Molecular characterization of hepatitis B virus X gene in chronic hepatitis B patients

BACKGROUND: HBV-X protein is associated with the pathogenesis of HBV related diseases, specially in hepatocellular carcinomas of chronic patients. Genetic variability of the X gene includes genotypic specific variations and mutations emerging during chronic infection. Its coding sequence overlaps important regions for virus replication, including the basal core promoter. Differences in the X gene may have implications in biological functions of the protein and thus, affect the evolution of the disease. There are controversial results about the consequences of mutations in this region and their relationship with pathogenesis. The purpose of this work was to describe the diversity of HBV-X gene in chronic hepatitis patients infected with different genotypes, according to liver disease. METHODS: HBV-X gene was sequenced from chronic hepatitis B patient samples, analyzed by phylogeny and genotyped. Nucleotide and aminoacid diversity was determined calculating intragenetic distances. Mutations at 127, 130 and 131 aminoacids were considered in relation to liver disease. RESULTS: The most prevalent genotype detected in this cohort was F (F1 and F4), followed by D and A. Most of the samples corresponding to genotypes A and F1 were HBeAg(+) and for genotypes D and F4, HBeAg(−) samples were represented in a higher percentage. Intragenetic distance values were higher in HBeAg(−) than in positive samples for all genotypes, and lower in overlapped regions, compared to single codification ones. Nucleotide and aminoacid diversities were higher in HBeAg(−), than in HBeAg(+) samples. CONCLUSIONS: Independently of the infecting genotypes, mutations at any of 127, 130 and/or 131 aminoacid positions and HBeAg(−) status were associated with mild liver disease in this cohort

Cleantech insinöörikoulutuksessa

Cleantech-insinoorit -projekti on Lahden ammattikorkeakoulun tekniikan alan hallinnoima ja Hameen ELY-keskuksen osarahoittama Euroopan Sosiaalirahaston hanke, jonka tavoitteena on parantaa Paijat-Hameen cleantech-osaamista seka insinoorikoulutuksen tyoelamavastaavuutta. Projektin tavoitteena on tuottaa uudenlainen koulutuksen toimintamalli, joka luo aitoja edellytyksia cleantech-innovaatioiden syntymiselle seka uusille tuotteille ja palveluille ymparistoliiketoiminnan alueella. Uuden yhteistyo- ja toimintamallin kehittaminen tekniikan alan koulutukseen perustuu yhteistyohon yrityselaman ja muiden toimijoiden kanssa. Yhteistyota on toteutettu erilaisissa opiskelija- ja T&K-projekteissa, opinnaytetoissa, koulutuksissa, tyopajoissa, seminaareissa, opintomatkoilla ja benchmarkkaamalla erilaisia kaytantoja koti- ja ulkomailla. Uusi yhteistyo- ja toimintamalli kasittaa lisaksi CDIO-/PBL-pedagogiikkaan (CDIO = Conceive – Design – Implement – Operate- / PBL = Problem Based Learning) perustuvan oppimismallin tuomisen tekniikan alan koulutukseen perinteisten insinooritietojen ja -taitojen ohella seka cleantech-osaamisen sisallyttamisen opintosuunnitelmiin. Myos tyoelamalta saadut tiedot tyoelamaosaamisen osaamis- ja muista tarpeista sisallytetaan opintosuunnitelmiin. Lahden ammattikorkeakoulu haluaa osaltaan seka kehittaa insinoorikoulutusta vastaamaan alueen cleantech-yritysten osaamistarpeita etta osallistua alueen yritysten tuotteiden, palvelujen ja prosessien kehittamiseen. Cleantech-insinoorit -projektin tarkoituksena on tunnistaa puhtaan teknologian suunnittelemisessa ja hyodyntamisessa tarvittavia tietoja ja taitoja ja integroida ne insinoorien koulutukseen. Lahden ammattikorkeakoulun tekniikan alalla on viisi koulutusohjelmaa, joista jokaisen cleantech-tarpeita on projektissa tarkasteltu. Lisaksi projektissa selvitettiin olemassa olevan tiedon avulla cleantech-sektorin tarpeita. Cleantech-osaamisen koulutustarvekartoitus tehtiin syksylla 2011, josta tarkempi koulutussuunnitelma cleantech-osaamisen parantamiseksi Paijat-Hameessa valmistui joulukuussa 2011. Kartoituksen ja yritysten haastattelujen pohjalta projektissa toteutettiin cleantech-osaamisen parantamiseksi koulutuksia vuosina 2012 – 2013. Koulutukset pureutuivat ajankohtaisiin teemoihin, kuten vihreaan ICT:hen, energia- ja materiaalitehokkuuteen, kestaviin hankintoihin seka ajankohtaisiin lainsaadannon vaatimuksiin. Tassa artikkelikokoelmassa kerrotaan Lahden ammattikorkeakoulun tekniikan alan koulutusohjelmien toimenpiteista, joilla alueen ja insinoorikoulutuksen cleantech-osaamista ja tyoelamavastaavuutta on parannettu. Raportin suomenkielisessa osassa on tarkasteltu cleantech-liiketoiminnan globaaleja markkinoita ja tulevaisuuden nakymia seka Suomen ja Lahden seudun cleantech-osaamista ja osaamistarpeita. Materiaalitekniikan koulutusohjelman artikkeleissa on kasitelty opintosuunnitelman muutostyota, joka kasittaa myos cleantech-nakokulman ja CDIO- / PBL-pedagogiikan sisallyttamisen opintosuunnitelmaan. Mekatroniikan koulutusohjelman artikkelissa on kasitelty CDIO- / PBL-pedagogiikan lahestymistapaa ja toteutumista kone- ja tuotantotekniikan koulutusohjelmassa. Raportin englanninkielinen osuus kasittelee ymparistoteknologian koulutusohjelman opintosuunnitelman muutosta, joka sisaltaa myos englanninkielisen ylemman ammattikorkeakoulututkinnon. Lisaksi englanninkieliset artikkelit kasittelevat tietotekniikan koulutusohjelman cleantech-nakokulmaa Green ICT -moduuleissa