Vorwort / Foreword

Die 35. Hauptversammlung der Deutschen Quartärvereinigung DEUQUA fand in der Zeit vom 13.–17. September mit mehr als 180 Teilnehmern aus 16 Ländern in Greifswald statt.editoria

Domain specific cues improve robustness of deep learning based segmentation of ct volumes

Machine Learning has considerably improved medical image analysis in the past years. Although data-driven approaches are intrinsically adaptive and thus, generic, they often do not perform the same way on data from different imaging modalities. In particular Computed tomography (CT) data poses many challenges to medical image segmentation based on convolutional neural networks (CNNs), mostly due to the broad dynamic range of intensities and the varying number of recorded slices of CT volumes. In this paper, we address these issues with a framework that combines domain-specific data preprocessing and augmentation with state-of-the-art CNN architectures. The focus is not limited to optimise the score, but also to stabilise the prediction performance since this is a mandatory requirement for use in automated and semi-automated workflows in the clinical environment. The framework is validated with an architecture comparison to show CNN architecture-independent effects of our framework functionality. We compare a modified U-Net and a modified Mixed-Scale Dense Network (MS-D Net) to compare dilated convolutions for parallel multi-scale processing to the U-Net approach based on traditional scaling operations. Finally, we propose an ensemble model combining the strengths of different individual methods. The framework performs well on a range of tasks such as liver and kidney segmentation, without significant differences in prediction performance on strongly differing volume sizes and varying slice thickness. Thus our framework is an essential step towards performing robust segmentation of unknown real-world samples

Kontextbasierte Eventerkennung in der Logistik mit drahtloser Sensornetztechnologie

Eine lückenlose Echtzeitüberwachung von Logistikprozessen erlaubt es Events frühzeitig zu erkennen und auf diese angemessen zu reagieren und eröffnet das Potential Haftungsfragen leichter zu klären und Versicherungsprämien zu senken. Mittels drahtloser Sensornetz-technologie wird eine entsprechende Echtzeiterkennung von und -benachrichtigung über Events in Logistikprozessen möglich. Diese muss aber sowohl kosten- und energieeffizient als auch kundenorientiert realisiert werden. Im vorliegenden Beitrag wird hierzu das Konzept der „übertragungsrelevanten Events“ vorgestellt und zur konkreten Umsetzung ein Scoresheet-basiertes Verfahren entwickelt. Die Effizienz und Vorteilhaftigkeit dieses Verfahrens im Vergleich zu anderen Verfahren zur Eventerkennung und -benachrichtigung im Rahmen einer Echtzeitüberwachung von Logistikprozessen wird mittels Simulations-experimenten gezeigt

Zur Landschafts- und Gewässergeschichte der Müritz: Umweltgeschichtlich orientierte Bohrungen 2004-2006 zur Rekonstruktion der nacheiszeitlichen Entwicklung

Mit 113,5 km2 Wasserfläche und einem Einzugsgebiet von 1230 km2 ist die Müritz (62 m HN) der zweitgrösste See des nordmitteleuropäischen Tieflandes (Knapp et al. 1999). Sie war in den vergangenen Jahrzehnten bereits mehrfach das Ziel paläohydrologischer und landschaftsgenetischer Untersuchungen,researc

Umweltgeschichtlich orientierte Bohrungen 2004–2006 zur Rekonstruktion der nacheiszeitlichen Entwicklung

Mit 113,5 km2 Wasserfläche und einem Einzugsgebiet von 1230 km2 ist die Müritz (62 m HN) der zweitgrösste See des nordmitteleuropäischen Tieflandes (Knapp et al. 1999). Sie war in den vergangenen Jahrzehnten bereits mehrfach das Ziel paläohydrologischer und landschaftsgenetischer Untersuchungen, die sich bislang jedoch auf das terrestrische und telmatische Umfeld beschränkten. Durch Kaiser (1998) und Kaiser et al. (2002) wurde der bisherige Wissensstand detailliert zusammengefasst. Die hier vorgestellten Seebohrungen hatten das Ziel, die Landschafts- und Gewässerentwicklung anhand von Seesedimenten gut aufgelöst zu rekonstruieren und offene Fragen zu Wasserstandsschwankungen zu klären. Die Untersuchung der Seesedimente bot zudem die Chance einer über ein grosses Einzugsgebiet integrierenden Rekonstruktion der Vegetationsgeschichte sowie der erstmaligen Bearbeitung der Sedimentations- und Trophieentwicklung der Müritz seit dem Spätglazial.researc

Zur jungquartären Landschaftsentwicklung der Mecklenburgischen Kleinseenplatte

Der Band „Zur jungquartären Landschaftsentwicklung der Mecklenburgischen Kleinseenplatte“ dokumentiert die Ergebnisse geomorphologischer, bodenkundlicher und limnologischer Untersuchungen am Krummen See bei Blankenförde. Er gibt damit einen tieferen Einblick in die jungquartäre Landschaftsentwicklung der Kleinseenlandschaft östlich der Müritz. Der Krumme See wird geomorphologisch als mittelgroßer Rinnen-Tiefsee in der Sanderlandschaft südlich der Pommerschen Haupteisrandlage sowie hydrologisch als abflussloser, oligomesotropher, subalkalischer Klarwassersee mit überwiegender Grundwasserspeisung charakterisiert. Er stellt damit ein repräsentatives Forschungsobjekt dar.researc

Continuing the sequence?:Towards an economic evaluation of whole genome sequencing for the diagnosis of rare diseases in Scotland

Funding This research was made possible through access to the data and findings generated by Scotland’s four regional genetics centres at NHS Grampian, Lothian, Tayside and Greater Glasgow and Clyde. These four centres participated in Scotland’s involvement in the 100,000 Genomes Project. The 100,000 Genomes Project is managed by Genomics England Limited (a wholly owned company of the Department of Health) and funded by the National Institute for Health Research and NHS England. The Wellcome Trust, Cancer Research UK and the Medical Research Council have also funded research infrastructure. Acknowledgements The authors would like to thank the Scottish Genomes Partnership for their support with this work. The Scottish Genomes Partnership is funded by the Chief Scientist Office of the Scottish Government Health Directorates [SGP/1] and The Medical Research Council Whole Genome Sequencing for Health and Wealth Initiative (MC/PC/15080). We are grateful for the contributions of the funding bodies; Scottish Regional Genetics centres at NHS Lothian, Tayside, Grampian and Greater Glasgow and Clyde, clinicians and healthcare teams who contributed to the provision of data as well as the analyses and interpretation of results. We also thank Morad Ansari, Christine Bell, Martin McClatchey, Nicola Williams, Austin Diamond, Jonathan Berg, Jon Warner, Alexis Duncan, Amy Rowlatt, and Tessa Coupar for their help and advice during the SGP Project, and Michael Doherty, Florence Richards and Quinn Heppe for help with costing the standard testing pathway. We thank Professor Tim Aitman for commenting on earlier drafts of the paper. We thank all participants who took part in the valuation study. The University of Aberdeen and the Chief Scientist Office of the Scottish Government Health and Social Care Directorates fund the Health Economics Research Unit (HERU). This study would not be possible without the families, patients, clinicians, nurses, research scientists, laboratory staff, and the wider Scottish Genomes Partnership team to whom we give grateful thanks.Peer reviewedPublisher PD

Dual Learning in an Emergency Medicine Clerkship Improves Student Performance

BackgroundThe emergency department (ED) is an ideal environment to teach learners about the "undifferentiated patient." Student learning may be inconsistent because of inherent variability in the ED. Previous research has suggested that standardizing the emergency medicine (EM) clerkship by implementing didactics and requiring students to see patients with particular chief complaints improves educational outcomes.ObjectiveTo compare knowledge acquisition after a new curriculum to the traditional curriculum.MethodsThis was a prospective, quasiexperimental study of senior medical students in an EM clerkship. Students were assigned to the dual learning (DL) group or standard learning (SL) groups based on month of rotation. All were required to see patients with 10 specific chief complaints and were lent an EM textbook. The SL group was instructed to read about the required cases. The DL group attended a 2-hour didactic session covering 5 of the 10 required cases. All students completed an identical pre- and postclerkship multiple choice knowledge test.ResultsData from 51 medical students (DL = 27; SL = 24) were analyzed. Mean pretest scores were comparable between groups. A 2 (groups) by 2 (sessions) mixed-design analysis of variance yielded a significant group by session interaction effect (p < 0.001). The DL group significantly increased its mean score from 8.7 (standard deviation [SD] = 1.8) pretest to 11.6 (SD = 1.9) posttest; there was no improvement in the SL group (pretest: 9.3 [SD = 1.5], posttest: 10.0 [SD = 2.0]).ConclusionA DL model combining clinical and enhanced didactic requirements for an EM clerkship led to greater knowledge gain than the standard curriculum. This model may suggest ways to improve the educational experience in the EM clerkship

Attenuated and Protease-Profile Modified Sendai Virus Vectors as a New Tool for Virotherapy of Solid Tumors

Peer reviewe