Missing observation analysis for matrix-variate time series data

Bayesian inference is developed for matrix-variate dynamic linear models (MV-DLMs), in order to allow missing observation analysis, of any sub-vector or sub-matrix of the observation time series matrix. We propose modifications of the inverted Wishart and matrix t distributions, replacing the scalar degrees of freedom by a diagonal matrix of degrees of freedom. The MV-DLM is then re-defined and modifications of the updating algorithm for missing observations are suggested

A comparative study of Odonata (Insecta) in aquatic ecosystems with distinct characteristicsUm estudo comparativo de Odonata (Insecta) em ecossistemas aquáticos com distintas características

O objetivo deste trabalho foi estudar comparativamente a riqueza e a densidade de larvas de Odonata em quatro ambientes distintos: lótico com grande carga de contaminantes, lótico com pouca carga de contaminantes, lêntico desconectado do rio e lêntico conectado ao rio, assim como caracterizar os quatro ambientes quanto às características físicas e químicas da água. Identificamos um total de 1.302 larvas de Odonata nos quatro ambientes. As variáveis ambientais medidas foram: oxigênio dissolvido, pH, condutividade, sólidos em suspensão, temperaturas do ar e da água, precipitação, profundidade e biomassa das macrófitas. Os ambientes lênticos mostraram uma maior densidade de larvas de Odonata em relação aos lóticos, exceto no mês de abril e dezembro de 2006. O rio Guareí mostrou uma alta condutividade devido à grande quantidade de contaminantes que recebe, no entanto, no período de junho a setembro de 2006, apresentou uma maior densidade de larvas de Odonata em comparação ao rio Paranapanema. A temperatura e oxigênio dissolvido na superfície da água foram, respectivamente, maiores e menores nos lagos em comparação aos rios. Apesar da densidade de larvas de Odonata ter sido maior nos ecossistemas lênticos em relação aos lóticos, a riqueza não se alterou durante o período estudado. Além disso, a composição de gêneros foi distinta, mostrando que alguns táxons apresentam certa preferência por determinados tipos de ecossistemas como Calopterygidae e Neogomphus os quais foram amostrados exclusivamente no rio Paranapanema.Abstract The objective of this study was to compare the richness and density of Odonata larvae in four distinct environments: lotic with large pollutant loads, lotic with small pollutant loads, lentic disconnected from a river and lentic connected to a river, as well as to record the physical and chemical parameters of the water in the four environments. We identified a total of 1,302 Odonata larvae in the four habitats. The environmental variables measured were: dissolved oxygen, pH, conductivity, suspended matter, air and water temperature, precipitation, depth, and the biomass of the macrophytes. The lentic habitats exhibited a greater Odonata larvae density in relation to the lotic habitats, except during April and December of 2006. The Guareí River, however, presented an elevated conductivity, possibly because of a greater quantity of pollutants it received during the period between June and September of 2006, and it showed a higher density of Odonata larvae in comparison to the Paranapanema River. The temperature and the dissolved oxygen on the water surface were, respectively, greater and smaller in the lakes in comparison to the rivers. In spite of the Odonata density being higher in the lentic ecosystems in comparison to the lotic, the richness was not altered during the period studied. Nevertheless, the genera composition was distinct, showing that some taxa show a certain preference for certain types of ecosystems like Calopterygidae and Neogomphus, which were shown exclusively in the Paranapanema River

A variação nictemeral das variáveis físicas e químicas da água influencia a abundância dos macroinvertebrados aquáticos?

The aim of this work was to assess if variation in the abundance of macroinvertebrates is influenced by the physical and chemical characteristics of water during a nycthemeral cycle in the dry and wet seasons. This study took place in a lake with low connectivity to the Paranapanema River, São Paulo, Brazil. Dissolved oxygen, pH, conductivity, temperature of surface water, and depth were measured at  6 hour intervals, and the macroinvertebrates were sampled in stands of Salvinia auriculata, in July 2006 and April 2007. The Canonical Correlation Analysis (CCA) was used to analyze abiotic factors, abundance of the macroinvertebrates, and sampling period. Ceratopogonidae, Chironomidae, Coleoptera, Culicidae, Odonata, and Oligochaeta were the most abundant taxa in the dry season, while Ephemeroptera, Gastropoda, Hemiptera, Hydracarina, Nematoda, Ostracoda, and pupae of Diptera were the most abundant taxa in the wet season. The CCA showed that in the dry season there was a positive correlation between the abundance of Ceratopogonidae, Chironomidae, Coleoptera, Culicidae, Odonata, and Orthoptera and dissolved oxygen and a negative correlation with surface water temperature and depth. We concluded that there was a positive variation in the abundance of Chironomidae, Ceratopogonidae, Coleoptera, Culicidae, Odonata, and Orthoptera and oxygen dissolved and, a negative variation with surface water temperature and depth in the dry season during the nycthemeral cycle.O objetivo deste trabalho foi investigar uma possível variação na abundância de macroinvertebrados em função da variação de parâmetros físicos e químicos da água em um período de 24 horas em duas estações distintas: seca e chuvosa em uma lagoa com baixa conectividade com o Rio Paranapanema,estado de SP, Brasil. O oxigênio dissolvido (OD), pH, condutividade elétrica, temperatura de superfície da água (TSA) e profundidade foram medidos em intervalos de 6 horas e os organismos coletados em bancos de Salvinia auriculata, em julho de 2006 e abril de 2007. A Análise de Correspondência Canônica (ACC) realizada entre as variáveis ambientais, abundância dos macroinvertebrados e período de amostragem revelou que Ceratopogonidae, Chironomidae, Coleoptera, Culicidae, Odonata e Oligochaeta foram os grupos com maior abundância na estação seca, enquanto que Ephemeroptera, Gastropoda, Hemiptera, Hydracarina, Nematoda, Ostracoda e pupa de Diptera foram mais abundantes no período chuvoso. A ACC mostrou na estação seca uma correlação positiva entre a abundância de Ceratopogonidae, Chironomidae, Coleoptera, Culicidae, Odonata e Orthoptera e oxigênio e negativa com a temperatura de superfície da água e profundidade. Concluímos que houve uma variação positiva na abundância de Chironomidae, Ceratopogonidae, Coleoptera, Culicidae, Odonata e Orthoptera e OD e negativa com a TSA e profundidade durante o período de 24 horas na estação seca

A profundidade como fator determinante na variação anual da densidade dos macroinvertebrados associados à Salvinia auriculata Aublet

The aim of this work was to study the effects of water annual variation of Paranapanema River and others variables on macroinvertebrates that lives in macrophytes roots, from March 2006 to February 2007. The sampled was realized with a hand-net (mesh size: 0.25 mm) and 0.07 m2 circle area. We measured air and water temperature, depth, dissolved oxygen, pH, K25  and suspended matter. The normality was tested and a Canonical Correspondence Analysis (CCA) was realized. Telebasis showed high density in period studied. There was a high variation in depth: 6.07 m in  April 2006 to 1.83 m in November 2007. The CCA showed that Culicidae, Ephemeroptera, Ostracoda, Calopterygidae, Coryphaeschna and Cyanallagma were significative correlated with the depth. We concluded that the effect of the depth on larvae Odonata can not have been direct, but indirect by the effect in your substrate as aquatic plant. O objetivo deste trabalho foi estudar, no período de março de 2006 a fevereiro de 2007, o efeito da flutuação anual no nível de água do Rio Paranapanema, estado de SP, dentre outros fatores ambientais, sobre os macroinvertebrados que vivem junto às raízes de Salvinia auriculata. A amostragem da macrófita foi realizada com auxílio de um puçá com abertura em formato circular de 0,07 m2, acoplado a uma rede de malha 0,25 mm. Foram obtidos os valores da temperatura do ar e da água, a profundidade, o oxigênio dissolvido, o pH, condutividade e material em suspensão. Após a confirmação da normalidade dos dados foi realizada uma análise de correspondência canônica (ACC). Houve uma grande variação na profundidade, variando de 6,07 metros em abril de 2006 a 1,83 metros em novembro do mesmo ano. A ACC mostrou que Culicidae, Ephemeroptera, Ostracoda, Calopterygidae, Coryphaeschna e Cyanallagma foram os únicos táxons que apresentaram correlações significativas com a profundidade. O efeito da profundidade sobre as larvas de Odonata que apresentaram as maiores densidades em todos os meses estudados pode não ter ocorrido diretamente sobre os macroinvertebrados, mas sim indiretamente por afetar o substrato no qual estão presentes como as plantas aquáticas

Dual self-assembly of supramolecular peptide nanotubes to provide stabilisation in water

Self-assembling peptides have the ability to spontaneously aggregate into large ordered structures. The reversibility of the peptide hydrogen bonded supramolecular assembly make them tunable to a host of different applications, although it leaves them highly dynamic and prone to disassembly at the low concentration needed for biological applications. Here we demonstrate that a secondary hydrophobic interaction, near the peptide core, can stabilise the highly dynamic peptide bonds, without losing the vital solubility of the systems in aqueous conditions. This hierarchical self-assembly process can be used to stabilise a range of different β-sheet hydrogen bonded architectures

Expert consensus document: Clinical and molecular diagnosis, screening and management of Beckwith-Wiedemann syndrome: an international consensus statement.

Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS), a human genomic imprinting disorder, is characterized by phenotypic variability that might include overgrowth, macroglossia, abdominal wall defects, neonatal hypoglycaemia, lateralized overgrowth and predisposition to embryonal tumours. Delineation of the molecular defects within the imprinted 11p15.5 region can predict familial recurrence risks and the risk (and type) of embryonal tumour. Despite recent advances in knowledge, there is marked heterogeneity in clinical diagnostic criteria and care. As detailed in this Consensus Statement, an international consensus group agreed upon 72 recommendations for the clinical and molecular diagnosis and management of BWS, including comprehensive protocols for the molecular investigation, care and treatment of patients from the prenatal period to adulthood. The consensus recommendations apply to patients with Beckwith-Wiedemann spectrum (BWSp), covering classical BWS without a molecular diagnosis and BWS-related phenotypes with an 11p15.5 molecular anomaly. Although the consensus group recommends a tumour surveillance programme targeted by molecular subgroups, surveillance might differ according to the local health-care system (for example, in the United States), and the results of targeted and universal surveillance should be evaluated prospectively. International collaboration, including a prospective audit of the results of implementing these consensus recommendations, is required to expand the evidence base for the design of optimum care pathways