96 research outputs found

    Un enfoque microbiológico en la mejora del manejo del Lince Ibérico

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    The Iberian lynx (Lynx pardinus), the most threatened feline on the planet and exclusive to the Iberian Peninsula, is listed as critically endangered by the International Union for Conservation of Nature (IUCN). Its current population is estimated at about 320 individuals, mainly distributed in two isolated breeding metapopulations: Eastern Sierra Morena (with the nuclei of Andújar-Cardeña, Guadalmellato and Guarrizas) and Doñana-Aljarafe, both in Andalusia.El lince ibérico (Lynx pardinus), el felino más amenaza- do del planeta y exclusivo de la Península Ibérica, está catalogado como en peligro crítico de extinción por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturale-  za (UICN). Su población actual se estima en unos 320 in- dividuos, distribuidos principalmente en dos metapobla- ciones reproductoras aisladas entre sí: Sierra Morena Oriental (con los núcleos de Andújar-Cardeña, Guadalme- llato y Guarrizas) y Doñana-Aljarafe, ambas en Andalucía

    Transcriptional study of Solea senegalensis immune related genes in response to Photobacterium damselae SUBSP. piscicida. Identification of immunogenic proteins of the pathogen

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    La acuicultura ha experimentado un gran crecimiento durante las últimas décadas, siendo el sector relacionado con la producción animal que más ha crecido a nivel mundial. El creciente interés en el cultivo del lenguado senegalés (Solea senegalensis) ha estado limitado por la irrupción de patologías, que se han traducido en pérdidas económicas para el sector acuícola. Una de las principales patologías que más problemas ocasiona en esta especie es la fotobacteriosis causada por la bacteria Photobacterium damselae subsp. piscicida (Phdp), siendo la región mediterránea especialmente proclive a sufrir estos brotes epizoóticos. Ante esta problemática, el control de las infecciones en la industria acuícola constituye un aspecto crucial para el avance de la misma. Los resultados derivados de la presente Tesis han demostrado que la infección de S. senegalensis con Phdp, tanto por vía intraperitoneal como por inmersión, induce la transcripción de genes del hospedador que codifican proteínas implicadas en la reducción de la disponibilidad de hierro para el patógeno, siendo el hígado el principal órgano involucrado en la respuesta inmune en los estadios iniciales de la infección. Además, se ha comprobado que someter a ejemplares de lenguado a inmunización con una preparación de bacterina y ECPs de Phdp, junto con adyuvante incompleto de Freund, por inyección intraperitoneal induce un mayor título de anticuerpos frente al patógeno e incrementa la transcripción de genes que codifican para la lisozima C1, el complemento y proteínas implicadas en el metabolismo del hierro. Todo ello asociado a una mayor resistencia de los ejemplares a la infección por Phdp.Por otra parte, la adaptación de la bacteria al hospedador, requiere la regulación de la expresión de genes in vivo que desempeñan un importante papel en la enfermedad y pueden ser determinantes en la virulencia del patógeno. Por ello, mediante la tecnología de antígenos inducidos in vivo (IVIAT) se han identificado cinco proteínas inmunogénicas: alanil-ARNt sintetasa, serina hidroximetil transferasa, inosina-5’-monofosfato deshidrogenasa, alquil hidroperóxido reductasa y la péptido sintetasa no ribosómica Irp2, inducidas en Phdp durante la infección de S. senegalensis. La transcripción de los genes que codifican a las mismas es inducida durante la infección ex vivo de riñón de S. senegalensis. Además, se ha demostrado que los niveles de hierro así como de radicales oxidantes superóxido y peroxinitrito regulan la transcripción de los genes que codifican las proteínas IVIAT alquil hidroperóxido reductasa y la péptido sintetasa no ribosómica Irp2. Por último, se ha comprobado que la presencia de peroxinitrito y las condiciones limitantes de hierro modulan la transcripción de los genes que codifican las proteínas extracelulares Aip56 y P53 implicadas en la virulencia de Phdp. Estas proteínas inmunogénicas pueden representar potenciales dianas para el diseño de nuevas estrategias profilácticas frente a la fotobacteriosis

    Use of in-vivo induced antigen technology to identify bacterial genes expressed during Solea senegalensis infection with Photobacterium damselae subsp. piscicida

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    The marine fish pathogen Photobacterium damselae subsp. piscicida (Phdp) is responsible for important disease outbreaks affecting several fish species including flatfish Solea senegalensis (Kaup). Phdp is able to avoid host defences by invasion and intracellular survival in non-phagocytic cells, mainly epithelial cells. Virulence factors reported in Phdp include restricting complement-mediated activity, apoptosis of phagocytes caused by exotoxins secretion, iron acquisition mechanisms such as siderophores that enable the pathogen to obtain iron from transferrin and ability to bind haemin and antioxidant enzymatic activities capable to counteract superoxide radicals (Do Vale et al., 2005; Andreoni and Magnano, 2014). Commonly, genes expressed during pathogen infection are important for pathogenicity. In vivo-induced antigen technology (IVIAT) (Handfield et al., 2000) has been used to identify in vivo-induced genes using pooled sera from fish that have experienced photobacteriosis. Materials and methods Sera were obtained from surviving S. senegalensis specimens after sublethal infection with Phdp (Lg41/01) and subsequently pooled and adsorbed against in vitro grown Phdp Lg41/01 and Escherichia coli BL21 (DE3) cells and lysates according to Handfield et al. (2000). The efficiency of sera adsorption was evaluated based on the immunoreactivity after each adsorption step with whole and lysed Phdp cells grown in vitro. A genomic expression library of Phdp Lg41/01 was generated in E. coli BL21 (DE3) using pET-30 expression system (Novagen, San Diego, CA, USA). The expression library was probed with adsorbed and non-absorbed sera using immunoblot technique. Reactive clones of in vivo-induced and in vitro antigens were obtained, purified and their inserted DNA sequenced (Macrogen Europe, Amsterdam, The Netherlands). Nucleotide sequences were compared against the NCBI protein database using BLASTx. Results A progressive reduction in sera immunoreactivity against in vitro grown Phdp cells was detected after the adsorption rounds, especially after the first adsorption step. Thus, following adsorption steps substantially removed antibodies against in vitro expressed antigens and resulted in relative enrichment in antibodies recognizing in vivo expressed antigens. The library from Phdp Lg14/01 constructed in E. coli BL21 (DE3) consisted of approximately 6500 recombinants. A total of 117 clones were selected for their reactivity with pooled adsorbed and non-adsorbed sera from convalescent S. senegalensis specimens after a first round of screening. In a second screening, 14 out of 117 candidate clones showed positive reaction, among which two clones were clearly positive and two gave weak reaction against adsorbed sera. Predicted proteins codified by inserted sequences have intracellular and membrane cell location and are involved in virulence, synthesis of intermediary products, energy metabolism and gene replication. Inosine-5’-monophosphate dehydrogenase (IMPDH) and alkyl hydroperoxide reductase (AhpC) have been identified as in vivo induced antigens expressed during S. senegalensis infection with Phdp. Iron/manganese superoxide dismutase (Fe/Mn-SOD) and alanyl-tRNA synthetase (AlaRS) proteins have also been identified, though with weak signal. Discussion and conclusion Identification of immunogenic bacterial proteins during Phdp infection is essential for understanding bacterial pathogenesis and development of effective vaccines. AhpC peroxidase activity has a protective role by reducing hydrogen peroxide, peroxynitrite and organic hydroperoxides. Immunization with AhpC conferred protection against Helicobacter pylori infection (O’Riordan et al., 2012). IMPDH catalyzes the conversion of products essential in de novo synthesis of guanine nucleotides. Adequate levels of purine nucleotides are critical for cell proliferation, nucleic acid replication, cell signaling and as a biochemical energy source. This gene is an important therapeutic target against bacterial diseases (Shu and Nair,2008). In conclusion, different genes expressed during Phdp infection in S. senegalensis have been identified. Among them, IMPDH and AhpC have been identified as in vivo induced antigens expressed during S. senegalensis infection with Phdp. Thus, they are likely to play a role in the virulence of Phdp. The antigenic character of these proteins makes them potential targets for the development of new vaccines. References Andreoni, F., and Magnani, M., 2014. Photobacteriosis: Prevention and Diagnosis. Journal of Immunology Research, 2014: 1-7. Do Vale, A., Silva, M.T., dos Santos, N.M., Nascimento, D.S., Reis Rodrigues, P., Costa Ramos, C., Ellis, A.E., and Azevedo, J.E., 2005. AIP56, a novel plasmid-encoded virulence factor of Photobacterium damselae subsp. piscicida with apoptogenic activity against sea bass macrophages and neutrophils. Molecular Microbiology, 58: 1025-1038. Handfield, M., Brady, L.J., Progulske-Fox, A., and Hillman, J.D., 2000. IVIAT: a novel method to identify microbial genes expressed specifically during human infections. Trends in Microbiology, 8: 336-339. O’Riordan A.A., Morales V.A., Mulligan L., Faheem N., Windle H.J., and Kelleher D.P., 2012. Alkyl hydroperoxide reductase: a candidate Helicobacter pylori vaccine. Vaccine, 30:3876-3884. Shu, Q., and Nair, V., 2008. Inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH) as a target in drug discovery. Medicinal Research Reviews, 28:219-232.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

    Insights into the fecal microbiota of captive Iberian lynx (Lynx pardinus)

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    The Iberian lynx (Lynx pardinus) is an endangered species restricted to several areas of Spain and Portugal. Its low genetic diversity likely provokes immune depression and high susceptibility to infectious diseases. The intestinal microbiota is closely related to host health and nutrition. In order to contribute to the knowledge of the Iberian lynx intestinal microbiota, fecal microbiota of captive specimens from two breeding centers (“La Olivilla” and “El Acebuche”), located in Southern Spain, were studied by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE). Results grouped microbiota in two main clusters (I and III) which included DGGE patterns of 19 out of 36 specimens, cluster I being the most frequent in “La Olivilla” (50%) and cluster III in “El Acebuche” (55.55 %) specimens. Bacteroidetes, Firmicutes and Proteobacteria phyla were identified. Segregation of clusters I and III was attributed to different microorganism presence (Pseudomonas koreensis, Pseudomonas migulae, Carnobacterium sp., Arthrobacter, Robinsoniella peorensis and Ornithinibacillus sp.) and ability to use different carbon sources. Biolog EcoPlates® results indicate high functional diversity of fecal microbiota, it being higher in cluster III. The great impact of intestinal microbiota on host health supports the importance of its microbial composition understanding. This study is the first report of captive Iberian lynx fecal microbiota composition. [Int Microbiol 20(1): 31-41 (2017)]Keywords: Iberian lynx (Lynx pardinus) · fecal microbiota · biodiversit

    Alcoholismo en adolescencia: visión Latinoamericana

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    Alcoholism is an ever-present condition of humanity, in every civilized society; it is only recently in history of science that it’s begun to be understood the implication of abusive alcohol consumption, specially from early stages of life, becoming a health issue in physical matter, as well as in mental health. Strategies for control and education must be taken in consideration. El alcoholismo es una condición siempre presente en la humanidad, en las sociedades civilizadas; apenas recientemente en la historia de la ciencia comienzan a entenderse las implicaciones del consumo abusivo del alcohol, especialmente desde tempranas edades, representando un problema de salud tanto en plano físico como de salud mental. Se deben tomar en consideración estrategias de control y educación.&nbsp

    Modelado estocástico de las operaciones de entrada/salida sobre un disco

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    Una de las técnicas más habituales de evaluación del rendimiento de los subsistemas de entrada/salida de un computador es la utilización de modelos de simulación detallados que tienen en cuenta características específicas de los dispositivos de almacenamiento como la geometría del disco, la división en zonas y los algoritmos utilizados por las políticas de la memoria caché del disco. No obstante, dichos modelos requieren una mayor carga computacional y además están basados en discos que difieren en sus características y prestaciones de los discos más actuales. Otra alternativa es el modelado del dispositivo de almacenamiento, incluyendo su caché, como un proceso estocástico. Esto permite la generación de los tiempos requeridos por las operaciones realizadas sobre el dispositivo con una menor carga computacional y con un alto nivel de fidelidad. De esta manera se puede alcanzar una mayor escalabilidad en la evaluación del rendimiento de subsistemas de entrada/salida mediante simulación. En este trabajo se presenta una evaluación y modelado de un disco de tamaño moderado (20 GB). Los resultados obtenidos demuestran que los tiempos de acceso al disco evaluado constituyen un proceso estocástico estacionario y que este hecho es independiente de la activación o no de la caché de disco. Asi mismo los resultados sugieren que, en ausencia de caché, los tiempos de acceso siguen una distribución normal. En cambio, en presencia de caché, el tiempo de acceso se puede modelar como la composición de varias funciones de distribución, debido al efecto de la propia caché. En ambos casos nuestro modelo se ajusta a los datos experimentales con un error cuadrático medio menor al 1%.Publicad

    Mapas de conocimiento regional: Agricultura, ganadería y turismo en el municipio de Montería – Colombia

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    This article collects the results of a research whose objective is to design knowledge maps (MC) applied to regional knowledge management for the sectors that drive the economy in the municipality of Montería, such as; livestock, agriculture and tourism. This article recognizes the components of a regional information system (SIR) to determine the factors and actors that are immersed in an innovation system. The methodology used is descriptive, based on the SIR that identifies the documentary sources and specific classifications for a region, with this information the profiles containing the MC are built. The discussion revolved around the fact that the sources of information found are diverse to the needs of identification of regional knowledge, in this sense the results reflect three types of MC, one for each sector where the actors, structures, infrastructure, resources and social capital. Likewise, the absence of elements such as technology parks was detected, which help to manage knowledge between actors, and it was concluded that it is relevant to know the information flows between sectors and actors for the analysis of CMs and facilitate knowledge management in the municipality, because they promote innovation and development, for the construction of territorial development plans.Este artículo recoge los resultados de una investigación cuyo objetivo es diseñar mapas de conocimiento (MC) aplicado a la gestión del conocimiento regional para los sectores que impulsan la economía en el municipio de Montería, como son; la ganadería, la agricultura y el turismo. En el presente artículo se reconocen los componentes de un Sistema de Información Regional (SIR) para determinar los factores y actores que están inmersos en un sistema de innovación. La metodología utilizada es de tipo descriptiva, basada en los SIR que identifica las fuentes documentales y clasificaciones específicas para una región, con esta información se construyen los perfiles que contienen los MC. La discusión giró entorno a que las fuentes de información encontradas son diversas a las necesidades de identificación del conocimiento regional, en este sentido los resultados reflejan tres tipos de MC, uno por cada sector donde se recogen los actores, las estructuras, la infraestructura, los recursos y el capital social. Asimismo, se detectó la ausencia de elementos como parques tecnológicos, que ayudan a gestionar el conocimiento entre actores, y se concluyó que es relevante conocer los flujos de información entre los sectores y actores para el análisis de los MC y faciliten la gestión del conocimiento en el municipio, debido a que estos promueven la innovación y el desarrollo, para la construcción de planes de desarrollo territorial

    Mapas de conocimiento regional: Agricultura, ganadería y turismo en el municipio de Montería – Colombia

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    This article collects the results of a research whose objective is to design knowledge maps (MC) applied to regional knowledge management for the sectors that drive the economy in the municipality of Montería, such as; livestock, agriculture and tourism. This article recognizes the components of a regional information system (SIR) to determine the factors and actors that are immersed in an innovation system. The methodology used is descriptive, based on the SIR that identifies the documentary sources and specific classifications for a region, with this information the profiles containing the MC are built. The discussion revolved around the fact that the sources of information found are diverse to the needs of identification of regional knowledge, in this sense the results reflect three types of MC, one for each sector where the actors, structures, infrastructure, resources and social capital. Likewise, the absence of elements such as technology parks was detected, which help to manage knowledge between actors, and it was concluded that it is relevant to know the information flows between sectors and actors for the analysis of CMs and facilitate knowledge management in the municipality, because they promote innovation and development, for the construction of territorial development plans.Este artículo recoge los resultados de una investigación cuyo objetivo es diseñar mapas de conocimiento (MC) aplicado a la gestión del conocimiento regional para los sectores que impulsan la economía en el municipio de Montería, como son; la ganadería, la agricultura y el turismo. En el presente artículo se reconocen los componentes de un Sistema de Información Regional (SIR) para determinar los factores y actores que están inmersos en un sistema de innovación. La metodología utilizada es de tipo descriptiva, basada en los SIR que identifica las fuentes documentales y clasificaciones específicas para una región, con esta información se construyen los perfiles que contienen los MC. La discusión giró entorno a que las fuentes de información encontradas son diversas a las necesidades de identificación del conocimiento regional, en este sentido los resultados reflejan tres tipos de MC, uno por cada sector donde se recogen los actores, las estructuras, la infraestructura, los recursos y el capital social. Asimismo, se detectó la ausencia de elementos como parques tecnológicos, que ayudan a gestionar el conocimiento entre actores, y se concluyó que es relevante conocer los flujos de información entre los sectores y actores para el análisis de los MC y faciliten la gestión del conocimiento en el municipio, debido a que estos promueven la innovación y el desarrollo, para la construcción de planes de desarrollo territorial

    Aspiration of excess follicles before intrauterine insemination in high response cycles

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    Purpose To assess the outcome of excess follicle aspiration before intrauterine insemination (EFABI) in intrauterine insemination (IUI) cycles with 4-6 follicles >= 14 mm. Methods A retrospective case-control study with 1559 patients undergoing IUI (donor and husband's sperm), of whom 86 underwent EFABI. We studied also an historical series of 2213 patients before EFABI implementation. For 3.5 years, all women undergoing IUI developing 4-6 follicles >= 14 mm were offered EFABI on the day of hCG administration. Pregnancy rates (PRs), multiple PRs, and adverse effects were measured. Results EFABI was associated with a similar multiple PR (17.8% vs 17.5% in non-EFABI cases), with no triplets in EFABI patients. Live birth rates were significantly higher in EFABI cycles in IUI overall (25.5% vs 15.2%). When considered separately, the performance of EFABI resulted in significantly increased live birth rates in IUI-donor cycles (32.5% vs 18.5%), whereas the differences in IUI-husband cycles (19.5% vs 12.9%) did not reach statistical significance. The PR was 21.2% during the EFABI implementation period and 19.4% in the pre-EFABI period. Conclusions EFABI in cycles in which 4-6 follicles reach >= 14 mm is a simple option that reduces cycle cancellation rates, results in higher PRs than cycles with 1-3 follicles, and lowers the risk of multiple pregnancy
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