Evaluation of CNN architectures for gait recognition based on optical flow maps

This work targets people identification in video based on the way they walk (\ie gait) by using deep learning architectures. We explore the use of convolutional neural networks (CNN) for learning high-level descriptors from low-level motion features (\ie optical flow components). The low number of training samples for each subject and the use of a test set containing subjects different from the training ones makes the search of a good CNN architecture a challenging task.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tec

Molecular characterization and clinical impact of TMPRSS2-ERG rearrangement on prostate cancer: comparison between FISH and RT-PCR

Prostate cancer (PCa) is a very heterogeneous disease, and there are constraints in its current diagnosis. Serum PSA levels, digital rectal examination (DRE), and histopathologic analysis often drive to overdiagnosis and overtreatment. Since 2005, the presence of the genetic rearrangement between transmembrane-serine protease gene (TMPRSS2) and the erythroblast transformation-specific (ETS)member ERG (v-ets erythroblastosis virus E26 oncogene homolog avian) has been demonstrated in almost half of PCa cases. Both FISH and RT-PCR are useful tools for detecting these rearrangements, but very few comparatives between both techniques have been published. In this study, we included FFPE tumors from 294 PCa patients treated with radical prostatectomy with more than 5 years of followup.We constructed a total of 20 tissue microarrays in order to perform break-apart and tricolor probe FISH approaches that were compared with RT-PCR, showing a concordance of 80.6% ( P < 0.001). The presence of TMPRSS2-ERG rearrangement was observed in 56.6% of cases. No association between TMPRSS2-ERG status and clinicopathological parameters nor biochemical progression and clinical progression free survival was found. In conclusion, this study demonstrates that both FISH and RT-PCR are useful tools in the assessment of the TMPRSS2-ERG fusion gene status in PCa patients and that this genetic feature per se lacks prognostic value.This study has been funded by the Grants FIS PI06/01619 and PI10/01206 from the Instituto de Salud Carlos III, Madrid, ACOMP 12/029 from the Generalitat Valenciana, Valencia, and Astra Zeneca, Spain

Extracción de características en un esquema de recuperación de imágenes

En este trabajo se presentan dos módulos fundamentales dentro del esquema diseñado de recuperación de imágenes de una base de datos a partir del color y la forma de los objetos presentes en las escenas. De una parte, se diseña un nuevo método para la detección de fronteras en imágenes en color. Se muestra una aproximación al espacio perceptual (H,S,I) (un espacio de Escala de Cromaticidad Uniforme (UCS)) sobre el que se describen tanto sus propiedades como una métrica para trabajar en el mismo. De otra, se lleva a cabo un proceso de simplificación de la información tendente a formar una estructura gráfica en la que los píxeles de la imagen se agrupan entorno a regiones de color similar. Para ello se diseña un mecanismo de crecimiento de regiones en base a la información de gradiente proporcionada por el módulo detector de fronteras, así como un módulo de división de las mismas.Eje: Procesamiento distribuido y paralelo. Tratamiento de señalesRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Extracción de características en un esquema de recuperación de imágenes

En este trabajo se presentan dos módulos fundamentales dentro del esquema diseñado de recuperación de imágenes de una base de datos a partir del color y la forma de los objetos presentes en las escenas. De una parte, se diseña un nuevo método para la detección de fronteras en imágenes en color. Se muestra una aproximación al espacio perceptual (H,S,I) (un espacio de Escala de Cromaticidad Uniforme (UCS)) sobre el que se describen tanto sus propiedades como una métrica para trabajar en el mismo. De otra, se lleva a cabo un proceso de simplificación de la información tendente a formar una estructura gráfica en la que los píxeles de la imagen se agrupan entorno a regiones de color similar. Para ello se diseña un mecanismo de crecimiento de regiones en base a la información de gradiente proporcionada por el módulo detector de fronteras, así como un módulo de división de las mismas.Eje: Procesamiento distribuido y paralelo. Tratamiento de señalesRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Influence of the Quaternary Glacial Cycles and the Mountains on the Reticulations in the Subsection Willkommia of the Genus Centaurea

Late Neogene and Quaternary climatic oscillations have greatly shaped the genetic structure of the Mediterranean Basin flora, with mountain plant species tracking warm interglacials/cold glacials by means of altitudinal shifts instead of broad latitudinal ones. Such dynamics may have enhanced population divergence but also secondary contacts. In this paper, we use a case example of subsection Willkommia of Centaurea (comprising three narrowly distributed endemic species, Centaurea gadorensis, C. pulvinata, and C. sagredoi) to test for reticulate evolution and recurrent hybridizations between nearby populations. For this, we combine analyses of genetic diversity and structuring, gene flow and spatial correlation, and ecological niche modeling. Our results support the contention that the current genetic structure of the three species is the result of historical gene flow at sites of secondary contact during the glacial periods, followed by isolation after the retraction of populations to the middle-upper areas of the mountains during the interglacial periods. The extent and direction of the gene flow was determined largely by the location of the populations on mountainsides oriented toward the same valley or toward different valleys, suggesting the intermountain valleys as the areas where secondary contacts occurred

Effect of thermal processing on the profile of bioactive compounds and antioxidant capacity of fermented orange juice

Previously, we reported that alcoholic fermentation enhanced flavanones and carotenoids content of orange juice. The aim of this work was to evaluate the influence of pasteurization on the qualitative and quantitative profile of bioactive compounds and the antioxidant capacity of fermented orange juice. Ascorbic acid (203 mg/L), total flavanones (647 mg/L), total carotenoids (7.07 mg/L) and provitamin A (90.06 RAEs/L) values of pasteurized orange beverage were lower than those of fermented juice. Total phenolic remained unchanged (585 mg/L) and was similar to that of original juice. The flavanones naringenin-7-O-glucoside, naringenin-7-O-rutinoside, hesperetin-7-O-rutinoside, hesperetin-7-O-glucoside and isosakuranetin-7-O-rutinoside, and the carotenoids karpoxanthin and isomer, neochrome, lutein, ζ-carotene, zeaxanthin, mutatoxanthin epimers, β-cryptoxanthin and auroxanthin epimers were the major compounds. Pasteurization produced a decrease in antioxidant capacity of fermented juice. However, TEAC (5.45 mM) and ORAC (6353 μM) values of orange beverage were similar to those of original orange juice. The novel orange beverage could be a valuable source of bioactive compounds with antioxidant capacity and exert potential beneficial effects.We are grateful for the support of Junta de Andalucía (Projects P09-AGR4814M, P08-AGR-03477 and Grupo PAI BIO311), and of National Funding Agencies (Projects AGL2010-14850/ALI, AGL2011-23690, CSD007-0063 and CSIC 201170E041). We are also grateful to Fundación Séneca - CARM “Group of Excellence in Research” 04486/GERM/06. The research project grant of B.E.-L. is supported by Junta de Andalucía. A.G.-I., F.F. and S.M. are members of the CORNUCOPIA Network 112RT0460 and D.H.-M. of the IBERCAROT Network 112RT0445 financed by CYTED. We are also grateful to Grupo Hespérides Biotech S.L. for providing the samples.Peer Reviewe

Hypersensitivity to Nonsteroidal Anti-inflammatory Drugs in Children and Adolescents: Cross-Intolerance Reactions.

Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't; Review;Nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) are used worldwide and are responsible for several types of drug hypersensitivity reactions (DHRs) in all age groups. The 2 major groups of DHRs to NSAIDs are those induced by immunological mechanisms (selective reactions) and those where inflammatory mediators are released through activation of the prostaglandin-leukotriene pathway without specific immunological recognition (cross-intolerance). In the present review, we focus on cross-intolerance reactions, which are the most frequent DHRs and are becoming a topic of major interest in children and adolescents. Paracetamol and ibuprofen are the drugs that most frequently cause DHRs in children; other NSAIDs are responsible for reactions in adolescents. In vivo and in vitro tests are of limited diagnostic value, with some exceptions for the less common selective reactions. In cross-intolerance, the clinical history and controlled administration are in many instances the only way to establish a diagnosis and look for alternatives. The clinical history is diagnostic when consistent symptoms occur repeatedly after exposure to NSAIDs with different chemical structures. Cutaneous and respiratory symptoms often co-occur in young children. The natural history of these reactions in children is unknown, and some patients can develop tolerance over time. Atopy remains a major risk factor for cross-intolerant reactions. The increasing interest in hypersensitivity to NSAIDs with improvements in patient phenotyping and the information provided by pharmacogenetics will improve our understanding and management of these reactions in the near future.The present study was supported by grants from the Carlos III National Health Institute RD12/0013 (RIRAAF Network), FIS PI12/02247, and FIS PI13/02598. It was also supported by Marie Curie (IAPP 7th Framework Program Mr. SymBioMath, no. 324554) and the Andalusian Public Health Service (PI-0279-2012 and PI-0463-2013).YesLos antiinflamatorios no esteroideos (AINEs) son ampliamente utilizados en todo el mundo y en todos los tramos de edad. Son responsables de un número importante de reacciones de hipersensibilidad a fármacos (RHFs), que no sólo afectan a adultos sino también a niños y adolescentes. Existen dos grandes grupos: reacciones selectivas, inducidas por mecanismos inmunológicos específicos, y de intolerancia cruzada (IC), donde se liberan mediadores inflamatorios en ausencia de reconocimiento inmunológico específico. En esta revisión nos ocuparemos de la IC, que es la causa más frecuente de RHFs y resulta de gran interés en niños y adolescentes. El paracetamol y el ibuprofeno son los medicamentos más frecuentemente implicados en las RHFs en niños. El uso diagnóstico de los tests in vivo e in vitro es muy limitado, con algunas excepciones en las reacciones selectivas. En las de IC, la historia clínica y la administración controlada son en ocasiones la única vía para confirmar el diagnóstico y determinar las alternativas terapéuticas más adecuadas. La historia clínica tiene valor diagnóstico cuando se reproducen síntomas consistentes repetidamente tras la exposición a AINEs no relacionados estructuralmente. En niños de corta edad es especialmente frecuente la combinación de síntomas cutáneos y respiratorios. Aunque se desconoce la historia natural de la IC en niños, es probable que se desarrolle tolerancia a lo largo de la vida. El fenotipado detallado junto con la información proporcionada por la fármaco-genética no sólo proporcionarán un conocimiento más preciso de la IC sino que también facilitará el manejo clínico de estos pacientes

Bacterias endófitas de tomate y su acción antagonista contra hongos fitopatógenos

El tomate es un alimento de alto valor nutricional e importancia económica, que es afectado por enfermedades provocadas por hongos, bacterias y virus. El objetivo del trabajo fue aislar bacterias endófitas y evaluar su capacidad para promover el crecimiento (BPCV) y/o la sanidad del tomate. A partir del macerado de semillas desinfectadas y de plántulas de tomate cultivadas en forma axénica, en tubos en Crone con agar y solución nutritiva, se obtuvo una colección de bacterias endófitas, que se caracterizaron molecularmente con BOX-PCR. Cada uno de los aislados con un patrón de bandas único se identificó inicialmente secuenciando un fragmento del ADNr 16S. Las secuencias se alinearon y compararon con las publicadas en la base de datos (NCBI). Se encontraron diversos géneros como Bacillus y Azotobacter, que se caracterizaron fisiológicamente en base a la producción de ácido indolacético y sideróforos y la capacidad de solubilizar fósforo. Además, se evaluó la acción antagonista de los aislados frente a Alternaria alternata, Corynespora cassiicola y Stemphylium lycopersici. Se concluye que el tomate contiene algunas bacterias endófitas que tienen capacidad para promover el crecimiento de las plantas y para bio-controlar patógenos, por lo tanto aparecen como bacterias con potencial para su uso en formulaciones como BPCV y/o agentes de control biológico

Generación de espacios para la integración, y aprovechamiento del tiempo libre, para mejorar la calidad de vida del adulto mayor del ancianato “Cándido Quintero” del municipio de Duitama.

Tablas, gráficos, anexosSe parte de una investigación a conciencia de material referente al tema para así tener un buen punto de partida y así saber en que forma se puede trabajar con los ancianos. Para conocer el entorno de la comunidad escogida (ancianato Candido Quintero de Duitama) se hace observación directa de las instalaciones del ancianato y de las personas en si, además de interactuar verbalmente con los ancianos y por supuesto con las personas que están a cargo de esta institución. Es así que se decide entonces entonces encausar gran parte del desarrollo de este proyecto en llevar a cabo actividades lúdicas que contribuyeran al esparcimiento y uso productivo del tiempo libre, mas aun cuando el diario vivir de los ancianos de este establecimiento es en resumen comer, dormir y permanecer en un patio enorme sin hacer nada durante todo el resto de día. Finalmente después de las actividades anteriores se tienen bases suficientes (no totales) para adoptar al proyecto unos objetivos claros y por supuesto unas recomendaciones a las personas que tengan acceso al escrito.This project begin with a hard investigation about ancient`s math for so have a good point of beginning and then know witch way can work with the ancients. For know the choosing community place (Ancianato Cándido Quintero de Duitama) make direct observation into the nursing home and too observe the people. Speak with the ancients. So decide then realize playful activities that help at recreation and productive using of free time, more still when the diary life of this ancients in this place is in summary: eat, sleep and stay all rest of day in a great courtyard without to do something productive, finally when the activities end, have sufficient bases (not absolute) for give concret objectives at project and recommendations at people that will have access at this writing

Efficacy of a strategy for implementing a guideline for the control of cardiovascular risk in a primary healthcare setting: the SIRVA2 study a controlled, blinded community intervention trial randomised by clusters

This work describes the methodology used to assess a strategy for implementing clinical practice guidelines (CPG) for cardiovascular risk control in a health area of Madrid