The imprint of the Slave Trade in an African American population: mitochondrial DNA, Y chromosome and HTLV-1 analysis in the Noir Marron of French Guiana

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Retracing the genetic histories of the descendant populations of the Slave Trade (16^th-19^thcenturies) is particularly challenging due to the diversity of African ethnic groups involved and the different hybridisation processes with Europeans and Amerindians, which have blurred their original genetic inheritances. The Noir Marron in French Guiana are the direct descendants of maroons who escaped from Dutch plantations in the current day Surinam. They represent an original ethnic group with a highly blended culture. Uniparental markers (mtDNA and NRY) coupled with HTLV-1 sequences (<it>env </it>and LTR) were studied to establish the genetic relationships linking them to African American and African populations.</p> <p>Results</p> <p>All genetic systems presented a high conservation of the African gene pool (African ancestry: mtDNA = 99.3%; NRY = 97.6%; HTLV-1 e<it>nv </it>= 20/23; HTLV-1 LTR = 6/8). Neither founder effect nor genetic drift was detected and the genetic diversity is within a range commonly observed in Africa. Higher genetic similarities were observed with the populations inhabiting the Bight of Benin (from Ivory Coast to Benin). Other ancestries were identified but they presented an interesting sex-bias. Whilst male origins spread throughout the north of the bight (from Benin to Senegal), female origins were spread throughout the south (from the Ivory Coast to Angola).</p> <p>Conclusions</p> <p>The Noir Marron are unique in having conserved their African genetic ancestry, despite major cultural exchanges with Amerindians and Europeans through inhabiting the same region for four centuries. Their maroon identity and the important number of slaves deported in this region have maintained the original African diversity. All these characteristics permit to identify a major origin located in the former region of the Gold Coast and the Bight of Benin; regions highly impacted by slavery, from which goes a sex-biased longitudinal gradient of ancestry.</p

Extracorporeal Membrane Oxygenation for Severe Acute Respiratory Distress Syndrome associated with COVID-19: An Emulated Target Trial Analysis.

RATIONALE: Whether COVID patients may benefit from extracorporeal membrane oxygenation (ECMO) compared with conventional invasive mechanical ventilation (IMV) remains unknown. OBJECTIVES: To estimate the effect of ECMO on 90-Day mortality vs IMV only Methods: Among 4,244 critically ill adult patients with COVID-19 included in a multicenter cohort study, we emulated a target trial comparing the treatment strategies of initiating ECMO vs. no ECMO within 7 days of IMV in patients with severe acute respiratory distress syndrome (PaO2/FiO2 <80 or PaCO2 ≥60 mmHg). We controlled for confounding using a multivariable Cox model based on predefined variables. MAIN RESULTS: 1,235 patients met the full eligibility criteria for the emulated trial, among whom 164 patients initiated ECMO. The ECMO strategy had a higher survival probability at Day-7 from the onset of eligibility criteria (87% vs 83%, risk difference: 4%, 95% CI 0;9%) which decreased during follow-up (survival at Day-90: 63% vs 65%, risk difference: -2%, 95% CI -10;5%). However, ECMO was associated with higher survival when performed in high-volume ECMO centers or in regions where a specific ECMO network organization was set up to handle high demand, and when initiated within the first 4 days of MV and in profoundly hypoxemic patients. CONCLUSIONS: In an emulated trial based on a nationwide COVID-19 cohort, we found differential survival over time of an ECMO compared with a no-ECMO strategy. However, ECMO was consistently associated with better outcomes when performed in high-volume centers and in regions with ECMO capacities specifically organized to handle high demand. This article is open access and distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial No Derivatives License 4.0 (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)

Caractérisation de défauts latents dans les circuits intégrés soumis à des décharges électrostatiques

Electrical stresses, such as electrostatic discharges (ESD) and electric overstress (EOS), are at the origin of more than 50% of integrated circuits failures. Moreover, with the advent of wireless technologies and the development of "X-by-wire" systems for automotive and aircraft applications, robustness specifications have become more severe. Concurrently, both shrinking and increasing complexity of semiconductor technologies increase their susceptibility to EOS/ESD stresses and generation of latent defects is more likely to occur. Finally, the required reliability levels in the majority of the applications are extremely high. To meet these new requirements, latent defects detection become essential. Due to feature size shrinking, the quiescent current of microelectronics circuits is increasing. This current increase will make difficult or impossible to detect latent defects susceptible to degrade the reliability of microelectronics systems. In this thesis, we studied the impact of latent defects induced by CDM ESD stresses on the reliability of integrated circuits, and proposed a new methodology for their detection. This methodology, based on low frequency noise measurements, enables the detection of latent defects with a higher sensitivity compared to leakage current measurement. The methodology was validated for simple ESD protection structures but also for complex commercial circuits submitted to CDM discharges. Various laser stimulation techniques were carried out for the localization of the generated defects and the validation of the physical mechanisms involved in the noise increase.Les agressions électriques, du type décharges électrostatiques (ESD) et surcharges électriques (EOS), sont à l'origine de plus de 50% des défaillances des circuits intégrés. De plus, avec l'avènement des technologies sans fil et des applications dites "plus électriques" en automobile et dans l'aviation, les spécifications de robustesse à ces agressions se sont considérablement durcies. Dans le même temps, la réduction des dimensions et la complexité croissante des technologies pose le problème de leur susceptibilité à ces contraintes EOS/ESD et de la probabilité non négligeable de génération de défauts latents. Enfin, les niveaux de fiabilité exigés maintenant dans la plupart des applications sont extrêmement élevés. Afin de répondre à ces nouvelles exigences, la détection des défauts latents est devenue indispensable, notamment pour des applications comme celles du domaine spatial. Or, la diminution des dimensions lithographiques a pour conséquence une augmentation des courants de repos des circuits microélectroniques. Cette augmentation rend difficile voire impossible la détection de défauts latents susceptibles de " dé-fiabiliser " des systèmes microélectroniques. Nous avons, dans cette thèse, étudié l'impact de défauts latents induits par stress ESD de type CDM sur la fiabilité de circuits et proposé une nouvelle méthodologie pour leur détection. Issue du domaine des radio fréquences, cette méthodologie basée sur des mesures du bruit basse fréquence nous a permis de mettre en évidence, avec une meilleure sensibilité, des défauts latents dans de simples structures de protections ESD mais aussi dans des circuits commerciaux complexes soumis à des décharges de type CDM. Différentes techniques de localisation par stimulation laser ont été mises en oeuvre pour la détection physique des défauts générés et corroborer l'analyse des mécanismes physiques à l'origine de l'augmentation du bruit

Caractérisation de défauts latents dans les circuits intégrés soumis à des décharges électrostatiques

TOULOUSE3-BU Sciences (315552104) / SudocSudocFranceF

Les examens radiologiques font-ils courir un risque aux patients de réanimation?

Il n'existe pas dans la littérature de données relatives à la dose de rayonnement ionisant reçue par les patients adultes en réanimation. L'objectif de cette étude est de déterminer la dose efficace (DE) moyenne délivrée par les examens de radiodiagnostics aux patients en réanimation. Cette DE représente en effet le risque global de lésions radio-induites tardives pour un individu. PATIENTS ET METHODES : Entre janvier et juin 2006, tous les patients admis dans le service de réanimation chirurgicale (16 lits) du CHU de Rouen ont été inclus de manière prospective. Les données suivantes ont été recueillies âge, sexe, durée de séjour, IGS2, modes d'admission et de sortie, nombre de radiographie thoracique (RT) ainsi que le nombre et le type de chaque scanner. Afin d'obtenir la DE, chaque RT a été multipliée par la dose optimale recommandée par l'Institut National de Veille Sanitaire (INVS) soit 0,05 milliSievert (mSv). Pour chaque scanner était relevé le produit dose -longueur qui nous a permis de déterminer la DE en y appliquant un coefficient publié par l'INVS et prenant en compte la radiosensibilité et la profondeur des organes irradiés. La DE globale reçue par chaque patient correspond à la somme des DE des RT et des scanners. Les analyses statistiques ont été principalement effectuées grâce au test de Student. RESULTATS : 281 patients ont été admis et inclus dans l'étude. La DE moyenne est de 22,59+-2,48mSv dont 98% secondaire aux scanners. 19 patients (7%) ont reçu plus de 100 mSv. Les facteurs de risque de surexposition retrouvés sont : - une durée de séjour supérieure à 7 jours, - une admission en réanimation pour sepsis abdominal ou polytraumatisme ainsi que la réalisation en réanimation de deux scanners non-cérébraux ou plus. DISCUSSION/CONCLUSION : L'irradiation secondaire aux examens radiologiques pratiqués en réanimation représente globalement 5 ans d'exposition naturelle en France mais ne justifie pas directement de mesure de radioprotection systématique. L'identification de facteurs de risque de surexposition permet de définir une sous-population exposée à plus de 100 mSv dont la surmortalité par cancer radio-induit est augmentée de plus de 0,5%. Cette sous-population pourrait, quant à elle, bénéficier d'une information et d'un suivi personnalisé sous forme, par exemple, d'une consultation post-réanimation.ROUEN-BU Médecine-Pharmacie (765402102) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Recovery of Intrinsic Heterojunction Bipolar Transistors Profiles by Neural Networks

International audienceDue to the shrinking size of devices, the calibration process for TCAD simulators is becoming increasingly complex with time mandatory to run simulations steadily increasing. In this work, we propose a Statistical Learning approach to predicting Figures of Merit (FoMs) of a Silicon Germanium Heterojunction bipolar transistor (HBT) 1D doping and germanium profile. The surrogate model thus built allows to simulate electrical outputs with high precision much faster than traditional simulations. This model is then used to solve the inverse design problem and recover profiles that match target FoMs

Recovery of Intrinsic Heterojunction Bipolar Transistors Profiles by Neural Networks

International audienceDue to the shrinking size of devices, the calibration process for TCAD simulators is becoming increasingly complex with time mandatory to run simulations steadily increasing. In this work, we propose a Statistical Learning approach to predicting Figures of Merit (FoMs) of a Silicon Germanium Heterojunction bipolar transistor (HBT) 1D doping and germanium profile. The surrogate model thus built allows to simulate electrical outputs with high precision much faster than traditional simulations. This model is then used to solve the inverse design problem and recover profiles that match target FoMs

Are artificial tracers conservative in argillaceous media? The Tournemire claystone case

International audienc

Appréhender les relations à la nature en Afrique par le dessin sur le terrain: Un entretien croisé entre Delphine et Élodie Chevalme, Émilie Guitard, Céline Lesourd et Nicolas Deleau, animé par Luisa Arango

International audiencePour ce numéro de la revue Sources sur les savoirs environnementaux et naturalistes en Afrique, nous avons voulu donner une place particulière à la collaboration entre chercheur·es en sciences sociales et artistes, et à la figure du·de la chercheur·e/dessinateur·trice. En effet, si ces échanges et ces figures fleurissent et se multiplient (Roussel et Guitard 2021), un questionnement demeure sur le statut et la légitimité des langages artistiques dans nos disciplines. Largement pensé dans les sciences sociales comme objet d’illustration et moyen de restitution ou de dissémination des résultats de la recherche, le dessin est aussi un réel outil d’investigation, un dispositif d’analyse, une source pour la réflexion et pour la production des connaissances, notamment dans les études sur la culture matérielle, l’architecture ou les relations à la nature justement. Au fil du temps, ou au bout d’une carrière scientifique, ces objets graphiques peuvent aussi devenir des archives qui témoignent des transformations environnementales et paysagères, mais également des changements dans les manières de voir et de penser la nature en Afrique.Aujourd’hui, de plus en plus de chercheur·e·s en sciences sociales revendiquent l’usage du dessin comme outil de l’enquête de terrain (pour renouveler l’observation et nouer de nouveaux modes d’interaction avec leurs interlocuteurs notamment) et comme instrument d’analyse (pour sa valeur heuristique et le brouillage qu’il permet entre cadres artistique et scientifique), dépassant ainsi sa seule valeur illustrative ou pédagogique. C’est à ce titre que nous présentons ici deux entretiens : le premier avec Céline Lesourd, Nicolas Deleau, Émilie Guitard, Élodie et Delphine Chevalme, réalisé par Luisa Arango, à lire ci-dessous ; le deuxième avec Christian Seignobos, conduit par Émilie Guitard

Appréhender les relations à la nature en Afrique par le dessin sur le terrain: Un entretien croisé entre Delphine et Élodie Chevalme, Émilie Guitard, Céline Lesourd et Nicolas Deleau, animé par Luisa Arango

International audiencePour ce numéro de la revue Sources sur les savoirs environnementaux et naturalistes en Afrique, nous avons voulu donner une place particulière à la collaboration entre chercheur·es en sciences sociales et artistes, et à la figure du·de la chercheur·e/dessinateur·trice. En effet, si ces échanges et ces figures fleurissent et se multiplient (Roussel et Guitard 2021), un questionnement demeure sur le statut et la légitimité des langages artistiques dans nos disciplines. Largement pensé dans les sciences sociales comme objet d’illustration et moyen de restitution ou de dissémination des résultats de la recherche, le dessin est aussi un réel outil d’investigation, un dispositif d’analyse, une source pour la réflexion et pour la production des connaissances, notamment dans les études sur la culture matérielle, l’architecture ou les relations à la nature justement. Au fil du temps, ou au bout d’une carrière scientifique, ces objets graphiques peuvent aussi devenir des archives qui témoignent des transformations environnementales et paysagères, mais également des changements dans les manières de voir et de penser la nature en Afrique.Aujourd’hui, de plus en plus de chercheur·e·s en sciences sociales revendiquent l’usage du dessin comme outil de l’enquête de terrain (pour renouveler l’observation et nouer de nouveaux modes d’interaction avec leurs interlocuteurs notamment) et comme instrument d’analyse (pour sa valeur heuristique et le brouillage qu’il permet entre cadres artistique et scientifique), dépassant ainsi sa seule valeur illustrative ou pédagogique. C’est à ce titre que nous présentons ici deux entretiens : le premier avec Céline Lesourd, Nicolas Deleau, Émilie Guitard, Élodie et Delphine Chevalme, réalisé par Luisa Arango, à lire ci-dessous ; le deuxième avec Christian Seignobos, conduit par Émilie Guitard