Improved serological detection of rheumatoid arthritis: a highly antigenic mimotope of carbonic anhydrase III selected in a murine model by phage display

© 2015 Araujo et al. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly credited. The Creative Commons Public Domain Dedication waiver (http:// creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/) applies to the data made available in this article, unless otherwise stated.Introduction: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic inflammatory autoimmune disease that affects around 1% of the human population worldwide. RA diagnosis can be difficult as there is no definitive test for its detection. Therefore, the aim of this study was to identify biomarkers that could be used for RA diagnosis. Methods: Sera from a collagen-induced arthritis mouse model were used to select potential biomarkers for RA diagnosis by phage display technology. In silico and in vitro analyses were performed to characterize and validate the selected peptides. Samples were classified into three groups: RA; two other immune-mediated rheumatic diseases (systemic lupus erythematosus (SLE) and ankylosing spondylitis (AS)); and healthy controls (HC). Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was carried out to determine antibody levels, and diagnostic parameters were determined by constructing receiver operating characteristic curves. Mass spectrometry and Western blot were performed to identify the putative autoantigen that was mimicked by a highly reactive mimotope. Results: After three rounds of selection, 14 clones were obtained and tested for immunoreactivity analysis against sera from RA and HC groups. The phage-fused peptide with the highest immunoreactivity (M12) was synthesized, and was able to efficiently discriminate RA patients from SLE, AS and HCs (p < 0.0001) by ELISA. The specificity and sensitivity of anti-M12 antibodies for RA diagnosis were 91 % and 84.3 %, respectively. The M12 peptide was identified as one that mimics a predicted antigenic site of the carbonic anhydrase III (CAIII) protein, a ubiquitous biomarker that has been identified in patients with other diseases. Conclusion: M12 is the first peptide associated with the CAIII protein that may be used as an antigen for antibody detection to aid in RA diagnosis with high sensitivity and specificity.This study was supported by the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Foundation, Ministry of Education of Brazil (CSF SDW-2027/13-5) and the Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Importância relativa das variáveis preditoras no processo de modelagem da produtividade florestal

Modeling forest growth and production is a major challenge for forest managers due to the large number of variables involved and the importance of the generated estimates for decision making in the forestry enterprise. Several statistical and artificial intelligence methods can be used to verify the importance of variables and their selection for the forest modeling process. This study demonstrates the use of the perturbation method in defining the relative importance of predictor variables (silvicultural, climatic and management) in predicting the productivity of eucalyptus stands at the end of the rotation. Data from 320 eucalyptus plantations located in the north of the State of Minas Gerais, aged over seven years, were used. Precipitation distributed at different ages and soil clay content were the most important variables for the prediction of volume at cutting age.A modelagem do crescimento e produção florestal é um grande desafio para os gestores florestais em função da grande quantidade de variáveis envolvidas e da importância das estimativas geradas para a tomada de decisão no empreendimento florestal. Diversos métodos estatísticos e de inteligência artificial podem ser utilizados visando a verificação da importância das variáveis e seleção das mesmas para o processo de modelagem florestal. Neste estudo é demostrado o uso do método de perturbação em modelos de Redes Neurais Artificiais na definição da importância relativa de variáveis preditoras (silviculturais, climáticas e de manejo) da produtividade de povoamentos de eucalipto ao final da rotação (produção florestal). Foram utilizados dados de 320 talhões de plantios de eucalipto localizados no norte do Estado de Minas Gerais, com idade superior a sete anos. A precipitação distribuída em diversas idades e o teor de argila do solo foram as variáveis de maior importância para a predição do volume na idade de corte

Predicting the Proteins of Angomonas deanei, Strigomonas culicis and Their Respective Endosymbionts Reveals New Aspects of the Trypanosomatidae Family

Endosymbiont-bearing trypanosomatids have been considered excellent models for the study of cell evolution because the host protozoan co-evolves with an intracellular bacterium in a mutualistic relationship. Such protozoa inhabit a single invertebrate host during their entire life cycle and exhibit special characteristics that group them in a particular phylogenetic cluster of the Trypanosomatidae family, thus classified as monoxenics. in an effort to better understand such symbiotic association, we used DNA pyrosequencing and a reference-guided assembly to generate reads that predicted 16,960 and 12,162 open reading frames (ORFs) in two symbiont-bearing trypanosomatids, Angomonas deanei (previously named as Crithidia deanei) and Strigomonas culicis (first known as Blastocrithidia culicis), respectively. Identification of each ORF was based primarily on TriTrypDB using tblastn, and each ORF was confirmed by employing getorf from EMBOSS and Newbler 2.6 when necessary. the monoxenic organisms revealed conserved housekeeping functions when compared to other trypanosomatids, especially compared with Leishmania major. However, major differences were found in ORFs corresponding to the cytoskeleton, the kinetoplast, and the paraflagellar structure. the monoxenic organisms also contain a large number of genes for cytosolic calpain-like and surface gp63 metalloproteases and a reduced number of compartmentalized cysteine proteases in comparison to other TriTryp organisms, reflecting adaptations to the presence of the symbiont. the assembled bacterial endosymbiont sequences exhibit a high A+T content with a total of 787 and 769 ORFs for the Angomonas deanei and Strigomonas culicis endosymbionts, respectively, and indicate that these organisms hold a common ancestor related to the Alcaligenaceae family. Importantly, both symbionts contain enzymes that complement essential host cell biosynthetic pathways, such as those for amino acid, lipid and purine/pyrimidine metabolism. These findings increase our understanding of the intricate symbiotic relationship between the bacterium and the trypanosomatid host and provide clues to better understand eukaryotic cell evolution.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)ERC AdG SISYPHEUniv Fed Rio de Janeiro, Inst Biofis Carlos Chagas Filho, Lab Ultraestrutura Celular Hertha Meyer, BR-21941 Rio de Janeiro, BrazilUniv Fed Rio de Janeiro, Inst Biofis Carlos Chagas Filho, Lab Metab Macromol Firmino Torres de Castro, BR-21941 Rio de Janeiro, BrazilLab Bioinformat, Lab Nacl Computacao Cient, Rio de Janeiro, BrazilINRIA Grenoble Rhone Alpes, BAMBOO Team, Villeurbanne, FranceUniv Lyon 1, CNRS, UMR5558, Lab Biometrie & Biol Evolut, F-69622 Villeurbanne, FranceUniv Estadual Campinas, Inst Biol, Dept Genet Evolucao & Bioagentes, São Paulo, BrazilUniv São Paulo, Fac Ciencias Farmaceut Ribeirao Preto, Dept Ciencias Farmaceut, São Paulo, BrazilLab Nacl Ciencia & Tecnol Bioetano, São Paulo, BrazilUniv Fed Minas Gerais, Inst Ciencias Biol, Dept Bioquim & Imunol, Belo Horizonte, MG, BrazilUniv Fed Goias, Inst Ciencias Biol, Mol Biol Lab, Goiania, Go, BrazilFundacao Oswaldo Cruz, Inst Carlos Chagas, Lab Biol Mol Tripanossomatideos, Curitiba, Parana, BrazilFundacao Oswaldo Cruz, Inst Carlos Chagas, Lab Genom Func, Curitiba, Parana, BrazilUniv Estadual Campinas, Ctr Pluridisciplinar Pesquisas Quim Biol & Agr, São Paulo, BrazilUniv Fed Minas Gerais, Inst Ciencias Biol, Dept Parasitol, Belo Horizonte, MG, BrazilUniv Fed Santa Catarina, Dept Microbiol Imunol & Parasitol, Ctr Ciencias Biol, Lab Protozool & Bioinformat, Florianopolis, SC, BrazilUniv Fed Vicosa, Dept Bioquim & Biol Mol, Ctr Ciencias Biol & Saude, Vicosa, MG, BrazilInst Butantan, Lab Especial Ciclo Celular, São Paulo, BrazilUniv São Paulo, Dept Biol, Fac Filosofia Ciencias & Letras Ribeirao Preto, São Paulo, BrazilUniversidade Federal de São Paulo, Escola Paulista Med, Dept Microbiol Imunol & Parasitol, São Paulo, BrazilUniversidade Federal de São Paulo, Escola Paulista Med, Dept Microbiol Imunol & Parasitol, São Paulo, BrazilWeb of Scienc

IMUNOTERAPIAS NO TRATAMENTO DA COVID-19

A COVID-19 é uma doença causada pelo novo coronavírus e se tornou-se ameaça mundial pouco tempo após seu surgimento na cidade chinesa de Wuhan. Desde Dezembro de 2019, diversas pesquisas estão sendo realizadas com o propósito de conter a disseminação do vírus e de se obter medidas de tratamento úteis no combate à pandemia. Com isso, o presente estudo volta-se para a análise das novas metodologias de caráter terapêutico que estão sendo desenvolvidas mundialmente para o tratamento e prevenção da COVID-19. A presente revisão bibliográfica foi realizada com os dados obtidos nas seguintes bases: SciELO, Medline, Scopus,&nbsp; Up-to-Date, dentre outros recursos atuais e relevantes para a temática, que foram publicados no primeiro trimestre do ano de 2020. Com esta abordagem foram identificadas diversas abordagens de tratamento ainda em desenvolvimento, com diferentes modelos, bem como mecanismo de ação de novas medidas terapêuticas e de imunização, sobretudo, as que utilizam soro, imunoglobulinas, anticorpos monoclonais, plasma de pacientes convalescentes e vacinas. O sistema de saúde mundial urge pela criação de uma vacina capaz de estabelecer a memória imunológica na população. Novos estudos mostram-se promissores em relação a essa criação, todavia, as medidas profiláticas permanecem como prioridade máxima e indispensáveis.&nbsp

Rarity of monodominance in hyperdiverse Amazonian forests.

Tropical forests are known for their high diversity. Yet, forest patches do occur in the tropics where a single tree species is dominant. Such "monodominant" forests are known from all of the main tropical regions. For Amazonia, we sampled the occurrence of monodominance in a massive, basin-wide database of forest-inventory plots from the Amazon Tree Diversity Network (ATDN). Utilizing a simple defining metric of at least half of the trees ≥ 10 cm diameter belonging to one species, we found only a few occurrences of monodominance in Amazonia, and the phenomenon was not significantly linked to previously hypothesized life history traits such wood density, seed mass, ectomycorrhizal associations, or Rhizobium nodulation. In our analysis, coppicing (the formation of sprouts at the base of the tree or on roots) was the only trait significantly linked to monodominance. While at specific locales coppicing or ectomycorrhizal associations may confer a considerable advantage to a tree species and lead to its monodominance, very few species have these traits. Mining of the ATDN dataset suggests that monodominance is quite rare in Amazonia, and may be linked primarily to edaphic factors

Adenoma pleomórfico da glândula submandibular: Pleomorphic adenoma of the submandibular gland

Introdução: O Adenoma Pleomórfico é o mais comum dentre os tumores benignos, desenvolvendo-se em áreas de tecido glandular, apesar de ser uma importante patologia glandular salivar, o acometimento da glândula submandibular não é o mais prevalente, e sim o da glândula parótida, o que acaba por negligenciar tal manifestação. Apresentação do Caso: Paciente com 38 anos, sexo feminino, melanoderma, procurou o serviço de otorrinolaringologia devido aparecimento de nódulo em região cervical há cerca de 04 anos, associado à limitação de movimento, com prejuízo estético há 02 meses. Nega dor. Ao exame físico local, evidenciou-se lesão nodular de consistência firme, unilocular.&nbsp; À análise histológica, evidenciou ausência de sinais de malignidade. Discussão: O Adenoma Pleomórfico tem crescimento lento, normalmente, perceptível previamente à consulta médica, de anos a meses, apresentando-se de forma muito semelhante a uma linfonodomegalia cervical, indolor e de consistência firme, podendo se manifestar em todas as idades, com predominância entre os 40 e 50 anos, sendo a excisão cirúrgica com margem de segurança seu tratamento de referência, na maioria das vezes, com um excelente prognóstico e baixo índice de recidivas. Conclusão: A evolução lenta é determinante para a percepção atrasada da lesão em questão, e consequentemente, para a necessidade de excisão cirúrgica, para que se tenha um bom prognóstico, além do aumento nas chances de malignização do tumor, o que torna necessário que haja uma maior exploração do tema ao longo da graduação médica, a fim de repercutir na otimização do diagnóstico e tratamento em níveis de saúde menos avançados e mais acessíveis à população em geral

Síndrome de Stickler: Stickler's Syndrome

INTRODUÇÃO: A Síndrome Stickler é uma colagenopatia, rara, hereditária e caráter autossômica dominante, sua incidência é de 1/7500 nascimentos. APRESENTAÇÃO CASO: GPS, sexo masculino, 5 anos, admitido no Hospital das Clínicas de Goiânia, portador de miopia importante e fissura palatina desde o nascimento, queixava-se de baixa acuidade visual há 3meses. Durante a inspeção, foram evidenciados face plana, maxilar curto, olhos proeminentes e pregas epicantais. DISCUSSÃO: A síndrome é caracterizada por um artro-oftalmopatia, ou seja, anormalidades esqueléticas, anomalias orofaciais, perda auditiva, osteoartrite prematura, perda neuro-sensorial,fenda palatina, miopatia grave e cegueira. É classificada de acordo com a mutação em Tipo I, II e III. CONCLUSÃO: Por se tratar de uma síndrome genética rara, é de difícil diagnóstico, necessita de uma análise fenotípica, um quadro clínico favorável e história familiar. Não existe um tratamento curativo. Portanto, quanto mais precoce seu diagnóstico, a intervenção será mais rápida e melhor será o prognóstico

Estimulação cerebral profunda na Doença de Parkinson: evidências de estudos de longa duração

A Doença de Parkinson (DP) é uma condição neurodegenerativa crônica que afeta principalmente idosos, mas pode ocorrer em adultos jovens. É a segunda doença neurodegenerativa mais comum, após o Alzheimer. A DP afeta 1% dos indivíduos acima de 60 anos em países industrializados. Sua causa envolve fatores genéticos e ambientais, como exposição a pesticidas e envelhecimento. A Estimulação Cerebral Profunda (DBS) é um tratamento que simula lesões cerebrais, melhorando sintomas motores e não motores. O presente estudo tem como objetivo analisar evidências de estudos sobre a eficácia da DBS no tratamento da DP. Trata-se de uma revisão sistemática de estudos quantitativos que utiliza as bases de dados PubMed (Medline), Cochrane Library e Scientific Electronic Library Online (SciELO) para selecionar artigos científicos. Os estudos incluídos abrangem o período de 2013 a 2023 e estão em inglês, abordando a DBS no tratamento da DP. A DBS melhora diversos sintomas motores e não motores, resultando em uma melhor qualidade de vida para os pacientes. Tais benefícios são sustentados mesmo em estágios avançados da Doença de Parkinson, a qual consiste em fornecer pulsos de corrente elétrica a áreas cerebrais profundas através de eletrodos implantados cirurgicamente, geralmente quando a terapia medicamentosa já não é eficaz. Em um estudo com 82 pacientes, a terapia com DBS resultou em uma redução de ± 52% nos sintomas motores do UPDRS sob medicação antes da cirurgia. A melhora nos sintomas motores com a estimulação, em comparação com a ausência de estimulação e medicação, foi de ± 61% no primeiro ano e ± 39% de 8 a 15 anos após a cirurgia (antes da reprogramação). A medicação foi reduzida em ± 55% após 1 ano e ± 44% após 8 a 15 anos, com a maioria dos pacientes mostrando melhorias após a reprogramação. De acordo com as literaturas analisadas, a DBS é uma terapia eficaz para a DP. Enfatiza-se a importância da inovação contínua e dos novos estudos para explorar as facetas não investigadas desse campo. Com a abordagem dos aspectos clínicos, cirúrgicos, tecnológicos e científicos, destacam-se os benefícios, limitações e desafios a serem superados. Ademais, inovações tecnológicas na DBS, como a estimulação direcional, adaptativa e a telemedicina estão sendo exploradas. Em suma, este artigo fornece evidências sobre os benefícios da DBS na DP, ressaltando a necessidade de pesquisas adicionais para otimizar tal intervenção terapêutica e melhorar a qualidade de vida dos pacientes