Chirurgiczna rewaskularyzacja mięśnia sercowego bez użycia krążenia pozaustrojowego - alternatywna technika bezpośredniej rewaskularyzacji mięśnia sercowego

Operacje pomostowania tętnic wieńcowych (CABG) bez użycia krążenia pozaustrojowego cieszą się coraz większą popularnością i zaczynają zastępować chirurgiczną rewaskularyzację mięśnia sercowego z wykorzystaniem krążenia pozaustrojowego. Idea operacji na bijącym sercu zrodziła się na początku XX wieku. Prekursorzy tej metody leczenia choroby wieńcowej serca — Sabiston i Kolessov — swoje pierwsze udane zabiegi przeprowadzili we wczesnych latach 60. Rozwój technologii medycznych przyczynił się do poprawy stabilizacji i ekspozycji pola operacyjnego, czego skutkiem był wzrost zainteresowania zabiegami bez użycia krążenia pozaustrojowego (OPCAB). W randomizowanych, retrospektywnych badaniach wykazano przewagę operacji na bijącym sercu nad tradycyjnymi zabiegami CABG z powodu: zmniejszenia potrzeby transfuzji, skrócenia czasu intubacji po operacji, spadku częstości występowania okołooperacyjnych zawałów serca i udarów mózgu, redukcji kosztów hospitalizacji i skrócenia okresu pobytu na oddziałach intensywnej terapii. Niestety, niewielka liczba randomizowanych, wieloośrodkowych badań prospektywnych nie daje wystarczających dowodów istnienia innych zalet OPCAB, szczególnie u chorych, których dotyczy małe ryzyko operacyjne. (Folia Cardiol. 2004; 11: 255–264

Chirurgiczna rewaskularyzacja mięśnia sercowego bez użycia krążenia pozaustrojowego - alternatywna technika bezpośredniej rewaskularyzacji mięśnia sercowego

Operacje pomostowania tętnic wieńcowych (CABG) bez użycia krążenia pozaustrojowego cieszą się coraz większą popularnością i zaczynają zastępować chirurgiczną rewaskularyzację mięśnia sercowego z wykorzystaniem krążenia pozaustrojowego. Idea operacji na bijącym sercu zrodziła się na początku XX wieku. Prekursorzy tej metody leczenia choroby wieńcowej serca — Sabiston i Kolessov — swoje pierwsze udane zabiegi przeprowadzili we wczesnych latach 60. Rozwój technologii medycznych przyczynił się do poprawy stabilizacji i ekspozycji pola operacyjnego, czego skutkiem był wzrost zainteresowania zabiegami bez użycia krążenia pozaustrojowego (OPCAB). W randomizowanych, retrospektywnych badaniach wykazano przewagę operacji na bijącym sercu nad tradycyjnymi zabiegami CABG z powodu: zmniejszenia potrzeby transfuzji, skrócenia czasu intubacji po operacji, spadku częstości występowania okołooperacyjnych zawałów serca i udarów mózgu, redukcji kosztów hospitalizacji i skrócenia okresu pobytu na oddziałach intensywnej terapii. Niestety, niewielka liczba randomizowanych, wieloośrodkowych badań prospektywnych nie daje wystarczających dowodów istnienia innych zalet OPCAB, szczególnie u chorych, których dotyczy małe ryzyko operacyjne. (Folia Cardiol. 2004; 11: 255–264

Human NK Cells Differ More in Their KIR2DL1-Dependent Thresholds for HLA-Cw6-Mediated Inhibition than in Their Maximal Killing Capacity

In this study we have addressed the question of how activation and inhibition of human NK cells is regulated by the expression level of MHC class I protein on target cells. Using target cell transfectants sorted to stably express different levels of the MHC class I protein HLA-Cw6, we show that induction of degranulation and that of IFN-γ secretion are not correlated. In contrast, the inhibition of these two processes by MHC class-I occurs at the same level of class I MHC protein. Primary human NK cell clones were found to differ in the amount of target MHC class I protein required for their inhibition, rather than in their maximum killing capacity. Importantly, we show that KIR2DL1 expression determines the thresholds (in terms of MHC I protein levels) required for NK cell inhibition, while the expression of other receptors such as LIR1 is less important. Furthermore, using mathematical models to explore the dynamics of target cell killing, we found that the observed delay in target cell killing is exhibited by a model in which NK cells require some activation or priming, such that each cell can lyse a target cell only after being activated by a first encounter with the same or a different target cell, but not by models which lack this feature

Proteomic Analysis of S-Acylated Proteins in Human B Cells Reveals Palmitoylation of the Immune Regulators CD20 and CD23

S-palmitoylation is a reversible post-translational modification important for controlling the membrane targeting and function of numerous membrane proteins with diverse roles in signalling, scaffolding, and trafficking. We sought to identify novel palmitoylated proteins in B lymphocytes using acyl-biotin exchange chemistry, coupled with differential analysis by liquid-chromatography tandem mass spectrometry. In total, we identified 57 novel palmitoylated protein candidates from human EBV-transformed lymphoid cells. Two of them, namely CD20 and CD23 (low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor), are immune regulators that are effective/potential therapeutic targets for haematological malignancies, autoimmune diseases and allergic disorders. Palmitoylation of CD20 and CD23 was confirmed by heterologous expression of alanine mutants coupled with bioorthogonal metabolic labeling. This study demonstrates a new subset of palmitoylated proteins in B cells, illustrating the ubiquitous role of protein palmitoylation in immune regulation

Blimp1 Activation by AP-1 in Human Lung Cancer Cells Promotes a Migratory Phenotype and Is Inhibited by the Lysyl Oxidase Propeptide

B lymphocyte-induced maturation protein 1 (Blimp1) is a master regulator of B cell differentiation, and controls migration of primordial germ cells. Recently we observed aberrant Blimp1 expression in breast cancer cells resulting from an NF-κB RelB to Ras signaling pathway. In order to address the question of whether the unexpected expression of Blimp1 is seen in other epithelial-derived tumors, we selected lung cancers as they are frequently driven by Ras signaling. Blimp1 was detected in all five lung cancer cell lines examined and shown to promote lung cancer cell migration and invasion. Interrogation of microarray datasets demonstrated elevated BLIMP1 RNA expression in lung adenocarcinoma, pancreatic ductal carcinomas, head and neck tumors as well as in glioblastomas. Involvement of Ras and its downstream kinase c-Raf was confirmed using mutant and siRNA strategies. We next addressed the issue of mechanism of Blimp1 activation in lung cancer. Using knockdown and ectopic expression, the role of the Activator Protein (AP)-1 family of transcription factors was demonstrated. Further, chromatin immunoprecipitation assays confirmed binding to identified AP-1 elements in the BLIMP1 promoter of ectopically expressed c-Jun and of endogenous AP-1 subunits following serum stimulation. The propeptide domain of lysyl oxidase (LOX-PP) was identified as a tumor suppressor, with ability to reduce Ras signaling in lung cancer cells. LOX-PP reduced expression of Blimp1 by binding to c-Raf and inhibiting activation of AP-1, thereby attenuating the migratory phenotype of lung cancer cells. Thus, Blimp1 is a mediator of Ras/Raf/AP-1 signaling that promotes cell migration, and is repressed by LOX-PP in lung cancer

ATHENA: A knowledge-based hybrid backpropagation-grammatical evolution neural network algorithm for discovering epistasis among quantitative trait Loci

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Growing interest and burgeoning technology for discovering genetic mechanisms that influence disease processes have ushered in a flood of genetic association studies over the last decade, yet little heritability in highly studied complex traits has been explained by genetic variation. Non-additive gene-gene interactions, which are not often explored, are thought to be one source of this "missing" heritability.</p> <p>Methods</p> <p>Stochastic methods employing evolutionary algorithms have demonstrated promise in being able to detect and model gene-gene and gene-environment interactions that influence human traits. Here we demonstrate modifications to a neural network algorithm in ATHENA (the Analysis Tool for Heritable and Environmental Network Associations) resulting in clear performance improvements for discovering gene-gene interactions that influence human traits. We employed an alternative tree-based crossover, backpropagation for locally fitting neural network weights, and incorporation of domain knowledge obtainable from publicly accessible biological databases for initializing the search for gene-gene interactions. We tested these modifications <it>in silico </it>using simulated datasets.</p> <p>Results</p> <p>We show that the alternative tree-based crossover modification resulted in a modest increase in the sensitivity of the ATHENA algorithm for discovering gene-gene interactions. The performance increase was highly statistically significant when backpropagation was used to locally fit NN weights. We also demonstrate that using domain knowledge to initialize the search for gene-gene interactions results in a large performance increase, especially when the search space is larger than the search coverage.</p> <p>Conclusions</p> <p>We show that a hybrid optimization procedure, alternative crossover strategies, and incorporation of domain knowledge from publicly available biological databases can result in marked increases in sensitivity and performance of the ATHENA algorithm for detecting and modelling gene-gene interactions that influence a complex human trait.</p

Erratum to: 36th International Symposium on Intensive Care and Emergency Medicine

[This corrects the article DOI: 10.1186/s13054-016-1208-6.]