P element temperature-specific transposition: a model for possible regulation of mobile elements activity by pre-mRNA secondary structure

P element is a DNA transposon, known to spread in genome using transposase activity. Its activity is tissue-specific and normally observed at high temperatures within 24°C to 29°C. Here, we present a predicted RNA secondary structure domain of P element pre-mRNA which could potentially regulate the temperature sensitivity of the P element activity. In canonical P elements, the structure is a small hairpin with double-helical part interrupted by a symmetric loop and a mismatch. In M type P elements, the A.A mismatch is substituted by an A-U base pair, stabilizing the structure. The hairpin structure covers the region involving the IVS-3 5′ splice site and both pseudo-splice sites F1 and F2. While the IVS-3 and F1 binding sites of U1 snRNA are located in the double-stranded part of the structure, the F2 site is exposed in the hairpin loop. The formation of this structure may interfere with landing of U1 snRNA on IVS-3 site, while F2 is positioned for the interaction. Alignment of P element sequences supports the proposed existence of the hairpin, showing high similarity for this region. The hairpin structure, stable at low temperatures, may prevent correct IVS-3 splicing. Conversely, temperature-induced destabilization of the hairpin structure may result in the splicing at the proper IVS-3 splice site. Taking into account the increasing amount of data demonstrating the important influence of RNA folding on phenotypes determined by alternative splicing a model for possible regulation of the activity of mobile elements by pre-mRNA secondary structure seems intriguing.Предсказана вторичная структура пре-мРНК P-элемента, которая, возможно, регулирует его активность и температурную чувствительность. Структура представляет собой шпильку, более стабильную в Р-элементах М-типа, в сравнении с каноническими. Регион, образующий шпильку, находится в области 5’ сайта сплайсинга третьего интрона (IVS-3), включая оба описанных псевдо-сайта сплайсинга - F1 и F2. В то время как истинный сайт и F1 расположены, главным образом, в двухцепочечной области шпильки, F2 - экспонирован в петле. Выравнивание последовательностей Р-элементов продемонстрировало высокую степень сходства для указанного региона, что свидетельствует в пользу существования предсказанной структуры. Формирование шпильки, по нашему мнению, может препятствовать связыванию U1 snRNA с истинным сайтом сплайсинга, и, напротив, индуцированная температурой дестабилизация шпильки может приводить к корректному сплайсингу IVS-3. Таким образом, предложена гипотеза о влиянии вторичной структуры пре-мРНК мобильного элемента на его активность.Передбачена вторинна структура пре-мРНК Р-елемента, що, можливо, регулює його активність та температурну чутливість. Структура являє собою шпильку, більш стабільну у Р-елементах М-типу, порівняно з канонічними. Регіон, що утворює шпильку розташований в області 5’ сайта сплайсинга третього інтрону (IVS-3), включає обидва відомих псевдо-сайта сплайсингу - F1 та F2. При цьому 5’ сайт сплайсингу IVS-3 та F1псевдо-сайт знаходяться у дволанцюговій частині шпильки, а F2 є єкспонованим у петлі. Вирівнювання послідовностей Р-елементів продемонструвало високий рівень подібності для вказаного регіону, що свідчить на користь існування передбаченої структури. Формування шпильки, на нашу думку, може перешкоджати зв’язуванню U1 snRNA з 5’ сайтом сплайсингу IVS-3, і, навпаки, індукована температурою дестабілізація шпильки може сприяти корректному сплайсингу третього інтрону. Таким чином, запропонована гіпотеза про вплив вторинної структури пре-мРНК мобільного елементу на його активність

APTT: A screening test for hypercoagulability in type 2 diabetes mellitus patients

Background: Thrombosis is a common complication in Type 2 Diabetes Mellitus (T2DM). Prolonged APTT values have clinical relevance as an indicator of factor deficiency or the presence of coagulation inhibitors. However, there is mounting evidence that shortened APTT values in some cases may reflect a hypercoagulable state, which is potentially associated with increased thrombotic risk and adverse cardiovascular events. We set out a cross-sectional study to measure the haemostatic profiles of T2DM patients and to determine the suitability of PT-APTT as markers for hypercoagulability in T2DM patients using VWF as a gold standard.Methods: PT, APTT, VWF and Fibrinogen concentrations were measured in 213 T2DM patients and 172 non-diabetic healthy participants. VWF was used as a proxy marker for hypercoagulability in T2DM patients. Participants with VWF of >2.0 IU/ml , PT and APTT less than 11 and 30 seconds respectively, were regarded as being in hypercoagulable state.Results: The results revealed that mean fibrinogen concentration for T2DM patients (4.3 ±2.5g/l) was significantly higher than control participants (2.3±1.6 g/l); P-value = 0.003.The mean Vonwillebrands factor concentration for T2DM patients (7.4 ±4.1 IU/ml) was significantly higher than control participants (2.6±2.2 IU/ml). P-value = 0.0004. The mean Prothrombin Time for T2DM patients (12.4±3.3 seconds) was lower than control participants (12.5 ±2.9 seconds) but the difference was not significant P-value = 0.168. The mean APTT for T2DM patients (24.7 ±3.8seconds) was significantly lower than control participants (32.2±4.2seconds). P value = 0.000. The study further revealed that APTT tests were more sensitive 93.7% (95% CI [88.0-96.7)] than PT test which had a sensitivity of 55.6% (95% CI [46.8- 63.9)]. Both APTT and PT tests had better specificity; however APTT was higher 95.4% (95% CI [88.8-98.2]) than PT test 90.8% (95% CI [82.9-94.3]). APTT test had a higher PPV 96.7% (95% CI [91.9-98.7)] than PT test 89.7% (95% CI 81.0 94.7]). PT test gave a much lower NPV 58.5% (95% CI [50.0-66.5]) as compared to APTT tests which had a higher NPV 91.2% (95% CI [83.6- 94.5]).Conclusion: Haemostatic profile results show that T2DM patients are more hypercoagulable than non-diabetic healthy individuals. APTT had a better diagnostic specificity and sensitivity than PT. It is cheaper, easier to do and has high PPV and NPV compared to PT. APTT could therefore be used as a marker for hypercoagulability in T2DM patients.Key words: Hypercoagulability, VWF, Type 2 diabetes mellitus, APTT, NPV, PP

Carbon and nitrogen uptake in above- and below-ground biomass of cereal crops in the integrated farming system

Received: February 1st, 2023 ; Accepted: April 8th, 2023 ; Published: April 24th, 2023 ; Correspondence: [email protected] significant reduction in greenhouse gas (GHG) emissions, as well as technologies that ensure removal of CO2 from the atmosphere, are necessary to achieve the set goals for the transition to carbon neutrality. During the crop growth cycle, a significant amount of biomass is produced, and carbon (C) and nitrogen (N) are captured both by the harvested crop removed from the field and by residues left on the field. The trials were conducted to find out patterns between crop and residues while trying to figure out the amount of captured C and N. In this study data of the most widely grown cereal crops in Latvia are summarized. The data are representative, obtained in different agroclimatic conditions, they vary both by species and variety, by year and fertilizers applied. The mean amount of biomass from cereal crops left on the field was 1,070.9 g m-2 DM, besides, 906.7 g m-2 of that was made up of above-ground (AG) residues and 164.2 g m-2 of below-ground (BG) residues. On average, 471.8 g m-2 C and 14.3 g m-2 N were captured, including: 411.2 g m-2 C and 12.9 g m-2 N by AG residues; 60.7 g m-2 C and 1.4 g m-2 N by BG residues. Regularities between grain yield and residues were found, however, they were not very strong. The dataset should be enlarged to reduce uncertainty. As the data calculated from crop have a greater uncertainty, the GHG inventory should be calculated according to the average AG and BG biomass, which provide more accurate data

It's not stealing if you need it: A panel on the ethics of performing research using public data of illicit origin

In a world where sensitive data can be published to a worldwide audience with the press of a button, researchers are increasingly making use of datasets that were publicized under questionable circumstances. In many cases, such research would otherwise not

Socio-economic conditions and factors necessary for the optimization of the network of higher education institutions in Ukraine

У статті досліджено вплив чинників на формування сучасної мережі ВНЗ в Україні, визначено об’єктивні та суб’єктивні чинники. Узагальнено думку фахівців щодо перебудови мережі ВНЗ в Україні і визначено, що більшість авторів характеризують сучасну мережу вищих навчальних закладів як не ефективну і таку, що потребує реформування. Проаналізовано сучасну територіальну і галузеву структуру вищих навчальних закладів, їх науково-педагогічний потенціал, обсяги підготовки фахівців. Визначено, що мережа ВНЗ України перенасичена філіями вищих навчальних закладів, які не мають необхідного науково-педагогічного потенціалу та матеріально-технічного забезпечення. Проведено розрахунки майбутньої чисельності студентів та викладачів і на цій підставі сформульовано позицію щодо необхідності, напрямів і шляхів оптимізації мережі ВНЗ. Запропоновано основні організаційні заходи щодо оптимізації мережі вищих навчальних закладів в Україні. Визначено позитивні та негативні наслідки цих заходів.В статье исследовано влияние факторов на формирование современной сети ВУЗов в Украине, определенны объективные и субъективные факторы. Обобщено мнение специалистов относительно перестройки сети ВУЗов в Украине и определенно, что большинство авторов считают современную сеть высших учебных заведений не эффективной и такой, которая нуждается в реформировании. Проанализирована современная территориальная и отраслевая структура высших учебных заведений, их научно-педагогический потенциал, объемы подготовки специалистов. Определено, что сеть ВУЗов Украины перенасыщена филиалами высших учебных заведений, которые не имеют необходимого научно-педагогического потенциала и материально-технического обеспечения. Проведены расчеты будущей численности студентов и преподавателей и на этом основании сформулирована позиция относительно необходимости, направлений и путей оптимизации сети ВУЗов. Предложены основные организационные мероприятия относительно оптимизации сети высших учебных заведений в Украине. Определены позитивные и негативные последствия этих мероприятий.The influence of factors on the formation of a modern network of higher education institutions in Ukraine is researched, objective and subjective factors are defined. Expert opinion on the restructuring of higher education institutions network in Ukraine is generalized, and it is specified that the majority of authors characterize modern network of higher education institutions as ineffective and as one that needs to be reformed. Modern territorial and sectoral structure of higher education institutions, their scientific and pedagogical potential, volume of specialists training are analyzed. It is defined that the network of higher education institutions in Ukraine is oversaturated with branches of higher educational institutions that do not have the necessary scientific and pedagogical potential, financial and technical support. The calculations of the future number of students and teachers are made, and on this basis, the standpoint on the need, directions and ways of optimization of the network of higher education institutions is formulated. The basic arrangements regarding the optimization of the network of higher education institutions in Ukraine are proposed. Positive and negative effects of these measures are determined

Common mechanisms of placental dysfunction in preeclampsia, gestational diabetes, and COVID-19 in pregnant women

COVID-19 infection, preeclampsia and gestational diabetes mellitus in pregnancy cause similar changes in the placenta and influence development of the fetus between conception and birth in gestation. Proper uterine and placental vascularization is essential for normal fetal development. The transplacental exchange is regulated and maintained by the placental endothelium. During placental implantation, the trophoblast differentiates into two distinct layers, the inner cytotrophoblast and outer syncytiotrophoblast, which are key elements of the human placental barrier. Proinflammatory cytokines exacerbate ischemic events and create an upward spiral of an inflammatory reaction in the placenta. Placental pathology in gestational COVID-19 shows desquamation and damage of trophoblast and chronic histiocytic intervillositis. Similar lesions also occur in gestational diabetes mellitus and preeclampsia. The systemic inflammatory response of the mother, the increased inflammation in the placenta and cytokine production by placental trophoblasts should be monitored throughout pregnancy. Placental angiogenesis can be evaluated by serum vascular endothelial growth factor, Annexin A2, placental growth factor or sclerostin. Tissue damage can be assessed by measuring levels of serum lactate dehydrogenase and myeloperoxidase. Blood flow can be monitored with three-dimensional Doppler and pathological changes can be documented with paraffin-embedded tissue sections stained with hematoxylin and eosin, and electron microscope images as well as immunohistochemistry tests for vascular endothelial growth factor, placental growth factor, sclerostin and Annexin A2. The damage of maternal and fetal vascular perfusion (villitis and fibrin deposition) is a common mechanism of gestational diseases. The placenta lesions liberate anti-endothelial factors that lead to anti-angiogenic conditions and are the common mechanism of maternal placental vascular malperfusion in gestational diseases. Keywords: dysfunction, inflammation, pathology, placenta, pregnancy, vascularizatio

Closing Water Cycles in the Built Environment through Nature-Based Solutions: The Contribution of Vertical Greening Systems and Green Roofs

Water in the city is typically exploited in a linear process, in which most of it is polluted, treated, and discharged; during this process, valuable nutrients are lost in the treatment process instead of being cycled back and used in urban agriculture or green space. The purpose of this paper is to advance a new paradigm to close water cycles in cities via the implementation of naturebased solutions units (NBS_u), with a particular focus on building greening elements, such as green roofs (GRs) and vertical greening systems (VGS). The hypothesis is that such “circular systems” can provide substantial ecosystem services and minimize environmental degradation. Our method is twofold: we first examine these systems from a life-cycle point of view, assessing not only the inputs of conventional and alternative materials, but the ongoing input of water that is required for irrigation. Secondly, the evapotranspiration performance of VGS in Copenhagen, Berlin, Lisbon, Rome, Istanbul, and Tel Aviv, cities with different climatic, architectural, and sociocultural contexts have been simulated using a verticalized ET0 approach, assessing rainwater runoff and greywater as irrigation resources. The water cycling performance of VGS in the mentioned cities would be sufficient at recycling 44% (Lisbon) to 100% (Berlin, Istanbul) of all accruing rainwater roof–runoff, if water shortages in dry months are bridged by greywater. Then, 27–53% of the greywater accruing in a building could be managed on its greened surface. In conclusion, we address the gaps in the current knowledge and policies identified in the different stages of analyses, such as the lack of comprehensive life cycle assessment studies that quantify the complete “water footprint” of building greening systems.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Regarding the optimization of the network of higher educational institutions in Ukraine

Досліджено динаміку, стан та особливості формування сучасної мережі вищих навчаль них закладів в Україні. На підставі здійсненого аналізу наведено об’єктивні причини не обхідності реформування мережі вищих навчальних закладів, запропоновано шляхи її оптимізації з адаптацією до сучасних умов. Визначено позитивні результати та нега тивні наслідки такої реформи.Dynamics, state and peculiarities of the formation of a modern network of higher education institutions in Ukraine are researched. On the basis of the analysis conducted, objective reasons for the need to reform the network of higher education institutions are presented and ways of its’ optimization with adaptation to modern conditions are proposed. Positive and negative consequences of such a reform are identified

КОНЦЕПТУАЛЬНА МОДЕЛЬ МАКРОРЕГУЛЮВАННЯ СОЦІАЛЬНО-ЕКОНОМІЧНИХ ВІДНОСИН В УМОВАХ ІННОВАЦІЙНО-ІНВЕСТИЦІЙНОГО РОЗВИТКУ УКРАЇНИ

The purpose of the study — is to propose and substantiate the conceptual model of macro-regulation of social-economic relations between the state and innovation-active business entities in terms of innovation and investment development of the economy of Ukraine. The article proposes a systematic approach to building a mechanism for macro-regulation of innovation and investment activities. The influence of innovation and investment changes on the acceleration of social progress is analyzed. The conceptual approach to the formation of the budget strategy of the state in the form of tax deduction from the value added of innovatively active economic entities proposed by the authors is formed on the basis of generalization of modern economic theories. It was revealed, that only through the growth of gross domestic product it is impossible to overcome poverty and increase the educational and cultural level. This allowed the authors to base the guidelines of methodological and practical aspects on the rational and effective interaction between the state and innovation-active actors of Ukraine, aimed at increasing real income, education, health, greening and general culture of society. The authors’ consideration of the category «quality of life» as a synergistic indicator of social-economic development under the influence of investment and innovation processes allows to more accurately define the tasks, functions, priorities and effectiveness of such macro-regulation. Building new social-economic relations on the basis of the proposed model makes it possible to optimize these processes of interaction taking into account transformational changes in the country’s economy and social development, which means benefiting from innovation and high technology in achieving common goals of the state and innovation-active business entities in raising the national level of welfare of society. The scientific novelty is to consider macroregulation issues related to building such a synergistic interaction between the state and innovation-active economic entities when material and universal values is created and the achieved positive result from the implementation of changes is comprehensively determined.Мета дослідження — запропонувати та обґрунтувати концептуальну модель макрорегулювання соціально-економічних відносин між державою та інноваційно активними суб’єктами господарювання в умовах інноваційно-інвестиційного розвитку економіки України. Запропоновано системний підхід до побудови механізму макрорегулювання інноваційно-інвестиційної діяльності. Проаналізовано вплив інноваційно-інвестиційних змін на прискорення суспільного прогресу. Запропоновано концептуальний підхід до формування бюджетної стратегії держави шляхом податкового вилучення з додаткової вартості інноваційно активних суб’єктів господарювання сформований на основі узагальнення сучасних економічних теорій. З’ясовано, що тільки за рахунок зростання валового внутрішнього продукту неможливе забезпечення подолання бідності населення і зростання освітнього та загальнокультурного рівня. Це дало можливість базувати орієнтири методологічних і практичних аспектів на раціональній та ефективній взаємодії між державою та інноваційно активними суб’єктами України, спрямованими на підвищення реального доходу, рівня освіти, здоров’я, екологізації та загальної культури суспільства. Розгляд категорії «якість життя» як синергійного показника соціально-економічного розвитку під впливом інноваційно-інвестиційних процесів дозволяє більш точно визначити завдання, функції, пріоритетні напрями та ефективність такого макрорегулювання. Побудова нових соціально-економічних відносин на основі запропонованої концептуальної моделі дає можливість оптимізувати ці процеси взаємодії з урахуванням трансформаційних зрушень в економіці країни та загальносоціального розвитку, що означає отримання вигоди від упровадження інновацій і високих технологій у досягненні єдиних цілей як самої держави, так і інноваційно активних суб’єктів господарювання в підвищенні загальнонаціонального рівня добробуту суспільства. Наукова новизна полягає в розгляді питань з макрорегулювання, пов’язаних із побудовою такої синергічної взаємодії між державою та інноваційно активними суб’єктами господарювання, коли створюються матеріальні та загальнолюдські цінності і комплексно визначається досягнутий позитивний результат від запровадження змін

Demographic aspect of social relations in society

Проведен анализ факторов и причин демографического кризиса в Украине и его влияния на социально-экономическое развитие страны. Раскрыты экономические, демографические и социальные последствия депопуляции. Освещен демографический аспект пенсионной реформы и высшего образования.Проведено аналіз факторів і причин демографічної кризи в Україні та його впливу на соціально-економічний розвиток країни. Розкрито економічні, демографічні та соціальні наслідки депопуляції. Висвітлено демографічний аспект пенсійної реформи та вищої освіти.The analysis of the factors and causes of the demographic crisis in Ukraine and its impact on socio-economic development of the country. Revealed economic, demographic and social consequences of depopulation. Lit demographic aspect of pension reform and higher education