Identification and Secretion of Effectors From the <i>Pseudomonas syringae</i> Type III Secretion System

The hrp pathogenicity island (PAI) of Pseudomonas syringae encodes a type III secretion system (TTSS) that translocates virulence proteins, called effectors, into plant cells. The whole array of effectors of different P. syringae stains and their activities inside the host are not known. Furthermore, the manner in which effectors are selected for secretion, and how the process is regulated are not clear in P. syringae. This study identified a novel effector from P. syringae pv. syringae Psy61 using a genomic screen. The effector was a 375 aa protein of 40.5 kDa that was designated HopPsyL. A hopPsyL::kan mutant of Psy61 exhibited strongly reduced virulence in Phaseolus vulgaris cv. Kentucky Wonder, but did not appear to act as a defense response suppressor. The ectopically expressed gene reduced the virulence of P. syringae DC3000 transformants in Arabidopsis thaliana Col-0. HopPsyL appears to be a novel TTSS-dependent effector that functions as a host-species-specific virulence factor in Psy61. In addition, this study reports that TTSS-dependent effectors are subject to the proteolytic degradation by Lon that appears to be rate-limiting to secretion. TTSS-dependent secretion of these effectors could be detected from the Lon mutants. This study found that a primary role for chaperones in P. syringae appeared to be protection of effectors from Lon-mediated degradation prior to secretion. Distinct Lon-targeting and chaperone-binding domains were identified in at least one effector. The results imply that Lon is involved at two distinct levels in the regulation of the P. syringae TTSS: regulation of assembly of the secretion apparatus and modulation of effector secretion. Interestingly, degradation of P. syringae effectors was also retarded by the presence or expression of the P. syringae TTSS. The protection from Lon-mediated degradation was not due to the assembly of the TTSS. Rather, the results suggest the existence of a stabilizing factor harbored within the hrp cluster. This study proposed that this factor functions as a general chaperone for type III secretion in P. syringae

Estudio de factibilidad para la creación de un hemocentro regional en Pereira

Con este artículo se busca realizar un estudio de factibilidad para la creación de un hemocentro regional en Pereira, apoyado por los nuevos lineamientos del gobierno nacional sobre la estructura de los bancos de sangre, de modo que se pueda determinar si es no competitivo con las empresas que prestan estos servicios en el mercado regional, por lo tanto el análisis se realiza fundamentado en los planes de presupuesto. La utilidad del presente artículo radica en la aplicación de conceptos financieros para estudios de factibilidad y competitividad, sin dejar de considerar la responsabilidad social del Estado en el control de la comercialización de los hemoderivados.With this article one looks for to realise a feasibility study for the creation of hemocentro regional in Pereira, supported by the new lineamientos of the national government on the structure of the blood donation points, so that it is possible to be determined if he is noncompetitive with the companies that serve these in the regional market, therefore the analysis is realised based on the budget plans. The utility of the present article is in the application of financial concepts for feasibility studies and competitiveness, without stopping considering the social responsibility of the State in the control of the commercialization of the hemoderivados ones

La exclusión probatoria como protección de la legalidad

El Sistema Penal Acusatorio tiene como fundamento el respeto por el debido proceso y la garantía de los derechos fundamentales de los procesados, en contraposición de la potestad del estado para sancionar las conductas punibles y el derecho de las victimas a obtener justicia y reparación; lo anterior teniendo en cuenta que la recolección de los elementos materiales probatorios con violación de las garantías fundamentales o recolección de pruebas prohibidas o con violación de los procedimientos previamente establecidos en la ley, podría generar la nulidad de los procedimientos. Por lo anterior resulta de vital importancia el estudio de la aplicación de la Exclusión Probatoria y sus efectos jurídicos en el proceso penal en cuanto a las garantías de los diferentes sujetos procesales

Relación entre cohesión y liderazgo en equipos deportivos del Departamento de Boyacá-Colombia

La presente investigación tiene como objetivo determinar si existerelación entre la cohesión y el liderazgo en los deportistas de las ligas debaloncesto, fútbol sala, fútbol y voleibol del Departamento de Boyacá. Serealiza un muestreo incidental con la participación de 136 jugadores, conedades entre los 13 y 24 años, de género femenino y masculino adscritos alInstituto Departamental de Deportes de Boyacá (Indeportes Boyacá). Investigaciónde tipo correlacional con diseño transversal, utilizando el InstrumentoMultidimensional de Cohesión en el Deporte IMCODE (MultidimensionalSport Cohesion Instrument, MSCI) y la Escala de Evaluacióndel Liderazgo Deportivo (EELD), validados para la población objeto de estudio.Los resultados evidencian una relación entre las dimensiones calidadde trabajo-aspectos relativos a la ejecución (cohesión) y valores deportivos(liderazgo)

Straight-line conventional transient pressure analysis for horizontal wells with isolated zones

It is common in the oil industry to complete horizontal wells selectively. Even, this selection is performed naturally since reservoir heterogeneity may cause segmented well performance. Segmentation may be partially open to flux due to high skin factor or low permeability bands. They can be treated as a nonuniform skin distribution. A few models have been introduced to capture these special details. Existing interpretation methodologies use non-linear regression analysis and the TDS technique; but, there is an absence of equations for the conventional technique. In this study, the conventional methodology is developed for the analysis of pressure transient tests in horizontal wells with isolated zones so directional permeabilities and skin factors can be obtained. The developed expressions were tested successfully with several examples reported in the literature and compared to results from other sources

Genome Sequencing and Analysis of Yersina pestis KIM D27, an Avirulent Strain Exempt from Select Agent Regulation

Yersinia pestis is the causative agent of the plague. Y. pestis KIM 10+ strain was passaged and selected for loss of the 102 kb pgm locus, resulting in an attenuated strain, KIM D27. In this study, whole genome sequencing was performed on KIM D27 in order to identify any additional differences. Initial assemblies of 454 data were highly fragmented, and various bioinformatic tools detected between 15 and 465 SNPs and INDELs when comparing both strains, the vast majority associated with A or T homopolymer sequences. Consequently, Illumina sequencing was performed to improve the quality of the assembly. Hybrid sequence assemblies were performed and a total of 56 validated SNP/INDELs and 5 repeat differences were identified in the D27 strain relative to published KIM 10+ sequence. However, further analysis showed that 55 of these SNP/INDELs and 3 repeats were errors in the KIM 10+ reference sequence. We conclude that both 454 and Illumina sequencing were required to obtain the most accurate and rapid sequence results for Y. pestis KIMD27. SNP and INDELS calls were most accurate when both Newbler and CLC Genomics Workbench were employed. For purposes of obtaining high quality genome sequence differences between strains, any identified differences should be verified in both the new and reference genomes

Genome Sequencing and Analysis of <i>Yersina pestis</i> KIM D27, an Avirulent Strain Exempt from Select Agent Regulation

Yersinia pestis is the causative agent of the plague. Y. pestis KIM 10+ strain was passaged and selected for loss of the 102 kb pgm locus, resulting in an attenuated strain, KIM D27. In this study, whole genome sequencing was performed on KIM D27 in order to identify any additional differences. Initial assemblies of 454 data were highly fragmented, and various bioinformatic tools detected between 15 and 465 SNPs and INDELs when comparing both strains, the vast majority associated with A or T homopolymer sequences. Consequently, Illumina sequencing was performed to improve the quality of the assembly. Hybrid sequence assemblies were performed and a total of 56 validated SNP/INDELs and 5 repeat differences were identified in the D27 strain relative to published KIM 10+ sequence. However, further analysis showed that 55 of these SNP/INDELs and 3 repeats were errors in the KIM 10+ reference sequence. We conclude that both 454 and Illumina sequencing were required to obtain the most accurate and rapid sequence results for Y. pestis KIMD27. SNP and INDELS calls were most accurate when both Newbler and CLC Genomics Workbench were employed. For purposes of obtaining high quality genome sequence differences between strains, any identified differences should be verified in both the new and reference genomes.</p

Genetic and phenotypic diversity in Burkholderia: contributions by prophage and phage-like elements

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p><it>Burkholderia </it>species exhibit enormous phenotypic diversity, ranging from the nonpathogenic, soil- and water-inhabiting <it>Burkholderia thailandensis </it>to the virulent, host-adapted mammalian pathogen <it>B. mallei</it>. Genomic diversity is evident within <it>Burkholderia </it>species as well. Individual isolates of <it>Burkholderia pseudomallei </it>and <it>B. thailandensis</it>, for example, carry a variety of strain-specific genomic islands (GIs), including putative pathogenicity and metabolic islands, prophage-like islands, and prophages. These GIs may provide some strains with a competitive advantage in the environment and/or in the host relative to other strains.</p> <p>Results</p> <p>Here we present the results of analysis of 37 prophages, putative prophages, and prophage-like elements from six different <it>Burkholderia </it>species. Five of these were spontaneously induced to form bacteriophage particles from <it>B. pseudomallei </it>and <it>B. thailandensis </it>strains and were isolated and fully sequenced; 24 were computationally predicted in sequenced <it>Burkholderia </it>genomes; and eight are previously characterized prophages or prophage-like elements. The results reveal numerous differences in both genome structure and gene content among elements derived from different species as well as from strains within species, due in part to the incorporation of additional DNA, or 'morons' into the prophage genomes. Implications for pathogenicity are also discussed. Lastly, RNAseq analysis of gene expression showed that many of the genes in ϕ1026b that appear to contribute to phage and lysogen fitness were expressed independently of the phage structural and replication genes.</p> <p>Conclusions</p> <p>This study provides the first estimate of the relative contribution of prophages to the vast phenotypic diversity found among the <it>Burkholderiae</it>.</p

Rancidity development during the chilled storage of farmed Coho salmon (Oncorhynchus kisutch)

7 páginas, 4 figuras, 2 tablasCoho salmon (Oncorhynchus kisutch) is a fatty fish species whose farming production has greatly increased in recent years. Lipid damage produced during Coho salmon chilled storage was studied for up to 24 d. Lipid hydrolysis (free fatty acids, FFA) and oxidation (conjugated dienes; peroxide value, PV; thiobarbituric acid index, TBA-i; fluorescent compounds formation, FR; browning development) were determined and compared to lipid composition (polyene index, PI; astaxanthin, AX) changes and sensory assessment (rancid odour development) results. Most lipid damage indices developed slowly during storage; thus, values obtained for FFA, PV, TBA-i and FR were in all cases under 1.5 g/100 g, 4.0 meq oxygen/kg lipid, 0.40 mg malondialdehyde/kg muscle and 0.40, respectively. Odour assessment showed a significant (p <0.05) rancidity development at day 10, when compared to starting fish material; then, non-acceptable values were obtained at days 19 and 24. The PI analysis showed not many differences during the storage time, with the lowest mean value at day 19. AX analysis indicated a relatively high content in the white muscle, which was maintained till the end of the experiment. A low oxidation development is concluded for Coho salmon lipids when compared to other fatty fish species under the same chilling conditions. AX was found to contribute to the oxidation stability of Coho salmon lipids, due to its free radical scavenger propertiesPeer reviewe

Describir los vínculos afectivos del subsistema conyugal de una familia nuclear, estrato 1 beneficiada del programa “brújula”; de la fundación carvajal en la ciudad de santiago de cali

Los cambios sociales que se presentan constantemente por la globalización, afectan de una u otra forma las relaciones en el sistema de la familia, generando modificaciones significativas dentro de su dinámica y en especial en los vínculos afectivos que en ella se producen. La familia está destinada a ser armónica, debe promover espacios para la humanización, la socialización, la creación de vínculos afectivos que les permitan a sus miembros desenvolverse en el contexto social de una manera adecuada, pero si estos vínculos afectivos no son acordes, se afecta significativamente todos los subsistemas de la estructura familiar. El presente trabajo de investigación tiene como objetivo describir cómo son los vínculos afectivos del subsistema conyugal de una familia nuclear, perteneciente al programa Brújula de la Fundación Carvajal en la ciudad de Santiago de Cali, debido a que los conflictos de pareja generalmente se deben a un exceso de emotividad o a una gestión inadecuada de las emociones, y esta afectación deteriora todo el sistema, por ello es importante revisar este problemática puesto que si se tiene en cuenta que el pilar para la construcción de una familia armónica, comprometida y consolidada es la pareja y si ésta presenta dificultades en su comunicación afectiva difícilmente podrá encaminar su estructura en busca de la realización de sus ideales y al cumplimiento de los objetivos familiares planteados dentro del proyecto de vida elaborado desde que conformaron la unidad familiar. Es importante establecer los límites, las responsabilidades y las obligaciones de cada uno de los miembros de la pareja, con el fin de entender hasta donde llega su responsabilidad y cual hace parte del otro, para que a través de la apoyo emocional la comprensión, la intimida, la pasión y el compromiso, se configuren estructuras familiares ideales en un mundo tan devastado por la escases de afecto familiar. 10 El trabajo de investigación se diagnosticó por medio de la herramienta Metaplan, donde determinaron las falencias del subsistema conyugal referente a su comunicación afectiva, así mismo se trabajó bajo la observación participante y como modelo metodológico de investigación se empleó la Investigación Acción Participación, debido a que los hallazgos se aplican de forma inmediata, la muestra no siempre es representativa, es participativa, los integrantes del equipo pueden participar en el mejoramiento de la investigación y el diagnóstico corresponde a un contexto específico. Algunos limitantes del proceso investigativo desarrollado, fue el corto tiempo de duración del proceso investigativo, debido a que precisó acelerar el proceso y por ende restringir el empleo de mayores herramienta que permitan fundamentar aún más los vinculo afectivos dentro de la familia investigada. Aun así se logró desarrollar y culminar la investigación de una manera satisfactoria de conformidad con los objetivos y metas planteadas.Los cambios sociales que se presentan constantemente por la globalización, afectan de una u otra forma las relaciones en el sistema de la familia, generando modificaciones significativas dentro de su dinámica y en especial en los vínculos afectivos que en ella se producen. La familia está destinada a ser armónica, debe promover espacios para la humanización, la socialización, la creación de vínculos afectivos que les permitan a sus miembros desenvolverse en el contexto social de una manera adecuada, pero si estos vínculos afectivos no son acordes, se afecta significativamente todos los subsistemas de la estructura familiar. El presente trabajo de investigación tiene como objetivo describir cómo son los vínculos afectivos del subsistema conyugal de una familia nuclear, perteneciente al programa Brújula de la Fundación Carvajal en la ciudad de Santiago de Cali, debido a que los conflictos de pareja generalmente se deben a un exceso de emotividad o a una gestión inadecuada de las emociones, y esta afectación deteriora todo el sistema, por ello es importante revisar este problemática puesto que si se tiene en cuenta que el pilar para la construcción de una familia armónica, comprometida y consolidada es la pareja y si ésta presenta dificultades en su comunicación afectiva difícilmente podrá encaminar su estructura en busca de la realización de sus ideales y al cumplimiento de los objetivos familiares planteados dentro del proyecto de vida elaborado desde que conformaron la unidad familiar. Es importante establecer los límites, las responsabilidades y las obligaciones de cada uno de los miembros de la pareja, con el fin de entender hasta donde llega su responsabilidad y cual hace parte del otro, para que a través de la apoyo emocional la comprensión, la intimida, la pasión y el compromiso, se configuren estructuras familiares ideales en un mundo tan devastado por la escases de afecto familiar. 10 El trabajo de investigación se diagnosticó por medio de la herramienta Metaplan, donde determinaron las falencias del subsistema conyugal referente a su comunicación afectiva, así mismo se trabajó bajo la observación participante y como modelo metodológico de investigación se empleó la Investigación Acción Participación, debido a que los hallazgos se aplican de forma inmediata, la muestra no siempre es representativa, es participativa, los integrantes del equipo pueden participar en el mejoramiento de la investigación y el diagnóstico corresponde a un contexto específico. Algunos limitantes del proceso investigativo desarrollado, fue el corto tiempo de duración del proceso investigativo, debido a que precisó acelerar el proceso y por ende restringir el empleo de mayores herramienta que permitan fundamentar aún más los vinculo afectivos dentro de la familia investigada. Aun así se logró desarrollar y culminar la investigación de una manera satisfactoria de conformidad con los objetivos y metas planteadas