De novo transcriptome sequencing and SSR markers development for Cedrela balansae C. DC., a native tree species of northwest Argentina

The endangered Cedrela balansae C.DC. (Meliaceae) is a high-value timber species with great potential for forest plantations that inhabits the tropical forests in Northwestern Argentina. Research on this species is scarce because of the limited genetic and genomic information available. Here, we explored the transcriptome of C. balansae using 454 GS FLX Titanium next-generation sequencing (NGS) technology. Following de novo assembling, we identified 27,111 non-redundant unigenes longer than 200 bp, and considered these transcripts for further downstream analysis. The functional annotation was performed searching the 27,111 unigenes against the NR-Protein and the Interproscan databases. This analysis revealed 26,977 genes with homology in at least one of the Database analyzed. Furthermore, 7,774 unigenes in 142 different active biological pathways in C. balansae were identified with the KEGG database. Moreover, after in silico analyses, we detected 2,663 simple sequence repeats (SSRs) markers. A subset of 70 SSRs related to important “stress tolerance” traits based on functional annotation evidence, were selected for wet PCR-validation in C. balansae and other Cedrela species inhabiting in northwest and northeast of Argentina (C. fissilis, C. saltensis and C. angustifolia). Successful transferability was between 77% and 93% and thanks to this study, 32 polymorphic functional SSRs for all analyzed Cedrela species are now available. The gene catalog and molecular markers obtained here represent a starting point for further research, which will assist genetic breeding programs in the Cedrela genus and will contribute to identifying key populations for its preservation.Fil: Torales, Susana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Rivarola, Maximo Lisandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Gonzalez, Sergio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Inza, María Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Pomponio, María Florencia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Fernández, Paula. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Acuña, Cintia Vanesa. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Zelener, Noga. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Fornes, Luis Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero; ArgentinaFil: Hopp, Horacio Esteban. Universidad de Belgrano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Marcucci Poltri, Susana Noemí. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentin

Sub Programa Cedrella

El Subprograma Cedrela del PROMEF se inició en el año 2010, con el fin de consolidar y dar continuidad al proyecto nacional de Domesticación de especies nativas de alto valor de las Selvas Subtropicales que conducía el INTA desde el año 2006, dirigido a llevar a cultivo especies forestales de alto valor socioeconómico de las Selvas, para incrementar la producción de maderas nobles y recuperar áreas degradadas a fin de mantener la función productiva del bosque y de sus servicios ambientales. El objetivo general del Subprograma Cedrela fue el de proveer a las regiones NOA y NEA de materiales de propagación mejorados de especies nativas emblemáticas ,adaptados a diferentes condiciones ecológicas y finalidades. Las especies más estudiadas hasta el presente son Cedrela angustifolia, C. balansa e y C. fissilis. Sin embargo, la existencia de más de 40 especies maderables/ha promovió la realización de encuestas de opinión para que el sector foresto-industrial definiera las que ingresarían al proceso de domesticación, ya que se requiere de un lapso extendido de tiempo y de un presupuesto considerable para desarrollar los estudios necesarios. En consecuencia, se generaron alianzas estratégicas con Universidades, la Administración de Parques Nacionales (APN), organismos provinciales y empresas. Posteriormente, se fueron incluyendo actividades para Cordia trichotoma y Araucaria angustifolia. El punto de partida fue la caracterización del material genético desde un enfoque poblacional para definir las estrategias de mejora genética y de conservación, dado que se trata mayormente de especies amenazadas. A partir de esta información y con la asistencia de herramientas moleculares se conformaron las poblaciones de mejora, incluyendo materiales con potencial productivo, plasticidad ante el estrés hídrico y térmico y diversidad genética suficiente. Esto permitió la instalación de huertos semilleros clonales y la ubicación de rodales semilleros para afrontar la demanda actual de semillas para los planes de producción sustentable y conservación (ley nacional 26.432 y ley nacional 26.331), así como el establecimiento de ensayos de orígenes y progenies para dar continuidad al programa de mejora, realizar observaciones fenológicas y asegurar la conservación ex situ-in vivo de numerosos genotipos que ya no existen en la naturaleza. Por otro lado, se evaluaron diferentes alternativas de conducción de plantaciones y manejo de vivero para mejorar la sobrevivencia a campo, incluyendo el control de la plaga Hypsipyla grandella. Por último, se realizaron actividades de transferencia de los resultados por diferentes vías de comunicación, poniendo énfasis en el sector productivo ya que reúne a los beneficiarios directos de esta propuesta. Asimismo, se capacitaron recursos humanos para fortalecer los grupos relacionados al uso y conservación de especies forestales nativas.Fil: Fornes, Luis Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Zelener, Noga. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Gauchat, M. Elena. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Inza, M. Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Soldati, María Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Ruíz, Veronica. No especifíca;Fil: Meloni, Diego Ariel. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Ciencias Forestales; ArgentinaFil: Grignola, Josefina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Barth, Sara Regina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Ledesma, Tilda. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Salta-jujuy. Estacion Experimental Agropecuaria Yuto.; ArgentinaFil: Tapia, Silvia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Salta-jujuy. Estacion Experimental Agropecuaria Yuto.; ArgentinaFil: Tarnowski, Christian. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Salta-jujuy. Estacion Experimental Agropecuaria Yuto.; ArgentinaFil: Eskiviski, Edgar Rafael. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Figueredo, Iris. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: González, Paola. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Leiva, Nidia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Rodríguez, Gustavo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Alarcon, Pamela. No especifíca;Fil: Cuello, Roberto. No especifíca;Fil: Gatto, Miguel. No especifíca;Fil: Rotundo, Cristian Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Giannoni, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Alonso, Fernando M.. No especifíca;Fil: Saravia, Pablo Federico. No especifíca;Fil: Trápani, Adrián Ignacio. No especifíca

Antes había muchas

La Araucaria angustifolia, también conocida como pino Paraná, es una especie arbórea nativa de la República Argentina y del sur de Brasil. Se estima que la distribución natural de la especie originalmente ocupaba una superficie de 20 millones de hectáreas, desarrollándose principalmente en los estados del sur y sudeste de Brasil y una pequeña porción en la región noreste de la provincia de Misiones en Argentina. Actualmente es posible encontrar bosques nativos de araucaria solo en el 3 % de su superficie original debido a que la especie fue sometida a una intensa explotación forestal y al reemplazo o desmonte para la realización de actividades agrícolas. A principios del siglo XX existían en Argentina exuberantes bosques de esta especie, según lo relatado por naturalistas y geógrafos que describieron la región, de manera que la explotación de su madera fue una de las principales actividades económicas de la región. Como consecuencia, la especie sufrió una rápida disminución de su superficie quedando restringida a fragmentos de bosques pequeños y aislados o en muchos casos a solo individuos aislados que van muriendo lentamente. Esta disminución de la población de la especie, tanto en Brasil como en Argentina, sumada a la escasa regeneración natural que se observa en los bosques hizo que su situación de conservación sea clasificada como "en peligro crítico" por parte de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN). Esta categoría quiere decir que la Araucaria angustifolia tiene un serio riesgo de desaparecer de la naturaleza para posteriormente, extinguirse del planeta.Fil: Pinazo, Martín Alcides. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; ArgentinaFil: Inza, María Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; ArgentinaFil: Latorre, Fabiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; ArgentinaFil: Rotundo, Cristian Andrés. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Molecular evidence of hybrid zones of Cedrela (Meliaceae) in the Yungas of Northwestern Argentina

In the Yungas of Northwestern Argentina, three endangered species of Cedrela (C. angustifolia, C. saltensis, and C. balansae) follow altitudinal gradients of distribution with contact zones between them. We sampled 210 individuals from 20 populations that spanned most of Cedrela’s geographical range in the Yungas, and used Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) markers and DNA sequences of the nuclear Internal Transcribed Spacer (ITS) to investigate hybrid zones. Data analyses employed an array of complementary methods, including principal coordinate analyses, Bayesian clustering analyses, maximum likelihood tree-building, and network techniques. Both nuclear molecular systems – AFLP and ITS – provided insights into the evolutionary history of Cedrela in the Yungas in a congruent manner. We uncovered strong support for the occurrence of natural hybridization between C. balansae and C. saltensis. Additionally, we identified hybrid zones in areas of sympatry (at both the Calilegua National Park and the San Andrés farm) and in transition zones from 820 to 1100 meters above sea level (localities of Pintascayo and Acambuco). There was no evidence for hybridization of either C. balansae or C. saltensis with C. angustifolia. The role of hybrid populations in conservation and use of genetic resources in the Yungas were discussed.Fil: Zelener, Noga. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Tosto, Daniela Sandra. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: de Oliveira, Luiz Orlando. Universidade Federal de Viçosa; BrasilFil: Soldati, María Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Inza, María Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Fornes, Luis Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentin

Genetic and morphological diversity and population structure of a polyploid complex of Mimosa (Leguminosae)

Evolutionary processes in plants such as hybridization and polyploidy are relevant to speciation and little studied in subtropical South America. In subtropical South America, the genus Mimosa is highly diverse, comprising 30% of polyploid species. The origin and genetic and morphological structure of polyploids in Mimosa are only very recently investigated, as well as their relevance to speciation, morphological variation, and distribution. Mimosa subser. Dolentes–Brevipedes, a taxonomic complex from that region, exhibits polyploidy, with specific and infraspecific taxa confusedly circumscribed. Studies of its population biology would facilitate the elucidation of evolutionary processes in Mimosa and resolution of taxonomic conflicts. We performed a multidisciplinary study of this complex, analysing seven populations and 87 individuals by means of morphometry, and AFLP fingerprinting throughout its area of distribution. Five populations included several taxa and intermediate individuals. Morphometric analyses revealed three clusters, distinguished mainly by leaf morphology and inflorescence. One population was tetraploid, one was tetraploid/octoploid and the rest octoploid. Genetic differentiation was high (PhiPT = 0.277) and expected heterozygosity was moderate (He = 0.190; H = 0.271). Multivariate molecular analyses revealed genetic divergence between highland and lowland grasslands. Structural genetic analyses revealed three clusters: two mixed, distinctly predominant in lowland/highland grasslands; another, exclusively from Mercedes. Molecular analysis of variance showed significant differences between highland/lowland grasslands and cytotypes. Cytotypes and populations differed partially by morphology. Tetraploids were morphologically similar to the sympatric octoploids, showing similar genetic structure and gene flow; furthermore, tetraploids are involved in origin of these higher polyploids. The systematics of this complex requires revision: subseries Dolentes and some Brevipedes species could be considered as one subseries. Admixture of genetic clusters and intermediates can be explained by hybridization and introgression. A marginal population differed from the others by morphology and genetics thus suggesting incipient speciation at the geographic edges of this complex.Fil: Morales, Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; Argentina. Universidad de Morón. Facultad de Agronomía y Ciencias Agroalimentarias; ArgentinaFil: Giannoni, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Inza, María Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Soldati, María Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Bessega, Cecilia Fabiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; ArgentinaFil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; ArgentinaFil: Zelener, Noga. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Fortunato, Renée Hersilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; Argentina. Universidad de Morón. Facultad de Agronomía y Ciencias Agroalimentarias; Argentin

Peteribí (Cordia trichotoma), Lapacho Rosado (Handroanthus impetiginosus), and Cebil Colorado (Anadenanthera colubrina var. cebil): Three Valuable Species with Incipient Breeding Programs

The development of forestry in Argentina has been based on the cultivation of fast-growing introduced species, mainly from the Pinus, Pseudotsuga, Eucalyptus, Populus, andSalix genera, for which both private companies and the National State through INTA, have developed high intensity genetic improvement programs. However, in the late 1990s, three complementary reasons gave impetus to the development of a domestication program at INTA: i) a certain social consensus (first international and finally national) on the importance of conserving and restoring natural forest ecosystems, ii) sympathy for native species per se, and iii) the baseline information that had been generated in previous years on the genetic resources of native forest species. Initial efforts were unstructured and responded to different projects with varying objectives, but finally a formal program started in 2006. In addition to INTA´s initiative to domesticate potentially productive native species using low-intensity breeding strategies (see Marcó and Llavallol 2016), efforts were also made by other institutions that had also started studying the genetic resources of forest species in Argentina. These actions make up the Argentine experience in the matter, at times systematic and well structured, and sometimes dispersed and with a varied level of depth. It is the intention of this book to summarize the most relevant experiences, trying to make visible the effort of many technicians and researchers who have managed to chart a path that, despite the years, has only just begun. The book is organized through the main forest ecosystems in Argentina. In each one, the advances referred to the knowledge of the genetic resources of the most studied species are presented, together with the implementation of actions for their domestication and genetic improvement. The most prominent results are reported, avoiding accounting for failures or low impact results. Towards the end of the book, we present the latest advances in the development of tools by means of high-throughput sequencing in native species of Argentina that will be the basis of the next technological generation for their genetic improvement. Finally, we conclude with essential considerations inherent in the planting of native species in the frame of climate change. We are addressing a wide and international public that seeks to know what has been achieved and what is being worked on in Argentina with respect to its native forest genetic resources. The interested reader should look for the most scientific details in the articles of the extensive list of bibliographic citations.Fil: Fornes, Luis Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Inza, María Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; ArgentinaFil: García, María Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; ArgentinaFil: Barrandeguy, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; ArgentinaFil: Soldati, María Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; ArgentinaFil: Barth, Sara Regina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Ledesma Guaraz, Tilda Teresa. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Salta-jujuy. Estacion Experimental Agropecuaria Yuto.; ArgentinaFil: Saravia, Pablo Federico. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Tarnowski, Christian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Mendoza-San Juan. Estación Experimental Agropecuaria La Consulta; ArgentinaFil: Rodríguez, Gustavo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Balducci, Ezequiel Diego. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Salta-jujuy. Estacion Experimental Agropecuaria Yuto.; ArgentinaFil: Grignola, Josefina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Schmid, Patricia Griselda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Galindez, Guadalupe. Universidad Nacional de Salta; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Trápani, Adrián Ignacio. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Agronomía y Zootecnia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán; Argentin

Application of High-Throughput Sequencing technologies in native forest tree species in Argentina: Implications for breeding

The high-throughput sequencing (HTS) or next-generation sequencing (NGS) technologies and associated bioinformatics tools have become a powerful approach for the development of entire genomes and transcriptomes, as well as molecular markers, on model and non-model organisms (Badenes et al. 2016). For non-model perennial trees, the HTS technologies provide a rapid way to access to genomic information crucial for breeding programs considering their long generation times and long intervals of breeding cycle (Badenes et al. 2016). This chapter aims to examine the state-of-the-art scientific knowledge on the application of HTS technologies on forest trees, particularly on genomic resources and marker development for Argentinean native species.Fil: Torales, Susana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: El Mutjar, Veronica. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Marcucci Poltri, Susana Noemí. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Pomponio, María Florencia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Soliani, Carolina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Villalba, Pamela Victoria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Estravis Barcala, Maximiliano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales. Universidad Nacional del Comahue. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales; ArgentinaFil: Klein, Lorena. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Chaco-formosa. Estacion Experimental Agropecuaria Saenz Peña.; ArgentinaFil: Garcia, Martín Nahuel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Pentreath, Vivien. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco"; ArgentinaFil: Inza, María Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Aguirre, Natalia Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Rivarola, Maximo Lisandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Acuña, Cintia Vanesa. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: González, Sergio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Amalfi, Sabrina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: López, Micaela. Instituto de Recursos Biologicos (irb) Inta Hurlingham; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; ArgentinaFil: Garnier Géré, Pauline. Instituto National de Recherches Agronomiques, Alimetation Et Environnement. Centre Nouvelle - Aquitaine Bordeaux; FranciaFil: Bellora, Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales. Universidad Nacional del Comahue. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales; ArgentinaFil: Arana, Verónica. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; Argentin