chroGPS, a global chromatin positioning system for the functional analysis and visualization of the epigenome

Development of tools to jointly visualize the genome and the epigenome remains a challenge. chroGPS is a computational approach that addresses this question. chroGPS uses multidimensional scaling techniques to represent similarity between epigenetic factors, or between genetic elements on the basis of their epigenetic state, in 2D/3D reference maps. We emphasize biological interpretability, statistical robustness, integration of genetic and epigenetic data from heterogeneous sources, and computational feasibility. Although chroGPS is a general methodology to create reference maps and study the epigenetic state of any class of genetic element or genomic region, we focus on two specific kinds of maps: chroGPSfactors, which visualizes functional similarities between epigenetic factors, and chroGPSgenes, which describes the epigenetic state of genes and integrates gene expression and other functional data. We use data from the modENCODE project on the genomic distribution of a large collection of epigenetic factors in Drosophila, a model system extensively used to study genome organization and function. Our results show that the maps allow straightforward visualization of relationships between factors and elements, capturing relevant information about their functional properties that helps to interpret epigenetic information in a functional context and derive testable hypotheses

Low-cost Soil Moisture Sensors Based on Inductive Coils Tested on Different Sorts of Soils

[EN] The use of precision agriculture and the Internet of Things has improved the efficiency of many cultures. Nevertheless, there are a few low-cost options to monitor soil moisture. Moreover, those options depend on the specific characteristics of the soil. In this paper, we attempt to find a sensor, based on mutual inductance, that could be used for more than one sort of soil. We study three prototypes, one of them with casing. The sensors are powered with a voltage of 10 peak to peak volts. One of the soils has a high content of organic matter and sand while the other is rich in sand and silt. The best prototype for the soil with high levels of organic matter has 10 turns on the powered coil and 5 on the induced coil. The best frequency for this sensor is 1340 kHz. For the soil with a significant quantity of silt, the best prototype has 80 turns on the powered coil and 40 on the induced coil. The frequency at which this sensor works best is 229 kHz, which happens to be its peak frequency. With those characteristics regressions lines with R2 values higher than 0.75 can be modeledThis work is partially found by the Conselleria de Educación, Cultura y Deporte with the Subvenciones para la contratación de personal investigador en fase postdoctoral, grant number APOSTD/2019/04, by European Union through the ERANETMED (Euromediterranean Cooperation through ERANET joint activities and beyond) project ERANETMED3-227 SMARTWATIR, and by the European Union with the Fondo Europeo Agrícola de Desarrollo Rural (FEADER) Europa invierte en zonas rurales, the MAPAMA, and Comunidad de Madrid with the IMIDRA, under the mark of the PDR-CM 2014-2020 project number PDR18-XEROCESPED.Parra-Boronat, M.; Parra-Boronat, L.; Lloret, J.; Mauri, PV.; Llinares Palacios, JV. (2019). Low-cost Soil Moisture Sensors Based on Inductive Coils Tested on Different Sorts of Soils. IEEE. 616-622. https://doi.org/10.1109/IOTSMS48152.2019.8939258S61662

Estructura sanitaria de atención al tabaquismo

El presente artículo trata de analizar la necesidad de generar una estructura sanitaria de atención al tabaquismo en los distintos departamentos de salud, dependientes de la red pública sanitaria. Esta estructura cobra fuerza y llega a un mayor número de sujetos si se asienta sobre la Atención Primaria de salud, articulándose alrededor de las consultas específicas de tabaquismo en los distintos centros de Salud. Estas consultas deben contar como mínimo con un médico y una enfermera que se dediquen especialmente a atender la consulta al menos 4 horas a la semana. Aun siendo la Atención Primaria la principal puerta de entrada de los pacientes, no podemos descartar el papel de otras unidades o servicios como, medicina Preventiva, los servicios de Neumología o las Unidades de Conductas Adictivas, que también deben hacer un papel importante a la hora de su interrelación. Con todo esto hay que establecer una correcta coordinación entre los distintos servicios, consultas y unidades, sumando a ellas los recursos de Salud Pública e incluso el apoyo que se pueda ofrecer desde distintos ayuntamientos y otras administraciones no sanitarias. Al contar con una estructura definida y una organización coordinada se puede llegar al máximo número de pacientes, además de realizar otras tareas como la prevención o incluso la investigación en este campo, por parte de personas que conozcan toda la problemática de los fumadores. A pesar de los documentos previos, llega la hora de que los distintos gobiernos tanto a nivel autonómico como estatal, consensúen y establezcan un modelo de Atención sanitaria al tabaquismo para todo el Estado español. En este trabajo, aparte de presentar nuestro proyecto, ofrecemos los resultados preliminares que nos indica que nuestra experiencia es efectiva y eficiente en nuestro Departamento de Salud cuando se compara con otros trabajos. Esperamos que con el seguimiento aportemos datos más concluyentes

La evaluación del primer curso del Grado en Turismo según la opinión del alumnado

El proyecto tiene como objetivo realizar el seguimiento del primer curso del Grado en Turismo a partir de la implementación de las guías docentes, investigación que se inició en el curso académico 2010-2011, coincidiendo con la implantación de dicha titulación en la Universidad de Alicante. En particular, el presente estudio aborda, a partir de un sistema de encuestas, el análisis de la opinión del alumnado matriculado en el curso 2013-2014, con el propósito de completar la serie de datos relativa a los cursos anteriores. De este modo, se efectúa el correspondiente estudio estadístico y con los resultados obtenidos se elabora un diagnóstico representativo de la trayectoria seguida hasta el momento, cuando se completa el primer ciclo de los estudios del Grado en Turismo y está más cerca la acreditación de la titulación. Por supuesto, como desde que se inició esta investigación, el fin último es mejorar en todo lo posible las guías docentes en cuanto instrumentos eficaces que puedan asegurar el óptimo rendimiento académico de los estudiantes

Alkane oxidation by a carboxylate-bridged dimanganese(III) complex

A new manganese(III) oxamato dimer possesing an unprecedented Mn2(μ-O2CR)(μ-OH2…O2CR) core has been synthesised, structurally and magnetically characterised, and used as a catalyst for the oxidation of alkanes to alcohols and ketones by Bu^tO2H and O2 in CH2Cl2 at rt.Blay Llinares, Gonzalo, [email protected] ; Fernandez Picot, Isabel, [email protected] ; Pedro Llinares, Jose Ramon, [email protected] ; Ruiz Garcia, Rafael, [email protected] ; Pardo Marin, Emilio Jose, [email protected] ; Lloret Pastor, Francisco, [email protected]

A precision RNA degradation machinery shapes stem cell development

In this issue, Belair et al. (2019. J. Cell Biol. https://doi.org/10.1083/jcb.201811148) show that, together with a complex network of transcription factors and chromatin modifiers, the RNA exosome regulates embryonic stem cell (ESC) differentiation and pluripotency.publishe