Analisis in silico de la base molecular del proceso de dormancia en Ilex Paraguariensis

Anais do V Encontro de Iniciação Científica e I Encontro Anual de Iniciação ao Desenvolvimento Tecnológico e Inovação – EICTI 2016 - 05 e 07 de outubro de 2016 – Sessão BiológicasEl cultivo de Yerba Mate enfrenta dificultades consecuencia del escaso proceso de domesticación por el cual ha pasado esta planta, lo que lleva a que se conserven la mayoría de sus características silvestres, poco deseables para la agricultura, como la baja tasa de germinación de sus semillas y desuniformidad de la misma provocada por un fenómeno de dormancia que puede prolongarse hasta 1 año. La dormancia se da como resultado de la interacción entre promotores e inhibidores de la germinación que se instalan en el embrión cuando el fruto es aun inmaduro, impidiendo la germinación. El objetivo de este trabajo es entender el proceso de dormancia y su término, en Ilex paraguariensis a nivel molecular. Vale mencionar que la metodología original fue modificada en el curso del estudio debido a dificultades que fueron surgiendo, no obstante el objetivo general propuesto inicialmente se mantuvo, enfocando identificar las rutas metabólicas y los genes involucrados en el control y regulación del proceso de germinación, específicamente del fenómeno de dormancia. Este trabajo pretende no solo aportar conocimiento específico sobre la biología de Ilex, sino que por tratarse de una planta representativa de un grupo de plantas que presentan poca importancia comercial son poco estudiadas, sin embargo no son menos importantes ya que a este grupo pertenecen la mayor parte de plantas no domesticadas que pueblan los ecosistemas naturales y muchas de ellas pueden presentar mecanismos de dormancia similares a los encontrados en Yerba Mate

Disponibilidad de alimentos básicos en Colombia 2000-2010: ¿producción nacional o importaciones?

Como dimensión constitutiva de la seguridad alimentaria, la disponibilidad de alimentos plantea la inquietud sobre la manera de obtener el suministro de alimentos para el país. Frente a este aspecto, la agricultura juega un papel determinante, pues puede ser ésta la que principalmente produzca los alimentos o, desde otra estrategia, la que genere los recursos para importarlos, a través de la producción de otros bienes agrícolas. Este documento establece en qué medida el suministro de un grupo de alimentos de la dieta básica de los colombianos estuvo determinado, entre los años 2000 y 2010, por la autosuficiencia en la producción nacional o, por el contrario, por una dependencia de importaciones de estos alimentos, considerando la concepción que ha tenido la política pública agropecuaria en cuanto a la orientación productiva de la agricultura colombiana. / Abstract. As a constitutive dimension of food security, food availability raises concerns on how to get food supplies for the country. Given this aspect, agriculture plays an important role, either by producing food or by generating resources to import food through the production of other agricultural goods. Considering the Colombian agriculture production orientation, according to the agricultural policy established between 2000 and 2010, this paper discusses if food supplies in Colombians basic diet was determinated during this period,either by self-sufficiency in domestic production or by a dependence on these foods imports.Maestrí

Estrategias defensivas en el mercado de renta variable en Colombia a la baja

El Mercado de Renta Variable en Colombia sigue estando en desarrollo, así como la confianza de los inversionistas a la hora de tomar decisiones de elección de portafolios óptimos de inversión, los cuales le brinden la maximización de los retornos esperados a un mínimo riesgo. Por lo anterior esta investigación explora y conoce más a fondo los sectores que conforman el mercado accionario y determina cual es más rentable que otro, a través del modelo propuesto por Harry Markowitz y teniendo en cuenta los avances a la teoría hecha por Sharpe a través del índice de Sharpe y Betas. Entre los sectores que conforman El Mercado de Renta Variable en Colombia está el Financiero, Materiales, Energía, Consumo Básico Servicios e Industrial; los cuales siguen la misma tendencia bajista que el Índice del Colcap, el cual en los últimos años está rentando negativamente. Por lo tanto con esta investigación el lector e inversionista cuenta con herramientas que aplican el modelo de Markowitz para vislumbrar de acuerdo a datos históricos, los sectores en los cuales se recomienda invertir y en los que por el contrario de acuerdo a la tendencia de debe desistir. Sin embargo, se aclara que esta investigación se basa en datos históricos, tendencias y cálculos matemáticos que pueden diferenciarse de la realidad actual, dado que por aspectos coyunturales económicos, políticos o sociales puede verse afectadas las rentabilidades de las acciones y sectores en los que decida invertir las personas.The Colombian equity market is still in development as the investors confidence at the decision time to choose optimal investment portfolio that bring them the maximum return with a minimum risk. Therefore, this research explores and make knowledge deepest of the sectors in the stock market in order to determine which sector is more profitable than other through model proposed by Harry Markowitz and considering the progress by Sharpe theory through the Sharpe and Betas index. The sectors in the Colombian equity market are Finance, Materials, Energy, Consumer staples, Utilities and Industrial, that have the same down trend in the Colcap index which in recent years are renting negatively. Therefore with this research the reader and investor has a tool applied by the Markowitz model to glimpse, according to historical data, the sectors in which is recommended to invest and the sectors where have to desist based on this trend. However, it is clear that this research is based on historical data, trends and mathematical calculations and may differ from the actual reality, since by economic, political or social aspects can be affected returns on stocks and sectors where it decides people investing

Estudio de la notación funcional de secuencias relacionadas a la dormancia y germinación en yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil )

Trabajo de Conclusión de Curso presentado al Instituto Latinoamericano de Ciencias de la Vida y la Naturaleza, como requisito parcial a la obtención del titulo de Licenciatura en Ciencias Biológicas – Ecología y Biodiversidad. Orientador: Prof. Dr. Cristian Antonio RojasLa yerba mate es un árbol de la familia Aquifoliaceae descrita por Auguste de Saint Hilaire en 1822 como Ilex paraguariensis, presenta gran importancia social, cultural y económica. Pese a esto, poco se conoce sobre la biología de esta especie, la cual no ha pasado por un proceso considerable de selección y mejoramiento genético presentando características como la dormancia y germinación desuniforme indeseables para el cultivo. En este trabajo se hace una búsqueda de secuencias relacionada a estos procesos en un transcriptoma de Yerba de 200.000 secuencias usando como referencia el genoma de Arabidopsis thaliana, y programas de análisis de secuencias BioEdit. De esta forma se encontró que existe conservación de la mayoría de los dominios estudiados. Al mismo tiempo una fracción del transcriptoma de yerba fue analizado mediante el programa Blast2go dejando en evidencia las principales vías metabólicas de la especie destacando la de purina y tiamina. También se señala a Vitis vinifera como la especie con la cual las secuencias de Ilex paraguariensis mostraron mayor homología. Se logró entonces, un mapeo razonable de las secuencias, teniendo en cuenta la separación filogenética entre las especies comparadas. Asimismo la disponibilidad de un trancriptoma de Yerba ofrece la posibilidad de explorar en profundidad las vías metabólicas por detrás de esta planta.A erva-mate é uma árvore da família Aquifoliaceae descrito por Auguste de Saint Hilaire, em 1822 como Ilex paraguariensis, apresenta grande importância social, cultural e económica, apesar disso, pouco se sabe sobre a biologia desta espécie, a qual não passou por um processo consideravel de seleção e melhoramento apresentando características como dormência e germinação não uniforme indesejável para o cultivo. Neste trabalho se faz uma busca de sequências relacionadas com esses processos em uma transcripto de erva de 200.000 sequências utilizando como referência o genoma de Arabidopsis thaliana, e programas de analises de secuencias BioEdit. Se achou que existe conservação na maioría dos dominios estudados. Ao mesmo tempo uma fracção do transcriptoma da erva foi analisado mediante o programa Blast2go deixando em evidência as principais vías metabólicas da especie, destacando purina e tiamina, também é mostrado Vitis vinifera como a especie com maior similaridade com as secuencias de Ilex paraguariensis. Foi obtido um mapeamento razoável das secuencias, tendo em conta a separação filogenética entre as espécies comparadas, de igual modo a disponibilidade de um trancriptoma de Erva-Mate oferece a oportunidade para explorar a fundo as vias metabólicas, por trás dessa planta

τ−→π−ηντ\tau^- \to \pi^- \eta \nu_\tau decay induced by QED one-loop effects

The $\tau^- \to \pi^-\eta\nu_{\tau}$ decay is forbidden in the Standard Model in the limit of exact $G$-parity, it becomes a rare decay due to isospin symmetry breaking and it is very sensitive to the effects of effective scalar interactions. Since the parameters driving isospin breaking, $(m_d-m_u)/(m_s-\bar{m})$ and $\alpha$, are of the same order, one may expect their $G$-parity breaking effects in this decay can be of similar magnitudes. In this work, we evaluate the effects of isospin-breaking amplitudes originated from a virtual photon at one-loop in a resonance dominance model to describe photon-hadron interactions. We find that these effects can shift the leading SM predictions based on the $u-d$ quark mass difference by roughly $12\%$, and should be taken into consideration in a precision comparison of theory and experiment in order to draw meaningful conclusions on New Physics. The effects in the rate of the analogous $\tau^- \to \pi^-\eta'\nu_{\tau}$ decay can be larger ($\sim$ $78\%$), under the approximations assumed in this model.Comment: 22 pages, 1 figure, 4 table

Incidencia de patógenos ESKAPE y resistencia antimicrobiana en pacientes con dispositivos invasivos en Unidad de Cuidados Intensivos del Hospital Nacional San Rafael

Introducción. La mayoría de infecciones en las UCI son causadas por patógenos ESKAPE, los cuales muestran altas tasas de resistencia a antibióticos mundialmente. Esto aumenta los costos hospitalarios, convirtiéndose en una amenaza para la salud pública. Por esta razón, se plantea la siguiente pregunta de investigación: ¿Cuál es la incidencia de patógenos ESKAPE, su resistencia antimicrobiana y su asociación a dispositivos invasivos durante el primer año de funcionamiento de esta UCI del HNSR? Materiales y Métodos. Se realizó un estudio retrospectivo, transversal, analítico, incluyendo a todos los pacientes que ingresaron en la UCI de HNSR desde el 1 de enero al 31 de diciembre del año 2014. El análisis estadístico se realizó con SPSS Versión 20, GraphPad Prism 6, y OpenEpi. Resultados. Ingresaron al estudio, 150 casos. La edad promedio fue de 52 ±21 años. El 54% (n=81) fueron casos infecciosos y el 13.3% (n=20) fueron casos ESKAPE. El 46.4% (n=26) de los cultivos positivos fue por patógenos ESKAPE. De estos, Acinetobacter baumannii fue el más frecuentemente aislado (50%). Los antibióticos más frecuentemente prescritos fueron ceftriaxona, imipenem, y vancomicina, con una resistencia de 83%, 56.7%, 11.1% respectivamente. El 86.5%(n=32) de casos con neumonía fue asociado a la utilización de TOT (p=0.0005) y estableció que al colocar TOT se presentan 5.2 veces más casos de neumonía en comparación con los pacientes a los que no se les coloca. El 53% (n=17) de los casos de neumonía y TOT fueron casos ESKAPE. Por otro lado, el 11.5% (n=16) de los casos con STU presentó IVU y el 2.8%(n=4) fue por casos ESKAPE. El promedio de los días de estancia en UCI fue de 7.8 días para los casos, 7.3 días para los casos No ESKAPE y 19.5 días para los casos ESKAPE. Conclusiones. La mayoría de los casos fueron infecciosos. Cerca de la mitad de los cultivos positivos de estos casos se le aisló algún patógenos ESKAPE. Acinetobacter 6 baumannii fue el patógeno ESKAPE más aislado.Los antibióticos más frecuentemente prescritos fueron Ceftriaxona e Imipenem, a pesar que presentaron alta tasa de resistencia bacteriana. El dispositivo invasivo más utilizado fue la STU seguido de CVC y TOT. Los casos ESKAPE presentaron un promedio de días de estancia en UCI 2.6 veces mayor que los casos No ESKAPE y 4 veces mayor que los casos no infecciosos.Tesis presentada para optar al título de Doctorado en Medicin

Novel Pole Photogrammetric System for Low-Cost Documentation of Archaeological Sites: The Case Study of “Cueva Pintada”

19 p.Close-range photogrammetry is a powerful and widely used technique for 3D reconstruction of archaeological environments, specifically when a high-level detail is required. This paper presents an innovative low-cost system that allows high quality and detailed reconstructions of indoor complex scenarios with unfavorable lighting conditions by means of close-range nadir and oblique images as an alternative to drone acquisitions for those places where the use of drones is limited or discouraged: (i) indoor scenarios in which both loss of GNSS signal and need of long exposure times occur, (ii) scenarios with risk of raising dust in suspension due to the proximity to the ground and (iii) complex scenarios with variability in the presence of nooks and vertical elements of different heights. The low-altitude aerial view reached with this system allows high-quality 3D documentation of complex scenarios helped by its ergonomic design, self-stability, lightness, and flexibility of handling. In addition, its interchangeable and remote-control support allows to board different sensors and perform both acquisitions that follow the ideal photogrammetric epipolar geometry but also acquisitions with geometry variations that favor a more complete and reliable reconstruction by avoiding occlusions. This versatile pole photogrammetry system has been successfully used to 3D reconstruct and document the “Cueva Pintada” archaeological site located in Gran Canaria (Spain), of approximately 5400 m2 with a Canon EOS 5D MARK II SLR digital camera. As final products: (i) a great quality photorealistic 3D model of 1.47 mm resolution and ±8.4 mm accuracy, (ii) detailed orthophotos of the main assets of the archaeological remains and (iii) a visor 3D with associated information on the structures, materials and plans of the site were obtained.S