Integration and comparison of different genomic data for outcome prediction in cancer

Clinical data per cancer type. (XLSX 9 kb

Study protocol for the evaluation of the health effects of superblocks in barcelona : The "salut als carrers" (health in the streets) project

Superblocks are currently being introduced in Barcelona to respond to the city's scarcity of green spaces and high levels of air pollution, traffic injuries, and sedentariness. The aim is to calm the streets by reducing the number of square meters dedicated to private vehicles and to reclaim part of this public space for people. Salut als Carrers (Health in the Streets) is a project to evaluate the potential environmental and health effects of the superblock model with an equity perspective in Barcelona. This study aims to explain the various interventions implemented in different neighborhoods in Barcelona and the methods that will be used to evaluate them in a quasi-experimental and health impact assessment (HIA) approaches. Given the complexity of the intervention evaluated, the project employs mixed methodologies. Quantitative methods include: (a) a pre-post health survey of 1200 people randomly selected from the municipal register asked about self-perceived health and quality of life, social support, mental health, mobility, physical activity, neighborhood characteristics, and housing; (b) pre-post environmental measurements, mainly of nitrogen dioxide (NO), particulate matter of less than 10 µm (PM), and particulate matter of less than 2.5 µm (PM) and black carbon; (c) pre-post environmental walkability measures using the Microscale Audit of Pedestrian Streetscapes (MAPS) tool; (d) use of public space and physical activity levels using the System for Observing Play and Recreation in Communities (SOPARC), a validated observation tool; (e) pre-post traffic injury measures with a comparison group; and (f) the comparison and integration of pre-post assessment with previous HIAs and the improvement of future HIAs. Qualitative studies will be performed to analyze residents' perception of these effects by using: (a) various focus groups according to different participant characteristics who are more or less likely to use the superblocks; and (b) a guerrilla ethnography, which is a method that combines ethnographic observation and semi-structured interviews. This study, which evaluates the impact of an ambitious urban-renewal program on health, will help to assess the effectiveness of public policy in terms of health and health inequalities

A model of membrane contraction predicting initiation and completion of bacterial cell division

Bacterial cell division involves a complex and dynamic sequence of events whereby polymers of the protein FtsZ assemble at the division plane and rearrange to achieve the goal of contracting the cell membrane at the site of cell division, thus dividing the parent cell into two daughter cells. We present a mathematical model (which we refer to as CAM-FF: Critical Accumulation of Membrane-bound FtsZ Fibres) of the assembly of the contractile ring in terms of the accumulation of short linear polymers of FtsZ that associate and dissociate from the cell membrane. In prokaryotes, the biochemical function of FtsZ is thought to underpin the assembly and at least the initial kinetic force of ring contraction. Our model extends earlier work of Surovtsev et al. [PLoS Comput. Biol., 2008, 4, e1000102] by adding (i) the kinetics of FtsZ accumulation on cell membrane anchor proteins and (ii) the physical forces required to deform the cell against its surface tension. Moreover, we provide a more rigorous treatment of intracellular diffusion and we revise some of the model parameter values in light of the experimental evidence now available. We derive a critical contraction parameter which links the chemical population dynamics of membrane-bound FtsZ molecules to the force of contraction. Using this parameter as a tool to predict the ability of the cell to initiate division, we are able to predict the division outcome in cells depleted of key FtsZ-binding proteins

Factores clínicos y electrocardiográficos como predictores de mortalidad en pacientes en fase aguda de un primer evento cerebrovascular Clinical and electrocardiographic factors as mortality predictors in patients in the acute phase of a first cerebrovasc

RESUMENIntroducción: El accidente cerebrovascular (ACV) es la segunda causa de muerte y tercera causa dediscapacidad en el mundo.Objetivo:Evaluar la asociación entre variables clínicas, electrocardiográficas,escalas neurológicas en pacientes con ACV como predictoras de mortalidad a 3 meses posteriores al egreso hospitalario. Materiales y métodos: Estudio de cohorte prospectivo con muestreo no probabilístico, en pacientes mayores de 18 años con primer ACV. Se evaluaron variables demográficos,clínicas, escalas neurológicas del Instituto Nacional de Salud (NIHSS) y canadiense (CNS), variabilidad de la frecuencia cardiaca (VFC) y del QT (QTV), dispersión del QT. Se determinó la mortalidad a los tres meses de seguimiento. Se realizó análisis bivariado y de regresión logística múltiple cuyo desenlacefue mortalidad a tres meses post egreso hospitalario, incluyendo variables con baja correlación (r< 0.4) y significancia estadística (p<0.05).Resultados: Se incluyeron 92 pacientes, 13 de los cuales fallecieron en la fase de tratamiento intrahospitalario. Se realizó seguimiento durante tres meses después del egreso hospitalario en 81 pacientes. La mortalidad total en tres meses de seguimiento fue del 21.7%(n=20).Se identificaron cinco variables predictoras de mortalidad en el modelo final: puntaje de escala NIHSS,frecuencia cardiaca media, VLF QT ≥36.311, LF/HF ≤1.019, valores extremos r-MSD (≥7.985o≤2.363) de VFC. La capacidad discriminatoria del modelo mediante el análisis del área bajo la curva fue de 0.95, con valores de sensibilidad y especificidad del 60% y 93% respectivamente.Conclusión:Altos puntajes de escala NIHSS, VLF-QT, frecuencia cardiaca media, así como valores bajos LF/HF y valores extremosr-MSD, fueron factores de riesgo independientes para mortalidad a los 90 días después de un primer ACV.Palabras Clave: Accidente cerebrovascular, Electrocardiografia, Frecuencia cardiaca, Mortalidad, Predicción.ABSTRACTIntroduction:Stroke is the second cause of death and third cause of disability worldwide.Objective: To assess association between clinical and electrocardiographic variables, neurological scales in stroke patients like predictorsof mortality at three months after hospital discharge.Subjects and methods:Prospective cohort with nonprobabilistic sampling, in patients over 18 years with first stroke. Demographic and clinical variables, neurological scales (NIHSS, Canadian), heart rate (HRV) and QT variability (QTV), QT dispersion were evaluated. Mortality was determined during the 3 months follow up. Bivariate and multiple logistic regression analysis were performed with mortality at three months after discharge as outcome. Variables were included in the model if they have low correlation (r<0.4) and significant statistically p values (P< 0.05).Results: 92 patients were included in the study,13 patients died during the intra-hospital stay, 81 were followed at 3 months after their hospital discharge. Totalmortality in patients included at three months follow-up was 21.7 % (n=20). We identified five predictors of mortality in the final model: NIHSS score, mean heart rate, VLF QT ≥36,311, LF/HF ≤ 1,019, extreme values of r-MSD (≥ 7,985 or ≤ 2,363) of HRV. The area under the curve (AUC) of the model was 0,95 with sensitivity of 60% and specificity of 93%. Conclusions: High NIHSS scores, VLF-QT, mean heart rate, low values of LF/HF and high extreme values of r-MSD were independent risk factors for mortality at 90 days after a first stroke.Keywords: Stroke, Electrocardiography, Heart Rate, Mortality Prediction. Forma de citar: Rueda Ochoa OL, Torres Mantilla HA, Fernández Dulcey CA, Villa Acuña MM, Velasco Gómez ST, Niño Niño CA, Sierra Bueno DA. Factores clínicos y electrocardiográficos como predictores de mortalidad en pacientes en fase aguda de un primer evento cerebrovascular. rev.univ.ind.santander.salud 2014; 46(2): 147-158

Factores clínicos y electrocardiográficos como predictores de mortalidad en pacientes en fase aguda de un primer evento cerebrovascular Clinical and electrocardiographic factors as mortality predictors in patients in the acute phase of a first cerebrovasc

RESUMENIntroducción: El accidente cerebrovascular (ACV) es la segunda causa de muerte y tercera causa dediscapacidad en el mundo.Objetivo:Evaluar la asociación entre variables clínicas, electrocardiográficas,escalas neurológicas en pacientes con ACV como predictoras de mortalidad a 3 meses posteriores al egreso hospitalario. Materiales y métodos: Estudio de cohorte prospectivo con muestreo no probabilístico, en pacientes mayores de 18 años con primer ACV. Se evaluaron variables demográficos,clínicas, escalas neurológicas del Instituto Nacional de Salud (NIHSS) y canadiense (CNS), variabilidad de la frecuencia cardiaca (VFC) y del QT (QTV), dispersión del QT. Se determinó la mortalidad a los tres meses de seguimiento. Se realizó análisis bivariado y de regresión logística múltiple cuyo desenlacefue mortalidad a tres meses post egreso hospitalario, incluyendo variables con baja correlación (r< 0.4) y significancia estadística (p<0.05).Resultados: Se incluyeron 92 pacientes, 13 de los cuales fallecieron en la fase de tratamiento intrahospitalario. Se realizó seguimiento durante tres meses después del egreso hospitalario en 81 pacientes. La mortalidad total en tres meses de seguimiento fue del 21.7%(n=20).Se identificaron cinco variables predictoras de mortalidad en el modelo final: puntaje de escala NIHSS,frecuencia cardiaca media, VLF QT ≥36.311, LF/HF ≤1.019, valores extremos r-MSD (≥7.985o≤2.363) de VFC. La capacidad discriminatoria del modelo mediante el análisis del área bajo la curva fue de 0.95, con valores de sensibilidad y especificidad del 60% y 93% respectivamente.Conclusión:Altos puntajes de escala NIHSS, VLF-QT, frecuencia cardiaca media, así como valores bajos LF/HF y valores extremosr-MSD, fueron factores de riesgo independientes para mortalidad a los 90 días después de un primer ACV.Palabras Clave: Accidente cerebrovascular, Electrocardiografia, Frecuencia cardiaca, Mortalidad, Predicción.ABSTRACTIntroduction:Stroke is the second cause of death and third cause of disability worldwide.Objective: To assess association between clinical and electrocardiographic variables, neurological scales in stroke patients like predictorsof mortality at three months after hospital discharge.Subjects and methods:Prospective cohort with nonprobabilistic sampling, in patients over 18 years with first stroke. Demographic and clinical variables, neurological scales (NIHSS, Canadian), heart rate (HRV) and QT variability (QTV), QT dispersion were evaluated. Mortality was determined during the 3 months follow up. Bivariate and multiple logistic regression analysis were performed with mortality at three months after discharge as outcome. Variables were included in the model if they have low correlation (r<0.4) and significant statistically p values (P< 0.05).Results: 92 patients were included in the study,13 patients died during the intra-hospital stay, 81 were followed at 3 months after their hospital discharge. Totalmortality in patients included at three months follow-up was 21.7 % (n=20). We identified five predictors of mortality in the final model: NIHSS score, mean heart rate, VLF QT ≥36,311, LF/HF ≤ 1,019, extreme values of r-MSD (≥ 7,985 or ≤ 2,363) of HRV. The area under the curve (AUC) of the model was 0,95 with sensitivity of 60% and specificity of 93%. Conclusions: High NIHSS scores, VLF-QT, mean heart rate, low values of LF/HF and high extreme values of r-MSD were independent risk factors for mortality at 90 days after a first stroke.Keywords: Stroke, Electrocardiography, Heart Rate, Mortality Prediction. Forma de citar: Rueda Ochoa OL, Torres Mantilla HA, Fernández Dulcey CA, Villa Acuña MM, Velasco Gómez ST, Niño Niño CA, Sierra Bueno DA. Factores clínicos y electrocardiográficos como predictores de mortalidad en pacientes en fase aguda de un primer evento cerebrovascular. rev.univ.ind.santander.salud 2014; 46(2): 147-158

Data Communication Magazine

Los multiplexores son herramientas importantes en la comunicación de datos, debido a que se permiten en envío de diferentes señales a través de un solo medio. En la actualidad, son aplicados en diversas áreas entres las que se encuentran seguridad, redes telefónicas, redes internas, entre otras.Desarrollo e implementación de un multiplexor y demultiplexor por división de timepo para la transmisión de señales digitales, triangualres y análogas. -- Proyecto de simulación de la trasformada de fourier discreta es sus aplicaciones físicas (transmisión de datos). -- Medición de pérdida de potencia. -- Opnet: modelado de infiniband(iba). -- Construcción de un escenario para la transmisión de datos mediante el uso de telefonía ip. -- Simulación de algoritmos de programación. -- Conmutación de paquetes. -- Simulación de computacional. -- Descripción de procedimientos para el muestreo y reconstrucción de señales. -- Planeación, diseño y desarrollo de un software didáctico. -- Descripción de los principales puertos usados en la comunicación de datos. -- Esquemas de codificación.Multiplexers are important tools in data communication because they allow different signals to be sent through a single medium. Currently, they are applied in various areas, including security, telephone networks, internal networks, among others

Ciencia Odontológica 2.0

Libro que muestra avances de la Investigación Odontológica en MéxicoEs para los integrantes de la Red de Investigación en Estomatología (RIE) una enorme alegría presentar el segundo de una serie de 6 libros sobre casos clínicos, revisiones de la literatura e investigaciones. La RIE está integrada por cuerpos académicos de la UAEH, UAEM, UAC y UdeG

Mis casos clínicos de especialidades odontológicas

Libro que muestra la atención de casos clínicos particulares referente a las diferentes especialidades odontológicasLibro que muestra la atención de casos clínicos particulares referente a las diferentes especialidades odontológicasUniversidad Autónoma de Campeche Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo Universidad Autónoma del Estado de Méxic

Capitulo 2. Ciencias Naturales y Ciencias Básicas, Ingeniería y Tecnología

La diseminación de la Levitación Magnética, a pesar de lo antiguo de su tecnología, ha sido limitada. Debido a sus inconvenientes prácticos de implementación, su uso es bastante restringido, comparado con otras tecnologías (SCMaglev japonés, Transrapid alemán, o productos comerciales para ocio y entretenimiento). Con el boom de las tecnologías limpias y amigables con el medio ambiente y en concordancia con los objetivos del milenio, es pertinente plantearse el objetivo de optimizar el proceso de Levitación Magnética para generar un aprovechamiento de las ventajas de esta tecnología a nivel mecánico, eléctrico, y ambiental.  Actualmente la UNAD adelanta un proyecto de investigación cuyo objetivo es generar un modelo físico matemático de levitación magnética para aplicaciones en ingeniería. De este proyecto se ha derivado una primera revisión sistemática de los principios físicos y los modelos vigentes en Levitación Magnética