor. Las fallas longitudinales que destacan en los terrenos Olmos-Loja se prolongan en el sur de Ecuador y Norte del Perú teniendo dentro de estas la "Falla Frente Baños" y "Falla Las Aradas" de extensión regional que delimitan a las unidades del Paleozoico con unidades del Cretáceo y Paleógeno - Neógeno con un frente de despegue hacia el occidente. Hacia el norte de la falla Jubones y Arenillas, los Andes Septentrionales sufren cambios en la arquitectura tectónica estructural al constituirse de bloques acrecionales (Peltetec-Romeral...), a partir del Jurásico, con una subducción oblicua ' mientras que los Andes Centrales al sur de la Deflexión de Huanbamba está constituido por un Ststema Cordtllerano, con subducción perpendicular. Constituye un hecho incuestionable, que el Paleozotco tanto sedimentario como ígneo forme una entidad tectónico-estructural de basamento de gran continuidad en el Norte del Perú y Sur de Ecuador, siendo en este basamento Paleozoico que se instalaron las cuencas mesozoicas y cenozoicas las cuales se desarrollaron en un régimen predominantemente extensional (Cuenca Lancones-Alamor, Cuenca Progreso, Cuenca, Talara, Cuenca Sechura ... ). Los cuerpos ígneos intrusivos gneisificados que forman parte de este basamento están datados como Permo - Triasico, sin excluir que existan cuerpos intrusivos del Devoniano. Cabe señalar que esta datación probablemente esté registrando la edad del metamorfismo que han afectado a estas rocas

Facile solventless synthesis of a nylon-6,6/silver nanoparticles composite and its XPS study

SINTESIS DE NANOPARTICULASSilver nanoparticles were synthesized and supported on thin nylon membranes by means of a simple method of impregnation and chemical reduction of Ag ions at ambient conditions. Particles of less than 10nm were obtained using this methodology, in which the nylon fibers behave as constrained nanoreactors. Pores on nylon fibres along with oxygen and nitrogen from amide moieties in nylon provide effective sites for in situ reduction of silver ions and for the formation and stabilization of Ag nanoparticles. Transmission electron microscopy (TEM) analysis showed that silver nanoparticles are well dispersed throughout the nylon fibers. Furthermore, an interaction betweenUAEME

Transición de los Andes Centrales a los Andes del Norte: nueva comprensión basada en el reconocimiento de campo y análisis geoquímicos

A escala de 1:500000 se verificó en campo el contexto lito-tectónico, morfo-estructural y la compilación estratigráfica de la región de frontera de Perú y Ecuador (situada entre los 2° y 6° latitud sur). Las actividades han sido realizadas por una comisión de geocientíficos de INGEMMET, Perú y de DINAGE-Ecuador, en el marco del Proyecto multinacional Andino (MAP-GAC), Convenio INGEMMET -DINAGE, asesorados por el Servicio Geológico de Canadá. El sistema de la Cordillera Andina se puede considerar en términos de tres regiones o bloques distintos; Meridional (Patagónico), Central, y Septentrional (Fig. 1). Los estudios de teledetección y las observaciones de campo indican que el área de estudio binacional se sitúa en la zona de transición de los Andes centrales a los del Norte, estando situados dentro de la región morfoestructural del bloque andino del Norte. Basado sobre fundamentos estratigráficos, consideraciones morfológicas y geo-tectónicas, la transición de los Andes Centrales a Los Andes del Norte se le pueden considerar en términos de seis dominios lito-tectónicos (Fig. 2), el contexto litoestratigráfico se puede correlacionar a lo largo de la frontera del Perú y de Ecuador. Estos dominios geológicos no coinciden siempre con la nomenclatura fisiográfica comúnmente usada para los Andes de Perú y de Ecuador (e.g. Cordillera Real, Cordillera Oriental, central. Occidental o de la Costa). El análisis litotectónico y morfoestructural de cada dominio asegura compatibilidad lito-estratigráfica interna (Fig.3) y destaca fundamentalmente las características y límites estructurales (las suturas y/o estructuras importantes) que indican cambios en el régimen tectónico vinculado a sus eventos geocronológicos