Transcription factor clusters regulate genes in eukaryotic cells

Transcription is regulated through binding factors to gene promoters to activate or repress expression, however, the mechanisms by which factors find targets remain unclear. Using single-molecule fluorescence microscopy, we determined in vivo stoichiometry and spatiotemporal dynamics of a GFP tagged repressor, Mig1, from a paradigm signaling pathway of Saccharomyces cerevisiae. We find the repressor operates in clusters, which upon extracellular signal detection, translocate from the cytoplasm, bind to nuclear targets and turnover. Simulations of Mig1 configuration within a 3D yeast genome model combined with a promoter-specific, fluorescent translation reporter confirmed clusters are the functional unit of gene regulation. In vitro and structural analysis on reconstituted Mig1 suggests that clusters are stabilized by depletion forces between intrinsically disordered sequences. We observed similar clusters of a co-regulatory activator from a different pathway, supporting a generalized cluster model for transcription factors that reduces promoter search times through intersegment transfer while stabilizing gene expression

Für | For Manfred from his Students

Dieses Buch enthält Beiträge von Personen, die ihre Magister- oder Doktorarbeit unter der Betreuung von Manfred Krifka geschrieben haben. Es ist als kleines Abschiedsgeschenk für Manfred Krifka zum Ende seiner Amtszeit als Direktor des Leibniz-Zentrums für Allgemeine Sprachwissenschaft gedacht. Die Herausgeberin und der Herausgeber haben Beiträge zu sprachwissenschaftlichen und nicht-sprachwissenschaftlichen Themen in einer Vielzahl von Genres gesammelt. Diese Vielfalt spiegelt die Interessen und Forschungsthemen von Manfred Krifka wider. Sie spiegelt auch die Vielfalt der Menschen wider, denen Manfred Krifka geholfen hat