Framework para criação e manipulação de redes bayesianas em dispositivos móveis

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade Gama, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Biomédica, 2012.As redes bayesianas são ferramentas interessantes para construção de cenários em que seja necessário representar algum tipo de conhecimento. Elas são um modelo computacional probabilístico e podem ser utilizada como auxílio para a tomada de decisões. Dentre suas características, duas merecem destaque: a facilidade na computação das probabilidades e o fato de que permitem a visualização das variáveis aleatórias envolvidas através da utilização de um grafo direcional e acíclico. Isso faz com que seja possível o estabelecimento de relações do tipo causa e efeito entre as variáveis. Elas têm sido utilizadas em aplicações de diagnóstico e prognóstico envolvendo informações incompletas ou incertas. Esse trabalho teve como objeto de estudo a elaboração de um software genérico que permitisse a modelagem e manipulação de redes bayesianas. Desta forma ele apresenta o projeto e a implementação de um framework. São tratados os fundamentos sobre redes bayesianas e também são fornecidos alguns exemplos. Os mecanismos de propagação de evidencias são descritos, bem como algumas considerações sobre a modelagem de uma rede bayesiana. Para a elaboração desse estudo, foram usadas três formas distintas de pesquisa : exploratória, experimental e estudo de caso. Inicialmente a pesquisa exploratória foi responsável por fornecer as referências teóricas para o desenvolvimento do raciocínio. A pesquisa experimental, por sua vez, visava a reprodução dos mecanismos básicos das redes bayesianas. O estudo de caso permitiu uma análise qualitativa do software, o que permitiu dentre outras coisas, verificar se as estruturas propostas no framework estavam adequadas para a modelagem de redes. Além disso, foi possível observar se as evidências seriam propagadas na rede e se os estados do nodo seriam alterados. Como principal contribuição deste trabalho destaca-se a facilidade de reuso oferecida pela arquitetura proposta, que foi baseada no uso de padrões de projeto. O trabalho demostra o uso desta arquitetura por meio de um estudo de caso, onde uma rede, que representa um domínio inerente a engenharia biomédica, é modelada e implementada pelo framework. Essa aplicação é implementada em um dispositivo móvel do tipo tablet. Esses dispositivos oferecem mobilidade dentre outras funcionalidades que os tornam interessantes aos profissionais de área de saúde. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACTThe Bayesian networks are interesting tools for the construction of scenarios that must represent some type of knowledge. They are a computational model probabilistic and can be used as an aid to decision making. Among its characteristics, two deserve special mention: the ease of computing probabilities and the fact that allow viewing of the random variables involved through the use of a directional graph and out acyclic engine frequencies on. This makes it possible the establishment of relations of type cause and effect between the variables. They have been used in applications of diagnostic and prognostic information involving incomplete or uncertain. This work has as its object of study the preparation of a generic software to allow the modeling and manipulation of Bayesian networks. This way he presents the design and implementation of a framework. Treaties are the foundations on Bayesian networks and are also provided some examples. The mechanisms of the propagation of evidence are described, as well as some considerations on the modeling of a bayesian network. For the preparation of this study were used three distinct forms of search : exploratory, experimental and case study. Initially the exploratory research was responsible for providing the references theoretical for the development of reasoning. Experimental research, in turn, was aimed at the playback of the basic mechanisms of Bayesian networks. The case study has a qualitative analysis of software, which allowed among other things, check if the structures proposed in the framework were appropriate for modeling of networks. In addition, it was possible to observe if the evidence would be propagated on the network and the states of node would be changed. The software project is discussed and its implementation is presented through examples. As the main contribution of this work there can be emphasized the reuse easiness provided by the software architecture proposed in this work, which is based on project patterns. The work demonstrates the utilization of that architecture by means of a case study. Its use was done in an application where the domain is inherent to the biomedical engineering. This application is implemented in a mobile device of the tablet type. Those devices offer mobility among other functionalities that make them interesting to the professionals of the health field

Nitrofurazone and its nitroheterocyclic analogues: a study of the electrochemical behavior in aqueous medium

The biological action of drugs with potential antichagasic activities can be better understood by knowing their reduction mechanism. For this proposal, the electrochemical reduction of nitrofurazone (NF) and its analogues, nitrofurfurilidene thiosemicarbazone (NFS), nitrothiophene semicarbazone (NT), nitrothiophene thiosemicarbazone (NTS), was studied by differential pulse and cyclic voltammetries and chronoamperometry in aqueous medium by using a glassy carbon electrode. Those three synthetic analogues have oxygen and sulfur atoms arranged between the nitroheterocyclic ring (furan and thiophene, respectively) and the carbonyl group (semicarbazone and thiosemicarbazone, respectively). The respective hydroxylamine derivatives are the main products formed in acidic medium, being its formation linearly pH dependent. Although chronoamperometric data show that this reduction involves 4 electrons, its corresponding reduction voltammetric wave, in alkaline medium, is unfolded and a reversible reduction peak at a more positive potential appears. This peak is characterized as a nitro anion radical formation, whose decay is caused by a disproportionation reaction. Its kinetic stability was studied by the current ratio values of the R - NO2/R - NO2•- redox couple and the second-order constant (k2) was determined, being NTS the analogue that registered the highest stability.A compreensão do mecanismo de redução de compostos com potencial atividade antichagásica pode contribuir para o melhor entendimento de sua ação biológica. Com este objetivo, a redução eletroquímica de nitrofural (nitrofurazona, NF) e seus análogos, nitrofurfurilideno tiossemicarbazona (NFS), nitrotiofeno semicarbazona (NT), nitrotiofeno tiossemicarbazona (NTS), foi estudada pelas voltametrias de pulso diferencial, cíclica e cronoamperometria em meio aquoso, utilizando eletrodo de carbono vítreo. Esses três análogos sintéticos apresentam átomos de oxigênio e de enxofre distribuídos no anel heterocíclico (furano e tiofeno, respectivamente) e no grupo carbonila (semicarbazona e tiossemicarbazona, respectivamente). A hidroxilamina é o principal produto formado em meio ácido, sendo sua formação linearmente dependente do pH. A cronoamperometria mostrou que esta redução envolve 4 elétrons. Entretanto, em meio alcalino, esta onda de redução é desdobrada e um pico reversível a potencial mais positivo foi registrado, correspondendo à formação nitro ânion radical. O nitro ânion radical sofre desproporcionamento e sua estabilidade cinética foi avaliada aplicando a razão de corrente correspondente ao par reversível R - NO2/R - NO2•- e as constantes de segunda ordem (k2) foram determinadas. A partir dos valores de k2 observou-se que o análogo NTS registrou a maior estabilidade.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Universidade de São Paulo Faculdade de Ciências Farmacêuticas Departmento de FarmáciaUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Departmento de Ciências Exatas e da TerraUNIFESP, Departmento de Ciências Exatas e da TerraProc. 2011/11499-0SciEL

Chemical investigation and anatomical aspects of wood residues from Hymenaea courbaril L, Platymiscium ulei Harms, Hymenolobium petraeum Ducke

In recent years, the interest in the propagation of native forest species has intensified with the aim of recovering degraded areas and the restoration of the landscape. As such, some species of Fabaceae are considered promising woody species for planting in reforestation programs and agroforestry systems. In the present paper, the authors complement the need for studies related to secondary metabolites of the woody species Hymenaea courbaril L. Platymiscium ulei Harms and Hymenolobium petraeum Ducke. Thus, the phytochemical study of H. courbaril led to the isolation and identification of diterpenes eperuic acid (1) and methyl eperuate (2); triterpenes oleanolic acid (3) and hederagenin (8); flavonoides quercetin (4), fisetinediol (5), liquiritigenin (6) and 3-methoxy-5,7,3\u27,5\u27-tetrahydroxyflavanonol (7). P. ulei gave pterocarpane homopterocarpin (9) and coumarin scoparone (10); H. petraeum gave isoflavan sativan (11), in addition to the amino acid tyrosine (12). Flavonoids were the predominant constituents in the three species of Fabaceae; however, the presence of isoflavonoids in Platymiscium ulei and Hymenolobium petraeum is probably associated with the resistance of this high density wood to pathogenic fungi

Análise de eficiência na utilização dos fatores de produção agropecuária na região Centro-Oeste do Brasil

O presente estudo objetivou avaliar a eficiência técnica e os níveis de produtividade da agropecuária da região Centro-Oeste através da estimativa de fronteira estocástica de produção com base nos dados do Censo Agropecuário de 2017. Deste modo, foi possível identificar as subregiões e municípios com maior produtividade agrícola. Os resultados obtidos evidenciaram a baixa produtividade da terra no Centro-Oeste brasileiro, bem como a alta produtividade do fator trabalho. As análises mostram ainda que proporção em que os fatores de produção estão sendo alocados no setor agropecuário do Centro-Oeste está inadequada, pois o capital está sendo utilizado em quantidade demasiadamente alta frente ao uso dos demais fatores, sendo a tecnologia caracterizada pelo uso extensivo de capital, o que faz com que sua produtividade seja baixa. Espera-se que esta análise possa ser útil principalmente no campo de formulação de políticas públicas voltadas para o aprimoramento das atividades agropecuárias em perspectivas regionais

Lung Cancer and the COVID-19 pandemic: Recommendations from the Brazilian Thoracic Oncology Group

New cases of the novel coronavirus disease 2019 (COVID-19), also known as severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), continue to rise worldwide following the declaration of a pandemic by the World Health Organization (WHO). The current pandemic has completely altered the workflow of health services worldwide. However, even during this critical period, patients with other diseases, like cancer, need to be properly treated. A few reports have shown that mortality due to SARS-CoV-2 is higher in elderly patients and those with other active comorbidities, including cancer. Patients with lung cancer are at risk of pulmonary complications from COVID-19, and as such, the risk/benefit ratio of local and systemic anticancer treatment has to be considered. For each patient, several factors, including age, comorbidities, and immunosuppression, as well as the number of hospital visits for treatment, can influence this risk. The number of cases is rising exponentially in Brazil, and it is important to consider the local characteristics when approaching the pandemic. In this regard, the Brazilian Thoracic Oncology Group has developed recommendations to guide decisions in lung cancer treatment during the SARS-CoV-2 pandemic. Due to the scarcity of relevant data, discussions based on disease stage, evaluation of surgical treatment, radiotherapy techniques, systemic therapy, follow-up, and supportive care were carried out, and specific suggestions issued. All recommendations seek to reduce contagion risk by decreasing the number of medical visits and hospitalization, and in the case of immunosuppression, by adapting treatment schemes when possible. This statement should be adjusted according to the reality of each service, and can be revised as new data become available

EFEITO DA CLOREXIDINA E SATURAÇÃO DA DENTINA POR ETANOL NA RESISTÊNCIA DE UNIÃO ADESIVA

Introdução: Especula-se que a degradação que ocorre na interface adesiva dentina/resina composta seja resultante da degradaçãohidrolítica de seus componentes resinosos, e degradação do substrato dentinário desmineralizado associada a deficientepenetração do material adesivo e ação de metaloproteinases. Objetivo: Avaliar a influência da associação da aplicação prévia daclorexidina à técnica da saturação da dentina por etanol na resistência de união adesiva, por meio da análise do teste de microtração.Métodos: Foram avaliados 32 terceiros molares humanos, recém-extraídos, randomicamente divididos em quatro gruposexperimentais (n=8): de acordo com a técnica adesiva utilizada: Grupo 1 – técnica convencional de três passos (TCTP), Grupo 2 –clorexidina + TCTP, Grupo 3 – técnica da adesão úmida por etanol (TAUE), Grupo 4 – clorexidina + técnica da adesão úmida poretanol. Após o procedimento adesivo, os substratos dentinários foram restaurados com incrementos de 2mm de resina compostananoparticulada e fotopolimerizados por 40 segundos. Os corpos-de-prova foram seccionados em palitos com área de seção2 retangular de aproximadamente 0,9 mm e após 24h foram submetidos ao teste de microtração. Os dados foram analisados pormeio do teste ANOVA-1 fator e nível de significância de 5,0%. Resultados: As médias e desvios-padrão após 24h foram: G1 –43,24 (±11,95), G2 – 42,17 (±9,20), G3 – 33,54 (±9,90), G4 – 44,53 (±8,01). Nenhuma diferença significante foi encontrada entreas diferentes técnicas adesivas após 24h de armazenamento (p > 0,05). Conclusão: A aplicação prévia da clorexidina em conjuntocom a saturação da dentina por etanol não alterou a resistência de união imediata do sistema adesivo utilizado.Palavras-chave: Adesão úmida por etanol. Clorexidina. Adesivos dentinários. Resistência de União

Sexagem de embriões bovinos fecundados in vitro pela técnica de PCR multiplex

Neste trabalho, a técnica de PCR ("polymerase chain reaction") foi utilizada para a sexagem de 92 embriões bovinos fertilizados in vitro. Os embriões originaram-se de fertilização in vitro de oócitos aspirados de ovários de fêmeas bovinas, provenientes de abatedouros comerciais. Os oócitos foram maturados, fertilizados e cultivados até o estádio de blastocisto. Os embriões foram lavados em solução de PBS, transferidos para tubos de polipropileno contendo água ultrapura, e imediatamente congelados a -196ºC. Os embriões foram descongelados sobre isopor contendo gelo picado e tratados com proteinase K. Para a reação de PCR, utilizaram-se alíquotas de 34 µl de cada tudo, onde foram acrescidos dois pares de primers, seqüência BC1.2 e seqüência satélite 1.715, desoxinucleotídeos, MgCl2, tampão PCR 10X, TaqDNA polimerase e água, em um volume final de 50 µl. As amostras foram amplificadas e a eletroforese realizada em gel de poliacrilamida a 8%. Os géis foram corados com solução de brometo de etídio e analisados em transiluminador de luz ultravioleta. Um índice de 93,47% de amplificação foi atingido, com 41 embriões (47,67%) machos e 45 (52,32%) embriões fêmeas. O uso de gel de poliacrilamida a 8% foi eficaz na separação de fragmentos de DNA muito próximos.In the present study the polymerase chain reaction (PCR) was used for sexing ninety-two in vitro fertilized bovine embryos. The embryos were obtained after in vitro fertilization of oocytes from slaughterhouses. The oocytes were matured, fertilized, and cultured until the blastocyst stage. The embryos were washed in PBS solution, and transferred to polypropylene tubes with containing ultrapure water and immediately frozen at -196ºC. The embryos were thawed on ice and treated with proteinase K. For the PCR reaction, aliquots of 34 µl from each tube were mixed to the primers BC1.2 and microsatellite sequence 1715, dNTPs, MgCl2, 10X PCR buffer, Taq DNA polymerase and water in a final volume of 50 µl. The samples were amplified and the PCR products separated by electrophoresis in a 8% polyacrylamide gel. The gels were stained in ethidium bromide solution and vizualized under UV-light. The amplification rate was 93.47%, with 41 (47.67%) male embryos and 45 (52.32%) female embryos. The use of 8% polyacrylamide gel was efficient for separating DNA fragments of very similar size

COMPOSIÇÃO FLORÍSTICA DA ARBORIZAÇÃO URBANA DE ANALÂNDIA/SP, BRASIL

O bem-estar e o conforto da população em uma cidade são positivamente afetados com a presença de arborização nas vias públicas. Assim, visto que, os estudos sobre arborização urbana são recentes no Brasil e, o município de Analândia apresenta potencial de conservação ambiental, o objetivo desse trabalho foi quantificar a arborização urbana de Analândia (SP) contribuindo para um plano de arborização e melhoria da cidade. Logo, foi realizado um levantamento censitário da arborização urbana em todas as ruas e avenidas do município de Analândia, com o objetivo de conhecer a composição florística, identificar a origem das espécies e detectar possíveis espécies ameaçadas de extinção. Este estudo foi realizado no período de setembro de 2017 a novembro de 2017. Foram amostradas 1.541 árvores distribuídas em 57 espécies pertencentes a 22 famílias. Do total de espécies, quatro estão referidas na Lista Vermelha da IUCN como tendo algum grau de ameaça. A maioria dos indivíduos (52,76%) e das espécies (42,86%) são nativas do Brasil. O índice de Shannon Wiener (H') foi de 3,19, valor alto se comparado a outros municípios do Brasil. Uma grande variedade de espécies foi observada, havendo dominância de poucas espécies na arborização urbana de Analândia

Hippocampal Astrocytes in Migrating and Wintering Semipalmated Sandpiper

Seasonal migratory birds return to the same breeding and wintering grounds year after year, and migratory long-distance shorebirds are good examples of this. These tasks require learning and long-term spatial memory abilities that are integrated into a navigational system for repeatedly locating breeding, wintering, and stopover sites. Previous investigations focused on the neurobiological basis of hippocampal plasticity and numerical estimates of hippocampal neurogenesis in birds but only a few studies investigated potential contributions of glial cells to hippocampal-dependent tasks related to migration. Here we hypothesized that the astrocytes of migrating and wintering birds may exhibit significant morphological and numerical differences connected to the long-distance flight. We used as a model the semipalmated sandpipe

Perfil proteômico hipocampal em epilepsia do lobo temporal

In this study we used proteomics approaches to obtain the protein profile of human epileptic hippocampi (N=6) and control hippocampi obtained from autopsy (N=6). We used two-dimensional gel electrophoresis (2-D) coupled to HPLC and Mass spectroscopy (MALDI-TOF) to identify proteins differentially expressed. Nine proteins were differentially expressed comparing the hippocampus of patients with the hippocampus of control. Proteins that were increased in the hippocampus of patients with TLE were: isoform 1 of serum albumin, HSP 70, dihydropyrimidinase-related protein 2, isoform 1 of myelin basic protein, proton ATPase catalytic subunit A, and dihydrolipoyllysine-residue acethyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex. The expression of isoform 3 of spectrin alpha chain (fodrin) was down-regulated while the proteins glutathione S-transferase P and the DJ-1 (PARK7) were detected only in the hippocampus of patients with TLE. Taken together, our results provide evidence supporting a direct link between metabolic disturb and oxidative damage related to pathophysiology of TLE. Besides, indicates biomarkers for further investigations as therapies targeted to epilepsy.No presente estudo empregou-se o método de proteômica para obter a expressão diferencial de proteínas em hipocampo de pacientes com epilepsia do lobo temporal (ELT) (N=6) comparado a hipocampos controle obtidos por meio de autópsia (N=6). O estudo foi feito por meio de eletroforese bidimensional, acoplada a HPLC e espectroscopia de massa. As proteínas que tiveram expressão aumentada no hipocampo de pacientes com ELT foram: isoforma-1 da soroalbumina, HSP70, diidropirimidinase-2, isoforma-1 da proteína básica da mielina, subunidade catalítica A da próton ATPase, glutationa S-transferase P, proteína DJ-1 (PARK7), e resíduo diidropolilisina do componente acetil-transferase do complexo da piruvato desidrogenase. A expressão da isoforma-3 da cadeia alfa da espectrina (fodrina) foi menor no hipocampo de pacientes com epilepsia do lobo temporal e as proteínas glutationa S-transferase P e PARK7 foram detectadas somente no tecido epiléptico. Assim, nossos resultados trazem evidencias sobre a direta relação entre distúrbio metabólico e dano oxidativo na patofisiologia da ELT. Além disto, o estudo indica biomarcadores para futuras investigações como alvos terapêuticos para epilepsia.UNIFESP Departamento de Neurologia e NeurocirurgiaUNIFESP Departamento de Microbiologia, Imunologia e ParasitologiaFaculdade de Medicina da Universidade de São Paulo Instituto do Coração Departamento de Anatomia PatológicaUNIFESP, Depto. de Neurologia e NeurocirurgiaUNIFESP, Depto. de Microbiologia, Imunologia e ParasitologiaSciEL