28 research outputs found
The membrane anchor of penicillin-binding protein PBP2a from Streptococcus pneumoniae influences peptidoglycan chain length.
The pneumococcus is an important Gram-positive pathogen, which shows increasing resistance to antibiotics, including β-lactams that target peptidoglycan assembly. Understanding cell-wall synthesis, at the molecular and cellular level, is essential for the prospect of combating drug resistance. As a first step towards reconstituting pneumococcal cell-wall assembly in vitro, we present the characterization of the glycosyltransferase activity of penicillin-binding protein (PBP)2a from Streptococcus pneumoniae. Recombinant full-length membrane-anchored PBP2a was purified by ion-exchange chromatography. The glycosyltransferase activity of this enzyme was found to differ from that of a truncated periplasmic form. The full-length protein with its cytoplasmic and transmembrane segment synthesizes longer glycan chains than the shorter form. The transpeptidase active site was functional, as shown by its reactivity towards bocillin and the catalysis of the hydrolysis of a thiol-ester substrate analogue. However, PBP2a did not cross-link the peptide stems of glycan chains in vitro. The absence of transpeptidase activity indicates that an essential component is missing from the in vitro system
Modélisation des secteurs de production et de transformation de l'énergie. Le cas français
Cet article décrit un modèle, réalisé à l'Institut Français du Pétrole (IFP) avec l'aide d'Électricité de France (EDF), représentant l'ensemble des secteurs de production et de transformation de l'énergie en France. Son but est de déterminer les programmes d'investissements (centrales de production d'électricité, unités de conversion en raffinerie) permettant de satisfaire au moindre coût (actualisé) des demandes de consommation dont l'évolution dans le temps est donnée. Il s'agit d'un modèle linéaire dynamique. Les sous-modèles relatifs à un secteur donné (raffinage d'une part, électricité d'autre part) ont été étalonnés au moyen de modèles plus sophistiqués. La mise en ceuvre de l'ensemble s'appuie sur des programmes générateurs de matrices et de rapports qui lui donnent une grande souplesse d'utilisation
Réduction des approvisionnements pétroliers multiples dans les programmes linéaires de raffinage
L'article propose une méthode pour réduire le nombre des pétroles bruts nécessaires pour représenter un approvisionnement lors de l'utilisation de programmes linéaires de raffinage, ceci afin de diminuer la taille et les temps de calcul de ces modèles. Les techniques utilisées sont celles de l'analyse de données multidimensionnelles. Un exemple est traité pour illustrer la méthode
Etude des relations structure-fonction de glycosyltransférases impliquées dans la biosynthèse du peptidoglycane bactérien
L'activité glycosyltransférase (GTase) des Penicillin Binding Proteins de classe A et des glycosyltransférases monofonctionnelles réalise une étape clé de la synthèse du peptidoglycane bactérien: l'élongation des chaînes glycaniques. La cristallisation d'un domaine GTase pourrait conduire au développement d'un nouvel agent antibactérien, actif contre des pathogènes multirésistants. Malheureusement, nous sommes dans l'incapacité d'obtenir une protéine stable en solution, non agrégée. Cette tendance à l'agrégation autologue serait liée à la présence de résidus apolaires exposés au solvant, probablement éloignés sur la séquence primaire du domaine GTase. Certaines conditions de solubilisation en détergent permettent l'obtention d'un module GTase monodisperse. Ces résultats sont encourageants et incitent à s'inspirer des méthodes de cristallisation des protéines membranaires pour augmenter nos chances d'accéder à la première structure cristalline d'un domaine GTaseAIX-MARSEILLE1-BU Sci.St Charles (130552104) / SudocSudocFranceF
Niveau de vie, croissance et énergie
Cet article rassemble les principaux résultats d'une Action Thématique Programmée consacrée aux « problèmes socio-économiques de l'énergie » et confiée par le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) au Département Économie de l'Institut Français du Pétrole (IFP). Les problèmes posés par la mesure du niveau de vie et par ses liaisons avec la consommation d'énergie sont l'objet d'une première analyse. Elle permet de dégager les grandes orientations des possibilités de réduction de la consommation d'énergie sans régression du niveau de vie, au sens des économies des pays d'Europe occidentale. Sur ces bases, deux scénarios contrastés de demande d'énergie finale à long terme sont quantifiés dans le cas de la France Le scénario de moindre consommation d'énergie intègre une restructuration industrielle déterminée par optimisation d'un modèle linéaire issu du tableau entrée-sorties de la Comptabilité nationale. Les deux projections de demande d'énergie sont appliquées à un modèle linéaire dynamique de production. Ce modèle fournit les résultats nécessaires à une analyse détaillée de l'évolution structurelle du secteur énergétique et au calcul de bilans d'énergie primaire prévisionnels cohérents
Functional characterization of the glycosyltransferase domain of penicillin-binding protein 1a from Thermotoga maritima
International audienc
Streptococcus pneumoniae Choline-Binding Protein E Interaction with Plasminogen/Plasmin Stimulates Migration across the Extracellular Matrix▿
The virulence mechanisms leading Streptococcus pneumoniae to convert from nasopharyngeal colonization to a tissue-invasive phenotype are still largely unknown. Proliferation of infection requires penetration of the extracellular matrix, which occurs by recruitment of host proteases to the bacterial cell surface. We present evidence supporting the role of choline-binding protein E (CBPE) (a member of the surface-exposed choline-binding protein family) as an important receptor for human plasminogen, the precursor of plasmin. The results of ligand overlay blot analyses, solid-phase binding assays, and surface plasmon resonance experiments support the idea of an interaction between CBPE and plasminogen. We have shown that the phosphorylcholine esterase (Pce) domain of CBPE interacts with the plasminogen kringle domains. Analysis of the crystal structure of the Pce domain, followed by site-directed mutagenesis, allowed the identification of the plasminogen-binding region composed in part by lysine residues, some of which map in a linear fashion on the surface of the Pce domain. The biological relevance of the CBPE-plasminogen interaction is supported by the fact that, compared to the wild-type strain, a mutant of pneumococcus with the cbpE gene deleted (i) displays a reduced level of plasminogen binding and plasmin activation and (ii) shows reduced ability to cross the extracellular matrix in an in vitro model. These results support the idea of a physiological role for the CBPE-plasminogen interaction in pneumococcal dissemination into human tissue